MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella frigidimarina NCIMB 400 chromosome

Total Repeats: 78560

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_008345	TAC	2	6	155734	155739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561326
2502	NC_008345	GAAA	2	8	155749	155756	75 %	0 %	25 %	0 %	114561326
2503	NC_008345	GAA	2	6	155882	155887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561326
2504	NC_008345	TTG	2	6	156204	156209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561327
2505	NC_008345	GTT	2	6	156248	156253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561327
2506	NC_008345	GCT	2	6	156302	156307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561327
2507	NC_008345	GT	3	6	156318	156323	0 %	50 %	50 %	0 %	114561327
2508	NC_008345	GTA	2	6	156332	156337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561327
2509	NC_008345	TCG	2	6	156352	156357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561327
2510	NC_008345	TGC	2	6	156442	156447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561327
2511	NC_008345	GAA	2	6	156569	156574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561327
2512	NC_008345	TGA	3	9	156588	156596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561327
2513	NC_008345	AAG	2	6	156603	156608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561327
2514	NC_008345	CTG	2	6	156612	156617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561327
2515	NC_008345	GTTC	2	8	156622	156629	0 %	50 %	25 %	25 %	114561327
2516	NC_008345	GCC	2	6	156638	156643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114561327
2517	NC_008345	CGC	2	6	156664	156669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114561327
2518	NC_008345	GCA	2	6	156764	156769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561328
2519	NC_008345	AGT	2	6	156784	156789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561328
2520	NC_008345	CTG	4	12	156828	156839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561328
2521	NC_008345	AGT	2	6	156841	156846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561328
2522	NC_008345	GGC	3	9	156851	156859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114561328
2523	NC_008345	TGC	2	6	156868	156873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561328
2524	NC_008345	GTA	2	6	156896	156901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561328
2525	NC_008345	TTA	2	6	156933	156938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561328
2526	NC_008345	AAG	2	6	156972	156977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561328
2527	NC_008345	TCT	2	6	156995	157000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561328
2528	NC_008345	AAG	2	6	157014	157019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561328
2529	NC_008345	AGA	2	6	157030	157035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561328
2530	NC_008345	TAAG	2	8	157087	157094	50 %	25 %	25 %	0 %	114561328
2531	NC_008345	AAG	2	6	157350	157355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561329
2532	NC_008345	TTAT	2	8	157403	157410	25 %	75 %	0 %	0 %	114561329
2533	NC_008345	AAG	2	6	157434	157439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561329
2534	NC_008345	CAC	2	6	157609	157614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114561329
2535	NC_008345	GTT	2	6	157637	157642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561329
2536	NC_008345	GCT	3	9	157653	157661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561329
2537	NC_008345	AAG	2	6	157687	157692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561329
2538	NC_008345	ATG	2	6	157713	157718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561329
2539	NC_008345	TAA	2	6	157721	157726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561329
2540	NC_008345	TTA	2	6	157738	157743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561329
2541	NC_008345	GT	3	6	157789	157794	0 %	50 %	50 %	0 %	114561329
2542	NC_008345	TAT	2	6	157853	157858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561329
2543	NC_008345	TTCG	2	8	157911	157918	0 %	50 %	25 %	25 %	114561329
2544	NC_008345	CGT	2	6	157926	157931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561329
2545	NC_008345	TAT	2	6	157949	157954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561329
2546	NC_008345	TTC	2	6	157998	158003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561329
2547	NC_008345	A	6	6	158025	158030	100 %	0 %	0 %	0 %	114561329
2548	NC_008345	GTG	2	6	158068	158073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561329
2549	NC_008345	CTG	2	6	158077	158082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561329
2550	NC_008345	GTC	2	6	158128	158133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561329
2551	NC_008345	A	6	6	158164	158169	100 %	0 %	0 %	0 %	114561329
2552	NC_008345	TAC	2	6	158174	158179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561329
2553	NC_008345	TTG	2	6	158206	158211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561329
2554	NC_008345	TGC	2	6	158219	158224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561329
2555	NC_008345	AGA	2	6	158288	158293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561329
2556	NC_008345	TTTA	2	8	158336	158343	25 %	75 %	0 %	0 %	114561329
2557	NC_008345	CAA	2	6	158395	158400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561329
2558	NC_008345	ATG	2	6	158436	158441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561329
2559	NC_008345	CCA	2	6	158454	158459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114561329
2560	NC_008345	TTC	2	6	158496	158501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561329
2561	NC_008345	CGT	2	6	158550	158555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561329
2562	NC_008345	GT	3	6	158584	158589	0 %	50 %	50 %	0 %	114561329
2563	NC_008345	AGA	2	6	158597	158602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561329
2564	NC_008345	GAA	2	6	158618	158623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561329
2565	NC_008345	ATC	2	6	158625	158630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561329
2566	NC_008345	ATG	2	6	158647	158652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561329
2567	NC_008345	CGA	2	6	158657	158662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561329
