MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella sp. MR-4 chromosome

Total Repeats: 71525

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_008321	GC	3	6	269699	269704	0 %	0 %	50 %	50 %	113968595
4002	NC_008321	GTT	2	6	269721	269726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968595
4003	NC_008321	ATC	2	6	269831	269836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968595
4004	NC_008321	CAG	2	6	270343	270348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968596
4005	NC_008321	CG	3	6	270407	270412	0 %	0 %	50 %	50 %	113968596
4006	NC_008321	GCA	2	6	270451	270456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968596
4007	NC_008321	CAG	2	6	270647	270652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968596
4008	NC_008321	CGGT	2	8	270696	270703	0 %	25 %	50 %	25 %	113968596
4009	NC_008321	GCCAGT	2	12	270732	270743	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	113968596
4010	NC_008321	TTC	2	6	270810	270815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968596
4011	NC_008321	AGC	2	6	271032	271037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968596
4012	NC_008321	AGA	3	9	271051	271059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968596
4013	NC_008321	ATA	2	6	271100	271105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113968596
4014	NC_008321	TGA	2	6	271161	271166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968596
4015	NC_008321	GTT	2	6	271174	271179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968596
4016	NC_008321	TTC	2	6	271181	271186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968596
4017	NC_008321	TCA	2	6	271192	271197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968596
4018	NC_008321	GCG	2	6	271310	271315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968596
4019	NC_008321	GCG	2	6	271390	271395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968596
4020	NC_008321	GCA	2	6	271423	271428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968596
4021	NC_008321	ATAA	2	8	271494	271501	75 %	25 %	0 %	0 %	113968596
4022	NC_008321	T	6	6	271600	271605	0 %	100 %	0 %	0 %	113968597
4023	NC_008321	T	6	6	271654	271659	0 %	100 %	0 %	0 %	113968597
4024	NC_008321	CTT	2	6	271683	271688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968597
4025	NC_008321	TCA	2	6	271692	271697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968597
4026	NC_008321	GT	3	6	271719	271724	0 %	50 %	50 %	0 %	113968597
4027	NC_008321	GCA	2	6	271725	271730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968597
4028	NC_008321	ATA	2	6	271754	271759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113968597
4029	NC_008321	GCT	2	6	271761	271766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968597
4030	NC_008321	GCG	2	6	271861	271866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968597
4031	NC_008321	AAT	2	6	271867	271872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113968597
4032	NC_008321	TCAGCA	2	12	271980	271991	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	113968597
4033	NC_008321	GTTT	2	8	271997	272004	0 %	75 %	25 %	0 %	113968597
4034	NC_008321	GCA	2	6	272049	272054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968597
4035	NC_008321	AGATC	2	10	272067	272076	40 %	20 %	20 %	20 %	113968597
4036	NC_008321	TTCGAG	2	12	272143	272154	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	113968597
4037	NC_008321	ATC	3	9	272185	272193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968597
4038	NC_008321	TAA	2	6	272197	272202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113968597
4039	NC_008321	ATG	2	6	272561	272566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968598
4040	NC_008321	ACA	2	6	272630	272635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113968598
4041	NC_008321	ATC	2	6	272664	272669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968598
4042	NC_008321	CGC	2	6	272794	272799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968598
4043	NC_008321	ATGC	2	8	272852	272859	25 %	25 %	25 %	25 %	113968598
4044	NC_008321	CAG	2	6	272915	272920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968598
4045	NC_008321	CAA	2	6	272993	272998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113968598
4046	NC_008321	TTA	3	9	273176	273184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113968599
4047	NC_008321	ATC	2	6	273268	273273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968599
4048	NC_008321	CTG	3	9	273394	273402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968599
4049	NC_008321	GTG	3	9	273460	273468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968599
4050	NC_008321	GGC	2	6	273525	273530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968599
4051	NC_008321	TGG	3	9	273631	273639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968599
4052	NC_008321	GCT	2	6	273720	273725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968599
