MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella frigidimarina NCIMB 400 chromosome

Total Repeats: 78560

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008345	GAC	2	6	26580	26585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561209
502	NC_008345	CGA	2	6	26592	26597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561209
503	NC_008345	TCA	2	6	26606	26611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561209
504	NC_008345	AAT	2	6	26620	26625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561209
505	NC_008345	CG	3	6	26634	26639	0 %	0 %	50 %	50 %	114561209
506	NC_008345	GGCC	2	8	26648	26655	0 %	0 %	50 %	50 %	114561209
507	NC_008345	GCC	2	6	26737	26742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114561209
508	NC_008345	ATA	2	6	26743	26748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561209
509	NC_008345	CAA	2	6	26760	26765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561209
510	NC_008345	CTA	2	6	26817	26822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561209
511	NC_008345	TGTA	2	8	26828	26835	25 %	50 %	25 %	0 %	114561209
512	NC_008345	TCA	2	6	26867	26872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561209
513	NC_008345	ATA	2	6	26873	26878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561209
514	NC_008345	TCT	2	6	27068	27073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561209
515	NC_008345	CTT	2	6	27081	27086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561209
516	NC_008345	ACA	3	9	27116	27124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561209
517	NC_008345	CTTGT	2	10	27136	27145	0 %	60 %	20 %	20 %	114561209
518	NC_008345	CGA	2	6	27174	27179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561209
519	NC_008345	GCC	2	6	27223	27228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114561209
520	NC_008345	ATA	2	6	27248	27253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561209
521	NC_008345	GC	3	6	27296	27301	0 %	0 %	50 %	50 %	114561210
522	NC_008345	TAA	2	6	27303	27308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561210
523	NC_008345	TTGTC	2	10	27321	27330	0 %	60 %	20 %	20 %	114561210
524	NC_008345	TTG	2	6	27368	27373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561210
525	NC_008345	TTG	2	6	27425	27430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561210
526	NC_008345	ATA	2	6	27466	27471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561210
527	NC_008345	CAA	2	6	27498	27503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561210
528	NC_008345	CAAG	2	8	27616	27623	50 %	0 %	25 %	25 %	114561210
529	NC_008345	TTG	2	6	27635	27640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561210
530	NC_008345	CCA	2	6	27647	27652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114561210
531	NC_008345	TGT	2	6	27717	27722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561210
532	NC_008345	CCA	2	6	27804	27809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114561210
533	NC_008345	GGCGC	2	10	27810	27819	0 %	0 %	60 %	40 %	114561210
534	NC_008345	CTG	2	6	27841	27846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561210
535	NC_008345	TGC	2	6	27896	27901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561210
536	NC_008345	ATT	2	6	28040	28045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561210
537	NC_008345	TGG	2	6	28068	28073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561210
538	NC_008345	AAT	2	6	28082	28087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561210
539	NC_008345	TTG	2	6	28112	28117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561210
540	NC_008345	TAA	2	6	28126	28131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561210
541	NC_008345	AGCGT	2	10	28150	28159	20 %	20 %	40 %	20 %	114561210
542	NC_008345	CGC	2	6	28277	28282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114561210
543	NC_008345	GTAAA	2	10	28299	28308	60 %	20 %	20 %	0 %	114561210
544	NC_008345	AAC	2	6	28315	28320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561210
545	NC_008345	CTA	2	6	28321	28326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561210
546	NC_008345	CAG	2	6	28328	28333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561210
547	NC_008345	AC	3	6	28386	28391	50 %	0 %	0 %	50 %	114561210
548	NC_008345	TAA	2	6	28439	28444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561210
549	NC_008345	GCT	2	6	28539	28544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561210
550	NC_008345	AC	4	8	28584	28591	50 %	0 %	0 %	50 %	114561211
551	NC_008345	CAC	2	6	28607	28612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114561211
552	NC_008345	TTG	2	6	28648	28653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561211
553	NC_008345	CTTG	2	8	28709	28716	0 %	50 %	25 %	25 %	114561211
554	NC_008345	AAT	2	6	28725	28730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561211
555	NC_008345	TTG	2	6	28794	28799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561211
556	NC_008345	CTT	3	9	28886	28894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561211
557	NC_008345	AGC	2	6	29065	29070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561211
558	NC_008345	CAA	2	6	29258	29263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561211
559	NC_008345	ATA	2	6	29266	29271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561211
560	NC_008345	AGC	2	6	29283	29288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561211
561	NC_008345	ATG	2	6	29318	29323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561211
562	NC_008345	CAG	2	6	29399	29404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561211
563	NC_008345	CTT	2	6	29554	29559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561212
564	NC_008345	ATAA	2	8	29599	29606	75 %	25 %	0 %	0 %	114561212
