MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella sp. MR-7 chromosome

Total Repeats: 72678

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_008322	TGC	2	6	361470	361475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045837
5502	NC_008322	TGGC	2	8	361526	361533	0 %	25 %	50 %	25 %	114045837
5503	NC_008322	GCG	2	6	361906	361911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045838
5504	NC_008322	TTCA	2	8	361950	361957	25 %	50 %	0 %	25 %	114045838
5505	NC_008322	GCC	2	6	362019	362024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045838
5506	NC_008322	ATC	2	6	362082	362087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045838
5507	NC_008322	T	6	6	362213	362218	0 %	100 %	0 %	0 %	114045838
5508	NC_008322	CGG	2	6	362406	362411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045839
5509	NC_008322	GC	3	6	362436	362441	0 %	0 %	50 %	50 %	114045839
5510	NC_008322	TGG	2	6	362444	362449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045839
5511	NC_008322	GAC	2	6	362572	362577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045839
5512	NC_008322	GCA	2	6	362632	362637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045839
5513	NC_008322	CT	3	6	362699	362704	0 %	50 %	0 %	50 %	114045839
5514	NC_008322	CGG	2	6	362885	362890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045839
5515	NC_008322	CG	3	6	362993	362998	0 %	0 %	50 %	50 %	114045839
5516	NC_008322	CGG	2	6	363129	363134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045839
5517	NC_008322	AGG	2	6	363231	363236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114045839
5518	NC_008322	GCAC	2	8	363284	363291	25 %	0 %	25 %	50 %	114045839
5519	NC_008322	GTG	3	9	363296	363304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045839
5520	NC_008322	CGA	2	6	363549	363554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045839
5521	NC_008322	TTG	2	6	363614	363619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045839
5522	NC_008322	GAC	2	6	363745	363750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045839
5523	NC_008322	ATA	2	6	363778	363783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114045839
5524	NC_008322	GCG	3	9	363880	363888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045839
5525	NC_008322	TGT	2	6	363921	363926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045839
5526	NC_008322	TGA	2	6	363945	363950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045839
5527	NC_008322	CAT	3	9	363979	363987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045839
5528	NC_008322	CTT	2	6	364011	364016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114045839
5529	NC_008322	T	6	6	364015	364020	0 %	100 %	0 %	0 %	114045839
5530	NC_008322	CAAC	2	8	364059	364066	50 %	0 %	0 %	50 %	114045839
5531	NC_008322	GCA	2	6	364137	364142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045839
5532	NC_008322	GCC	2	6	364145	364150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045839
5533	NC_008322	GCAACC	2	12	364193	364204	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	114045839
5534	NC_008322	CGC	2	6	364224	364229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045839
5535	NC_008322	GGC	2	6	364418	364423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045840
5536	NC_008322	GCT	2	6	364440	364445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045840
5537	NC_008322	TCACGC	2	12	364446	364457	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	114045840
5538	NC_008322	ACG	2	6	364595	364600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045840
5539	NC_008322	CGC	2	6	364601	364606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045840
5540	NC_008322	TCT	2	6	364650	364655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114045840
5541	NC_008322	ATA	2	6	364855	364860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114045841
5542	NC_008322	AATA	2	8	364986	364993	75 %	25 %	0 %	0 %	114045841
5543	NC_008322	TAG	2	6	365110	365115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045841
5544	NC_008322	TTC	2	6	365172	365177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114045841
5545	NC_008322	CGG	2	6	365261	365266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045841
5546	NC_008322	CAG	2	6	365277	365282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045841
5547	NC_008322	CAC	2	6	365309	365314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114045841
5548	NC_008322	AATA	2	8	365328	365335	75 %	25 %	0 %	0 %	114045841
5549	NC_008322	AAG	2	6	365381	365386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045841
5550	NC_008322	GT	3	6	365797	365802	0 %	50 %	50 %	0 %	114045842
5551	NC_008322	CGC	2	6	365825	365830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045842
5552	NC_008322	CTGCG	2	10	365893	365902	0 %	20 %	40 %	40 %	114045842
5553	NC_008322	ATG	2	6	365911	365916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045842
5554	NC_008322	TA	3	6	365979	365984	50 %	50 %	0 %	0 %	114045842
5555	NC_008322	GCC	2	6	365993	365998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045842
5556	NC_008322	TAT	2	6	366093	366098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114045842
5557	NC_008322	TGC	2	6	366203	366208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045842
5558	NC_008322	CTG	2	6	366352	366357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045842
5559	NC_008322	CAC	2	6	366499	366504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114045842
5560	NC_008322	TGA	2	6	366524	366529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045842
5561	NC_008322	GAA	2	6	366591	366596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045842
5562	NC_008322	CGT	2	6	366600	366605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045842
5563	NC_008322	CGC	2	6	366606	366611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045842
5564	NC_008322	T	6	6	366666	366671	0 %	100 %	0 %	0 %	114045842
