MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella sp. MR-7 chromosome

Total Repeats: 72678

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_008322	GAT	2	6	329759	329764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045811
5002	NC_008322	GCC	2	6	329771	329776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045811
5003	NC_008322	GCA	2	6	329803	329808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045811
5004	NC_008322	TGATGC	2	12	329814	329825	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	114045811
5005	NC_008322	GC	3	6	329824	329829	0 %	0 %	50 %	50 %	114045811
5006	NC_008322	GCTG	2	8	329839	329846	0 %	25 %	50 %	25 %	114045811
5007	NC_008322	AGCG	2	8	329847	329854	25 %	0 %	50 %	25 %	114045811
5008	NC_008322	CAG	2	6	329876	329881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045811
5009	NC_008322	AGT	2	6	329975	329980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045811
5010	NC_008322	TTC	2	6	329986	329991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114045811
5011	NC_008322	GAT	2	6	329999	330004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045811
5012	NC_008322	GCA	2	6	330085	330090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045811
5013	NC_008322	ATT	2	6	330129	330134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114045811
5014	NC_008322	AGG	2	6	330141	330146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114045811
5015	NC_008322	ATT	2	6	330149	330154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114045811
5016	NC_008322	GGA	2	6	330160	330165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114045811
5017	NC_008322	GCA	2	6	330288	330293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045811
5018	NC_008322	TAGA	2	8	330332	330339	50 %	25 %	25 %	0 %	114045812
5019	NC_008322	GCG	2	6	330362	330367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045812
5020	NC_008322	TATG	2	8	330595	330602	25 %	50 %	25 %	0 %	114045812
5021	NC_008322	AG	3	6	330603	330608	50 %	0 %	50 %	0 %	114045812
5022	NC_008322	AGTT	2	8	330627	330634	25 %	50 %	25 %	0 %	114045813
5023	NC_008322	GATTT	2	10	330701	330710	20 %	60 %	20 %	0 %	114045813
5024	NC_008322	TGA	2	6	330799	330804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045813
5025	NC_008322	AAG	2	6	330864	330869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045813
5026	NC_008322	CAT	2	6	330947	330952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045813
5027	NC_008322	CGG	2	6	330988	330993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045813
5028	NC_008322	TTG	2	6	331032	331037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045813
5029	NC_008322	AC	3	6	331164	331169	50 %	0 %	0 %	50 %	114045813
5030	NC_008322	T	6	6	331181	331186	0 %	100 %	0 %	0 %	114045813
5031	NC_008322	TGG	2	6	331191	331196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045813
5032	NC_008322	GCA	2	6	331231	331236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045813
5033	NC_008322	GAT	2	6	331360	331365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045813
5034	NC_008322	GCA	3	9	331384	331392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045813
5035	NC_008322	GC	3	6	331474	331479	0 %	0 %	50 %	50 %	114045813
5036	NC_008322	CCG	2	6	331625	331630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045813
5037	NC_008322	A	6	6	331782	331787	100 %	0 %	0 %	0 %	114045814
5038	NC_008322	GCA	2	6	331800	331805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045814
5039	NC_008322	TTA	2	6	331812	331817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114045814
5040	NC_008322	AAG	2	6	331849	331854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045814
5041	NC_008322	A	6	6	332092	332097	100 %	0 %	0 %	0 %	114045814
5042	NC_008322	GCG	2	6	332103	332108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045814
5043	NC_008322	GAA	2	6	332129	332134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045814
5044	NC_008322	ACA	2	6	332135	332140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114045814
5045	NC_008322	GAC	2	6	332154	332159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045814
5046	NC_008322	GC	3	6	332162	332167	0 %	0 %	50 %	50 %	114045814
5047	NC_008322	TTGT	2	8	332169	332176	0 %	75 %	25 %	0 %	114045814
5048	NC_008322	GTG	2	6	332298	332303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045814
5049	NC_008322	T	6	6	332965	332970	0 %	100 %	0 %	0 %	114045815
5050	NC_008322	GAAC	2	8	333019	333026	50 %	0 %	25 %	25 %	114045815
5051	NC_008322	ATC	2	6	333042	333047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045815
5052	NC_008322	CAA	2	6	333084	333089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114045816
5053	NC_008322	AAG	2	6	333111	333116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045816
5054	NC_008322	TTG	2	6	333124	333129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045816
5055	NC_008322	GTT	2	6	333132	333137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045816
5056	NC_008322	TTG	2	6	333154	333159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045816
5057	NC_008322	CTCA	2	8	333166	333173	25 %	25 %	0 %	50 %	114045816
