MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella frigidimarina NCIMB 400 chromosome

Total Repeats: 78560

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_008345	GATA	2	8	183355	183362	50 %	25 %	25 %	0 %	114561361
3002	NC_008345	TCG	2	6	183400	183405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561361
3003	NC_008345	TTG	2	6	183441	183446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561361
3004	NC_008345	TGT	2	6	183472	183477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561361
3005	NC_008345	AGA	2	6	183478	183483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561361
3006	NC_008345	TGC	2	6	183507	183512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561361
3007	NC_008345	CGA	2	6	183520	183525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561361
3008	NC_008345	AGTTG	2	10	183607	183616	20 %	40 %	40 %	0 %	114561361
3009	NC_008345	GAC	2	6	183731	183736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561361
3010	NC_008345	GTC	2	6	183802	183807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561362
3011	NC_008345	CAG	2	6	183821	183826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561362
3012	NC_008345	GTT	2	6	183921	183926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561362
3013	NC_008345	TAA	2	6	183934	183939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561362
3014	NC_008345	TGG	2	6	184055	184060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561362
3015	NC_008345	TAG	2	6	184126	184131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561362
3016	NC_008345	GTC	2	6	184132	184137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561362
3017	NC_008345	GCT	2	6	184143	184148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561362
3018	NC_008345	GTTGAA	2	12	184155	184166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561362
3019	NC_008345	GCT	2	6	184167	184172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561362
3020	NC_008345	TAAT	2	8	184176	184183	50 %	50 %	0 %	0 %	114561362
3021	NC_008345	TCA	2	6	185332	185337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561363
3022	NC_008345	GTA	2	6	185429	185434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561363
3023	NC_008345	TTA	2	6	185732	185737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561364
3024	NC_008345	TTTC	2	8	185745	185752	0 %	75 %	0 %	25 %	114561364
3025	NC_008345	GTT	2	6	185757	185762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561364
3026	NC_008345	TGAA	2	8	185907	185914	50 %	25 %	25 %	0 %	114561364
3027	NC_008345	ATT	2	6	185924	185929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561364
3028	NC_008345	CCT	2	6	185933	185938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114561365
3029	NC_008345	CTG	2	6	185939	185944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561365
3030	NC_008345	TC	3	6	185953	185958	0 %	50 %	0 %	50 %	114561365
3031	NC_008345	GC	3	6	185979	185984	0 %	0 %	50 %	50 %	114561365
3032	NC_008345	ATC	2	6	186025	186030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561365
3033	NC_008345	ACT	2	6	186126	186131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561365
3034	NC_008345	CCA	2	6	186132	186137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114561365
3035	NC_008345	TAA	2	6	186152	186157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561365
3036	NC_008345	ATTA	2	8	186165	186172	50 %	50 %	0 %	0 %	114561365
3037	NC_008345	GCG	2	6	186205	186210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114561365
3038	NC_008345	ATG	2	6	186227	186232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561365
3039	NC_008345	CCA	2	6	186303	186308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114561365
3040	NC_008345	GCA	2	6	186334	186339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561365
3041	NC_008345	TAA	2	6	186345	186350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561365
3042	NC_008345	TGC	2	6	186387	186392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561365
3043	NC_008345	GCA	2	6	186481	186486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561365
3044	NC_008345	GAT	2	6	186501	186506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561365
3045	NC_008345	TTG	2	6	186522	186527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561365
3046	NC_008345	CAA	2	6	186606	186611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561365
3047	NC_008345	GCA	2	6	186741	186746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561366
3048	NC_008345	CAT	2	6	186763	186768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561366
3049	NC_008345	TA	4	8	186824	186831	50 %	50 %	0 %	0 %	114561366
3050	NC_008345	CCT	2	6	186861	186866	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114561366
3051	NC_008345	CTAATG	2	12	186928	186939	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	114561366
3052	NC_008345	TCT	2	6	186966	186971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561366
3053	NC_008345	AGTA	2	8	187022	187029	50 %	25 %	25 %	0 %	114561366
3054	NC_008345	TAAA	2	8	187123	187130	75 %	25 %	0 %	0 %	114561366
3055	NC_008345	ACA	2	6	187141	187146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561366
3056	NC_008345	AAC	2	6	187257	187262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561366
3057	NC_008345	TGT	2	6	187331	187336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561366
3058	NC_008345	TTCA	2	8	187353	187360	25 %	50 %	0 %	25 %	114561366
3059	NC_008345	TAA	2	6	187414	187419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561367
3060	NC_008345	TG	3	6	187434	187439	0 %	50 %	50 %	0 %	114561367
3061	NC_008345	TTC	2	6	187493	187498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561367
3062	NC_008345	T	6	6	187505	187510	0 %	100 %	0 %	0 %	114561367
3063	NC_008345	TCG	2	6	187530	187535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561367
3064	NC_008345	TGT	2	6	187560	187565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561367
3065	NC_008345	TGT	2	6	187590	187595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561367
3066	NC_008345	CTT	2	6	187621	187626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561367
3067	NC_008345	ATC	2	6	187673	187678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561367
3068	NC_008345	TCT	2	6	187713	187718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561367
3069	NC_008345	CAC	2	6	187804	187809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114561367
3070	NC_008345	AAT	2	6	187850	187855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561367
3071	NC_008345	A	6	6	188345	188350	100 %	0 %	0 %	0 %	114561368
