MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella frigidimarina NCIMB 400 chromosome

Total Repeats: 78560

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_008345	TTA	2	6	218370	218375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561385
3502	NC_008345	TA	3	6	218393	218398	50 %	50 %	0 %	0 %	114561385
3503	NC_008345	CAG	2	6	218399	218404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561385
3504	NC_008345	AGC	2	6	218408	218413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561385
3505	NC_008345	CTGA	2	8	218443	218450	25 %	25 %	25 %	25 %	114561385
3506	NC_008345	GCC	2	6	218540	218545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114561385
3507	NC_008345	CAG	2	6	218546	218551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561385
3508	NC_008345	TGA	2	6	218631	218636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561385
3509	NC_008345	A	6	6	218684	218689	100 %	0 %	0 %	0 %	114561385
3510	NC_008345	GCA	2	6	218692	218697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561385
3511	NC_008345	TGT	2	6	219156	219161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561386
3512	NC_008345	TTTG	2	8	219164	219171	0 %	75 %	25 %	0 %	114561386
3513	NC_008345	GTG	2	6	219173	219178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561386
3514	NC_008345	GAT	2	6	219256	219261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561386
3515	NC_008345	CTC	2	6	219268	219273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114561386
3516	NC_008345	ACC	2	6	219274	219279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114561386
3517	NC_008345	CAT	2	6	219357	219362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561386
3518	NC_008345	CAA	2	6	219409	219414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561386
3519	NC_008345	CGA	2	6	219479	219484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561386
3520	NC_008345	ATGC	2	8	219487	219494	25 %	25 %	25 %	25 %	114561386
3521	NC_008345	TTG	2	6	219529	219534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561386
3522	NC_008345	ATA	2	6	219590	219595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561386
3523	NC_008345	ATC	2	6	219724	219729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561386
3524	NC_008345	ATA	2	6	219737	219742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561386
3525	NC_008345	TAA	2	6	219772	219777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561386
3526	NC_008345	T	6	6	219787	219792	0 %	100 %	0 %	0 %	114561386
3527	NC_008345	TCT	2	6	219803	219808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561386
3528	NC_008345	CTT	2	6	219855	219860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561386
3529	NC_008345	GAGT	2	8	219891	219898	25 %	25 %	50 %	0 %	114561386
3530	NC_008345	TGG	2	6	219934	219939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561386
3531	NC_008345	ATTA	2	8	220205	220212	50 %	50 %	0 %	0 %	114561387
3532	NC_008345	GTTA	2	8	220216	220223	25 %	50 %	25 %	0 %	114561387
3533	NC_008345	TGG	2	6	220345	220350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561387
3534	NC_008345	GAT	2	6	220372	220377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561387
3535	NC_008345	GCA	2	6	220493	220498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561387
3536	NC_008345	CAA	2	6	220530	220535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561387
3537	NC_008345	ATC	2	6	220706	220711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561387
3538	NC_008345	T	6	6	220720	220725	0 %	100 %	0 %	0 %	114561387
3539	NC_008345	AGC	2	6	220744	220749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561387
3540	NC_008345	CCAG	2	8	220882	220889	25 %	0 %	25 %	50 %	114561387
3541	NC_008345	AACC	2	8	220904	220911	50 %	0 %	0 %	50 %	114561387
3542	NC_008345	GCAC	2	8	220949	220956	25 %	0 %	25 %	50 %	114561387
3543	NC_008345	CTG	2	6	221073	221078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561387
3544	NC_008345	T	6	6	221107	221112	0 %	100 %	0 %	0 %	114561387
3545	NC_008345	TCA	2	6	221114	221119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561387
3546	NC_008345	CG	3	6	221153	221158	0 %	0 %	50 %	50 %	114561387
3547	NC_008345	CAT	2	6	221185	221190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561387
3548	NC_008345	CTT	3	9	221313	221321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561387
3549	NC_008345	TTC	2	6	221464	221469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561387
3550	NC_008345	TTTGG	2	10	221539	221548	0 %	60 %	40 %	0 %	114561387
3551	NC_008345	AAT	2	6	221575	221580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561387
3552	NC_008345	GCT	2	6	221662	221667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561387
3553	NC_008345	AACC	2	8	221681	221688	50 %	0 %	0 %	50 %	114561387
3554	NC_008345	CAT	2	6	221706	221711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561387
3555	NC_008345	TTG	2	6	221725	221730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561387
3556	NC_008345	GCA	2	6	221750	221755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561387
3557	NC_008345	GTC	2	6	221758	221763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561387
3558	NC_008345	AGG	2	6	221794	221799	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114561387
3559	NC_008345	TTG	2	6	221870	221875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561387