5058	NC_008322	TTA	2	6	333495	333500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114045817
5059	NC_008322	GTG	2	6	333659	333664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045817
5060	NC_008322	CTG	2	6	333693	333698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045817
5061	NC_008322	GCA	2	6	333700	333705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045817
5062	NC_008322	CTC	2	6	333714	333719	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114045817
5063	NC_008322	GCG	2	6	333727	333732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045817
5064	NC_008322	TGGTG	2	10	333794	333803	0 %	40 %	60 %	0 %	114045817
5065	NC_008322	TTG	2	6	333804	333809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045817
5066	NC_008322	TGGT	2	8	333813	333820	0 %	50 %	50 %	0 %	114045817
5067	NC_008322	CGC	2	6	333934	333939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045817
5068	NC_008322	ACC	2	6	334068	334073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114045817
5069	NC_008322	GGC	2	6	334139	334144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045817
5070	NC_008322	CTCC	2	8	334168	334175	0 %	25 %	0 %	75 %	114045817
5071	NC_008322	GCT	2	6	334190	334195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045817
5072	NC_008322	CT	3	6	334240	334245	0 %	50 %	0 %	50 %	114045817
5073	NC_008322	GC	3	6	334252	334257	0 %	0 %	50 %	50 %	114045817
5074	NC_008322	GTT	2	6	334358	334363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045817
5075	NC_008322	GAT	2	6	334421	334426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045817
5076	NC_008322	GAT	2	6	334460	334465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045817
5077	NC_008322	TTG	2	6	334500	334505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045817
5078	NC_008322	CTG	2	6	334539	334544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045817
5079	NC_008322	TAT	2	6	334571	334576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114045817
5080	NC_008322	TTG	2	6	334662	334667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045817
5081	NC_008322	GCT	2	6	334762	334767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045817
5082	NC_008322	AGTT	2	8	334840	334847	25 %	50 %	25 %	0 %	114045817
5083	NC_008322	ATT	2	6	334904	334909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114045817
5084	NC_008322	AGC	2	6	335060	335065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045818
5085	NC_008322	CCA	2	6	335074	335079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114045818
5086	NC_008322	ACG	2	6	335141	335146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045818
5087	NC_008322	TTG	2	6	335204	335209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045818
5088	NC_008322	CTAT	2	8	335217	335224	25 %	50 %	0 %	25 %	114045818
5089	NC_008322	ATGA	2	8	335234	335241	50 %	25 %	25 %	0 %	114045818
5090	NC_008322	TG	3	6	335306	335311	0 %	50 %	50 %	0 %	114045818
5091	NC_008322	GGC	2	6	335314	335319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045818
5092	NC_008322	GCC	2	6	335360	335365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045818
5093	NC_008322	TAC	2	6	335849	335854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045819
5094	NC_008322	CGA	2	6	335955	335960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045819
5095	NC_008322	TGGGTC	2	12	335984	335995	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	114045819
5096	NC_008322	CAT	2	6	336115	336120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045819
5097	NC_008322	TCT	3	9	336159	336167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114045820
5098	NC_008322	GAG	2	6	336177	336182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114045820
5099	NC_008322	TTA	2	6	336200	336205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114045820
5100	NC_008322	TAT	2	6	336295	336300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114045820
5101	NC_008322	AGT	2	6	336326	336331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045820
5102	NC_008322	GCCC	2	8	336333	336340	0 %	0 %	25 %	75 %	114045820
5103	NC_008322	TAA	2	6	336367	336372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114045820
5104	NC_008322	GACC	2	8	336373	336380	25 %	0 %	25 %	50 %	114045820
5105	NC_008322	GTGG	2	8	336552	336559	0 %	25 %	75 %	0 %	114045820
5106	NC_008322	GGTG	2	8	336604	336611	0 %	25 %	75 %	0 %	114045820
5107	NC_008322	CAG	2	6	336635	336640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045820
5108	NC_008322	AGT	2	6	336818	336823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045820
5109	NC_008322	TGC	2	6	336880	336885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045820
5110	NC_008322	GTGG	2	8	336913	336920	0 %	25 %	75 %	0 %	114045820
5111	NC_008322	GAA	2	6	336938	336943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045820
5112	NC_008322	GGCT	2	8	336962	336969	0 %	25 %	50 %	25 %	114045820
5113	NC_008322	GCA	2	6	336976	336981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045820
5114	NC_008322	AAATA	2	10	337164	337173	80 %	20 %	0 %	0 %	114045821
5115	NC_008322	GTCA	2	8	337359	337366	25 %	25 %	25 %	25 %	114045821
5116	NC_008322	CAA	2	6	337426	337431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114045821
