MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella frigidimarina NCIMB 400 chromosome

Total Repeats: 78560

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_008345	AAT	2	6	246541	246546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561411
4002	NC_008345	ATA	2	6	246569	246574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561411
4003	NC_008345	GAA	2	6	246655	246660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561412
4004	NC_008345	GT	3	6	246675	246680	0 %	50 %	50 %	0 %	114561412
4005	NC_008345	TGT	2	6	246700	246705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561412
4006	NC_008345	TGTC	2	8	246716	246723	0 %	50 %	25 %	25 %	114561412
4007	NC_008345	TGC	2	6	246727	246732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561412
4008	NC_008345	GTT	2	6	246903	246908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561412
4009	NC_008345	T	6	6	246914	246919	0 %	100 %	0 %	0 %	114561412
4010	NC_008345	AGCT	2	8	246921	246928	25 %	25 %	25 %	25 %	114561412
4011	NC_008345	TTG	2	6	246960	246965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561412
4012	NC_008345	CTG	2	6	246998	247003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561412
4013	NC_008345	CAC	2	6	247046	247051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114561412
4014	NC_008345	TGCC	2	8	247118	247125	0 %	25 %	25 %	50 %	114561412
4015	NC_008345	GATA	2	8	247256	247263	50 %	25 %	25 %	0 %	114561412
4016	NC_008345	TCCAG	2	10	247274	247283	20 %	20 %	20 %	40 %	114561412
4017	NC_008345	ACT	2	6	247288	247293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561412
4018	NC_008345	CAT	2	6	247313	247318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561412
4019	NC_008345	ATA	2	6	247387	247392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561412
4020	NC_008345	AAC	2	6	247398	247403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561412
4021	NC_008345	CCACA	2	10	247404	247413	40 %	0 %	0 %	60 %	114561412
4022	NC_008345	TTC	2	6	247455	247460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561412
4023	NC_008345	AAT	2	6	247548	247553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561412
4024	NC_008345	CGC	2	6	247598	247603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114561412
4025	NC_008345	GCC	2	6	247633	247638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114561412
4026	NC_008345	AGG	2	6	247860	247865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114561413
4027	NC_008345	CAG	2	6	247910	247915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561413
4028	NC_008345	TAA	2	6	248052	248057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561413
4029	NC_008345	CAA	2	6	248063	248068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561413
4030	NC_008345	CGA	2	6	248090	248095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561413
4031	NC_008345	CATCGA	2	12	248103	248114	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	114561413
4032	NC_008345	GCA	2	6	248135	248140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561413
4033	NC_008345	GTT	2	6	248692	248697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561414
4034	NC_008345	GCG	2	6	248716	248721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114561414
4035	NC_008345	GAT	2	6	248838	248843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561414
4036	NC_008345	GCG	2	6	248848	248853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114561414
4037	NC_008345	T	6	6	248883	248888	0 %	100 %	0 %	0 %	114561414
4038	NC_008345	AATG	2	8	248988	248995	50 %	25 %	25 %	0 %	114561414
4039	NC_008345	TTA	2	6	249023	249028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561414
4040	NC_008345	CAA	2	6	249076	249081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561414
4041	NC_008345	A	6	6	249179	249184	100 %	0 %	0 %	0 %	114561414
4042	NC_008345	T	6	6	249196	249201	0 %	100 %	0 %	0 %	114561414
4043	NC_008345	ATG	2	6	249219	249224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561415
4044	NC_008345	GGC	2	6	249264	249269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114561415
4045	NC_008345	GAT	2	6	249291	249296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561415
4046	NC_008345	TGCCG	2	10	249299	249308	0 %	20 %	40 %	40 %	114561415
4047	NC_008345	A	6	6	249395	249400	100 %	0 %	0 %	0 %	114561415
4048	NC_008345	TTG	2	6	249484	249489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561415
4049	NC_008345	TGC	2	6	249509	249514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561415
4050	NC_008345	CCG	2	6	249712	249717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114561415
4051	NC_008345	GGT	2	6	249780	249785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561415
4052	NC_008345	CTG	2	6	249793	249798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561415
4053	NC_008345	TGT	2	6	249944	249949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561415
4054	NC_008345	GGC	2	6	250035	250040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114561415
4055	NC_008345	TTTA	2	8	250069	250076	25 %	75 %	0 %	0 %	114561415
4056	NC_008345	AAG	2	6	250227	250232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561415
4057	NC_008345	CCA	2	6	250518	250523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114561416
4058	NC_008345	CAA	2	6	250638	250643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561416
