MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella sp. MR-7 chromosome

Total Repeats: 72678

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_008322	ATGGTA	2	12	233189	233200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045724
3502	NC_008322	GGCTAT	2	12	233206	233217	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	114045724
3503	NC_008322	GC	3	6	233224	233229	0 %	0 %	50 %	50 %	114045724
3504	NC_008322	CAG	2	6	233237	233242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045724
3505	NC_008322	CGT	2	6	233269	233274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045724
3506	NC_008322	GTTGA	2	10	233287	233296	20 %	40 %	40 %	0 %	114045724
3507	NC_008322	GTC	2	6	233327	233332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045724
3508	NC_008322	TAT	2	6	233379	233384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114045724
3509	NC_008322	CG	3	6	233479	233484	0 %	0 %	50 %	50 %	114045724
3510	NC_008322	CTA	2	6	233579	233584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045725
3511	NC_008322	CG	3	6	233638	233643	0 %	0 %	50 %	50 %	114045725
3512	NC_008322	AGA	2	6	233691	233696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045725
3513	NC_008322	CAA	2	6	233721	233726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114045725
3514	NC_008322	CTA	2	6	233730	233735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045725
3515	NC_008322	GGA	2	6	233748	233753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114045725
3516	NC_008322	GCGGTG	2	12	233885	233896	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	114045726
3517	NC_008322	GGT	2	6	233914	233919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045726
3518	NC_008322	TCGCG	2	10	233962	233971	0 %	20 %	40 %	40 %	114045726
3519	NC_008322	TTA	2	6	234059	234064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114045726
3520	NC_008322	GCA	2	6	234157	234162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045726
3521	NC_008322	GCT	2	6	234169	234174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045726
3522	NC_008322	AAT	2	6	234191	234196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114045726
3523	NC_008322	CCT	2	6	234265	234270	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114045727
3524	NC_008322	GTG	2	6	234405	234410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045727
3525	NC_008322	TGT	2	6	234487	234492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045727
3526	NC_008322	A	6	6	234515	234520	100 %	0 %	0 %	0 %	114045727
3527	NC_008322	A	7	7	234539	234545	100 %	0 %	0 %	0 %	114045727
3528	NC_008322	TCAG	2	8	234546	234553	25 %	25 %	25 %	25 %	114045727
3529	NC_008322	AC	3	6	234555	234560	50 %	0 %	0 %	50 %	114045727
3530	NC_008322	TTG	2	6	234777	234782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045727
3531	NC_008322	TTG	3	9	234851	234859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045727
3532	NC_008322	ATT	2	6	234869	234874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114045727
3533	NC_008322	GTG	2	6	234893	234898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045727
3534	NC_008322	CGT	2	6	234917	234922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045727
3535	NC_008322	GTT	2	6	234926	234931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045727
3536	NC_008322	CAT	2	6	235039	235044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045727
3537	NC_008322	ATT	2	6	235147	235152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114045727
3538	NC_008322	GCA	2	6	235157	235162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045727
3539	NC_008322	TCT	3	9	235170	235178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114045727
3540	NC_008322	TCT	2	6	235182	235187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114045727
3541	NC_008322	CAG	2	6	235218	235223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045727
3542	NC_008322	GAA	2	6	235231	235236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045727
3543	NC_008322	GTG	2	6	235239	235244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045727
3544	NC_008322	ACT	2	6	235408	235413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045727
3545	NC_008322	ATG	2	6	235463	235468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045727
3546	NC_008322	TGA	2	6	235488	235493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045727
3547	NC_008322	GAA	2	6	235585	235590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045728
3548	NC_008322	GAA	2	6	235965	235970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045729
3549	NC_008322	TAG	2	6	235984	235989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045729
3550	NC_008322	CGT	2	6	236001	236006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045729
3551	NC_008322	GTT	2	6	236044	236049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045729
3552	NC_008322	TCG	2	6	236066	236071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045729
3553	NC_008322	GCCT	2	8	236074	236081	0 %	25 %	25 %	50 %	114045729
3554	NC_008322	AAG	2	6	236142	236147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045729
3555	NC_008322	CGTA	2	8	236200	236207	25 %	25 %	25 %	25 %	114045730
3556	NC_008322	ATGGC	2	10	236220	236229	20 %	20 %	40 %	20 %	114045730
3557	NC_008322	CTT	2	6	236241	236246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114045730
3558	NC_008322	CAA	2	6	236248	236253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114045730
3559	NC_008322	GGT	2	6	236309	236314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045730
3560	NC_008322	TGC	2	6	236350	236355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045730
3561	NC_008322	GCT	2	6	236363	236368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045730
3562	NC_008322	TGC	3	9	236380	236388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045730
3563	NC_008322	A	6	6	236404	236409	100 %	0 %	0 %	0 %	114045730
3564	NC_008322	GTCCAG	2	12	236430	236441	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	114045730
3565	NC_008322	GTC	2	6	236529	236534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045730
3566	NC_008322	CGT	2	6	236546	236551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045730
3567	NC_008322	CAAGCT	2	12	236609	236620	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	114045731
3568	NC_008322	GCC	2	6	236623	236628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045731
3569	NC_008322	TCG	2	6	236771	236776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045731
3570	NC_008322	GT	3	6	236785	236790	0 %	50 %	50 %	0 %	114045731
3571	NC_008322	ACT	2	6	236809	236814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045731
3572	NC_008322	GTT	2	6	236889	236894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045731
3573	NC_008322	GTT	2	6	236973	236978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045731
3574	NC_008322	ATG	2	6	237007	237012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045731
3575	NC_008322	GCT	2	6	237072	237077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045731
3576	NC_008322	TCG	2	6	237187	237192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045731