5117	NC_008322	AAG	2	6	337551	337556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045821
5118	NC_008322	GTCT	2	8	337602	337609	0 %	50 %	25 %	25 %	114045821
5119	NC_008322	GTG	2	6	337640	337645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045821
5120	NC_008322	GTG	2	6	337656	337661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045821
5121	NC_008322	TAC	2	6	337664	337669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045821
5122	NC_008322	GCG	2	6	337670	337675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045821
5123	NC_008322	CTG	2	6	337697	337702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045821
5124	NC_008322	GGT	2	6	337733	337738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045821
5125	NC_008322	GCG	2	6	337754	337759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045821
5126	NC_008322	TGC	2	6	337768	337773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045821
5127	NC_008322	AAC	2	6	337838	337843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114045821
5128	NC_008322	GAA	2	6	337853	337858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045821
5129	NC_008322	ATC	2	6	337904	337909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045821
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5131	NC_008322	GCT	2	6	338072	338077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045821
5132	NC_008322	CTG	2	6	338085	338090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045821
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5135	NC_008322	GTT	2	6	338322	338327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045822
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5140	NC_008322	TCG	2	6	338504	338509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045822
5141	NC_008322	GTTA	2	8	338515	338522	25 %	50 %	25 %	0 %	114045822
5142	NC_008322	ATC	2	6	338608	338613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045822
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5144	NC_008322	ATC	2	6	338684	338689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045822
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5147	NC_008322	TCC	2	6	338900	338905	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114045822
5148	NC_008322	CGG	2	6	338922	338927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045822
5149	NC_008322	ATG	2	6	338950	338955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045822
5150	NC_008322	GCA	2	6	338961	338966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045822
5151	NC_008322	AGTG	2	8	338980	338987	25 %	25 %	50 %	0 %	114045822
5152	NC_008322	CCGA	2	8	339127	339134	25 %	0 %	25 %	50 %	114045822
5153	NC_008322	CAT	2	6	339195	339200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045822
5154	NC_008322	ATC	2	6	339247	339252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045822
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5159	NC_008322	AGC	2	6	339419	339424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045822
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5164	NC_008322	TTG	2	6	339728	339733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045822
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5170	NC_008322	CGATA	2	10	340104	340113	40 %	20 %	20 %	20 %	114045822
5171	NC_008322	AAAG	2	8	340123	340130	75 %	0 %	25 %	0 %	114045822
5172	NC_008322	CAG	2	6	340141	340146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045822
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5189	NC_008322	GAGC	2	8	341251	341258	25 %	0 %	50 %	25 %	114045822
5190	NC_008322	TAG	2	6	341482	341487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045822
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5194	NC_008322	T	7	7	342035	342041	0 %	100 %	0 %	0 %	114045822
5195	NC_008322	TGT	2	6	342065	342070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045822
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5197	NC_008322	AATA	2	8	342230	342237	75 %	25 %	0 %	0 %	114045822
5198	NC_008322	GGCTA	2	10	342253	342262	20 %	20 %	40 %	20 %	114045822
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5201	NC_008322	GGTC	2	8	342396	342403	0 %	25 %	50 %	25 %	114045822
5202	NC_008322	AAT	2	6	342508	342513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114045822
5203	NC_008322	CTT	2	6	342675	342680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114045822
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5205	NC_008322	TAA	2	6	342762	342767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114045822
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5234	NC_008322	GCCT	2	8	344637	344644	0 %	25 %	25 %	50 %	161367435
5235	NC_008322	AC	3	6	344660	344665	50 %	0 %	0 %	50 %	161367435
5236	NC_008322	GCC	2	6	344749	344754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161367435
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5242	NC_008322	GCG	2	6	345171	345176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161367435
5243	NC_008322	GCC	2	6	345194	345199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161367435
5244	NC_008322	TGC	2	6	345291	345296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161367435
