MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella frigidimarina NCIMB 400 chromosome

Total Repeats: 78560

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_008345	TGC	2	6	306180	306185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561465
5002	NC_008345	TCG	2	6	306246	306251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561465
5003	NC_008345	TGA	2	6	306266	306271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561465
5004	NC_008345	TGGCT	2	10	306353	306362	0 %	40 %	40 %	20 %	114561465
5005	NC_008345	ATT	2	6	306364	306369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561465
5006	NC_008345	CAT	2	6	306485	306490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561465
5007	NC_008345	ACA	2	6	306525	306530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561465
5008	NC_008345	ATA	2	6	306552	306557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561465
5009	NC_008345	CAAT	2	8	306803	306810	50 %	25 %	0 %	25 %	114561466
5010	NC_008345	CA	3	6	306825	306830	50 %	0 %	0 %	50 %	114561466
5011	NC_008345	TAG	2	6	306835	306840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561466
5012	NC_008345	AATT	2	8	306951	306958	50 %	50 %	0 %	0 %	114561466
5013	NC_008345	TGT	2	6	306976	306981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561466
5014	NC_008345	AAG	2	6	307035	307040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561466
5015	NC_008345	TGA	2	6	307053	307058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561466
5016	NC_008345	ATT	2	6	307198	307203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561466
5017	NC_008345	GGTT	2	8	307235	307242	0 %	50 %	50 %	0 %	114561466
5018	NC_008345	GAC	2	6	307364	307369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561466
5019	NC_008345	CAT	2	6	307370	307375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561466
5020	NC_008345	AGA	2	6	307399	307404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561466
5021	NC_008345	TTC	2	6	307408	307413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561466
5022	NC_008345	TTA	2	6	307469	307474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561466
5023	NC_008345	AT	3	6	307509	307514	50 %	50 %	0 %	0 %	114561466
5024	NC_008345	GAT	2	6	307532	307537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561466
5025	NC_008345	CTG	2	6	307581	307586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561466
5026	NC_008345	GCG	2	6	307907	307912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114561467
5027	NC_008345	TGA	2	6	307935	307940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561467
5028	NC_008345	CCAA	2	8	307987	307994	50 %	0 %	0 %	50 %	114561467
5029	NC_008345	A	6	6	307993	307998	100 %	0 %	0 %	0 %	114561467
5030	NC_008345	AACT	2	8	308035	308042	50 %	25 %	0 %	25 %	114561467
5031	NC_008345	GCT	2	6	308090	308095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561467
5032	NC_008345	TAT	3	9	308130	308138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561467
5033	NC_008345	AAT	2	6	308148	308153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561467
5034	NC_008345	AAT	2	6	308155	308160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561467
5035	NC_008345	GCA	2	6	308162	308167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561467
5036	NC_008345	TAA	2	6	308233	308238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561467
5037	NC_008345	GTT	2	6	308250	308255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561467
5038	NC_008345	ATG	2	6	308485	308490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561467
5039	NC_008345	TAA	2	6	308494	308499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561467
5040	NC_008345	GGT	2	6	308512	308517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561467
5041	NC_008345	TGT	2	6	308573	308578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561467
5042	NC_008345	CCA	2	6	308609	308614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114561467
5043	NC_008345	GTT	2	6	308721	308726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561467
5044	NC_008345	AAT	2	6	308788	308793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561467
5045	NC_008345	CCA	2	6	308801	308806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114561467
5046	NC_008345	ATA	2	6	308826	308831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561467
5047	NC_008345	GCT	2	6	308881	308886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561467
5048	NC_008345	AAT	2	6	308947	308952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561467
5049	NC_008345	ATCC	2	8	309155	309162	25 %	25 %	0 %	50 %	114561467
5050	NC_008345	ATGC	2	8	309170	309177	25 %	25 %	25 %	25 %	114561467
5051	NC_008345	ATT	2	6	309202	309207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561467
5052	NC_008345	ACAA	2	8	309213	309220	75 %	0 %	0 %	25 %	114561467
5053	NC_008345	TTG	2	6	309259	309264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561467
5054	NC_008345	AGT	2	6	309310	309315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561467