565	NC_008345	AAC	2	6	29661	29666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561212
566	NC_008345	CTT	2	6	29773	29778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561212
567	NC_008345	CAC	2	6	29791	29796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114561212
568	NC_008345	TAA	2	6	29818	29823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561212
569	NC_008345	CAAT	2	8	29863	29870	50 %	25 %	0 %	25 %	114561212
570	NC_008345	TGA	2	6	29874	29879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561212
571	NC_008345	AGC	2	6	29894	29899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561212
572	NC_008345	AT	3	6	30039	30044	50 %	50 %	0 %	0 %	114561212
573	NC_008345	ACA	2	6	30162	30167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561213
574	NC_008345	T	6	6	30202	30207	0 %	100 %	0 %	0 %	114561213
575	NC_008345	T	6	6	30316	30321	0 %	100 %	0 %	0 %	114561213
576	NC_008345	ATTTA	2	10	30381	30390	40 %	60 %	0 %	0 %	114561213
577	NC_008345	GTT	2	6	30440	30445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561213
578	NC_008345	AGC	2	6	30447	30452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561213
579	NC_008345	TCC	2	6	30502	30507	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114561213
580	NC_008345	TTAA	2	8	30521	30528	50 %	50 %	0 %	0 %	114561213
581	NC_008345	GTG	2	6	30594	30599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561213
582	NC_008345	TCA	2	6	30613	30618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561213
583	NC_008345	T	6	6	30698	30703	0 %	100 %	0 %	0 %	114561213
584	NC_008345	ATT	2	6	30721	30726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561213
585	NC_008345	AT	3	6	30777	30782	50 %	50 %	0 %	0 %	114561213
586	NC_008345	AGA	2	6	30844	30849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561213
587	NC_008345	TTATT	2	10	30868	30877	20 %	80 %	0 %	0 %	114561213
588	NC_008345	TAT	2	6	30910	30915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561213
589	NC_008345	GTG	2	6	30972	30977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561213
590	NC_008345	T	6	6	31005	31010	0 %	100 %	0 %	0 %	114561213
591	NC_008345	ATT	3	9	31034	31042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561213
592	NC_008345	ATG	2	6	31047	31052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561213
593	NC_008345	AGA	2	6	31111	31116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561213
594	NC_008345	AAT	2	6	31269	31274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561213
595	NC_008345	GCCTT	2	10	31402	31411	0 %	40 %	20 %	40 %	114561214
596	NC_008345	TAA	2	6	31449	31454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561214
597	NC_008345	CT	3	6	31510	31515	0 %	50 %	0 %	50 %	114561214
598	NC_008345	TAT	2	6	31565	31570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561214
599	NC_008345	TTA	2	6	31571	31576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561214
600	NC_008345	TTA	2	6	31597	31602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561214
601	NC_008345	TTG	2	6	31616	31621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561214
602	NC_008345	GGC	2	6	31642	31647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114561214
603	NC_008345	GCA	2	6	31657	31662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561214
604	NC_008345	TCA	2	6	31815	31820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561214
605	NC_008345	ATT	2	6	31837	31842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561214
606	NC_008345	GTA	2	6	31948	31953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561214
607	NC_008345	AAGC	2	8	31955	31962	50 %	0 %	25 %	25 %	114561214
608	NC_008345	AGG	2	6	32043	32048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114561214
609	NC_008345	TTAA	2	8	32071	32078	50 %	50 %	0 %	0 %	114561214
610	NC_008345	CTG	2	6	32102	32107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561214
611	NC_008345	ATA	2	6	32113	32118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561214
612	NC_008345	GAA	2	6	32119	32124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561214
613	NC_008345	ATG	2	6	32186	32191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561214
614	NC_008345	TCC	2	6	32208	32213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114561214
615	NC_008345	CTTGAA	2	12	32305	32316	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	114561214
616	NC_008345	GGGT	2	8	32323	32330	0 %	25 %	75 %	0 %	114561214
617	NC_008345	GGT	2	6	32344	32349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561214
618	NC_008345	TATT	2	8	32394	32401	25 %	75 %	0 %	0 %	114561215
619	NC_008345	ATT	2	6	32429	32434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561215
620	NC_008345	TGA	2	6	32438	32443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561215
621	NC_008345	TCA	2	6	32480	32485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561215
622	NC_008345	AG	3	6	32537	32542	50 %	0 %	50 %	0 %	114561215
623	NC_008345	CATT	2	8	32574	32581	25 %	50 %	0 %	25 %	114561215
624	NC_008345	T	6	6	32633	32638	0 %	100 %	0 %	0 %	114561215
625	NC_008345	T	7	7	32641	32647	0 %	100 %	0 %	0 %	114561215
626	NC_008345	AGA	2	6	32732	32737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561215
627	NC_008345	GGT	2	6	32747	32752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561215
628	NC_008345	AGC	2	6	32821	32826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561215
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879	NC_008345	GATA	2	8	53364	53371	50 %	25 %	25 %	0 %	114561229
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882	NC_008345	AGA	2	6	53481	53486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561229
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