4053	NC_008321	CAAG	2	8	273774	273781	50 %	0 %	25 %	25 %	113968599
4054	NC_008321	ACGC	2	8	273810	273817	25 %	0 %	25 %	50 %	113968599
4055	NC_008321	TAC	2	6	273903	273908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968599
4056	NC_008321	GCC	2	6	273925	273930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968599
4057	NC_008321	ATT	2	6	273949	273954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113968599
4058	NC_008321	ATC	2	6	273996	274001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968599
4059	NC_008321	GCA	2	6	274053	274058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968600
4060	NC_008321	ATC	2	6	274103	274108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968600
4061	NC_008321	ATC	2	6	274199	274204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968600
4062	NC_008321	GAGC	2	8	274218	274225	25 %	0 %	50 %	25 %	113968600
4063	NC_008321	TAT	2	6	274246	274251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113968600
4064	NC_008321	CCATT	2	10	274262	274271	20 %	40 %	0 %	40 %	113968600
4065	NC_008321	TTG	2	6	274312	274317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968600
4066	NC_008321	TTG	2	6	274364	274369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968600
4067	NC_008321	CGT	2	6	274390	274395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968600
4068	NC_008321	TCC	2	6	274418	274423	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113968600
4069	NC_008321	AGT	2	6	274440	274445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968600
4070	NC_008321	A	6	6	274643	274648	100 %	0 %	0 %	0 %	113968601
4071	NC_008321	TAT	2	6	274671	274676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113968601
4072	NC_008321	TAG	2	6	274683	274688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968601
4073	NC_008321	ATA	2	6	274713	274718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113968601
4074	NC_008321	TGA	2	6	274768	274773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968601
4075	NC_008321	GGT	2	6	274805	274810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968601
4076	NC_008321	TGGTT	2	10	274826	274835	0 %	60 %	40 %	0 %	113968601
4077	NC_008321	T	7	7	274846	274852	0 %	100 %	0 %	0 %	113968601
4078	NC_008321	TGC	2	6	275053	275058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968601
4079	NC_008321	CAC	2	6	275098	275103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113968601
4080	NC_008321	GAT	2	6	275261	275266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968602
4081	NC_008321	TTC	2	6	275307	275312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968602
4082	NC_008321	CTT	2	6	275334	275339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968602
4083	NC_008321	TAA	2	6	275410	275415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113968602
4084	NC_008321	GGC	2	6	275638	275643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968602
4085	NC_008321	GCG	2	6	275687	275692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968602
4086	NC_008321	GCG	2	6	275745	275750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968602
4087	NC_008321	AAT	2	6	275845	275850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113968602
4088	NC_008321	GCC	2	6	275878	275883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968602
4089	NC_008321	GCC	2	6	275974	275979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968602
4090	NC_008321	TGC	2	6	276013	276018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968602
4091	NC_008321	GCC	2	6	276080	276085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968602
4092	NC_008321	TACCCG	2	12	276156	276167	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	113968602
4093	NC_008321	CCT	2	6	276228	276233	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113968602
4094	NC_008321	GGCG	2	8	276238	276245	0 %	0 %	75 %	25 %	113968602
4095	NC_008321	GC	3	6	276326	276331	0 %	0 %	50 %	50 %	113968602
4096	NC_008321	CGA	2	6	276333	276338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968602
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4098	NC_008321	ATG	3	9	276437	276445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968602
4099	NC_008321	TCG	2	6	276647	276652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968602
4100	NC_008321	ATT	2	6	276718	276723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113968603
4101	NC_008321	TGG	2	6	276893	276898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968603
4102	NC_008321	TGCG	2	8	276975	276982	0 %	25 %	50 %	25 %	113968603
4103	NC_008321	CAC	2	6	277000	277005	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113968603
4104	NC_008321	TG	3	6	277007	277012	0 %	50 %	50 %	0 %	113968603
4105	NC_008321	TGC	2	6	277056	277061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968603
4106	NC_008321	TGG	2	6	277126	277131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968603
