MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella frigidimarina NCIMB 400 chromosome

Total Repeats: 78560

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_008345	A	6	6	90426	90431	100 %	0 %	0 %	0 %	114561264
1502	NC_008345	AAG	2	6	90449	90454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561264
1503	NC_008345	AGCC	2	8	90483	90490	25 %	0 %	25 %	50 %	114561264
1504	NC_008345	TAG	2	6	90515	90520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561264
1505	NC_008345	CAA	2	6	90601	90606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561264
1506	NC_008345	GGC	2	6	90624	90629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114561264
1507	NC_008345	ATC	2	6	90646	90651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561264
1508	NC_008345	ATT	2	6	90694	90699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561264
1509	NC_008345	TGA	2	6	90758	90763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561264
1510	NC_008345	CCA	2	6	90768	90773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114561264
1511	NC_008345	ATG	2	6	90902	90907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561264
1512	NC_008345	TGA	2	6	90915	90920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561264
1513	NC_008345	ATG	2	6	90935	90940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561264
1514	NC_008345	T	6	6	90972	90977	0 %	100 %	0 %	0 %	114561264
1515	NC_008345	A	6	6	91012	91017	100 %	0 %	0 %	0 %	114561264
1516	NC_008345	CAA	2	6	91021	91026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561264
1517	NC_008345	A	6	6	91063	91068	100 %	0 %	0 %	0 %	114561264
1518	NC_008345	AAG	2	6	91079	91084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561264
1519	NC_008345	TTA	2	6	91102	91107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561264
1520	NC_008345	GTT	2	6	91176	91181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561264
1521	NC_008345	GTT	2	6	91278	91283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561264
1522	NC_008345	GAT	2	6	91284	91289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561264
1523	NC_008345	GC	3	6	91320	91325	0 %	0 %	50 %	50 %	114561264
1524	NC_008345	TTGC	2	8	91466	91473	0 %	50 %	25 %	25 %	114561265
1525	NC_008345	GGT	2	6	91523	91528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561265
1526	NC_008345	TGG	2	6	91546	91551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561265
1527	NC_008345	GGC	3	9	91565	91573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114561265
1528	NC_008345	TTG	2	6	91710	91715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561265
1529	NC_008345	TGA	2	6	91740	91745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561265
1530	NC_008345	GAAC	2	8	91757	91764	50 %	0 %	25 %	25 %	114561265
1531	NC_008345	ATT	2	6	91766	91771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561265
1532	NC_008345	CAC	2	6	91803	91808	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114561265
1533	NC_008345	GCT	2	6	92087	92092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561265
1534	NC_008345	AAC	2	6	92097	92102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561265
1535	NC_008345	TAC	2	6	92134	92139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561265
1536	NC_008345	GCA	2	6	92159	92164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561265
1537	NC_008345	GATGC	2	10	92204	92213	20 %	20 %	40 %	20 %	114561265
1538	NC_008345	CAT	2	6	92232	92237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561265
1539	NC_008345	CAA	2	6	92247	92252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561265
1540	NC_008345	CGG	2	6	92754	92759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114561266
1541	NC_008345	CAT	2	6	92776	92781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561266
1542	NC_008345	CGC	2	6	92809	92814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114561266
1543	NC_008345	GGTT	2	8	93028	93035	0 %	50 %	50 %	0 %	114561266
1544	NC_008345	AG	3	6	93090	93095	50 %	0 %	50 %	0 %	114561266
1545	NC_008345	ATTT	2	8	93130	93137	25 %	75 %	0 %	0 %	114561266
1546	NC_008345	T	6	6	93135	93140	0 %	100 %	0 %	0 %	114561266
1547	NC_008345	AGA	2	6	93243	93248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561266
1548	NC_008345	GAC	2	6	93354	93359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561267
1549	NC_008345	AGCA	2	8	93363	93370	50 %	0 %	25 %	25 %	114561267
1550	NC_008345	GCC	2	6	93399	93404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114561267
1551	NC_008345	TGA	2	6	93473	93478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561267
1552	NC_008345	CAAT	2	8	93491	93498	50 %	25 %	0 %	25 %	114561267
1553	NC_008345	AT	3	6	93537	93542	50 %	50 %	0 %	0 %	114561267
1554	NC_008345	ATT	2	6	93615	93620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561267
1555	NC_008345	TAT	2	6	93626	93631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561267
1556	NC_008345	TTA	2	6	93688	93693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561267
1557	NC_008345	CTG	2	6	93884	93889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561268
1558	NC_008345	GCA	2	6	93964	93969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561268
1559	NC_008345	GCTT	2	8	94032	94039	0 %	50 %	25 %	25 %	114561268
1560	NC_008345	ATCA	2	8	94125	94132	50 %	25 %	0 %	25 %	114561268
1561	NC_008345	CGC	2	6	94155	94160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114561268
1562	NC_008345	AGC	2	6	94230	94235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561268
1563	NC_008345	GTTT	2	8	94263	94270	0 %	75 %	25 %	0 %	114561268
1564	NC_008345	TGAT	2	8	94375	94382	25 %	50 %	25 %	0 %	114561268
