MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella frigidimarina NCIMB 400 chromosome

Total Repeats: 78560

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_008345	ATTA	2	8	120071	120078	50 %	50 %	0 %	0 %	114561293
2003	NC_008345	GAA	2	6	120081	120086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561293
2004	NC_008345	TCT	3	9	120153	120161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561293
2005	NC_008345	TTA	2	6	120193	120198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561293
2006	NC_008345	CCA	2	6	120202	120207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114561293
2007	NC_008345	ATT	2	6	120256	120261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561293
2008	NC_008345	AAC	2	6	120280	120285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561293
2009	NC_008345	TTAAT	2	10	120298	120307	40 %	60 %	0 %	0 %	114561293
2010	NC_008345	GAA	2	6	120333	120338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561293
2011	NC_008345	TGA	2	6	120500	120505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561294
2012	NC_008345	GTT	2	6	120547	120552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561294
2013	NC_008345	TGA	2	6	120558	120563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561294
2014	NC_008345	CGA	2	6	120575	120580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561294
2015	NC_008345	GAAA	2	8	120633	120640	75 %	0 %	25 %	0 %	114561294
2016	NC_008345	AC	3	6	120671	120676	50 %	0 %	0 %	50 %	114561294
2017	NC_008345	TTAA	2	8	120727	120734	50 %	50 %	0 %	0 %	114561294
2018	NC_008345	AGA	2	6	120867	120872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561294
2019	NC_008345	CTTG	2	8	120873	120880	0 %	50 %	25 %	25 %	114561294
2020	NC_008345	CGA	2	6	120885	120890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561294
2021	NC_008345	ATT	2	6	120901	120906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561294
2022	NC_008345	ATTA	2	8	120909	120916	50 %	50 %	0 %	0 %	114561294
2023	NC_008345	AGA	2	6	120942	120947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561294
2024	NC_008345	GTT	2	6	120988	120993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561294
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2029	NC_008345	AAAT	2	8	121373	121380	75 %	25 %	0 %	0 %	114561294
2030	NC_008345	TCA	2	6	121675	121680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561294
2031	NC_008345	AAG	2	6	121736	121741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561294
2032	NC_008345	TGA	2	6	121752	121757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561294
2033	NC_008345	TGA	2	6	121884	121889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561294
2034	NC_008345	GGC	2	6	121912	121917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114561294
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2038	NC_008345	GCAA	2	8	122087	122094	50 %	0 %	25 %	25 %	114561295
2039	NC_008345	CG	3	6	122121	122126	0 %	0 %	50 %	50 %	114561295
2040	NC_008345	AAG	2	6	122133	122138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561295
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2048	NC_008345	AGT	2	6	122502	122507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561295
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2050	NC_008345	GCT	2	6	122629	122634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561295
2051	NC_008345	GTG	2	6	122635	122640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561295
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2055	NC_008345	TGC	2	6	122760	122765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561295
2056	NC_008345	GCT	2	6	122784	122789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561295
2057	NC_008345	CAGC	2	8	122906	122913	25 %	0 %	25 %	50 %	114561295
2058	NC_008345	GC	3	6	122973	122978	0 %	0 %	50 %	50 %	114561295
2059	NC_008345	TGA	2	6	122985	122990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561295
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2062	NC_008345	GCA	2	6	123124	123129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561295
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2109	NC_008345	CCA	2	6	125581	125586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114561300
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2117	NC_008345	TGA	2	6	125927	125932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561300
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2119	NC_008345	TATG	2	8	126132	126139	25 %	50 %	25 %	0 %	114561300
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2121	NC_008345	GCT	2	6	126198	126203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561300
2122	NC_008345	GCA	2	6	126210	126215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561300
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2124	NC_008345	TCAG	2	8	126234	126241	25 %	25 %	25 %	25 %	114561300
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2237	NC_008345	CAA	2	6	133161	133166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561308
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2240	NC_008345	GCCA	2	8	133408	133415	25 %	0 %	25 %	50 %	114561308
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2242	NC_008345	ACT	2	6	133457	133462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561308
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2480	NC_008345	A	7	7	154547	154553	100 %	0 %	0 %	0 %	114561324
2481	NC_008345	TGA	2	6	154571	154576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561324
2482	NC_008345	A	6	6	154622	154627	100 %	0 %	0 %	0 %	114561324
2483	NC_008345	AGC	2	6	154800	154805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561325
2484	NC_008345	CCA	2	6	154825	154830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114561325
2485	NC_008345	CAT	2	6	154863	154868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561325
2486	NC_008345	TGT	2	6	154929	154934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561325
2487	NC_008345	TA	3	6	154943	154948	50 %	50 %	0 %	0 %	114561325
2488	NC_008345	GCT	2	6	155101	155106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561325
2489	NC_008345	GTA	2	6	155176	155181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561325
2490	NC_008345	CTAA	2	8	155204	155211	50 %	25 %	0 %	25 %	114561326
2491	NC_008345	CAA	2	6	155244	155249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561326
2492	NC_008345	GTA	2	6	155273	155278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561326
2493	NC_008345	TTG	2	6	155307	155312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561326
2494	NC_008345	CGTG	2	8	155368	155375	0 %	25 %	50 %	25 %	114561326
2495	NC_008345	CA	3	6	155428	155433	50 %	0 %	0 %	50 %	114561326
2496	NC_008345	GCT	2	6	155450	155455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561326
2497	NC_008345	GCT	2	6	155459	155464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561326
2498	NC_008345	GTT	2	6	155531	155536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561326
2499	NC_008345	GTT	2	6	155561	155566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561326
2500	NC_008345	TAT	2	6	155701	155706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561326

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