3560	NC_008345	TTC	3	9	221950	221958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561387
3561	NC_008345	ATT	2	6	222023	222028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561387
3562	NC_008345	TGC	2	6	222055	222060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561387
3563	NC_008345	T	6	6	222070	222075	0 %	100 %	0 %	0 %	114561387
3564	NC_008345	CAG	2	6	222105	222110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561387
3565	NC_008345	GCC	2	6	222157	222162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114561387
3566	NC_008345	CAT	2	6	222213	222218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561387
3567	NC_008345	TCA	2	6	222236	222241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561387
3568	NC_008345	GCC	2	6	222404	222409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114561387
3569	NC_008345	A	6	6	222461	222466	100 %	0 %	0 %	0 %	114561387
3570	NC_008345	CGG	2	6	222470	222475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114561387
3571	NC_008345	GTT	2	6	222515	222520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561388
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3574	NC_008345	CAC	2	6	222844	222849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114561388
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3578	NC_008345	TTG	3	9	223034	223042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561389
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3580	NC_008345	GCCGA	2	10	223221	223230	20 %	0 %	40 %	40 %	114561389
3581	NC_008345	TAAT	2	8	223234	223241	50 %	50 %	0 %	0 %	114561389
3582	NC_008345	GAC	2	6	223243	223248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561389
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3588	NC_008345	GCT	2	6	223356	223361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561389
3589	NC_008345	TCG	2	6	223386	223391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561389
3590	NC_008345	GTT	2	6	223394	223399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561389
3591	NC_008345	GC	3	6	223554	223559	0 %	0 %	50 %	50 %	114561389
3592	NC_008345	TTG	2	6	223579	223584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561389
3593	NC_008345	ATG	2	6	223591	223596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561389
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3596	NC_008345	TAAG	2	8	223706	223713	50 %	25 %	25 %	0 %	114561389
3597	NC_008345	TTGC	2	8	223736	223743	0 %	50 %	25 %	25 %	114561389
3598	NC_008345	ACA	2	6	223774	223779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561389
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3603	NC_008345	TTA	2	6	223911	223916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561389
3604	NC_008345	TAA	2	6	223940	223945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561389
3605	NC_008345	GCGA	2	8	223982	223989	25 %	0 %	50 %	25 %	114561389
3606	NC_008345	CCA	2	6	224007	224012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114561389
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3609	NC_008345	CTG	2	6	224134	224139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561389
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3611	NC_008345	ACG	2	6	224196	224201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561389
3612	NC_008345	AT	3	6	224225	224230	50 %	50 %	0 %	0 %	114561389
3613	NC_008345	CAA	2	6	224248	224253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561389
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3619	NC_008345	ATG	2	6	225159	225164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561390
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3621	NC_008345	GTA	2	6	225211	225216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561390
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3985	NC_008345	AAT	2	6	245347	245352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561411
3986	NC_008345	GCC	2	6	245437	245442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114561411
3987	NC_008345	GAA	2	6	245578	245583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561411
3988	NC_008345	CA	3	6	245630	245635	50 %	0 %	0 %	50 %	114561411
3989	NC_008345	CAT	2	6	245800	245805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561411
3990	NC_008345	AAG	2	6	245831	245836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561411
3991	NC_008345	ATA	2	6	246052	246057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561411
3992	NC_008345	ACCCCC	2	12	246062	246073	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	114561411
3993	NC_008345	TTAA	2	8	246152	246159	50 %	50 %	0 %	0 %	114561411
3994	NC_008345	GTT	2	6	246193	246198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561411
3995	NC_008345	TGG	2	6	246334	246339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561411
3996	NC_008345	TGCT	2	8	246370	246377	0 %	50 %	25 %	25 %	114561411
3997	NC_008345	CAT	2	6	246385	246390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561411
3998	NC_008345	ATA	2	6	246443	246448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561411
3999	NC_008345	T	6	6	246454	246459	0 %	100 %	0 %	0 %	114561411
4000	NC_008345	ATG	2	6	246530	246535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561411

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