5245	NC_008322	CCA	2	6	345422	345427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161367435
5246	NC_008322	GCTT	2	8	345451	345458	0 %	50 %	25 %	25 %	161367435
5247	NC_008322	ATA	2	6	345500	345505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161367435
5248	NC_008322	CGG	2	6	345506	345511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161367435
5249	NC_008322	CTG	2	6	345540	345545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161367435
5250	NC_008322	GGT	2	6	345582	345587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161367435
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5252	NC_008322	CTT	2	6	345644	345649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161367435
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5264	NC_008322	GCCC	2	8	346349	346356	0 %	0 %	25 %	75 %	161367435
5265	NC_008322	GTCT	2	8	346574	346581	0 %	50 %	25 %	25 %	161367435
5266	NC_008322	ACC	2	6	346620	346625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161367435
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5271	NC_008322	GCT	2	6	347237	347242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045825
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5273	NC_008322	TTGG	2	8	347302	347309	0 %	50 %	50 %	0 %	114045825
5274	NC_008322	GAA	2	6	347340	347345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045825
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5277	NC_008322	ATC	2	6	347418	347423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045825
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5282	NC_008322	GCC	2	6	347610	347615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045825
5283	NC_008322	CA	4	8	347684	347691	50 %	0 %	0 %	50 %	114045825
5284	NC_008322	GCA	2	6	347789	347794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045825
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5292	NC_008322	TGA	2	6	348621	348626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045826
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5298	NC_008322	CGG	2	6	348967	348972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045826
5299	NC_008322	GAC	2	6	349004	349009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045826
5300	NC_008322	TTG	2	6	349014	349019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045826
5301	NC_008322	CGG	2	6	349066	349071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045826
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5311	NC_008322	CGA	2	6	349603	349608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045827
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5319	NC_008322	GCAG	2	8	350073	350080	25 %	0 %	50 %	25 %	114045827
5320	NC_008322	TGA	2	6	350089	350094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045827
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5323	NC_008322	TCG	2	6	350182	350187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045827
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5332	NC_008322	GT	3	6	350980	350985	0 %	50 %	50 %	0 %	114045828
5333	NC_008322	TG	4	8	351095	351102	0 %	50 %	50 %	0 %	114045829
5334	NC_008322	CTGT	2	8	351116	351123	0 %	50 %	25 %	25 %	114045829
5335	NC_008322	CAC	2	6	351274	351279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114045829
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5338	NC_008322	CCGC	2	8	351404	351411	0 %	0 %	25 %	75 %	114045829
5339	NC_008322	TGA	2	6	351492	351497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045829
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5351	NC_008322	CCAG	2	8	352059	352066	25 %	0 %	25 %	50 %	114045830
5352	NC_008322	GTTC	2	8	352099	352106	0 %	50 %	25 %	25 %	114045830
5353	NC_008322	GTA	2	6	352253	352258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045830
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5356	NC_008322	T	6	6	352364	352369	0 %	100 %	0 %	0 %	114045830
5357	NC_008322	TCA	2	6	352408	352413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045830
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5364	NC_008322	CAC	2	6	352880	352885	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114045830
5365	NC_008322	AAG	2	6	352893	352898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045830
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5389	NC_008322	CGG	2	6	354160	354165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045831
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5463	NC_008322	TGCT	2	8	358553	358560	0 %	50 %	25 %	25 %	114045835
5464	NC_008322	ACG	2	6	358839	358844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045836
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5480	NC_008322	CA	3	6	360362	360367	50 %	0 %	0 %	50 %	114045837
5481	NC_008322	GAA	2	6	360404	360409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045837
5482	NC_008322	GCC	2	6	360426	360431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045837
5483	NC_008322	ATA	2	6	360452	360457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114045837
5484	NC_008322	TCA	2	6	360463	360468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045837
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