4059	NC_008345	ATCGGT	2	12	250743	250754	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	114561416
4060	NC_008345	GCG	2	6	250780	250785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114561416
4061	NC_008345	TC	3	6	250942	250947	0 %	50 %	0 %	50 %	114561416
4062	NC_008345	AAT	2	6	251045	251050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561416
4063	NC_008345	TAA	2	6	251060	251065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561416
4064	NC_008345	AGC	2	6	251101	251106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561416
4065	NC_008345	TGAT	2	8	251110	251117	25 %	50 %	25 %	0 %	114561416
4066	NC_008345	GAA	2	6	251130	251135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561416
4067	NC_008345	A	6	6	251202	251207	100 %	0 %	0 %	0 %	114561416
4068	NC_008345	TGA	2	6	251279	251284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561416
4069	NC_008345	GAT	2	6	251307	251312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561416
4070	NC_008345	TTA	2	6	251508	251513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561417
4071	NC_008345	TTC	2	6	251577	251582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561417
4072	NC_008345	CAC	2	6	251655	251660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114561417
4073	NC_008345	GGCA	2	8	251762	251769	25 %	0 %	50 %	25 %	114561417
4074	NC_008345	TAA	2	6	251775	251780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561417
4075	NC_008345	TGC	2	6	251850	251855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561417
4076	NC_008345	ATGGTA	2	12	251857	251868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561417
4077	NC_008345	CCG	2	6	252119	252124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114561417
4078	NC_008345	TGT	2	6	252148	252153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561417
4079	NC_008345	ATC	2	6	252156	252161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561417
4080	NC_008345	GCC	2	6	252216	252221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114561417
4081	NC_008345	GCTCA	2	10	252240	252249	20 %	20 %	20 %	40 %	114561417
4082	NC_008345	TGT	2	6	252283	252288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561417
4083	NC_008345	CAGG	2	8	252463	252470	25 %	0 %	50 %	25 %	114561417
4084	NC_008345	CAC	2	6	252471	252476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114561417
4085	NC_008345	AATC	2	8	252608	252615	50 %	25 %	0 %	25 %	114561417
4086	NC_008345	TGC	2	6	252622	252627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561417
4087	NC_008345	CTT	2	6	252639	252644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561417
4088	NC_008345	GCG	2	6	252646	252651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114561417
4089	NC_008345	TTG	2	6	252660	252665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561417
4090	NC_008345	TAA	2	6	252690	252695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561417
4091	NC_008345	GCA	2	6	252718	252723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561417
4092	NC_008345	ATA	2	6	252819	252824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561417
4093	NC_008345	CAT	2	6	252827	252832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561417
4094	NC_008345	ATT	2	6	252994	252999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561418
4095	NC_008345	ATT	2	6	253099	253104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561418
4096	NC_008345	CCAG	2	8	253141	253148	25 %	0 %	25 %	50 %	114561418
4097	NC_008345	GGC	2	6	253298	253303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114561418
4098	NC_008345	A	7	7	253395	253401	100 %	0 %	0 %	0 %	114561418
4099	NC_008345	ACC	2	6	253486	253491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114561418
4100	NC_008345	ATCAA	2	10	253509	253518	60 %	20 %	0 %	20 %	114561418
4101	NC_008345	TAC	2	6	253606	253611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561418
4102	NC_008345	TTGGG	2	10	253634	253643	0 %	40 %	60 %	0 %	114561418
4103	NC_008345	TGAGGC	2	12	253657	253668	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	114561418
4104	NC_008345	TGT	2	6	253695	253700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561418
4105	NC_008345	GGTA	2	8	253804	253811	25 %	25 %	50 %	0 %	114561418
4106	NC_008345	T	6	6	253823	253828	0 %	100 %	0 %	0 %	114561418
4107	NC_008345	CAA	2	6	253925	253930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561418
4108	NC_008345	ACA	2	6	254028	254033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561418
4109	NC_008345	GGT	2	6	254219	254224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561418
4110	NC_008345	GTA	2	6	254253	254258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561418
4111	NC_008345	GGT	2	6	254311	254316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561418
4112	NC_008345	GCG	2	6	254321	254326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114561418
4113	NC_008345	ATT	2	6	254377	254382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561418
4114	NC_008345	A	6	6	254399	254404	100 %	0 %	0 %	0 %	114561418
4115	NC_008345	ATT	2	6	254466	254471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561418
4116	NC_008345	TAA	2	6	254472	254477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561418
4117	NC_008345	GTTG	2	8	254518	254525	0 %	50 %	50 %	0 %	114561418
