MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus thermophilus LMD-9

Total Repeats: 28637

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_008532	TGA	2	6	337149	337154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627261
5003	NC_008532	CAT	2	6	337170	337175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627261
5004	NC_008532	GAA	2	6	337177	337182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627261
5005	NC_008532	TGGAA	2	10	337317	337326	40 %	20 %	40 %	0 %	116627262
5006	NC_008532	TTC	2	6	337349	337354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116627262
5007	NC_008532	AAG	2	6	337357	337362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627262
5008	NC_008532	CGG	2	6	337424	337429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116627262
5009	NC_008532	TAA	2	6	337596	337601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116627262
5010	NC_008532	TGA	2	6	337605	337610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627262
5011	NC_008532	CAAT	2	8	338731	338738	50 %	25 %	0 %	25 %	116627263
5012	NC_008532	CTC	2	6	338811	338816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116627263
5013	NC_008532	AG	3	6	338830	338835	50 %	0 %	50 %	0 %	116627263
5014	NC_008532	TTTA	2	8	338855	338862	25 %	75 %	0 %	0 %	116627263
5015	NC_008532	AGAA	2	8	338863	338870	75 %	0 %	25 %	0 %	116627263
5016	NC_008532	TTA	2	6	338912	338917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116627263
5017	NC_008532	CT	3	6	338997	339002	0 %	50 %	0 %	50 %	116627263
5018	NC_008532	TGA	2	6	339069	339074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627263
5019	NC_008532	TGC	2	6	339081	339086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116627263
5020	NC_008532	CAT	2	6	339095	339100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627263
5021	NC_008532	A	6	6	339115	339120	100 %	0 %	0 %	0 %	116627263
5022	NC_008532	GAA	2	6	339145	339150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627263
5023	NC_008532	TGA	2	6	339153	339158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627263
5024	NC_008532	CAG	2	6	339197	339202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116627263
5025	NC_008532	AG	3	6	339201	339206	50 %	0 %	50 %	0 %	116627263
5026	NC_008532	A	7	7	339249	339255	100 %	0 %	0 %	0 %	116627263
5027	NC_008532	TGA	2	6	339321	339326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627263
5028	NC_008532	AAG	2	6	339365	339370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627263
5029	NC_008532	A	6	6	339379	339384	100 %	0 %	0 %	0 %	116627263
5030	NC_008532	CTA	2	6	339429	339434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627263
5031	NC_008532	GAA	2	6	339547	339552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627263
5032	NC_008532	AAGT	2	8	339612	339619	50 %	25 %	25 %	0 %	116627263
5033	NC_008532	TTG	2	6	339725	339730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116627263
5034	NC_008532	AAG	2	6	339772	339777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627263
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5036	NC_008532	TCA	2	6	340096	340101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627264
5037	NC_008532	ATTT	2	8	340116	340123	25 %	75 %	0 %	0 %	116627264
5038	NC_008532	GAC	2	6	340157	340162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116627264
5039	NC_008532	TGG	2	6	340216	340221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116627264
5040	NC_008532	CGA	2	6	340274	340279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116627264
5041	NC_008532	TGAG	2	8	340300	340307	25 %	25 %	50 %	0 %	116627264
5042	NC_008532	T	6	6	340347	340352	0 %	100 %	0 %	0 %	116627264
5043	NC_008532	AGGC	2	8	340381	340388	25 %	0 %	50 %	25 %	116627264
5044	NC_008532	CAG	2	6	340394	340399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116627264
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5047	NC_008532	AGT	2	6	340634	340639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627264
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5049	NC_008532	CAT	2	6	340797	340802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627264
5050	NC_008532	AGTTA	2	10	340830	340839	40 %	40 %	20 %	0 %	116627264
5051	NC_008532	GAA	2	6	340845	340850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627264
5052	NC_008532	TGT	2	6	340938	340943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116627264
5053	NC_008532	TAG	2	6	340968	340973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627264
5054	NC_008532	GCTT	2	8	341026	341033	0 %	50 %	25 %	25 %	116627264
5055	NC_008532	A	6	6	341154	341159	100 %	0 %	0 %	0 %	116627264
5056	NC_008532	AAGA	2	8	341192	341199	75 %	0 %	25 %	0 %	116627264
5057	NC_008532	TAG	3	9	341227	341235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627264
5058	NC_008532	ATA	2	6	341248	341253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116627264
5059	NC_008532	GCA	4	12	341427	341438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116627265
5060	NC_008532	GTC	2	6	341483	341488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116627265
5061	NC_008532	TAT	2	6	341505	341510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116627265
5062	NC_008532	CT	3	6	341555	341560	0 %	50 %	0 %	50 %	116627265
5063	NC_008532	ATA	2	6	341573	341578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116627265
5064	NC_008532	CCTTTT	2	12	341586	341597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116627265
5065	NC_008532	CAG	2	6	341606	341611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116627265
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5081	NC_008532	ATT	2	6	342676	342681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116627265
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5089	NC_008532	CAA	2	6	344068	344073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116627266
5090	NC_008532	A	6	6	344152	344157	100 %	0 %	0 %	0 %	116627266
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5092	NC_008532	GTAG	2	8	344244	344251	25 %	25 %	50 %	0 %	116627266
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5105	NC_008532	AAG	2	6	344749	344754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627266
5106	NC_008532	GAT	2	6	344816	344821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627266
5107	NC_008532	AAGAT	2	10	344842	344851	60 %	20 %	20 %	0 %	116627266
5108	NC_008532	TAT	2	6	344858	344863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116627266
5109	NC_008532	GTG	2	6	344902	344907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116627266
5110	NC_008532	TTAC	2	8	344920	344927	25 %	50 %	0 %	25 %	116627266
5111	NC_008532	AGC	2	6	345020	345025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116627266
5112	NC_008532	ACA	2	6	345097	345102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116627267
5113	NC_008532	ACT	2	6	345162	345167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627267
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5118	NC_008532	AGA	2	6	345399	345404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627267
5119	NC_008532	AC	3	6	345422	345427	50 %	0 %	0 %	50 %	116627267
5120	NC_008532	AAT	2	6	345463	345468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116627267
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5122	NC_008532	ATG	2	6	345554	345559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627267
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5244	NC_008532	TGG	2	6	351772	351777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116627276
5245	NC_008532	TTC	2	6	351813	351818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116627276
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5247	NC_008532	TGC	2	6	351934	351939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116627276
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5489	NC_008532	A	6	6	370432	370437	100 %	0 %	0 %	0 %	116627289
5490	NC_008532	GTT	2	6	370662	370667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116627290
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5492	NC_008532	T	7	7	370783	370789	0 %	100 %	0 %	0 %	116627290
5493	NC_008532	AG	3	6	370791	370796	50 %	0 %	50 %	0 %	116627290
5494	NC_008532	GCT	2	6	370804	370809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116627290
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