MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Shewanella sp. MR-4 chromosome

Total Repeats: 8648

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008321	ATGG	2	8	175	182	25 %	25 %	50 %	0 %	113968347
2	NC_008321	CCGT	2	8	318	325	0 %	25 %	25 %	50 %	113968347
3	NC_008321	GATT	2	8	1122	1129	25 %	50 %	25 %	0 %	113968347
4	NC_008321	TAAC	2	8	1307	1314	50 %	25 %	0 %	25 %	113968347
5	NC_008321	TCAC	2	8	1598	1605	25 %	25 %	0 %	50 %	113968348
6	NC_008321	TCAT	2	8	1654	1661	25 %	50 %	0 %	25 %	113968348
7	NC_008321	TGAT	2	8	1894	1901	25 %	50 %	25 %	0 %	113968348
8	NC_008321	CGTT	2	8	1931	1938	0 %	50 %	25 %	25 %	113968348
9	NC_008321	CAAG	2	8	2270	2277	50 %	0 %	25 %	25 %	113968348
10	NC_008321	ATGT	2	8	2553	2560	25 %	50 %	25 %	0 %	113968348
11	NC_008321	TTAT	2	8	2823	2830	25 %	75 %	0 %	0 %	113968349
12	NC_008321	CGTT	2	8	2891	2898	0 %	50 %	25 %	25 %	113968349
13	NC_008321	GTAG	2	8	3521	3528	25 %	25 %	50 %	0 %	113968349
14	NC_008321	GAAT	2	8	4478	4485	50 %	25 %	25 %	0 %	113968350
15	NC_008321	GAAG	2	8	5984	5991	50 %	0 %	50 %	0 %	113968350
16	NC_008321	CTAT	2	8	6341	6348	25 %	50 %	0 %	25 %	113968351
17	NC_008321	CTGG	2	8	6418	6425	0 %	25 %	50 %	25 %	113968351
18	NC_008321	GAGC	2	8	6714	6721	25 %	0 %	50 %	25 %	113968351
19	NC_008321	ATTT	2	8	8683	8690	25 %	75 %	0 %	0 %	113968353
20	NC_008321	TCAC	2	8	8908	8915	25 %	25 %	0 %	50 %	113968353
21	NC_008321	TTGG	2	8	9112	9119	0 %	50 %	50 %	0 %	113968353
22	NC_008321	AATT	2	8	9498	9505	50 %	50 %	0 %	0 %	113968354
23	NC_008321	ATGC	2	8	10060	10067	25 %	25 %	25 %	25 %	113968354
24	NC_008321	GAAT	2	8	10827	10834	50 %	25 %	25 %	0 %	113968354
25	NC_008321	TGTC	2	8	10968	10975	0 %	50 %	25 %	25 %	113968354
26	NC_008321	AAGA	2	8	11219	11226	75 %	0 %	25 %	0 %	113968354
27	NC_008321	AAGT	2	8	11771	11778	50 %	25 %	25 %	0 %	113968355
28	NC_008321	GCAG	2	8	12838	12845	25 %	0 %	50 %	25 %	113968356
29	NC_008321	GAGC	2	8	13417	13424	25 %	0 %	50 %	25 %	113968357
30	NC_008321	CATA	2	8	13445	13452	50 %	25 %	0 %	25 %	113968357
31	NC_008321	GGTT	2	8	13738	13745	0 %	50 %	50 %	0 %	113968357
32	NC_008321	GAGT	2	8	13809	13816	25 %	25 %	50 %	0 %	113968357
33	NC_008321	GATT	2	8	15212	15219	25 %	50 %	25 %	0 %	113968357
34	NC_008321	CTGA	2	8	15564	15571	25 %	25 %	25 %	25 %	113968357
35	NC_008321	GGCT	2	8	15600	15607	0 %	25 %	50 %	25 %	113968357
36	NC_008321	CGAC	2	8	15724	15731	25 %	0 %	25 %	50 %	113968357
37	NC_008321	TGGC	2	8	16070	16077	0 %	25 %	50 %	25 %	113968357
38	NC_008321	ATTG	2	8	17652	17659	25 %	50 %	25 %	0 %	113968360
39	NC_008321	ATAA	2	8	17738	17745	75 %	25 %	0 %	0 %	113968360
40	NC_008321	AATC	2	8	18391	18398	50 %	25 %	0 %	25 %	113968360
41	NC_008321	TCCT	2	8	19165	19172	0 %	50 %	0 %	50 %	113968361
42	NC_008321	TTGC	2	8	19512	19519	0 %	50 %	25 %	25 %	113968362
43	NC_008321	GATG	2	8	20853	20860	25 %	25 %	50 %	0 %	113968363
44	NC_008321	TCTT	2	8	21516	21523	0 %	75 %	0 %	25 %	113968364
45	NC_008321	TTGA	2	8	22023	22030	25 %	50 %	25 %	0 %	113968364
46	NC_008321	TCAC	2	8	22065	22072	25 %	25 %	0 %	50 %	113968364
