MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella sp. MR-4 chromosome

Total Repeats: 71525

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_008321	AGT	2	6	234326	234331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968553
3502	NC_008321	GCG	2	6	234563	234568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968554
3503	NC_008321	TCG	2	6	234609	234614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968554
3504	NC_008321	CAT	2	6	234633	234638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968554
3505	NC_008321	AAG	2	6	234653	234658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968554
3506	NC_008321	GAA	2	6	234678	234683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968554
3507	NC_008321	GGT	2	6	234702	234707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968554
3508	NC_008321	CGT	2	6	234730	234735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968554
3509	NC_008321	GCA	2	6	234769	234774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968554
3510	NC_008321	TTC	2	6	234776	234781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968554
3511	NC_008321	AAC	3	9	234784	234792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113968554
3512	NC_008321	CGT	2	6	234918	234923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968555
3513	NC_008321	TTG	2	6	235006	235011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968555
3514	NC_008321	GGT	2	6	235068	235073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968555
3515	NC_008321	TTG	2	6	235075	235080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968555
3516	NC_008321	AGAA	2	8	235081	235088	75 %	0 %	25 %	0 %	113968555
3517	NC_008321	A	6	6	235173	235178	100 %	0 %	0 %	0 %	113968555
3518	NC_008321	TTC	2	6	235185	235190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968555
3519	NC_008321	TGT	2	6	235262	235267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968556
3520	NC_008321	A	6	6	235368	235373	100 %	0 %	0 %	0 %	113968556
3521	NC_008321	AGT	2	6	235424	235429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968556
3522	NC_008321	GCGT	2	8	235621	235628	0 %	25 %	50 %	25 %	113968556
3523	NC_008321	GAA	2	6	235719	235724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968556
3524	NC_008321	GC	3	6	235848	235853	0 %	0 %	50 %	50 %	113968557
3525	NC_008321	ATT	2	6	235867	235872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113968557
3526	NC_008321	CTT	2	6	235883	235888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968557
3527	NC_008321	GTG	2	6	236048	236053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968557
3528	NC_008321	GCT	2	6	236164	236169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968558
3529	NC_008321	AGA	2	6	236232	236237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968558
3530	NC_008321	AAGCC	2	10	236270	236279	40 %	0 %	20 %	40 %	113968558
3531	NC_008321	TGA	2	6	236438	236443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968558
3532	NC_008321	GCC	2	6	236452	236457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968558
3533	NC_008321	CAA	2	6	236623	236628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113968559
3534	NC_008321	TGT	2	6	236638	236643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968559
3535	NC_008321	TTCC	2	8	236666	236673	0 %	50 %	0 %	50 %	113968559
3536	NC_008321	ACA	2	6	236730	236735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113968559
3537	NC_008321	GTT	2	6	236738	236743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968559
3538	NC_008321	AAGTTA	2	12	236768	236779	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	113968559
3539	NC_008321	TCG	2	6	236805	236810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968559
3540	NC_008321	TC	3	6	236838	236843	0 %	50 %	0 %	50 %	113968559
3541	NC_008321	GCT	2	6	236945	236950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968559
3542	NC_008321	CCA	2	6	236969	236974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113968559
3543	NC_008321	GAC	2	6	237005	237010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968559
3544	NC_008321	GAA	2	6	237011	237016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968559
3545	NC_008321	AAG	3	9	237035	237043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968559
3546	NC_008321	AAG	2	6	237102	237107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968560
3547	NC_008321	GGT	2	6	237191	237196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968560
3548	NC_008321	GCT	2	6	237201	237206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968560
3549	NC_008321	TTG	2	6	237283	237288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968560
3550	NC_008321	GC	3	6	237293	237298	0 %	0 %	50 %	50 %	113968560
3551	NC_008321	GCT	2	6	237363	237368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968560
3552	NC_008321	TGC	2	6	237377	237382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968560
3553	NC_008321	ATTG	2	8	237464	237471	25 %	50 %	25 %	0 %	113968561
3554	NC_008321	AGT	2	6	237491	237496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968561
3555	NC_008321	AGT	2	6	237533	237538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968561
3556	NC_008321	ATGGTA	2	12	237544	237555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968561
3557	NC_008321	GGCTAT	2	12	237561	237572	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	113968561
3558	NC_008321	GC	3	6	237579	237584	0 %	0 %	50 %	50 %	113968561
3559	NC_008321	CAG	2	6	237592	237597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968561
3560	NC_008321	CGT	2	6	237624	237629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968561
3561	NC_008321	GTTGA	2	10	237642	237651	20 %	40 %	40 %	0 %	113968561
3562	NC_008321	GTC	2	6	237682	237687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968561
3563	NC_008321	TAT	2	6	237734	237739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113968561
3564	NC_008321	CG	3	6	237834	237839	0 %	0 %	50 %	50 %	113968561
3565	NC_008321	CTA	2	6	237934	237939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968562
3566	NC_008321	CG	3	6	237993	237998	0 %	0 %	50 %	50 %	113968562
3567	NC_008321	AGA	2	6	238046	238051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968562
3568	NC_008321	CAA	2	6	238076	238081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113968562
3569	NC_008321	CTA	2	6	238085	238090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968562
