MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella frigidimarina NCIMB 400 chromosome

Total Repeats: 78560

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_008345	ATG	2	6	60246	60251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561235
1002	NC_008345	CAG	2	6	60289	60294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561235
1003	NC_008345	TTTTA	2	10	60410	60419	20 %	80 %	0 %	0 %	114561235
1004	NC_008345	AAT	2	6	60452	60457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561235
1005	NC_008345	TTA	2	6	60463	60468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561235
1006	NC_008345	TGG	2	6	60469	60474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561235
1007	NC_008345	AAG	2	6	60519	60524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561235
1008	NC_008345	ATG	2	6	60615	60620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561235
1009	NC_008345	TAT	2	6	60631	60636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561235
1010	NC_008345	TTCA	2	8	60654	60661	25 %	50 %	0 %	25 %	114561235
1011	NC_008345	GAA	2	6	60671	60676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561235
1012	NC_008345	TGG	3	9	60679	60687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561235
1013	NC_008345	GTTAT	2	10	60747	60756	20 %	60 %	20 %	0 %	114561235
1014	NC_008345	TGC	2	6	60805	60810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561235
1015	NC_008345	ACT	2	6	60869	60874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561235
1016	NC_008345	GTG	2	6	60879	60884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561235
1017	NC_008345	GTA	2	6	60936	60941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561235
1018	NC_008345	TCTT	2	8	60983	60990	0 %	75 %	0 %	25 %	114561235
1019	NC_008345	AGC	2	6	61023	61028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561235
1020	NC_008345	AT	3	6	61029	61034	50 %	50 %	0 %	0 %	114561235
1021	NC_008345	CTAT	2	8	61109	61116	25 %	50 %	0 %	25 %	114561235
1022	NC_008345	TAT	2	6	61172	61177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561235
1023	NC_008345	TCAGG	2	10	61178	61187	20 %	20 %	40 %	20 %	114561235
1024	NC_008345	AAT	2	6	61199	61204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561235
1025	NC_008345	AGA	2	6	61276	61281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561235
1026	NC_008345	GATTAT	2	12	61283	61294	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	114561235
1027	NC_008345	GTTG	2	8	61303	61310	0 %	50 %	50 %	0 %	114561235
1028	NC_008345	TTTGA	2	10	61442	61451	20 %	60 %	20 %	0 %	114561235
1029	NC_008345	TATGG	2	10	61517	61526	20 %	40 %	40 %	0 %	114561235
1030	NC_008345	TGA	2	6	61531	61536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561235
1031	NC_008345	TAAC	2	8	61545	61552	50 %	25 %	0 %	25 %	114561235
1032	NC_008345	GCG	2	6	61590	61595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114561235
1033	NC_008345	CCA	2	6	61675	61680	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114561235
1034	NC_008345	GCTGG	2	10	61691	61700	0 %	20 %	60 %	20 %	114561235
1035	NC_008345	ATC	2	6	61773	61778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561235
1036	NC_008345	GCA	2	6	61859	61864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561235
1037	NC_008345	TACA	2	8	61885	61892	50 %	25 %	0 %	25 %	114561235
1038	NC_008345	GTG	2	6	61893	61898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561235
1039	NC_008345	TGA	2	6	61927	61932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561235
1040	NC_008345	GC	3	6	61947	61952	0 %	0 %	50 %	50 %	114561235
1041	NC_008345	AGCA	2	8	62013	62020	50 %	0 %	25 %	25 %	114561235
1042	NC_008345	ACAG	2	8	62021	62028	50 %	0 %	25 %	25 %	114561235
1043	NC_008345	CAG	2	6	62062	62067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561235
1044	NC_008345	ACC	2	6	62074	62079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114561235
1045	NC_008345	GGC	2	6	62150	62155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114561235
1046	NC_008345	AAT	2	6	62189	62194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561235
1047	NC_008345	CCA	2	6	62196	62201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114561235
1048	NC_008345	AGT	2	6	62302	62307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561235
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1051	NC_008345	TAACT	2	10	62353	62362	40 %	40 %	0 %	20 %	114561235
1052	NC_008345	ACC	2	6	62501	62506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114561235
1053	NC_008345	ACCA	2	8	62578	62585	50 %	0 %	0 %	50 %	114561235
1054	NC_008345	ACAG	2	8	62588	62595	50 %	0 %	25 %	25 %	114561235
1055	NC_008345	GTA	2	6	62598	62603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561235
1056	NC_008345	GCG	2	6	62604	62609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114561235
1057	NC_008345	GCA	2	6	62793	62798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561236
1058	NC_008345	ACT	2	6	62867	62872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561236
1059	NC_008345	TGG	2	6	62893	62898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561236
1060	NC_008345	CTA	2	6	62967	62972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561236
1061	NC_008345	ATC	2	6	63041	63046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561236
1062	NC_008345	AAT	2	6	63135	63140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561236
1063	NC_008345	GT	3	6	63239	63244	0 %	50 %	50 %	0 %	114561236
1064	NC_008345	GAA	2	6	63508	63513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561237
1065	NC_008345	GTTA	2	8	63526	63533	25 %	50 %	25 %	0 %	114561237
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1067	NC_008345	TGC	2	6	63562	63567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561237
1068	NC_008345	TTA	2	6	63595	63600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561237
1069	NC_008345	TAAC	2	8	63621	63628	50 %	25 %	0 %	25 %	114561237
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1076	NC_008345	TAG	2	6	63945	63950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561238
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1080	NC_008345	TTA	2	6	64288	64293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561238
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1088	NC_008345	T	6	6	64941	64946	0 %	100 %	0 %	0 %	114561238
1089	NC_008345	CAA	2	6	64963	64968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561238
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1095	NC_008345	T	6	6	65483	65488	0 %	100 %	0 %	0 %	114561239
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1098	NC_008345	T	6	6	65605	65610	0 %	100 %	0 %	0 %	114561239
1099	NC_008345	AGTG	2	8	65622	65629	25 %	25 %	50 %	0 %	114561239
1100	NC_008345	CGA	2	6	65720	65725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561239
1101	NC_008345	ATTGC	2	10	65797	65806	20 %	40 %	20 %	20 %	114561239
1102	NC_008345	AC	3	6	66192	66197	50 %	0 %	0 %	50 %	114561240
1103	NC_008345	TG	3	6	66405	66410	0 %	50 %	50 %	0 %	114561240
1104	NC_008345	CGA	2	6	66411	66416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561240
1105	NC_008345	ATTG	2	8	66417	66424	25 %	50 %	25 %	0 %	114561240
1106	NC_008345	GAT	2	6	66444	66449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561240
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1109	NC_008345	TCT	2	6	66671	66676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561241
1110	NC_008345	AAG	2	6	66724	66729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561241
1111	NC_008345	GCA	2	6	66737	66742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561241
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1113	NC_008345	GGC	2	6	66867	66872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114561241
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1116	NC_008345	AAAAG	2	10	67067	67076	80 %	0 %	20 %	0 %	114561241
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1121	NC_008345	ATG	2	6	67258	67263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561241
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1500	NC_008345	ACT	2	6	90382	90387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561264

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