4107	NC_008321	CCA	2	6	277144	277149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113968603
4108	NC_008321	CAC	2	6	277166	277171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113968603
4109	NC_008321	TGA	2	6	277173	277178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968603
4110	NC_008321	TGT	2	6	277180	277185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968603
4111	NC_008321	GTTGG	2	10	277195	277204	0 %	40 %	60 %	0 %	113968603
4112	NC_008321	GAT	2	6	277259	277264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968603
4113	NC_008321	GCGCC	2	10	277318	277327	0 %	0 %	40 %	60 %	113968603
4114	NC_008321	GCC	2	6	277386	277391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968603
4115	NC_008321	TGG	2	6	277419	277424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968603
4116	NC_008321	GTT	2	6	277432	277437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968603
4117	NC_008321	ATG	2	6	277511	277516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968603
4118	NC_008321	GCT	2	6	277669	277674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968603
4119	NC_008321	CTG	2	6	277675	277680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968603
4120	NC_008321	AGC	2	6	277746	277751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968603
4121	NC_008321	CGC	2	6	277926	277931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968604
4122	NC_008321	TGA	2	6	277933	277938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968604
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4126	NC_008321	TGA	2	6	278189	278194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968604
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4129	NC_008321	TGGGG	2	10	278306	278315	0 %	20 %	80 %	0 %	113968604
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4142	NC_008321	TCAA	2	8	279181	279188	50 %	25 %	0 %	25 %	113968605
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4146	NC_008321	AGCTT	2	10	279376	279385	20 %	40 %	20 %	20 %	113968605
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4150	NC_008321	CCGCAG	2	12	279527	279538	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	113968605
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4152	NC_008321	ATCA	2	8	279555	279562	50 %	25 %	0 %	25 %	113968605
4153	NC_008321	ACC	3	9	279567	279575	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113968605
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4158	NC_008321	GCT	2	6	280054	280059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968606
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4232	NC_008321	AAAT	2	8	288433	288440	75 %	25 %	0 %	0 %	113968612
4233	NC_008321	AAC	2	6	288470	288475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113968612
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4237	NC_008321	A	6	6	289077	289082	100 %	0 %	0 %	0 %	113968612
4238	NC_008321	TGC	2	6	289232	289237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968612
4239	NC_008321	CTG	2	6	289351	289356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968612
4240	NC_008321	AGCG	2	8	289369	289376	25 %	0 %	50 %	25 %	113968612
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4463	NC_008321	TGG	2	6	303954	303959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968628
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4466	NC_008321	GCA	2	6	304017	304022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968628
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4470	NC_008321	T	7	7	304142	304148	0 %	100 %	0 %	0 %	113968628
4471	NC_008321	ATTTTG	2	12	304232	304243	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	113968628
4472	NC_008321	ATC	2	6	304271	304276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968628
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4475	NC_008321	GAA	2	6	304387	304392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968628
4476	NC_008321	GAT	2	6	304405	304410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968628
4477	NC_008321	AGT	2	6	304479	304484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968628
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4479	NC_008321	GCG	2	6	304586	304591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968628
4480	NC_008321	TGC	2	6	304623	304628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968628
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4482	NC_008321	AT	3	6	304689	304694	50 %	50 %	0 %	0 %	113968628
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4484	NC_008321	GCAG	2	8	304860	304867	25 %	0 %	50 %	25 %	113968628
4485	NC_008321	AAAT	2	8	305100	305107	75 %	25 %	0 %	0 %	113968629
4486	NC_008321	TCA	2	6	305117	305122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968629
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4488	NC_008321	GTGTT	2	10	305194	305203	0 %	60 %	40 %	0 %	113968629
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