MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella frigidimarina NCIMB 400 chromosome

Total Repeats: 78560

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_008345	ACATTG	2	12	367116	367127	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	114561527
6002	NC_008345	GCC	2	6	367131	367136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114561527
6003	NC_008345	TGA	2	6	367149	367154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561527
6004	NC_008345	A	6	6	367278	367283	100 %	0 %	0 %	0 %	114561527
6005	NC_008345	ATC	2	6	367295	367300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561527
6006	NC_008345	TGC	2	6	367331	367336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561527
6007	NC_008345	A	6	6	367574	367579	100 %	0 %	0 %	0 %	114561528
6008	NC_008345	GCC	2	6	367596	367601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114561528
6009	NC_008345	ATA	2	6	367621	367626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561528
6010	NC_008345	ATT	2	6	367650	367655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561528
6011	NC_008345	TGC	2	6	367696	367701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561528
6012	NC_008345	TAA	3	9	367749	367757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561528
6013	NC_008345	GCA	2	6	367786	367791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561528
6014	NC_008345	CAT	2	6	367880	367885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561528
6015	NC_008345	TTTG	2	8	367925	367932	0 %	75 %	25 %	0 %	114561528
6016	NC_008345	TTG	2	6	367959	367964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561528
6017	NC_008345	GGC	2	6	367968	367973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114561528
6018	NC_008345	GTG	2	6	367997	368002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561528
6019	NC_008345	ACC	2	6	368202	368207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114561528
6020	NC_008345	AAT	2	6	368320	368325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561528
6021	NC_008345	AAT	2	6	368333	368338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561528
6022	NC_008345	CTG	2	6	368358	368363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561528
6023	NC_008345	AAT	2	6	368366	368371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561528
6024	NC_008345	G	6	6	368380	368385	0 %	0 %	100 %	0 %	114561528
6025	NC_008345	GGC	2	6	368523	368528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114561528
6026	NC_008345	TAA	2	6	368535	368540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561528
6027	NC_008345	ATT	2	6	368544	368549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561528
6028	NC_008345	GCAA	2	8	368553	368560	50 %	0 %	25 %	25 %	114561528
6029	NC_008345	GCA	2	6	368687	368692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561528
6030	NC_008345	TTAG	2	8	368834	368841	25 %	50 %	25 %	0 %	114561529
6031	NC_008345	CGG	2	6	368870	368875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114561529
6032	NC_008345	CGTTAT	2	12	368925	368936	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	114561529
6033	NC_008345	CCG	2	6	369004	369009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114561529
6034	NC_008345	ATT	2	6	369055	369060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561529
6035	NC_008345	TAA	2	6	369093	369098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561529
6036	NC_008345	AAT	2	6	369145	369150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561529
6037	NC_008345	TGT	2	6	369187	369192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561529
6038	NC_008345	TAA	2	6	369213	369218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561529
6039	NC_008345	TGC	2	6	369274	369279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561529
6040	NC_008345	GTT	2	6	369286	369291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561529
6041	NC_008345	TTG	2	6	369363	369368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561529
6042	NC_008345	CCA	2	6	369404	369409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114561529
6043	NC_008345	CAG	2	6	369441	369446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561529
6044	NC_008345	CAA	2	6	369483	369488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561530
6045	NC_008345	CGT	2	6	369500	369505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561530
6046	NC_008345	TTG	2	6	369581	369586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561530
6047	NC_008345	CGTC	2	8	369620	369627	0 %	25 %	25 %	50 %	114561530
6048	NC_008345	TGA	2	6	369778	369783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561530
6049	NC_008345	GGT	2	6	369844	369849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561530
6050	NC_008345	CTT	2	6	369913	369918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561530
6051	NC_008345	ATTA	2	8	369934	369941	50 %	50 %	0 %	0 %	114561530
6052	NC_008345	TTG	2	6	369952	369957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561530
6053	NC_008345	CCA	2	6	369999	370004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114561530
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6055	NC_008345	TTA	2	6	370088	370093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561530
6056	NC_008345	TGT	2	6	370116	370121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561530
6057	NC_008345	GTT	2	6	370167	370172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561530
6058	NC_008345	AATC	2	8	370293	370300	50 %	25 %	0 %	25 %	114561530
6059	NC_008345	TGA	2	6	370310	370315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561530
6060	NC_008345	GGT	2	6	370435	370440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561530
6061	NC_008345	TGC	2	6	370462	370467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561530
6062	NC_008345	ACA	2	6	370537	370542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561530
6063	NC_008345	GTA	2	6	370545	370550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561530
6064	NC_008345	AAC	3	9	370594	370602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561530
6065	NC_008345	TGA	2	6	370604	370609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561530
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6068	NC_008345	CAACGT	2	12	370668	370679	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	114561530
6069	NC_008345	TAA	2	6	370732	370737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561531
6070	NC_008345	AAG	2	6	370781	370786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561531
6071	NC_008345	A	6	6	370796	370801	100 %	0 %	0 %	0 %	114561531
6072	NC_008345	CAT	2	6	370877	370882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561531
6073	NC_008345	A	6	6	370913	370918	100 %	0 %	0 %	0 %	114561531
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6077	NC_008345	TCAG	2	8	371211	371218	25 %	25 %	25 %	25 %	114561531
6078	NC_008345	AG	3	6	371229	371234	50 %	0 %	50 %	0 %	114561531
6079	NC_008345	TGT	2	6	371291	371296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561531
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6091	NC_008345	TTG	2	6	371972	371977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561531
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6105	NC_008345	CGC	2	6	372787	372792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114561531
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6107	NC_008345	ATT	2	6	372875	372880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561531
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6115	NC_008345	TAA	2	6	373438	373443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561532
6116	NC_008345	TTG	2	6	373516	373521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561532
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6118	NC_008345	GCT	3	9	373566	373574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561532
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6120	NC_008345	GCTG	2	8	373726	373733	0 %	25 %	50 %	25 %	114561532
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6230	NC_008345	T	6	6	379159	379164	0 %	100 %	0 %	0 %	114561537
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6233	NC_008345	AAAT	2	8	379315	379322	75 %	25 %	0 %	0 %	114561537
6234	NC_008345	AGC	2	6	379340	379345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561537
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6238	NC_008345	ATG	2	6	379426	379431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561537
6239	NC_008345	GCT	2	6	379446	379451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561537
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6483	NC_008345	TGT	2	6	393438	393443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561551
6484	NC_008345	TGA	2	6	393462	393467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561551
6485	NC_008345	CAT	3	9	393496	393504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561551
6486	NC_008345	CTT	2	6	393528	393533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561551
6487	NC_008345	CCA	2	6	393576	393581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114561551
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6489	NC_008345	CAG	2	6	393925	393930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561552
6490	NC_008345	TTCACG	2	12	393932	393943	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	114561552
6491	NC_008345	TCA	2	6	393957	393962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561552
6492	NC_008345	TCAT	2	8	394029	394036	25 %	50 %	0 %	25 %	114561552
6493	NC_008345	TCA	2	6	394038	394043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561552
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6495	NC_008345	TTTA	2	8	394124	394131	25 %	75 %	0 %	0 %	114561552
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6498	NC_008345	TGC	2	6	394260	394265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561553
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