5565	NC_008322	TTA	2	6	366688	366693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114045842
5566	NC_008322	CGG	2	6	366740	366745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045842
5567	NC_008322	TGT	2	6	366760	366765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045842
5568	NC_008322	GAA	2	6	366816	366821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045842
5569	NC_008322	GCT	2	6	366822	366827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045842
5570	NC_008322	ATT	2	6	366921	366926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114045842
5571	NC_008322	GC	3	6	367000	367005	0 %	0 %	50 %	50 %	114045842
5572	NC_008322	TAA	2	6	367013	367018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114045842
5573	NC_008322	TTGC	2	8	367050	367057	0 %	50 %	25 %	25 %	114045842
5574	NC_008322	CGC	2	6	367084	367089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045842
5575	NC_008322	ATC	2	6	367104	367109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045842
5576	NC_008322	TCG	2	6	367121	367126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045842
5577	NC_008322	GCA	2	6	367129	367134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045842
5578	NC_008322	TG	3	6	367141	367146	0 %	50 %	50 %	0 %	114045842
5579	NC_008322	ATT	2	6	367207	367212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114045842
5580	NC_008322	GGC	2	6	367398	367403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045843
5581	NC_008322	GGC	2	6	367423	367428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045843
5582	NC_008322	CCTC	2	8	367442	367449	0 %	25 %	0 %	75 %	114045843
5583	NC_008322	CGG	2	6	367580	367585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045843
5584	NC_008322	CCG	2	6	367628	367633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045843
5585	NC_008322	GAT	2	6	367741	367746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045843
5586	NC_008322	GAT	2	6	367809	367814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045843
5587	NC_008322	CTTC	2	8	367975	367982	0 %	50 %	0 %	50 %	114045843
5588	NC_008322	TTA	2	6	368036	368041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114045843
5589	NC_008322	AAC	2	6	368066	368071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114045843
5590	NC_008322	CCG	2	6	368105	368110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045843
5591	NC_008322	TTG	2	6	368147	368152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045843
5592	NC_008322	TGC	2	6	368364	368369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045844
5593	NC_008322	CGC	2	6	368397	368402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045844
5594	NC_008322	GTAA	2	8	368411	368418	50 %	25 %	25 %	0 %	114045844
5595	NC_008322	GATAA	2	10	368423	368432	60 %	20 %	20 %	0 %	114045844
5596	NC_008322	CAT	2	6	368435	368440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045844
5597	NC_008322	ACA	2	6	368458	368463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114045844
5598	NC_008322	GTG	2	6	368480	368485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045844
5599	NC_008322	CGAT	2	8	368517	368524	25 %	25 %	25 %	25 %	114045844
5600	NC_008322	GAAGCC	2	12	368597	368608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045844
5601	NC_008322	GGC	2	6	368614	368619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045844
5602	NC_008322	CCA	2	6	368695	368700	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114045844
5603	NC_008322	CAG	2	6	368798	368803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045844
5604	NC_008322	TTA	2	6	368807	368812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114045844
5605	NC_008322	AAT	2	6	368876	368881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114045844
5606	NC_008322	CAAT	2	8	369038	369045	50 %	25 %	0 %	25 %	114045844
5607	NC_008322	GCC	2	6	369050	369055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045844
5608	NC_008322	TGA	2	6	369144	369149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045844
5609	NC_008322	GCGT	2	8	369153	369160	0 %	25 %	50 %	25 %	114045844
5610	NC_008322	T	6	6	369160	369165	0 %	100 %	0 %	0 %	114045844
5611	NC_008322	AAG	2	6	369270	369275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045844
5612	NC_008322	GCTT	2	8	369287	369294	0 %	50 %	25 %	25 %	114045844
5613	NC_008322	CAG	2	6	369503	369508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045845
5614	NC_008322	TCG	2	6	369521	369526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045845
5615	NC_008322	ATG	2	6	369527	369532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045845
5616	NC_008322	CGA	2	6	369537	369542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045845
5617	NC_008322	T	6	6	369551	369556	0 %	100 %	0 %	0 %	114045845
5618	NC_008322	CCG	2	6	369676	369681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045845
5619	NC_008322	TGG	2	6	369717	369722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045845
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5621	NC_008322	T	6	6	369878	369883	0 %	100 %	0 %	0 %	114045845
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5740	NC_008322	CAG	2	6	379652	379657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045853
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5987	NC_008322	ACG	2	6	397149	397154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045866
5988	NC_008322	CAC	2	6	397240	397245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114045867
5989	NC_008322	TCA	2	6	397263	397268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045867
5990	NC_008322	AACA	2	8	397298	397305	75 %	0 %	0 %	25 %	114045867
5991	NC_008322	CGG	2	6	397468	397473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045867
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5993	NC_008322	ATTT	2	8	397665	397672	25 %	75 %	0 %	0 %	114045867
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