5055	NC_008345	TTG	2	6	309326	309331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561467
5056	NC_008345	TTA	2	6	309338	309343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561467
5057	NC_008345	AGT	2	6	309346	309351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561467
5058	NC_008345	CAATAG	2	12	309384	309395	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	114561467
5059	NC_008345	GAT	2	6	309402	309407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561467
5060	NC_008345	TGC	2	6	309412	309417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561467
5061	NC_008345	CAT	2	6	309433	309438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561467
5062	NC_008345	TA	3	6	309439	309444	50 %	50 %	0 %	0 %	114561468
5063	NC_008345	TGGC	2	8	309465	309472	0 %	25 %	50 %	25 %	114561468
5064	NC_008345	TGA	2	6	309499	309504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561468
5065	NC_008345	AAC	2	6	309535	309540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561468
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5068	NC_008345	ATAA	2	8	309996	310003	75 %	25 %	0 %	0 %	114561468
5069	NC_008345	TAA	2	6	310085	310090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561468
5070	NC_008345	CAC	2	6	310122	310127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114561468
5071	NC_008345	TGCA	2	8	310182	310189	25 %	25 %	25 %	25 %	114561468
5072	NC_008345	ATG	2	6	310211	310216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561468
5073	NC_008345	GCA	2	6	310286	310291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561468
5074	NC_008345	TCA	2	6	310306	310311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561468
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5077	NC_008345	AGCA	2	8	310413	310420	50 %	0 %	25 %	25 %	114561468
5078	NC_008345	TTGATA	2	12	310482	310493	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	114561468
5079	NC_008345	TGA	2	6	310524	310529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561468
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5081	NC_008345	T	6	6	310712	310717	0 %	100 %	0 %	0 %	114561469
5082	NC_008345	TCA	2	6	310719	310724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561469
5083	NC_008345	CATA	2	8	310729	310736	50 %	25 %	0 %	25 %	114561469
5084	NC_008345	TGC	2	6	310782	310787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561469
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5087	NC_008345	T	6	6	310946	310951	0 %	100 %	0 %	0 %	114561469
5088	NC_008345	CG	3	6	310977	310982	0 %	0 %	50 %	50 %	114561469
5089	NC_008345	TTG	2	6	310985	310990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561469
5090	NC_008345	CGCC	2	8	311079	311086	0 %	0 %	25 %	75 %	114561469
5091	NC_008345	GTC	2	6	311267	311272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561469
5092	NC_008345	TGC	2	6	311275	311280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561469
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5094	NC_008345	TAA	2	6	311300	311305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561469
5095	NC_008345	TGGC	2	8	311318	311325	0 %	25 %	50 %	25 %	114561469
5096	NC_008345	ACG	2	6	311330	311335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561469
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5099	NC_008345	CTT	2	6	311448	311453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561470
5100	NC_008345	ATC	2	6	311479	311484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561470
5101	NC_008345	CCAAA	2	10	311499	311508	60 %	0 %	0 %	40 %	114561470
5102	NC_008345	GGC	2	6	311512	311517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114561470
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5104	NC_008345	CCG	2	6	311606	311611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114561470
5105	NC_008345	TAA	3	9	311619	311627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561470
5106	NC_008345	GT	3	6	311802	311807	0 %	50 %	50 %	0 %	114561470
5107	NC_008345	CATA	2	8	311823	311830	50 %	25 %	0 %	25 %	114561470
5108	NC_008345	GC	3	6	311900	311905	0 %	0 %	50 %	50 %	114561470
5109	NC_008345	TGC	2	6	311942	311947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561470
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5111	NC_008345	TGA	2	6	312007	312012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561470
5112	NC_008345	CTTG	2	8	312047	312054	0 %	50 %	25 %	25 %	114561470
5113	NC_008345	TGGGT	2	10	312074	312083	0 %	40 %	60 %	0 %	114561470
5114	NC_008345	TTG	2	6	312130	312135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561470
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5116	NC_008345	ACC	2	6	312172	312177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114561470
5117	NC_008345	GTT	2	6	312207	312212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561470
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5119	NC_008345	GCCA	2	8	312303	312310	25 %	0 %	25 %	50 %	114561470