1565	NC_008345	GCT	2	6	94453	94458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561268
1566	NC_008345	AAC	2	6	94515	94520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561268
1567	NC_008345	ATG	2	6	94522	94527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561268
1568	NC_008345	GATTG	2	10	94565	94574	20 %	40 %	40 %	0 %	114561268
1569	NC_008345	GCT	2	6	94604	94609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561268
1570	NC_008345	TGA	2	6	94652	94657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561268
1571	NC_008345	CGAG	2	8	94672	94679	25 %	0 %	50 %	25 %	114561268
1572	NC_008345	TCA	2	6	94693	94698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561268
1573	NC_008345	TCACCT	2	12	94726	94737	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	114561268
1574	NC_008345	AAT	2	6	94753	94758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561268
1575	NC_008345	GAC	2	6	94778	94783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561268
1576	NC_008345	AATA	2	8	94815	94822	75 %	25 %	0 %	0 %	114561268
1577	NC_008345	CCG	2	6	94823	94828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114561268
1578	NC_008345	TTTA	2	8	94998	95005	25 %	75 %	0 %	0 %	114561268
1579	NC_008345	ATC	2	6	95160	95165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561268
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1581	NC_008345	CAA	2	6	95259	95264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561268
1582	NC_008345	T	6	6	95271	95276	0 %	100 %	0 %	0 %	114561268
1583	NC_008345	A	6	6	95292	95297	100 %	0 %	0 %	0 %	114561268
1584	NC_008345	A	6	6	95329	95334	100 %	0 %	0 %	0 %	114561268
1585	NC_008345	TAG	2	6	95347	95352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561268
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1588	NC_008345	CAA	2	6	95594	95599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561268
1589	NC_008345	TAA	2	6	95622	95627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561268
1590	NC_008345	TCG	2	6	95639	95644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561268
1591	NC_008345	T	6	6	95678	95683	0 %	100 %	0 %	0 %	114561268
1592	NC_008345	CGC	3	9	95947	95955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114561269
1593	NC_008345	AATG	2	8	96013	96020	50 %	25 %	25 %	0 %	114561269
1594	NC_008345	T	6	6	96044	96049	0 %	100 %	0 %	0 %	114561269
1595	NC_008345	CTT	2	6	96058	96063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561269
1596	NC_008345	TCA	2	6	96108	96113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561269
1597	NC_008345	TCT	2	6	96177	96182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561269
1598	NC_008345	CGA	2	6	96209	96214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561269
1599	NC_008345	TCGC	2	8	96270	96277	0 %	25 %	25 %	50 %	114561269
1600	NC_008345	GTG	2	6	96303	96308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561269
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1604	NC_008345	AAT	2	6	96602	96607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561269
1605	NC_008345	ACC	2	6	96647	96652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114561269
1606	NC_008345	TCA	2	6	96741	96746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561269
1607	NC_008345	TGAGG	2	10	96754	96763	20 %	20 %	60 %	0 %	114561269
1608	NC_008345	CCA	3	9	96831	96839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114561269
1609	NC_008345	ACC	2	6	96863	96868	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114561269
1610	NC_008345	TGT	2	6	96894	96899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561269
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1612	NC_008345	TGT	2	6	96942	96947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561269
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1616	NC_008345	CAT	2	6	97243	97248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561269
1617	NC_008345	AAT	2	6	97374	97379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561269
1618	NC_008345	CA	3	6	97451	97456	50 %	0 %	0 %	50 %	114561269
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1620	NC_008345	TCT	2	6	97573	97578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561269
1621	NC_008345	ACCT	2	8	98049	98056	25 %	25 %	0 %	50 %	114561270
1622	NC_008345	CA	3	6	98109	98114	50 %	0 %	0 %	50 %	114561270
1623	NC_008345	TGG	2	6	98130	98135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561270
1624	NC_008345	ACC	2	6	98215	98220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114561270
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1626	NC_008345	AAAT	2	8	98334	98341	75 %	25 %	0 %	0 %	114561270
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1991	NC_008345	GT	3	6	119548	119553	0 %	50 %	50 %	0 %	114561293
1992	NC_008345	ACAGTA	2	12	119580	119591	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	114561293
1993	NC_008345	GGC	2	6	119604	119609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114561293
1994	NC_008345	CTA	2	6	119611	119616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561293
1995	NC_008345	CCA	3	9	119617	119625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114561293
1996	NC_008345	GCG	2	6	119715	119720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114561293
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1998	NC_008345	TGA	2	6	119816	119821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561293
1999	NC_008345	ATT	2	6	119829	119834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561293
2000	NC_008345	AAG	2	6	119962	119967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561293

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