MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella sp. MR-7 chromosome

Total Repeats: 72678

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_008322	ACT	2	6	298119	298124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045783
4502	NC_008322	GGT	2	6	298131	298136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045783
4503	NC_008322	GAA	2	6	298147	298152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045783
4504	NC_008322	TAT	2	6	298275	298280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114045783
4505	NC_008322	CTT	2	6	298302	298307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114045783
4506	NC_008322	AATA	2	8	298345	298352	75 %	25 %	0 %	0 %	114045783
4507	NC_008322	TCA	2	6	298362	298367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045783
4508	NC_008322	ATTGC	2	10	298432	298441	20 %	40 %	20 %	20 %	114045783
4509	NC_008322	CAG	2	6	298465	298470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045783
4510	NC_008322	GCA	2	6	298542	298547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045783
4511	NC_008322	CG	3	6	298739	298744	0 %	0 %	50 %	50 %	114045784
4512	NC_008322	CGG	2	6	298887	298892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045784
4513	NC_008322	GATT	2	8	299034	299041	25 %	50 %	25 %	0 %	114045784
4514	NC_008322	GTG	2	6	299090	299095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045784
4515	NC_008322	TGG	2	6	299106	299111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045784
4516	NC_008322	TCA	2	6	299138	299143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045784
4517	NC_008322	GTG	2	6	299236	299241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045784
4518	NC_008322	TTA	2	6	299264	299269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114045784
4519	NC_008322	ATT	2	6	299284	299289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114045784
4520	NC_008322	GTC	2	6	299302	299307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045784
4521	NC_008322	GT	3	6	299492	299497	0 %	50 %	50 %	0 %	114045784
4522	NC_008322	ATC	2	6	299548	299553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045784
4523	NC_008322	CCG	2	6	299562	299567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045784
4524	NC_008322	TAT	2	6	299637	299642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114045784
4525	NC_008322	CGG	2	6	299652	299657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045784
4526	NC_008322	TCT	2	6	299774	299779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114045784
4527	NC_008322	CTA	2	6	299816	299821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045784
4528	NC_008322	TGG	3	9	299826	299834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045784
4529	NC_008322	TCA	2	6	299876	299881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045784
4530	NC_008322	TCG	2	6	299972	299977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045784
4531	NC_008322	A	6	6	300079	300084	100 %	0 %	0 %	0 %	114045784
4532	NC_008322	CAC	2	6	300121	300126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114045784
4533	NC_008322	G	6	6	300160	300165	0 %	0 %	100 %	0 %	114045784
4534	NC_008322	CAA	2	6	300218	300223	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114045784
4535	NC_008322	GCGT	2	8	300437	300444	0 %	25 %	50 %	25 %	114045785
4536	NC_008322	TGG	2	6	300447	300452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045785
4537	NC_008322	ACG	2	6	300457	300462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045785
4538	NC_008322	GCA	2	6	300611	300616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045785
4539	NC_008322	GGCG	2	8	300627	300634	0 %	0 %	75 %	25 %	114045785
4540	NC_008322	GAA	2	6	300687	300692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045785
4541	NC_008322	A	6	6	300711	300716	100 %	0 %	0 %	0 %	114045785
4542	NC_008322	GAA	2	6	300738	300743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045785
4543	NC_008322	CCG	2	6	300830	300835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045785
4544	NC_008322	GAA	2	6	300888	300893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045785
4545	NC_008322	ACA	3	9	300941	300949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114045785
4546	NC_008322	GCC	2	6	300994	300999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045785
4547	NC_008322	GAT	3	9	301041	301049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045785
4548	NC_008322	GGA	2	6	301050	301055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114045785
4549	NC_008322	CAC	2	6	301062	301067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114045785
4550	NC_008322	AATATT	2	12	301071	301082	50 %	50 %	0 %	0 %	114045785
4551	NC_008322	GGC	2	6	301107	301112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045785
4552	NC_008322	TCG	2	6	301127	301132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045785
4553	NC_008322	GGC	2	6	301260	301265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045785
4554	NC_008322	GGGTT	2	10	301309	301318	0 %	40 %	60 %	0 %	114045785
4555	NC_008322	TCT	2	6	301330	301335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114045785
4556	NC_008322	A	6	6	301510	301515	100 %	0 %	0 %	0 %	114045785
4557	NC_008322	GTT	2	6	301849	301854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045786
4558	NC_008322	GTG	2	6	301877	301882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045786
4559	NC_008322	A	6	6	301899	301904	100 %	0 %	0 %	0 %	114045786
4560	NC_008322	GGC	2	6	301919	301924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045786
4561	NC_008322	TTGA	2	8	301964	301971	25 %	50 %	25 %	0 %	114045786
4562	NC_008322	TGG	2	6	302001	302006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045786
4563	NC_008322	AGCCT	2	10	302162	302171	20 %	20 %	20 %	40 %	114045786
4564	NC_008322	ATT	3	9	302539	302547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114045787
4565	NC_008322	ATT	2	6	302635	302640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114045787
