MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Shewanella sp. MR-7 chromosome

Total Repeats: 51889

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008322	CAA	2	6	99	104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114045514
2	NC_008322	CAG	2	6	138	143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045514
3	NC_008322	ATG	2	6	286	291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045514
4	NC_008322	TGT	2	6	425	430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045514
5	NC_008322	ATC	2	6	439	444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045514
6	NC_008322	GCA	2	6	445	450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045514
7	NC_008322	TCG	2	6	481	486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045514
8	NC_008322	GGT	2	6	543	548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045514
9	NC_008322	TTA	2	6	600	605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114045514
10	NC_008322	CAT	2	6	623	628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045514
11	NC_008322	AAT	2	6	633	638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114045514
12	NC_008322	GAA	2	6	717	722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045514
13	NC_008322	TAC	2	6	732	737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045514
14	NC_008322	CGA	2	6	761	766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045514
15	NC_008322	GAA	2	6	801	806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045514
16	NC_008322	ATC	2	6	841	846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045514
17	NC_008322	ATC	2	6	849	854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045514
18	NC_008322	GCC	2	6	944	949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045514
19	NC_008322	CGA	2	6	1013	1018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045514
20	NC_008322	CTT	2	6	1025	1030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114045514
21	NC_008322	GCC	2	6	1111	1116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045514
22	NC_008322	TAC	2	6	1215	1220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045514
23	NC_008322	TGT	2	6	1240	1245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045514
24	NC_008322	CGT	2	6	1251	1256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045514
25	NC_008322	TGG	2	6	1346	1351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045514
26	NC_008322	CAC	2	6	1361	1366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114045514
27	NC_008322	AGA	2	6	1424	1429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045514
28	NC_008322	TCT	2	6	1455	1460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114045514
29	NC_008322	GTT	2	6	1655	1660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045515
30	NC_008322	GAA	2	6	1699	1704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045515
31	NC_008322	CAA	2	6	1757	1762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114045515
32	NC_008322	GTT	2	6	1774	1779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045515
33	NC_008322	AGA	2	6	1822	1827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045515
34	NC_008322	TGC	2	6	1980	1985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045515
35	NC_008322	TTG	2	6	2099	2104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045515
36	NC_008322	GAT	2	6	2111	2116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045515
37	NC_008322	ACC	2	6	2159	2164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114045515
38	NC_008322	CAC	2	6	2167	2172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114045515
39	NC_008322	GAA	2	6	2381	2386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045515
40	NC_008322	GAA	2	6	2390	2395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045515
41	NC_008322	ATC	2	6	2396	2401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045515
42	NC_008322	GAT	2	6	2483	2488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045515
43	NC_008322	GAA	2	6	2543	2548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045515
44	NC_008322	ATT	2	6	3571	3576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114045516
45	NC_008322	ACA	2	6	3616	3621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114045516
46	NC_008322	GAT	2	6	3650	3655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045516
47	NC_008322	AGC	2	6	3699	3704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045516
48	NC_008322	GCA	2	6	3749	3754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045516
49	NC_008322	ATA	2	6	3841	3846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114045517
50	NC_008322	TTC	2	6	3866	3871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114045517
51	NC_008322	CGA	2	6	3938	3943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045517
52	NC_008322	CAT	2	6	3957	3962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045517
53	NC_008322	AGT	2	6	3974	3979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045517
54	NC_008322	CGA	2	6	4064	4069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045517
55	NC_008322	GAA	2	6	4101	4106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045517
56	NC_008322	GCC	2	6	4116	4121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045517
57	NC_008322	CGA	2	6	4160	4165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045517
58	NC_008322	GGT	2	6	4185	4190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045517
59	NC_008322	CGC	2	6	4251	4256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045517
60	NC_008322	GAA	2	6	4365	4370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045517
61	NC_008322	CGA	2	6	4463	4468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045517
62	NC_008322	TAA	2	6	4538	4543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114045517
63	NC_008322	CAA	2	6	4658	4663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114045517
64	NC_008322	TGG	2	6	4679	4684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045517
65	NC_008322	CAA	2	6	4727	4732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114045517
66	NC_008322	CTG	2	6	4929	4934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045517
67	NC_008322	TCG	2	6	4960	4965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045517
68	NC_008322	GCG	2	6	4998	5003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045517
69	NC_008322	CCG	2	6	5024	5029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045517
70	NC_008322	GGT	2	6	5049	5054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045517
71	NC_008322	CTG	2	6	5128	5133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045517
72	NC_008322	TCT	2	6	5235	5240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114045517
73	NC_008322	TTA	2	6	5257	5262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114045517
74	NC_008322	CAT	2	6	5324	5329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045517
