MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella sp. MR-7 chromosome

Total Repeats: 72678

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008322	ATA	2	6	31981	31986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114045539
502	NC_008322	TGC	2	6	32003	32008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045539
503	NC_008322	TGG	2	6	32009	32014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045539
504	NC_008322	CTT	2	6	32096	32101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114045539
505	NC_008322	CTT	3	9	32141	32149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114045539
506	NC_008322	ATC	3	9	32289	32297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045539
507	NC_008322	CAG	2	6	32319	32324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045539
508	NC_008322	CG	3	6	32397	32402	0 %	0 %	50 %	50 %	114045539
509	NC_008322	GTG	2	6	32468	32473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045539
510	NC_008322	ACT	2	6	32482	32487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045539
511	NC_008322	ACC	3	9	32512	32520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114045539
512	NC_008322	ATA	2	6	32521	32526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114045539
513	NC_008322	GCA	2	6	32539	32544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045539
514	NC_008322	TGC	2	6	32551	32556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045539
515	NC_008322	T	6	6	32640	32645	0 %	100 %	0 %	0 %	114045539
516	NC_008322	TGTGA	2	10	32693	32702	20 %	40 %	40 %	0 %	114045539
517	NC_008322	GAT	2	6	32754	32759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045539
518	NC_008322	GACA	2	8	33019	33026	50 %	0 %	25 %	25 %	114045540
519	NC_008322	AAT	2	6	33060	33065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114045540
520	NC_008322	GTT	2	6	33125	33130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045540
521	NC_008322	TGC	2	6	33150	33155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045540
522	NC_008322	ATC	2	6	33195	33200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045540
523	NC_008322	CAG	2	6	33218	33223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045540
524	NC_008322	ACA	2	6	33417	33422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114045541
525	NC_008322	AAG	2	6	33536	33541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045541
526	NC_008322	ATTTA	2	10	33636	33645	40 %	60 %	0 %	0 %	114045541
527	NC_008322	GTAT	2	8	33948	33955	25 %	50 %	25 %	0 %	114045541
528	NC_008322	CTT	2	6	33970	33975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114045541
529	NC_008322	CAA	2	6	33976	33981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114045541
530	NC_008322	AAG	2	6	34005	34010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045541
531	NC_008322	CGG	2	6	34176	34181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045541
532	NC_008322	TAA	2	6	34315	34320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114045541
533	NC_008322	TGG	2	6	34368	34373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045541
534	NC_008322	GTC	2	6	34381	34386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045541
535	NC_008322	CGA	2	6	34498	34503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045541
536	NC_008322	AATT	2	8	34506	34513	50 %	50 %	0 %	0 %	114045541
537	NC_008322	AAT	2	6	34542	34547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114045541
538	NC_008322	GAC	2	6	34639	34644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045542
539	NC_008322	TGC	2	6	34734	34739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045542
540	NC_008322	CAG	2	6	34753	34758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045542
541	NC_008322	ACC	2	6	34769	34774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114045542
542	NC_008322	GTTT	2	8	34777	34784	0 %	75 %	25 %	0 %	114045542
543	NC_008322	TCC	2	6	34800	34805	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114045542
544	NC_008322	TCC	2	6	34827	34832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114045542
545	NC_008322	TTAT	2	8	34840	34847	25 %	75 %	0 %	0 %	114045542
546	NC_008322	TGT	2	6	34868	34873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045542
547	NC_008322	GA	3	6	34946	34951	50 %	0 %	50 %	0 %	114045542
548	NC_008322	ATT	2	6	35071	35076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114045542
549	NC_008322	AGC	2	6	35093	35098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045542
550	NC_008322	TAA	2	6	35129	35134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114045542
551	NC_008322	CGAAA	2	10	35177	35186	60 %	0 %	20 %	20 %	114045542
552	NC_008322	ATT	2	6	35191	35196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114045542
553	NC_008322	TCTT	2	8	35202	35209	0 %	75 %	0 %	25 %	114045542
554	NC_008322	TGG	2	6	35219	35224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045542
555	NC_008322	TCA	2	6	35252	35257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045542
556	NC_008322	GGC	2	6	35317	35322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045542
557	NC_008322	TCA	2	6	35325	35330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045542
558	NC_008322	TTA	2	6	35344	35349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114045542
559	NC_008322	GAA	2	6	35425	35430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045542
560	NC_008322	CCA	2	6	35442	35447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114045542
561	NC_008322	ACA	2	6	35515	35520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114045542
562	NC_008322	GGTTG	2	10	35596	35605	0 %	40 %	60 %	0 %	114045542
563	NC_008322	GGT	2	6	35617	35622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045542
564	NC_008322	ACTC	2	8	35735	35742	25 %	25 %	0 %	50 %	114045543
565	NC_008322	TTGG	2	8	35783	35790	0 %	50 %	50 %	0 %	114045543
566	NC_008322	CATT	2	8	35847	35854	25 %	50 %	0 %	25 %	114045543
567	NC_008322	AGA	2	6	35870	35875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045543
568	NC_008322	GCCT	2	8	35990	35997	0 %	25 %	25 %	50 %	114045543
569	NC_008322	AGC	2	6	36094	36099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045543
570	NC_008322	GAA	2	6	36102	36107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045543
571	NC_008322	AAC	2	6	36264	36269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114045544
572	NC_008322	GCAC	2	8	36286	36293	25 %	0 %	25 %	50 %	114045544
573	NC_008322	AAC	2	6	36377	36382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114045544
574	NC_008322	GCA	2	6	36415	36420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045544
575	NC_008322	A	6	6	36780	36785	100 %	0 %	0 %	0 %	114045544
576	NC_008322	CG	3	6	36800	36805	0 %	0 %	50 %	50 %	114045544
577	NC_008322	CGG	2	6	36994	36999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045545
