MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella frigidimarina NCIMB 400 chromosome

Total Repeats: 78560

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_008345	TGC	2	6	336144	336149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561494
5502	NC_008345	AGCCTT	2	12	336176	336187	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	114561494
5503	NC_008345	T	6	6	336194	336199	0 %	100 %	0 %	0 %	114561494
5504	NC_008345	GCA	2	6	336228	336233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561494
5505	NC_008345	TTG	2	6	336299	336304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561494
5506	NC_008345	T	7	7	336322	336328	0 %	100 %	0 %	0 %	114561494
5507	NC_008345	TAA	2	6	336375	336380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561495
5508	NC_008345	AAT	2	6	336463	336468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561495
5509	NC_008345	CAT	2	6	336510	336515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561495
5510	NC_008345	GTG	2	6	336557	336562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561495
5511	NC_008345	AAT	2	6	336568	336573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561495
5512	NC_008345	A	6	6	336596	336601	100 %	0 %	0 %	0 %	114561495
5513	NC_008345	AAT	2	6	336642	336647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561495
5514	NC_008345	CG	3	6	336655	336660	0 %	0 %	50 %	50 %	114561495
5515	NC_008345	TTTCT	2	10	336667	336676	0 %	80 %	0 %	20 %	114561495
5516	NC_008345	TCAA	2	8	336698	336705	50 %	25 %	0 %	25 %	114561495
5517	NC_008345	TTG	2	6	336722	336727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561495
5518	NC_008345	ATG	2	6	336740	336745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561495
5519	NC_008345	ATA	2	6	337050	337055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561496
5520	NC_008345	TTG	2	6	337091	337096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561496
5521	NC_008345	ATC	2	6	337103	337108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561496
5522	NC_008345	GCT	2	6	337115	337120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561496
5523	NC_008345	TCT	2	6	337149	337154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561496
5524	NC_008345	TGT	2	6	337177	337182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561496
5525	NC_008345	GC	3	6	337311	337316	0 %	0 %	50 %	50 %	114561496
5526	NC_008345	TCG	2	6	337399	337404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561496
5527	NC_008345	T	6	6	337416	337421	0 %	100 %	0 %	0 %	114561496
5528	NC_008345	TGA	2	6	337458	337463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561496
5529	NC_008345	CAT	2	6	337510	337515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561496
5530	NC_008345	CCAATG	2	12	337518	337529	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	114561496
5531	NC_008345	CGT	2	6	337618	337623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561496
5532	NC_008345	ACC	2	6	337662	337667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114561496
5533	NC_008345	AGT	2	6	337725	337730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561496
5534	NC_008345	TGC	2	6	337798	337803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561496
5535	NC_008345	TAA	2	6	337804	337809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561496
5536	NC_008345	AT	3	6	337849	337854	50 %	50 %	0 %	0 %	114561496
5537	NC_008345	GAT	2	6	337868	337873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561496
5538	NC_008345	TGC	2	6	337885	337890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561496
5539	NC_008345	AGC	2	6	337980	337985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561496
5540	NC_008345	GAC	2	6	338198	338203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561496
5541	NC_008345	GCT	2	6	338231	338236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561496
5542	NC_008345	GTT	2	6	338257	338262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561496
5543	NC_008345	ACA	2	6	338322	338327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561496
5544	NC_008345	TAG	2	6	338345	338350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561496
5545	NC_008345	GAT	2	6	338373	338378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561496
5546	NC_008345	TGC	2	6	338386	338391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561496
5547	NC_008345	TTA	2	6	338749	338754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561497
5548	NC_008345	CCA	2	6	338779	338784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114561497
5549	NC_008345	TAAG	2	8	338810	338817	50 %	25 %	25 %	0 %	114561497
5550	NC_008345	TTA	3	9	338821	338829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561497
5551	NC_008345	AGC	2	6	339261	339266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561498
5552	NC_008345	CACC	2	8	339292	339299	25 %	0 %	0 %	75 %	114561498
5553	NC_008345	CGT	2	6	339380	339385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561498
5554	NC_008345	TAAT	2	8	339395	339402	50 %	50 %	0 %	0 %	114561498
5555	NC_008345	GCA	2	6	339467	339472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561498
5556	NC_008345	GC	3	6	339484	339489	0 %	0 %	50 %	50 %	114561498
5557	NC_008345	TGC	2	6	339556	339561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561498
5558	NC_008345	TGGC	2	8	339634	339641	0 %	25 %	50 %	25 %	114561498
5559	NC_008345	TTA	2	6	339674	339679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561498
5560	NC_008345	TGC	2	6	339730	339735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561498
5561	NC_008345	T	6	6	339738	339743	0 %	100 %	0 %	0 %	114561498
5562	NC_008345	AGTG	2	8	339774	339781	25 %	25 %	50 %	0 %	114561498
5563	NC_008345	GTT	2	6	339825	339830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561498
5564	NC_008345	CCATT	2	10	339854	339863	20 %	40 %	0 %	40 %	114561498
5565	NC_008345	TCA	2	6	339889	339894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561498
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5568	NC_008345	AGTA	2	8	340044	340051	50 %	25 %	25 %	0 %	114561498
5569	NC_008345	AAAGAA	2	12	340065	340076	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	114561498
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5572	NC_008345	CTT	2	6	340199	340204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561498
5573	NC_008345	TTG	2	6	340452	340457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561498
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5575	NC_008345	AAT	2	6	340519	340524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561498
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5577	NC_008345	T	6	6	340552	340557	0 %	100 %	0 %	0 %	114561498
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5579	NC_008345	CAT	2	6	340853	340858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561499
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5581	NC_008345	GTT	2	6	340884	340889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561499
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5584	NC_008345	GCA	2	6	341083	341088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561499
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5587	NC_008345	CAT	2	6	341149	341154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561499
5588	NC_008345	ATC	2	6	341219	341224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561499
5589	NC_008345	AAT	2	6	341407	341412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561500
5590	NC_008345	TGC	2	6	341493	341498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561500
5591	NC_008345	CAT	2	6	341509	341514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561500
5592	NC_008345	CTT	2	6	341544	341549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561500
5593	NC_008345	AGC	2	6	341599	341604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561500
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5601	NC_008345	CTGC	2	8	342056	342063	0 %	25 %	25 %	50 %	114561500
5602	NC_008345	TTC	2	6	342163	342168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561500
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5605	NC_008345	TAC	2	6	342319	342324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561500
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5609	NC_008345	CAT	2	6	342429	342434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561500
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5611	NC_008345	CAC	2	6	342459	342464	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114561500
5612	NC_008345	GT	3	6	342503	342508	0 %	50 %	50 %	0 %	114561500
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