75	NC_008322	CTT	3	9	5384	5392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114045517
76	NC_008322	GCC	2	6	5441	5446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045517
77	NC_008322	GAA	2	6	5459	5464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045517
78	NC_008322	GAC	2	6	5516	5521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045517
79	NC_008322	ATC	2	6	5680	5685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045517
80	NC_008322	CAA	2	6	5693	5698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114045517
81	NC_008322	TGG	2	6	5758	5763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045517
82	NC_008322	GTG	2	6	5776	5781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045517
83	NC_008322	CTT	2	6	5888	5893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114045517
84	NC_008322	TGC	2	6	6133	6138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045517
85	NC_008322	TGA	2	6	6149	6154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045517
86	NC_008322	TCG	2	6	6364	6369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045518
87	NC_008322	CTA	2	6	6374	6379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045518
88	NC_008322	GAA	2	6	6486	6491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045518
89	NC_008322	CAT	2	6	6513	6518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045518
90	NC_008322	ATG	2	6	7125	7130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045519
91	NC_008322	TTA	2	6	7455	7460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114045519
92	NC_008322	GCG	2	6	7548	7553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045519
93	NC_008322	TTA	2	6	7590	7595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114045519
94	NC_008322	GCG	2	6	7698	7703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045519
95	NC_008322	TGA	2	6	7714	7719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045519
96	NC_008322	GTT	2	6	7739	7744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045519
97	NC_008322	AGC	2	6	7752	7757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045519
98	NC_008322	TGC	2	6	7760	7765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045519
99	NC_008322	CAC	2	6	7831	7836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114045519
100	NC_008322	ATT	2	6	7842	7847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114045519
101	NC_008322	TAA	2	6	8149	8154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114045520
102	NC_008322	TGG	2	6	8341	8346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045520
103	NC_008322	TTG	2	6	8498	8503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045520
104	NC_008322	GCA	2	6	8599	8604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045520
105	NC_008322	GAA	2	6	8762	8767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045520
106	NC_008322	ATG	2	6	8802	8807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045520
107	NC_008322	AGC	2	6	8868	8873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045520
108	NC_008322	TGA	2	6	8898	8903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045520
109	NC_008322	TTG	2	6	8930	8935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045520
110	NC_008322	ATC	2	6	9044	9049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045520
111	NC_008322	TGC	2	6	9063	9068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045520
112	NC_008322	CTG	2	6	9087	9092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045520
113	NC_008322	CAG	2	6	9164	9169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045520
114	NC_008322	CAG	2	6	9293	9298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045521
115	NC_008322	GTT	2	6	9308	9313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045521
116	NC_008322	GAA	2	6	9353	9358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045521
117	NC_008322	CAG	2	6	9386	9391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045521
118	NC_008322	CGC	2	6	9563	9568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045521
119	NC_008322	GCG	2	6	9650	9655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045521
120	NC_008322	GCG	2	6	9863	9868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045521
121	NC_008322	GCT	2	6	9885	9890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045521
122	NC_008322	GCA	2	6	9969	9974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045521
123	NC_008322	GGC	2	6	10190	10195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045521
124	NC_008322	GTT	3	9	10237	10245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045521
125	NC_008322	GAA	3	9	10307	10315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045521
126	NC_008322	CTT	2	6	10558	10563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114045521
127	NC_008322	CAG	2	6	10565	10570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045521
128	NC_008322	GTC	2	6	10571	10576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045521
129	NC_008322	CCA	2	6	10593	10598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114045521
130	NC_008322	CAG	2	6	10682	10687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045521
131	NC_008322	TGC	2	6	10846	10851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045521
132	NC_008322	AGC	2	6	10907	10912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045521
133	NC_008322	TTG	2	6	11041	11046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045521
134	NC_008322	CGG	2	6	11148	11153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045521
135	NC_008322	GCT	2	6	11169	11174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045521
136	NC_008322	TTC	2	6	11204	11209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114045521
137	NC_008322	GGC	2	6	11256	11261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045521
138	NC_008322	TTC	2	6	11264	11269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114045521
139	NC_008322	ATA	2	6	11354	11359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114045522
140	NC_008322	TCA	2	6	11470	11475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045522
141	NC_008322	TGG	2	6	11616	11621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045522
142	NC_008322	GCC	2	6	11759	11764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045522
143	NC_008322	TCT	2	6	11862	11867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114045522
144	NC_008322	GTA	2	6	11975	11980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045522
145	NC_008322	TGC	2	6	11982	11987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045522
146	NC_008322	GCG	2	6	12026	12031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045522
147	NC_008322	TGC	2	6	12150	12155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045522
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149	NC_008322	TCG	2	6	12211	12216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045522