3072	NC_008345	AAG	2	6	188406	188411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561368
3073	NC_008345	TAA	2	6	188425	188430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561368
3074	NC_008345	CCA	2	6	188564	188569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114561368
3075	NC_008345	GGT	2	6	188570	188575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561368
3076	NC_008345	ACTG	2	8	188582	188589	25 %	25 %	25 %	25 %	114561368
3077	NC_008345	TGA	2	6	188593	188598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561368
3078	NC_008345	AGT	2	6	188631	188636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561368
3079	NC_008345	CCAC	2	8	188768	188775	25 %	0 %	0 %	75 %	114561369
3080	NC_008345	T	6	6	188831	188836	0 %	100 %	0 %	0 %	114561369
3081	NC_008345	CAC	2	6	188886	188891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114561369
3082	NC_008345	GTGACA	2	12	188915	188926	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	114561369
3083	NC_008345	GCT	2	6	188932	188937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561369
3084	NC_008345	TGC	2	6	188953	188958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561369
3085	NC_008345	CATT	2	8	189159	189166	25 %	50 %	0 %	25 %	114561369
3086	NC_008345	CAT	2	6	189183	189188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561369
3087	NC_008345	ATC	2	6	189206	189211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561369
3088	NC_008345	T	6	6	189229	189234	0 %	100 %	0 %	0 %	114561369
3089	NC_008345	CAA	2	6	189264	189269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561369
3090	NC_008345	AGT	2	6	189272	189277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561369
3091	NC_008345	ATCA	2	8	189313	189320	50 %	25 %	0 %	25 %	114561369
3092	NC_008345	CTG	2	6	189343	189348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561369
3093	NC_008345	TATAG	2	10	189357	189366	40 %	40 %	20 %	0 %	114561369
3094	NC_008345	ATTG	2	8	189450	189457	25 %	50 %	25 %	0 %	114561369
3095	NC_008345	AT	3	6	189462	189467	50 %	50 %	0 %	0 %	114561369
3096	NC_008345	CAT	2	6	189529	189534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561369
3097	NC_008345	TGA	2	6	189575	189580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561369
3098	NC_008345	TTGC	2	8	189584	189591	0 %	50 %	25 %	25 %	114561369
3099	NC_008345	TGG	2	6	189595	189600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561369
3100	NC_008345	TCA	2	6	189722	189727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561369
3101	NC_008345	TTCT	2	8	189766	189773	0 %	75 %	0 %	25 %	114561369
3102	NC_008345	TAA	2	6	189799	189804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561369
3103	NC_008345	TTC	2	6	189883	189888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561369
3104	NC_008345	TTG	2	6	189904	189909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561369
3105	NC_008345	AATA	2	8	189961	189968	75 %	25 %	0 %	0 %	114561369
3106	NC_008345	GCTA	2	8	190458	190465	25 %	25 %	25 %	25 %	114561370
3107	NC_008345	T	8	8	190540	190547	0 %	100 %	0 %	0 %	114561370
3108	NC_008345	TC	3	6	190554	190559	0 %	50 %	0 %	50 %	114561370
3109	NC_008345	TGA	2	6	190590	190595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561370
3110	NC_008345	GCG	2	6	190657	190662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114561370
3111	NC_008345	GGT	2	6	190669	190674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561370
3112	NC_008345	ATT	3	9	190686	190694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561370
3113	NC_008345	AGA	2	6	190752	190757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561370
3114	NC_008345	GAT	2	6	190791	190796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561370
3115	NC_008345	GTT	2	6	190798	190803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561370
3116	NC_008345	TGT	2	6	190925	190930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561370
3117	NC_008345	TTTTGC	2	12	190959	190970	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	114561370
3118	NC_008345	GTC	2	6	191021	191026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561370
3119	NC_008345	TGG	2	6	191058	191063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561370
3120	NC_008345	TGG	2	6	191080	191085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561370
3121	NC_008345	TAC	2	6	191089	191094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561370
3122	NC_008345	TGG	2	6	191113	191118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561370
3123	NC_008345	CAT	2	6	191141	191146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561370
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3126	NC_008345	TGG	2	6	191367	191372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561370
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3134	NC_008345	TTG	2	6	191723	191728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561370
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3243	NC_008345	GGC	2	6	203825	203830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114561375
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3365	NC_008345	TTC	2	6	209708	209713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561378
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3367	NC_008345	TCA	2	6	209880	209885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561378
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3474	NC_008345	A	6	6	215935	215940	100 %	0 %	0 %	0 %	114561383
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3479	NC_008345	AATAA	2	10	216817	216826	80 %	20 %	0 %	0 %	114561384
3480	NC_008345	CAGT	2	8	216828	216835	25 %	25 %	25 %	25 %	114561384
3481	NC_008345	TAT	2	6	216933	216938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561384
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3483	NC_008345	CGT	2	6	217124	217129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561384
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3485	NC_008345	GAT	2	6	217276	217281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561384
3486	NC_008345	GTT	2	6	217285	217290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561384
3487	NC_008345	ACA	2	6	217331	217336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561384
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3489	NC_008345	CTA	2	6	217376	217381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561384
3490	NC_008345	TGA	2	6	217421	217426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561384
3491	NC_008345	TAG	2	6	217491	217496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561384
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