5120	NC_008345	CGA	2	6	312327	312332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561470
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5122	NC_008345	AAT	2	6	312635	312640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561470
5123	NC_008345	AAT	2	6	312715	312720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561470
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5241	NC_008345	CCG	2	6	319295	319300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114561477
5242	NC_008345	GCA	2	6	319331	319336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561477
5243	NC_008345	GAT	2	6	319351	319356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561477
5244	NC_008345	GAT	2	6	319434	319439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561477
5245	NC_008345	AGC	2	6	319494	319499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561477
5246	NC_008345	TAC	2	6	319505	319510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561477
5247	NC_008345	TTGC	2	8	319967	319974	0 %	50 %	25 %	25 %	114561478
5248	NC_008345	TGG	2	6	320133	320138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561478
5249	NC_008345	TG	4	8	320140	320147	0 %	50 %	50 %	0 %	114561478
5250	NC_008345	GC	3	6	320213	320218	0 %	0 %	50 %	50 %	114561478
5251	NC_008345	TAA	2	6	320290	320295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561478
5252	NC_008345	CTG	2	6	320312	320317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561478
5253	NC_008345	GTT	2	6	320444	320449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561478
5254	NC_008345	TGC	2	6	320455	320460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561478
5255	NC_008345	AAG	2	6	320473	320478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561478
5256	NC_008345	T	7	7	320494	320500	0 %	100 %	0 %	0 %	114561478
5257	NC_008345	GCA	2	6	320507	320512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561478
5258	NC_008345	GCTATT	2	12	320522	320533	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	114561478
5259	NC_008345	TTTA	2	8	320535	320542	25 %	75 %	0 %	0 %	114561478
5260	NC_008345	CTGC	2	8	320564	320571	0 %	25 %	25 %	50 %	114561478
5261	NC_008345	TGT	2	6	320731	320736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561478
5262	NC_008345	TGA	2	6	320857	320862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561478
5263	NC_008345	CAG	2	6	320888	320893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561478
5264	NC_008345	GTC	2	6	320906	320911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561478
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5266	NC_008345	A	6	6	321027	321032	100 %	0 %	0 %	0 %	114561478
5267	NC_008345	GGC	2	6	321187	321192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114561478
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5271	NC_008345	GGC	2	6	321331	321336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114561478
5272	NC_008345	ATT	2	6	321358	321363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561478
5273	NC_008345	GGT	2	6	321371	321376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561478
5274	NC_008345	CGG	2	6	321426	321431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114561478
5275	NC_008345	AAT	2	6	321485	321490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561478
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5284	NC_008345	GAA	2	6	322454	322459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561479
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5351	NC_008345	TTGC	2	8	327686	327693	0 %	50 %	25 %	25 %	114561485
5352	NC_008345	AAG	2	6	327732	327737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561485
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5356	NC_008345	GAGC	2	8	327842	327849	25 %	0 %	50 %	25 %	114561485
5357	NC_008345	ACGGCG	2	12	327854	327865	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	114561485
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5360	NC_008345	ATT	2	6	327989	327994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561485
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5362	NC_008345	TAT	2	6	328174	328179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561486
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5482	NC_008345	A	6	6	335100	335105	100 %	0 %	0 %	0 %	114561492
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5487	NC_008345	GGCAG	2	10	335522	335531	20 %	0 %	60 %	20 %	114561493
5488	NC_008345	GCC	2	6	335533	335538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114561493
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5490	NC_008345	CAA	3	9	335662	335670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561493
5491	NC_008345	GAT	2	6	335707	335712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561493
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5495	NC_008345	ATGGCA	2	12	335850	335861	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	114561493
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