578	NC_008322	GCGA	2	8	37121	37128	25 %	0 %	50 %	25 %	114045545
579	NC_008322	CGTG	2	8	37282	37289	0 %	25 %	50 %	25 %	114045545
580	NC_008322	TGA	2	6	37390	37395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045545
581	NC_008322	AGC	2	6	37452	37457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045545
582	NC_008322	CCA	2	6	37467	37472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114045545
583	NC_008322	GCAA	2	8	37632	37639	50 %	0 %	25 %	25 %	114045546
584	NC_008322	GGCGGT	2	12	37672	37683	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	114045546
585	NC_008322	TGG	2	6	37918	37923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045546
586	NC_008322	TGG	3	9	37926	37934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045546
587	NC_008322	GAA	2	6	37963	37968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045546
588	NC_008322	CGA	2	6	38019	38024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045546
589	NC_008322	AT	3	6	38026	38031	50 %	50 %	0 %	0 %	114045546
590	NC_008322	AAG	2	6	38041	38046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045546
591	NC_008322	TGA	2	6	38052	38057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045546
592	NC_008322	TTC	2	6	38062	38067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114045546
593	NC_008322	CTT	2	6	38175	38180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114045546
594	NC_008322	TTG	2	6	38198	38203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045546
595	NC_008322	GAGCGT	2	12	38230	38241	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	114045546
596	NC_008322	TCG	2	6	38256	38261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045546
597	NC_008322	TGG	2	6	38322	38327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045546
598	NC_008322	GCC	2	6	38355	38360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045546
599	NC_008322	GCG	2	6	38545	38550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045547
600	NC_008322	T	6	6	38563	38568	0 %	100 %	0 %	0 %	114045547
601	NC_008322	TTC	2	6	38574	38579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114045547
602	NC_008322	GCC	2	6	38694	38699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045547
603	NC_008322	TCT	2	6	38782	38787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114045547
604	NC_008322	CG	3	6	38823	38828	0 %	0 %	50 %	50 %	114045547
605	NC_008322	CCA	2	6	38842	38847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114045547
606	NC_008322	TG	3	6	38898	38903	0 %	50 %	50 %	0 %	114045547
607	NC_008322	CAG	2	6	39219	39224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045548
608	NC_008322	T	6	6	39285	39290	0 %	100 %	0 %	0 %	114045548
609	NC_008322	GGA	2	6	39297	39302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114045548
610	NC_008322	CT	3	6	39346	39351	0 %	50 %	0 %	50 %	114045548
611	NC_008322	TTG	2	6	39405	39410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045548
612	NC_008322	TGG	2	6	39454	39459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045548
613	NC_008322	GCA	2	6	39488	39493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045548
614	NC_008322	TGG	2	6	39518	39523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045548
615	NC_008322	GC	3	6	39528	39533	0 %	0 %	50 %	50 %	114045548
616	NC_008322	ACA	2	6	39635	39640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114045548
617	NC_008322	CGATGC	2	12	39667	39678	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	114045548
618	NC_008322	CAT	2	6	39761	39766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045548
619	NC_008322	ATG	2	6	39792	39797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045548
620	NC_008322	TGAT	2	8	39856	39863	25 %	50 %	25 %	0 %	114045548
621	NC_008322	GGC	2	6	39887	39892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045548
622	NC_008322	TGGCG	2	10	39909	39918	0 %	20 %	60 %	20 %	114045548
623	NC_008322	AAGAT	2	10	39996	40005	60 %	20 %	20 %	0 %	114045549
624	NC_008322	CAG	3	9	40076	40084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045549
625	NC_008322	GC	3	6	40110	40115	0 %	0 %	50 %	50 %	114045549
626	NC_008322	GCC	2	6	40169	40174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045549
627	NC_008322	GAA	2	6	40211	40216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045549
628	NC_008322	AGA	2	6	40240	40245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045549
629	NC_008322	TGA	2	6	40249	40254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045549
630	NC_008322	ACT	2	6	40335	40340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045550
631	NC_008322	CGG	2	6	40489	40494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045550
632	NC_008322	CAT	2	6	40521	40526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045550
633	NC_008322	GCA	2	6	40599	40604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045550
634	NC_008322	CAT	2	6	40626	40631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045550
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646	NC_008322	GGC	2	6	47371	47376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045552
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649	NC_008322	GCA	2	6	47459	47464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045552
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651	NC_008322	CTG	2	6	47596	47601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045552
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659	NC_008322	TGG	2	6	47917	47922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045553
660	NC_008322	GCT	2	6	47944	47949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045553
661	NC_008322	ATC	2	6	47984	47989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045553
662	NC_008322	TTG	2	6	48018	48023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045553
663	NC_008322	ATT	2	6	48092	48097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114045553
664	NC_008322	ACC	2	6	48104	48109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114045553
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747	NC_008322	AAGTT	2	10	53408	53417	40 %	40 %	20 %	0 %	114045558
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750	NC_008322	TG	3	6	53516	53521	0 %	50 %	50 %	0 %	114045558
751	NC_008322	ACA	2	6	53526	53531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114045558
752	NC_008322	TCT	2	6	53540	53545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114045558
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754	NC_008322	CTCA	2	8	53576	53583	25 %	25 %	0 %	50 %	114045558
755	NC_008322	GTAG	2	8	53632	53639	25 %	25 %	50 %	0 %	114045558
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1000	NC_008322	CATTT	2	10	68811	68820	20 %	60 %	0 %	20 %	114045570

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