3577	NC_008322	TAAG	2	8	237203	237210	50 %	25 %	25 %	0 %	114045731
3578	NC_008322	GTC	2	6	237377	237382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045732
3579	NC_008322	CAG	2	6	237437	237442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045732
3580	NC_008322	AAGG	2	8	237444	237451	50 %	0 %	50 %	0 %	114045732
3581	NC_008322	AAG	2	6	237457	237462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045732
3582	NC_008322	GCA	2	6	237567	237572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045732
3583	NC_008322	ATG	2	6	237583	237588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045732
3584	NC_008322	CGTGGT	2	12	237672	237683	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	114045732
3585	NC_008322	GAT	2	6	237720	237725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045732
3586	NC_008322	CTT	2	6	237754	237759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114045732
3587	NC_008322	AGC	2	6	237794	237799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045732
3588	NC_008322	CGT	2	6	237882	237887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045732
3589	NC_008322	CGTT	2	8	237919	237926	0 %	50 %	25 %	25 %	114045732
3590	NC_008322	AGA	2	6	237959	237964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045732
3591	NC_008322	CGA	2	6	238001	238006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045732
3592	NC_008322	GCT	2	6	238094	238099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045732
3593	NC_008322	GAC	2	6	238212	238217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045732
3594	NC_008322	GTC	2	6	238283	238288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045733
3595	NC_008322	CAG	2	6	238302	238307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045733
3596	NC_008322	ATC	2	6	238360	238365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045733
3597	NC_008322	CGT	2	6	238450	238455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045733
3598	NC_008322	TGG	2	6	238536	238541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045733
3599	NC_008322	TAG	2	6	238607	238612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045733
3600	NC_008322	GTC	2	6	238613	238618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045733
3601	NC_008322	GCT	2	6	238624	238629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045733
3602	NC_008322	GTTGAA	2	12	238636	238647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045733
3603	NC_008322	GCT	2	6	238648	238653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045733
3604	NC_008322	CTG	2	6	239859	239864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045734
3605	NC_008322	GGC	2	6	239914	239919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045734
3606	NC_008322	GCA	2	6	240026	240031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045734
3607	NC_008322	TCG	2	6	240034	240039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045734
3608	NC_008322	CGC	2	6	240056	240061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045734
3609	NC_008322	GCC	2	6	240135	240140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045734
3610	NC_008322	CAG	2	6	240246	240251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045734
3611	NC_008322	CAATG	2	10	240282	240291	40 %	20 %	20 %	20 %	114045734
3612	NC_008322	TCT	2	6	240370	240375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114045735
3613	NC_008322	TGA	2	6	240418	240423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045735
3614	NC_008322	AGA	2	6	240439	240444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045735
3615	NC_008322	CA	3	6	240465	240470	50 %	0 %	0 %	50 %	114045735
3616	NC_008322	A	7	7	240494	240500	100 %	0 %	0 %	0 %	114045735
3617	NC_008322	ATT	2	6	240522	240527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114045735
3618	NC_008322	CCT	2	6	240531	240536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114045736
3619	NC_008322	ACA	2	6	240663	240668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114045736
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3732	NC_008322	TCTT	2	8	247006	247013	0 %	75 %	0 %	25 %	114045742
3733	NC_008322	GGAA	2	8	247076	247083	50 %	0 %	50 %	0 %	114045742
3734	NC_008322	GAT	2	6	247130	247135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045742
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3739	NC_008322	GC	3	6	247381	247386	0 %	0 %	50 %	50 %	114045742
3740	NC_008322	TAT	2	6	247415	247420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114045742
3741	NC_008322	GT	3	6	247453	247458	0 %	50 %	50 %	0 %	114045742
3742	NC_008322	CAA	2	6	247485	247490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114045742
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3744	NC_008322	ATC	2	6	247541	247546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045743
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3859	NC_008322	GCG	2	6	261163	261168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045749
3860	NC_008322	TGC	2	6	261203	261208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045749
3861	NC_008322	CAA	2	6	261268	261273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114045749
3862	NC_008322	AAAGTA	2	12	261316	261327	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	114045749
3863	NC_008322	CA	3	6	261432	261437	50 %	0 %	0 %	50 %	114045749
3864	NC_008322	GTG	2	6	261583	261588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045750
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3874	NC_008322	CTAT	2	8	262112	262119	25 %	50 %	0 %	25 %	114045750
3875	NC_008322	TGA	2	6	262205	262210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045750
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3888	NC_008322	CTG	2	6	262921	262926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045751
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3912	NC_008322	GCTG	2	8	264368	264375	0 %	25 %	50 %	25 %	114045752
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3970	NC_008322	A	6	6	268010	268015	100 %	0 %	0 %	0 %	114045754
3971	NC_008322	GATGCC	2	12	268044	268055	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	114045754
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3981	NC_008322	TGC	2	6	268681	268686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045754
3982	NC_008322	TAT	2	6	268753	268758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114045754
3983	NC_008322	TTA	2	6	268794	268799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114045754
3984	NC_008322	AT	3	6	268901	268906	50 %	50 %	0 %	0 %	114045754
3985	NC_008322	GAG	2	6	268928	268933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114045754
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3988	NC_008322	GCA	2	6	269215	269220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045755
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3991	NC_008322	AT	3	6	269279	269284	50 %	50 %	0 %	0 %	114045755
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3993	NC_008322	AAC	2	6	269345	269350	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114045755
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