MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen chromosome

Total Repeats: 49570

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_008346	GCC	2	6	318547	318552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114565840
5502	NC_008346	T	6	6	318606	318611	0 %	100 %	0 %	0 %	114565840
5503	NC_008346	TGG	2	6	318618	318623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114565840
5504	NC_008346	AGC	2	6	318630	318635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114565840
5505	NC_008346	ATG	2	6	318758	318763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114565840
5506	NC_008346	TAA	2	6	318767	318772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114565840
5507	NC_008346	GCC	2	6	318820	318825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114565840
5508	NC_008346	GGT	2	6	318864	318869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114565840
5509	NC_008346	G	6	6	318889	318894	0 %	0 %	100 %	0 %	114565840
5510	NC_008346	GAT	2	6	318930	318935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114565840
5511	NC_008346	ATTG	2	8	319015	319022	25 %	50 %	25 %	0 %	114565840
5512	NC_008346	GAT	2	6	319033	319038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114565840
5513	NC_008346	CAG	2	6	319094	319099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114565840
5514	NC_008346	GC	3	6	319223	319228	0 %	0 %	50 %	50 %	114565841
5515	NC_008346	TGA	2	6	319476	319481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114565841
5516	NC_008346	ATA	2	6	319491	319496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114565841
5517	NC_008346	GCC	2	6	319559	319564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114565841
5518	NC_008346	CGG	2	6	319600	319605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114565841
5519	NC_008346	ATG	2	6	319634	319639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114565841
5520	NC_008346	AT	3	6	319641	319646	50 %	50 %	0 %	0 %	114565841
5521	NC_008346	ATA	2	6	319668	319673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114565841
5522	NC_008346	ATA	2	6	319779	319784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114565841
5523	NC_008346	GCC	2	6	319847	319852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114565841
5524	NC_008346	CGC	2	6	319927	319932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114565841
5525	NC_008346	CAG	2	6	319969	319974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114565841
5526	NC_008346	TCC	2	6	319991	319996	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114565841
5527	NC_008346	GGA	2	6	320065	320070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114565841
5528	NC_008346	AGA	2	6	320176	320181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114565841
5529	NC_008346	GGA	2	6	320308	320313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114565841
5530	NC_008346	CTA	2	6	320316	320321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114565841
5531	NC_008346	CTG	2	6	320408	320413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114565841
5532	NC_008346	GAG	2	6	320420	320425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114565841
5533	NC_008346	TAT	2	6	320593	320598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114565842
5534	NC_008346	GGA	2	6	320711	320716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114565842
5535	NC_008346	A	6	6	320720	320725	100 %	0 %	0 %	0 %	114565842
5536	NC_008346	T	7	7	320958	320964	0 %	100 %	0 %	0 %	114565843
5537	NC_008346	TGC	2	6	321047	321052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114565843
5538	NC_008346	GCA	2	6	321068	321073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114565843
5539	NC_008346	GGA	2	6	321111	321116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114565843
5540	NC_008346	GCC	2	6	321148	321153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114565843
5541	NC_008346	ATT	2	6	321165	321170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114565843
5542	NC_008346	AGG	2	6	321179	321184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114565843
5543	NC_008346	GTG	2	6	321202	321207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114565843
5544	NC_008346	CTG	2	6	321226	321231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114565843
5545	NC_008346	ATC	2	6	321273	321278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114565843
5546	NC_008346	GAC	2	6	321312	321317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114565843
5547	NC_008346	CTC	2	6	321326	321331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114565843
5548	NC_008346	AGCAGG	2	12	321362	321373	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	114565843
5549	NC_008346	ATG	2	6	321445	321450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114565843
5550	NC_008346	GGT	2	6	321465	321470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114565843
5551	NC_008346	ATG	2	6	321521	321526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114565843
5552	NC_008346	GGT	2	6	321528	321533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114565843
5553	NC_008346	TGG	2	6	321590	321595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114565843
5554	NC_008346	AGA	3	9	321635	321643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114565843
5555	NC_008346	AG	3	6	322112	322117	50 %	0 %	50 %	0 %	114565844
5556	NC_008346	ATT	2	6	322129	322134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114565844
5557	NC_008346	CAT	2	6	322166	322171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114565844
5558	NC_008346	GAA	2	6	322229	322234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114565844
5559	NC_008346	CTG	2	6	322250	322255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114565844
5560	NC_008346	GAA	2	6	322325	322330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114565844
5561	NC_008346	GCCT	2	8	322335	322342	0 %	25 %	25 %	50 %	114565844
5562	NC_008346	GCC	2	6	322424	322429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114565844
5563	NC_008346	AAG	2	6	322511	322516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114565844
5564	NC_008346	AGCC	2	8	322546	322553	25 %	0 %	25 %	50 %	114565844
5565	NC_008346	GCT	2	6	322569	322574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114565844
5566	NC_008346	TAAT	2	8	322655	322662	50 %	50 %	0 %	0 %	114565844
5567	NC_008346	AT	3	6	322880	322885	50 %	50 %	0 %	0 %	114565845
5568	NC_008346	AAAG	2	8	322920	322927	75 %	0 %	25 %	0 %	114565845
5569	NC_008346	GA	3	6	323032	323037	50 %	0 %	50 %	0 %	114565845
5570	NC_008346	ATG	2	6	323076	323081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114565845