4566	NC_008322	T	6	6	302698	302703	0 %	100 %	0 %	0 %	114045787
4567	NC_008322	CCG	2	6	302711	302716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045787
4568	NC_008322	GAT	2	6	302730	302735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045787
4569	NC_008322	CCG	2	6	302747	302752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045787
4570	NC_008322	CGT	2	6	302755	302760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045787
4571	NC_008322	GAT	2	6	302770	302775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045787
4572	NC_008322	GGT	2	6	302797	302802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045787
4573	NC_008322	AAG	2	6	302846	302851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045787
4574	NC_008322	GGC	2	6	302878	302883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045787
4575	NC_008322	ATT	2	6	302918	302923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114045787
4576	NC_008322	CGT	2	6	303016	303021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045787
4577	NC_008322	GCG	2	6	303025	303030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045787
4578	NC_008322	GGAT	2	8	303107	303114	25 %	25 %	50 %	0 %	114045787
4579	NC_008322	AGAT	2	8	303122	303129	50 %	25 %	25 %	0 %	114045787
4580	NC_008322	GATC	2	8	303141	303148	25 %	25 %	25 %	25 %	114045787
4581	NC_008322	CGA	2	6	303171	303176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045787
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4583	NC_008322	TGC	3	9	303290	303298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045787
4584	NC_008322	GC	3	6	303380	303385	0 %	0 %	50 %	50 %	114045787
4585	NC_008322	GTG	2	6	303413	303418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045787
4586	NC_008322	TG	3	6	303417	303422	0 %	50 %	50 %	0 %	114045787
4587	NC_008322	CGA	2	6	303453	303458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045787
4588	NC_008322	GATG	2	8	303459	303466	25 %	25 %	50 %	0 %	114045787
4589	NC_008322	CAT	2	6	303558	303563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045787
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4591	NC_008322	GGC	2	6	303712	303717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045787
4592	NC_008322	CGC	2	6	303852	303857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045787
4593	NC_008322	GCGT	2	8	303899	303906	0 %	25 %	50 %	25 %	114045787
4594	NC_008322	GGC	2	6	303964	303969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045787
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4596	NC_008322	GAT	2	6	304017	304022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045787
4597	NC_008322	TTATT	2	10	304110	304119	20 %	80 %	0 %	0 %	114045787
4598	NC_008322	CGAC	2	8	304136	304143	25 %	0 %	25 %	50 %	114045787
4599	NC_008322	CGA	2	6	304235	304240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045787
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4603	NC_008322	CGC	2	6	304324	304329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045787
4604	NC_008322	GCT	2	6	304341	304346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045787
4605	NC_008322	CAG	2	6	304361	304366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045787
4606	NC_008322	ATC	2	6	304375	304380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045787
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4608	NC_008322	AACG	2	8	304459	304466	50 %	0 %	25 %	25 %	114045787
4609	NC_008322	CAG	2	6	304627	304632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045787
4610	NC_008322	ATCAG	2	10	304692	304701	40 %	20 %	20 %	20 %	114045787
4611	NC_008322	CCA	2	6	304713	304718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114045787
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4616	NC_008322	CGC	2	6	305252	305257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045788
4617	NC_008322	CGA	2	6	305366	305371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045788
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4619	NC_008322	TGAG	2	8	305459	305466	25 %	25 %	50 %	0 %	114045788
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4621	NC_008322	T	6	6	305536	305541	0 %	100 %	0 %	0 %	114045788
4622	NC_008322	GGC	2	6	305565	305570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045788
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4743	NC_008322	AGTTG	2	10	313006	313015	20 %	40 %	40 %	0 %	114045794
4744	NC_008322	TTG	2	6	313017	313022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045794
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4851	NC_008322	AT	3	6	320235	320240	50 %	50 %	0 %	0 %	114045800
4852	NC_008322	AGA	2	6	320831	320836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045801
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4856	NC_008322	TGA	3	9	321098	321106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045801
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4858	NC_008322	CTG	2	6	321157	321162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045801
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4862	NC_008322	CGCC	2	8	321444	321451	0 %	0 %	25 %	75 %	114045802
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4866	NC_008322	CGA	2	6	321695	321700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045802
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4985	NC_008322	T	7	7	328861	328867	0 %	100 %	0 %	0 %	114045811
4986	NC_008322	TGGC	2	8	328925	328932	0 %	25 %	50 %	25 %	114045811
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4988	NC_008322	TTA	2	6	329029	329034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114045811
4989	NC_008322	TGG	2	6	329062	329067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045811
4990	NC_008322	ATT	2	6	329099	329104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114045811
4991	NC_008322	GGC	2	6	329153	329158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045811
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