4118	NC_008345	ACC	2	6	254537	254542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114561418
4119	NC_008345	ACA	2	6	254590	254595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561418
4120	NC_008345	GT	3	6	254609	254614	0 %	50 %	50 %	0 %	114561418
4121	NC_008345	CATC	2	8	254650	254657	25 %	25 %	0 %	50 %	114561418
4122	NC_008345	CGC	3	9	254685	254693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114561418
4123	NC_008345	TGG	3	9	254694	254702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561418
4124	NC_008345	TTTA	2	8	254778	254785	25 %	75 %	0 %	0 %	114561418
4125	NC_008345	TGTT	2	8	254850	254857	0 %	75 %	25 %	0 %	114561418
4126	NC_008345	GCG	2	6	254880	254885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114561418
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4130	NC_008345	CTG	2	6	255096	255101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561418
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4133	NC_008345	CTG	2	6	255218	255223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561418
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4143	NC_008345	ATG	2	6	256529	256534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561419
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4231	NC_008345	CGT	3	9	262120	262128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561423
4232	NC_008345	TGA	2	6	262149	262154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561423
4233	NC_008345	A	6	6	262154	262159	100 %	0 %	0 %	0 %	114561423
4234	NC_008345	CTG	2	6	262223	262228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561423
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4236	NC_008345	CCAG	2	8	262273	262280	25 %	0 %	25 %	50 %	114561423
4237	NC_008345	CAC	2	6	262295	262300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114561423
4238	NC_008345	A	7	7	262347	262353	100 %	0 %	0 %	0 %	114561423
4239	NC_008345	CAG	2	6	262694	262699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561424
4240	NC_008345	TTA	2	6	262735	262740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561424
4241	NC_008345	GTT	2	6	262745	262750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561424
4242	NC_008345	TGA	2	6	262799	262804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561424
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4244	NC_008345	AT	3	6	262920	262925	50 %	50 %	0 %	0 %	114561424
4245	NC_008345	TCG	2	6	263031	263036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561424
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4248	NC_008345	AAT	3	9	263119	263127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561424
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4262	NC_008345	GCAT	2	8	264105	264112	25 %	25 %	25 %	25 %	114561424
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4276	NC_008345	TGA	2	6	265143	265148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561426
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4361	NC_008345	TTG	2	6	270225	270230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561430
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4365	NC_008345	CTG	2	6	270516	270521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561430
4366	NC_008345	TCC	2	6	270561	270566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114561430
4367	NC_008345	T	6	6	270634	270639	0 %	100 %	0 %	0 %	114561430
4368	NC_008345	C	6	6	270665	270670	0 %	0 %	0 %	100 %	114561430
4369	NC_008345	ATGCA	2	10	270720	270729	40 %	20 %	20 %	20 %	114561430
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4372	NC_008345	GT	3	6	270970	270975	0 %	50 %	50 %	0 %	114561431
4373	NC_008345	GCG	2	6	270979	270984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114561431
4374	NC_008345	CTG	2	6	271033	271038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561431
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4379	NC_008345	GAT	2	6	271339	271344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561431
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4386	NC_008345	GTGTG	2	10	271975	271984	0 %	40 %	60 %	0 %	114561432
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4390	NC_008345	TCAG	2	8	272206	272213	25 %	25 %	25 %	25 %	114561432
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4394	NC_008345	CGTGA	2	10	272396	272405	20 %	20 %	40 %	20 %	114561432
4395	NC_008345	AGCATG	2	12	272409	272420	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	114561432
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4482	NC_008345	A	6	6	277612	277617	100 %	0 %	0 %	0 %	114561437
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4485	NC_008345	GCT	3	9	277862	277870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561437
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4489	NC_008345	TAA	2	6	278028	278033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561438
4490	NC_008345	ACA	2	6	278042	278047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561438
4491	NC_008345	TAAA	2	8	278128	278135	75 %	25 %	0 %	0 %	114561438
4492	NC_008345	AT	3	6	278166	278171	50 %	50 %	0 %	0 %	114561438
4493	NC_008345	CA	3	6	278177	278182	50 %	0 %	0 %	50 %	114561438
4494	NC_008345	GTA	2	6	278198	278203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561438
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