2568	NC_008345	CGT	2	6	158682	158687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561329
2569	NC_008345	TTAA	2	8	158805	158812	50 %	50 %	0 %	0 %	114561329
2570	NC_008345	TTC	2	6	158852	158857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561329
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2572	NC_008345	CGT	2	6	158913	158918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561329
2573	NC_008345	GGT	2	6	158937	158942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561329
2574	NC_008345	TGA	2	6	159131	159136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561329
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2578	NC_008345	GC	3	6	159266	159271	0 %	0 %	50 %	50 %	114561329
2579	NC_008345	ATT	2	6	159309	159314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561329
2580	NC_008345	GCA	2	6	159321	159326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561329
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2582	NC_008345	GCT	2	6	159480	159485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561329
2583	NC_008345	TCGTA	2	10	159521	159530	20 %	40 %	20 %	20 %	114561329
2584	NC_008345	CTAA	2	8	159588	159595	50 %	25 %	0 %	25 %	114561329
2585	NC_008345	TTG	2	6	159638	159643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561329
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2588	NC_008345	ACT	2	6	159816	159821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561329
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2591	NC_008345	ACT	2	6	160031	160036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561329
2592	NC_008345	CAT	2	6	160112	160117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561329
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2594	NC_008345	CTGT	2	8	160269	160276	0 %	50 %	25 %	25 %	114561329
2595	NC_008345	CGA	3	9	160337	160345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561329
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2597	NC_008345	CGT	2	6	160428	160433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561329
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2599	NC_008345	GTC	2	6	160534	160539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561329
2600	NC_008345	ACG	2	6	160591	160596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561329
2601	NC_008345	AAG	2	6	160597	160602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561329
2602	NC_008345	GCA	2	6	160686	160691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561329
2603	NC_008345	TAA	2	6	160706	160711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561329
2604	NC_008345	AGC	2	6	160732	160737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561329
2605	NC_008345	CAAG	2	8	160766	160773	50 %	0 %	25 %	25 %	114561329
2606	NC_008345	TGA	2	6	160787	160792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561329
2607	NC_008345	TGA	3	9	160826	160834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561329
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2609	NC_008345	AAAGAG	2	12	160902	160913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561329
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2611	NC_008345	TGA	2	6	161048	161053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561329
2612	NC_008345	ATGC	2	8	161058	161065	25 %	25 %	25 %	25 %	114561329
2613	NC_008345	CAA	2	6	161097	161102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561329
2614	NC_008345	GGT	2	6	161127	161132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561329
2615	NC_008345	TGC	2	6	161177	161182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561329
2616	NC_008345	TCG	2	6	161254	161259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561329
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2618	NC_008345	TTA	2	6	161452	161457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561330
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2620	NC_008345	AAG	2	6	161557	161562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561330
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2978	NC_008345	TGC	2	6	181880	181885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561359
2979	NC_008345	TGC	2	6	181901	181906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561359
2980	NC_008345	GTC	2	6	182047	182052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561359
2981	NC_008345	CGT	2	6	182064	182069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561359
2982	NC_008345	CAAGCT	2	12	182128	182139	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	114561360
2983	NC_008345	ACA	2	6	182224	182229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561360
2984	NC_008345	TCG	2	6	182290	182295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561360
2985	NC_008345	TAC	2	6	182330	182335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561360
2986	NC_008345	AAG	2	6	182337	182342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561360
2987	NC_008345	CGT	2	6	182407	182412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561360
2988	NC_008345	GTT	2	6	182492	182497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561360
2989	NC_008345	ATG	2	6	182526	182531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561360
2990	NC_008345	TCG	2	6	182706	182711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561360
2991	NC_008345	GTC	2	6	182896	182901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561361
2992	NC_008345	CAG	2	6	182956	182961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561361
2993	NC_008345	AAGG	2	8	182963	182970	50 %	0 %	50 %	0 %	114561361
2994	NC_008345	AAG	2	6	182976	182981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561361
2995	NC_008345	CAG	3	9	183084	183092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561361
2996	NC_008345	ATG	2	6	183102	183107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561361
2997	NC_008345	CGTGGT	2	12	183191	183202	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	114561361
2998	NC_008345	GAT	2	6	183239	183244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561361
2999	NC_008345	CTT	2	6	183273	183278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561361
3000	NC_008345	AGC	2	6	183313	183318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561361

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