5571	NC_008346	AAG	2	6	323175	323180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114565845
5572	NC_008346	TCA	2	6	323263	323268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114565845
5573	NC_008346	GCC	2	6	323317	323322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114565845
5574	NC_008346	CTG	2	6	323325	323330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114565845
5575	NC_008346	GGT	2	6	323333	323338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114565845
5576	NC_008346	GAT	2	6	323343	323348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114565845
5577	NC_008346	CTAT	2	8	323365	323372	25 %	50 %	0 %	25 %	114565845
5578	NC_008346	AAG	2	6	323401	323406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114565845
5579	NC_008346	A	6	6	323526	323531	100 %	0 %	0 %	0 %	114565845
5580	NC_008346	GAA	2	6	323568	323573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114565845
5581	NC_008346	GAT	2	6	323679	323684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114565845
5582	NC_008346	A	6	6	323698	323703	100 %	0 %	0 %	0 %	114565845
5583	NC_008346	AGA	2	6	323759	323764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114565845
5584	NC_008346	GATA	2	8	323813	323820	50 %	25 %	25 %	0 %	114565845
5585	NC_008346	TGC	2	6	323833	323838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114565845
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5587	NC_008346	TGA	2	6	324067	324072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114565845
5588	NC_008346	TAG	2	6	324151	324156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114565845
5589	NC_008346	AGA	2	6	324218	324223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114565845
5590	NC_008346	GAA	2	6	324312	324317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114565845
5591	NC_008346	GGA	2	6	324428	324433	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114565845
5592	NC_008346	TGA	2	6	324448	324453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114565845
5593	NC_008346	CTA	2	6	324521	324526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114565845
5594	NC_008346	CAG	2	6	324584	324589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114565845
5595	NC_008346	AAG	2	6	324618	324623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114565845
5596	NC_008346	AGC	2	6	324624	324629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114565845
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5598	NC_008346	GAG	2	6	324687	324692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114565845
5599	NC_008346	AG	3	6	324699	324704	50 %	0 %	50 %	0 %	114565845
5600	NC_008346	AT	3	6	324728	324733	50 %	50 %	0 %	0 %	114565845
5601	NC_008346	TGA	2	6	324749	324754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114565845
5602	NC_008346	T	7	7	324791	324797	0 %	100 %	0 %	0 %	114565845
5603	NC_008346	TGA	2	6	324848	324853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114565845
5604	NC_008346	TAC	2	6	324855	324860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114565845
5605	NC_008346	GTGGAT	2	12	324951	324962	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	114565845
5606	NC_008346	AAG	2	6	325275	325280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114565846
5607	NC_008346	GGT	2	6	325298	325303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114565846
5608	NC_008346	CCG	2	6	325310	325315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114565846
5609	NC_008346	TGG	2	6	325366	325371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114565846
5610	NC_008346	AAT	2	6	325455	325460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114565846
5611	NC_008346	CGG	2	6	325536	325541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114565846
5612	NC_008346	AAG	2	6	325612	325617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114565846
5613	NC_008346	A	6	6	325653	325658	100 %	0 %	0 %	0 %	114565846
5614	NC_008346	AGCC	2	8	325682	325689	25 %	0 %	25 %	50 %	114565846
5615	NC_008346	AG	3	6	325724	325729	50 %	0 %	50 %	0 %	114565846
5616	NC_008346	CAAA	2	8	327051	327058	75 %	0 %	0 %	25 %	114565847
5617	NC_008346	AGTA	2	8	327118	327125	50 %	25 %	25 %	0 %	114565847
5618	NC_008346	ACC	2	6	327142	327147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114565847
5619	NC_008346	GGC	2	6	327205	327210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114565847
5620	NC_008346	TGC	2	6	327213	327218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114565847
5621	NC_008346	GGA	2	6	327340	327345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114565847
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5623	NC_008346	GAT	2	6	327424	327429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114565847
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5630	NC_008346	ATT	2	6	328099	328104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114565848
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5632	NC_008346	CAGT	2	8	328144	328151	25 %	25 %	25 %	25 %	114565848
5633	NC_008346	CTAT	2	8	328156	328163	25 %	50 %	0 %	25 %	114565848
5634	NC_008346	AGTC	2	8	328231	328238	25 %	25 %	25 %	25 %	114565848
5635	NC_008346	GGA	2	6	328265	328270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114565848
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5642	NC_008346	AAAAT	2	10	328862	328871	80 %	20 %	0 %	0 %	114565849
5643	NC_008346	CCTG	2	8	329058	329065	0 %	25 %	25 %	50 %	114565849
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5645	NC_008346	AT	3	6	329104	329109	50 %	50 %	0 %	0 %	114565849
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5739	NC_008346	AT	3	6	335947	335952	50 %	50 %	0 %	0 %	114565856
5740	NC_008346	CTTT	2	8	335954	335961	0 %	75 %	0 %	25 %	114565856
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5990	NC_008346	TGA	2	6	353424	353429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114565861
5991	NC_008346	GCT	2	6	353461	353466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114565861
5992	NC_008346	GCT	2	6	353476	353481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114565861
5993	NC_008346	ATG	2	6	353488	353493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114565861
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5996	NC_008346	TGA	2	6	353571	353576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114565861
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5998	NC_008346	AGA	2	6	353613	353618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114565861
5999	NC_008346	GAAT	2	8	353637	353644	50 %	25 %	25 %	0 %	114565861
6000	NC_008346	T	6	6	353662	353667	0 %	100 %	0 %	0 %	114565861

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