47	NC_008321	TTGC	2	8	23323	23330	0 %	50 %	25 %	25 %	113968364
48	NC_008321	ATTA	2	8	23902	23909	50 %	50 %	0 %	0 %	113968365
49	NC_008321	TACT	2	8	25217	25224	25 %	50 %	0 %	25 %	113968366
50	NC_008321	GCCA	2	8	25249	25256	25 %	0 %	25 %	50 %	113968366
51	NC_008321	GTGC	2	8	25444	25451	0 %	25 %	50 %	25 %	113968366
52	NC_008321	TGAA	2	8	25658	25665	50 %	25 %	25 %	0 %	113968366
53	NC_008321	TTAT	2	8	25932	25939	25 %	75 %	0 %	0 %	113968367
54	NC_008321	ATCT	2	8	26355	26362	25 %	50 %	0 %	25 %	113968367
55	NC_008321	TGGC	2	8	26394	26401	0 %	25 %	50 %	25 %	113968367
56	NC_008321	GCGG	2	8	26850	26857	0 %	0 %	75 %	25 %	113968367
57	NC_008321	GATT	2	8	27627	27634	25 %	50 %	25 %	0 %	113968368
58	NC_008321	GACC	2	8	27695	27702	25 %	0 %	25 %	50 %	113968368
59	NC_008321	AAAG	2	8	29022	29029	75 %	0 %	25 %	0 %	113968371
60	NC_008321	ATAA	2	8	31475	31482	75 %	25 %	0 %	0 %	113968372
61	NC_008321	GGCA	2	8	31563	31570	25 %	0 %	50 %	25 %	113968372
62	NC_008321	CACC	2	8	31749	31756	25 %	0 %	0 %	75 %	113968372
63	NC_008321	CTCA	2	8	32548	32555	25 %	25 %	0 %	50 %	113968373
64	NC_008321	TTAA	2	8	32678	32685	50 %	50 %	0 %	0 %	113968373
65	NC_008321	ACAA	2	8	34319	34326	75 %	0 %	0 %	25 %	113968375
66	NC_008321	GTAT	2	8	35247	35254	25 %	50 %	25 %	0 %	113968376
67	NC_008321	AATT	2	8	35805	35812	50 %	50 %	0 %	0 %	113968376
68	NC_008321	GTTT	2	8	36076	36083	0 %	75 %	25 %	0 %	113968377
69	NC_008321	TTAT	2	8	36139	36146	25 %	75 %	0 %	0 %	113968377
70	NC_008321	TCTT	2	8	36501	36508	0 %	75 %	0 %	25 %	113968377
71	NC_008321	ACTC	2	8	37034	37041	25 %	25 %	0 %	50 %	113968378
72	NC_008321	TTGG	2	8	37082	37089	0 %	50 %	50 %	0 %	113968378
73	NC_008321	AGGA	2	8	37108	37115	50 %	0 %	50 %	0 %	113968378
74	NC_008321	CATT	2	8	37146	37153	25 %	50 %	0 %	25 %	113968378
75	NC_008321	GCCT	2	8	37289	37296	0 %	25 %	25 %	50 %	113968378
76	NC_008321	GCAC	2	8	37585	37592	25 %	0 %	25 %	50 %	113968379
77	NC_008321	GCGA	2	8	38420	38427	25 %	0 %	50 %	25 %	113968380
78	NC_008321	GCAA	2	8	38931	38938	50 %	0 %	25 %	25 %	113968381
79	NC_008321	ATAG	2	8	39827	39834	50 %	25 %	25 %	0 %	113968382
80	NC_008321	AGCC	2	8	39990	39997	25 %	0 %	25 %	50 %	113968382
81	NC_008321	TGAT	2	8	41145	41152	25 %	50 %	25 %	0 %	113968383
82	NC_008321	TACA	2	8	42111	42118	50 %	25 %	0 %	25 %	113968385
83	NC_008321	GGAT	2	8	42136	42143	25 %	25 %	50 %	0 %	113968385
84	NC_008321	AGCG	2	8	48688	48695	25 %	0 %	50 %	25 %	113968387
85	NC_008321	GATT	2	8	48745	48752	25 %	50 %	25 %	0 %	113968387
86	NC_008321	GTTT	2	8	49014	49021	0 %	75 %	25 %	0 %	113968388
87	NC_008321	CCAC	2	8	52306	52313	25 %	0 %	0 %	75 %	113968390
88	NC_008321	TCAG	2	8	52726	52733	25 %	25 %	25 %	25 %	113968390
89	NC_008321	TGGG	2	8	53932	53939	0 %	25 %	75 %	0 %	113968391
90	NC_008321	TTTG	2	8	53940	53947	0 %	75 %	25 %	0 %	113968391
91	NC_008321	GGCA	2	8	54275	54282	25 %	0 %	50 %	25 %	113968391
92	NC_008321	TTTC	2	8	54646	54653	0 %	75 %	0 %	25 %	113968392
93	NC_008321	CTGA	2	8	54849	54856	25 %	25 %	25 %	25 %	113968392
94	NC_008321	CTCA	2	8	54868	54875	25 %	25 %	0 %	50 %	113968392