150	NC_008322	GAA	2	6	12342	12347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045523
151	NC_008322	GAT	2	6	12369	12374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045523
152	NC_008322	CAA	2	6	12462	12467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114045523
153	NC_008322	ACA	2	6	12500	12505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114045523
154	NC_008322	CGA	2	6	12557	12562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045523
155	NC_008322	TGA	2	6	12580	12585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045523
156	NC_008322	ATT	2	6	12627	12632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114045523
157	NC_008322	TGG	2	6	12704	12709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045523
158	NC_008322	TTG	2	6	12811	12816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045523
159	NC_008322	ATC	2	6	12865	12870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045523
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161	NC_008322	GAA	3	9	13012	13020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045524
162	NC_008322	AAC	2	6	13073	13078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114045524
163	NC_008322	GGT	2	6	13207	13212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045524
164	NC_008322	CCG	2	6	13517	13522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045524
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166	NC_008322	GGT	2	6	13621	13626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045524
167	NC_008322	CAT	2	6	13687	13692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045524
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169	NC_008322	CTG	2	6	13720	13725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045524
170	NC_008322	ACG	2	6	13735	13740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045524
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232	NC_008322	ATG	2	6	19633	19638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045528
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237	NC_008322	ACC	2	6	20016	20021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114045529
238	NC_008322	CTT	2	6	20090	20095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114045529
239	NC_008322	GAT	2	6	20142	20147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045529
240	NC_008322	GGC	2	6	20181	20186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045529
241	NC_008322	CAG	2	6	20190	20195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045529
242	NC_008322	TTC	2	6	20272	20277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114045529
243	NC_008322	GTG	2	6	20373	20378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045529
244	NC_008322	GAA	2	6	20532	20537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045529
245	NC_008322	AAC	2	6	20553	20558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114045529
246	NC_008322	CAA	2	6	20591	20596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114045529
247	NC_008322	TCT	2	6	20611	20616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114045529
248	NC_008322	GAA	2	6	20670	20675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045529
249	NC_008322	CTT	2	6	20700	20705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114045529
250	NC_008322	TGT	2	6	20885	20890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045529
251	NC_008322	TCA	2	6	21002	21007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045529
252	NC_008322	ATG	2	6	21055	21060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045529
253	NC_008322	CGG	2	6	21074	21079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045529
254	NC_008322	AAG	2	6	21145	21150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045529
255	NC_008322	CGC	2	6	21240	21245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045529
256	NC_008322	GCC	2	6	21265	21270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045529
257	NC_008322	CAT	2	6	21333	21338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045529
258	NC_008322	GTG	2	6	21362	21367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045529
259	NC_008322	GGC	3	9	21435	21443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045529
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261	NC_008322	TCT	2	6	21496	21501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114045529
262	NC_008322	GTG	2	6	21520	21525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045529
263	NC_008322	CCA	2	6	21577	21582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114045529
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266	NC_008322	CAT	2	6	21782	21787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045529
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268	NC_008322	TCA	2	6	22483	22488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045530
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270	NC_008322	GAC	2	6	22598	22603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045530
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272	NC_008322	GTG	2	6	22679	22684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045530
273	NC_008322	TGA	2	6	22914	22919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045530
274	NC_008322	ACT	2	6	22940	22945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045530
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276	NC_008322	GCG	2	6	23132	23137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045530
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280	NC_008322	ATG	2	6	23493	23498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045530
281	NC_008322	CAG	2	6	23666	23671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045530
282	NC_008322	TGA	2	6	23689	23694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045530
283	NC_008322	GGT	2	6	23708	23713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045530
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293	NC_008322	GGT	2	6	24598	24603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045532
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377	NC_008322	TCA	2	6	31812	31817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045538
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495	NC_008322	ATT	2	6	48092	48097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114045553
496	NC_008322	ACC	2	6	48104	48109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114045553
497	NC_008322	GCA	2	6	48151	48156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045553
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499	NC_008322	GCG	2	6	48205	48210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045553
500	NC_008322	TCG	2	6	48261	48266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045553

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