95	NC_008321	GTAG	2	8	54924	54931	25 %	25 %	50 %	0 %	113968392
96	NC_008321	CGCT	2	8	55190	55197	0 %	25 %	25 %	50 %	113968393
97	NC_008321	AGGC	2	8	56733	56740	25 %	0 %	50 %	25 %	113968394
98	NC_008321	AATC	2	8	57085	57092	50 %	25 %	0 %	25 %	113968394
99	NC_008321	AATG	2	8	57301	57308	50 %	25 %	25 %	0 %	113968394
100	NC_008321	GATG	2	8	57424	57431	25 %	25 %	50 %	0 %	113968394
101	NC_008321	GGTT	2	8	57437	57444	0 %	50 %	50 %	0 %	113968394
102	NC_008321	TTGT	2	8	58323	58330	0 %	75 %	25 %	0 %	113968395
103	NC_008321	TATG	2	8	58497	58504	25 %	50 %	25 %	0 %	113968395
104	NC_008321	AATG	2	8	58620	58627	50 %	25 %	25 %	0 %	113968395
105	NC_008321	GGAA	2	8	59270	59277	50 %	0 %	50 %	0 %	113968395
106	NC_008321	GAGC	2	8	59366	59373	25 %	0 %	50 %	25 %	113968395
107	NC_008321	ATAA	2	8	59623	59630	75 %	25 %	0 %	0 %	113968395
108	NC_008321	GCCA	2	8	60082	60089	25 %	0 %	25 %	50 %	113968396
109	NC_008321	AATA	2	8	60567	60574	75 %	25 %	0 %	0 %	113968396
110	NC_008321	AAGC	2	8	61071	61078	50 %	0 %	25 %	25 %	113968396
111	NC_008321	GGGC	2	8	61947	61954	0 %	0 %	75 %	25 %	113968398
112	NC_008321	TGGG	2	8	62130	62137	0 %	25 %	75 %	0 %	113968398
113	NC_008321	CAGC	2	8	62196	62203	25 %	0 %	25 %	50 %	113968398
114	NC_008321	TCAA	2	8	62953	62960	50 %	25 %	0 %	25 %	113968399
115	NC_008321	ATCA	2	8	63573	63580	50 %	25 %	0 %	25 %	113968399
116	NC_008321	TGCG	2	8	63634	63641	0 %	25 %	50 %	25 %	113968399
117	NC_008321	GCTT	2	8	64302	64309	0 %	50 %	25 %	25 %	113968400
118	NC_008321	CAAT	2	8	64324	64331	50 %	25 %	0 %	25 %	113968400
119	NC_008321	CGCC	2	8	64345	64352	0 %	0 %	25 %	75 %	113968400
120	NC_008321	GCAT	2	8	64440	64447	25 %	25 %	25 %	25 %	113968400
121	NC_008321	CATT	2	8	64621	64628	25 %	50 %	0 %	25 %	113968400
122	NC_008321	TGAT	2	8	65623	65630	25 %	50 %	25 %	0 %	113968401
123	NC_008321	ATGG	2	8	65631	65638	25 %	25 %	50 %	0 %	113968401
124	NC_008321	TGAT	2	8	66553	66560	25 %	50 %	25 %	0 %	113968401
125	NC_008321	CGTG	2	8	66788	66795	0 %	25 %	50 %	25 %	113968401
126	NC_008321	TTTA	2	8	66955	66962	25 %	75 %	0 %	0 %	113968401
127	NC_008321	ACCG	2	8	67490	67497	25 %	0 %	25 %	50 %	113968402
128	NC_008321	GCGT	2	8	68039	68046	0 %	25 %	50 %	25 %	113968403
129	NC_008321	GTGA	2	8	68800	68807	25 %	25 %	50 %	0 %	113968403
130	NC_008321	GAAA	2	8	69724	69731	75 %	0 %	25 %	0 %	113968404
131	NC_008321	GCGG	2	8	70640	70647	0 %	0 %	75 %	25 %	113968405
132	NC_008321	GTCG	2	8	71258	71265	0 %	25 %	50 %	25 %	113968406
133	NC_008321	GCAC	2	8	71389	71396	25 %	0 %	25 %	50 %	113968406
134	NC_008321	GGCT	2	8	71766	71773	0 %	25 %	50 %	25 %	113968407
135	NC_008321	GGTC	2	8	72446	72453	0 %	25 %	50 %	25 %	113968407
136	NC_008321	CTCG	2	8	73973	73980	0 %	25 %	25 %	50 %	113968408
137	NC_008321	TGAG	2	8	74181	74188	25 %	25 %	50 %	0 %	113968409
138	NC_008321	CCAT	2	8	74745	74752	25 %	25 %	0 %	50 %	113968409
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140	NC_008321	GATA	2	8	75256	75263	50 %	25 %	25 %	0 %	113968409
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