3570	NC_008321	GGA	2	6	238103	238108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113968562
3571	NC_008321	GCGGTG	2	12	238240	238251	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	113968563
3572	NC_008321	GGT	2	6	238269	238274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968563
3573	NC_008321	TCGCG	2	10	238317	238326	0 %	20 %	40 %	40 %	113968563
3574	NC_008321	TTA	2	6	238414	238419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113968563
3575	NC_008321	GCA	2	6	238512	238517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968563
3576	NC_008321	GCT	2	6	238524	238529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968563
3577	NC_008321	AAT	2	6	238546	238551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113968563
3578	NC_008321	CCT	2	6	238620	238625	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113968564
3579	NC_008321	GTG	2	6	238760	238765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968564
3580	NC_008321	TGT	2	6	238842	238847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968564
3581	NC_008321	A	6	6	238870	238875	100 %	0 %	0 %	0 %	113968564
3582	NC_008321	A	7	7	238894	238900	100 %	0 %	0 %	0 %	113968564
3583	NC_008321	TCAG	2	8	238901	238908	25 %	25 %	25 %	25 %	113968564
3584	NC_008321	AC	3	6	238910	238915	50 %	0 %	0 %	50 %	113968564
3585	NC_008321	TTG	2	6	239132	239137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968564
3586	NC_008321	TTG	3	9	239206	239214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968564
3587	NC_008321	ATT	2	6	239224	239229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113968564
3588	NC_008321	GTG	2	6	239248	239253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968564
3589	NC_008321	CGT	2	6	239272	239277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968564
3590	NC_008321	GTT	2	6	239281	239286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968564
3591	NC_008321	CAT	2	6	239394	239399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968564
3592	NC_008321	ATT	2	6	239502	239507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113968564
3593	NC_008321	GCA	2	6	239512	239517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968564
3594	NC_008321	TCT	3	9	239525	239533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968564
3595	NC_008321	TCT	2	6	239537	239542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968564
3596	NC_008321	CAG	2	6	239573	239578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968564
3597	NC_008321	GAA	2	6	239586	239591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968564
3598	NC_008321	GTG	2	6	239594	239599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968564
3599	NC_008321	ACT	2	6	239763	239768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968564
3600	NC_008321	ATG	2	6	239818	239823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968564
3601	NC_008321	TGA	2	6	239843	239848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968564
3602	NC_008321	GAA	2	6	239940	239945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968565
3603	NC_008321	GAA	2	6	240320	240325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968566
3604	NC_008321	TAG	2	6	240339	240344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968566
3605	NC_008321	CGT	2	6	240356	240361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968566
3606	NC_008321	GTT	2	6	240399	240404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968566
3607	NC_008321	TCG	2	6	240421	240426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968566
3608	NC_008321	GCCT	2	8	240429	240436	0 %	25 %	25 %	50 %	113968566
3609	NC_008321	AAG	2	6	240497	240502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968566
3610	NC_008321	CGTA	2	8	240555	240562	25 %	25 %	25 %	25 %	113968567
3611	NC_008321	ATGGC	2	10	240575	240584	20 %	20 %	40 %	20 %	113968567
3612	NC_008321	CTT	2	6	240596	240601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968567
3613	NC_008321	CAA	2	6	240603	240608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113968567
3614	NC_008321	GGT	2	6	240664	240669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968567
3615	NC_008321	TGC	2	6	240705	240710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968567
3616	NC_008321	GCT	2	6	240718	240723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968567
3617	NC_008321	TGC	3	9	240735	240743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968567
3618	NC_008321	A	6	6	240759	240764	100 %	0 %	0 %	0 %	113968567
3619	NC_008321	GTCCAG	2	12	240785	240796	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	113968567
3620	NC_008321	GTC	2	6	240884	240889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968567
3621	NC_008321	CGT	2	6	240901	240906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968567
3622	NC_008321	CAAGCT	2	12	240964	240975	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	113968568
3623	NC_008321	GCC	2	6	240978	240983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968568
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3633	NC_008321	GTC	2	6	241732	241737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968569
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3850	NC_008321	GT	3	6	260101	260106	0 %	50 %	50 %	0 %	113968584
3851	NC_008321	AGT	2	6	260229	260234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968584
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3861	NC_008321	GCA	2	6	260910	260915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968585
3862	NC_008321	GCA	2	6	261006	261011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968585
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3974	NC_008321	CG	4	8	268358	268365	0 %	0 %	50 %	50 %	113968595
3975	NC_008321	AAACAT	2	12	268372	268383	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	113968595
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3978	NC_008321	G	6	6	268508	268513	0 %	0 %	100 %	0 %	113968595
3979	NC_008321	AGC	2	6	268643	268648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968595
3980	NC_008321	T	6	6	268694	268699	0 %	100 %	0 %	0 %	113968595
3981	NC_008321	AGC	3	9	268742	268750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968595
3982	NC_008321	GCA	2	6	268758	268763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968595
3983	NC_008321	GCA	2	6	268791	268796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968595
3984	NC_008321	GCT	2	6	268809	268814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968595
3985	NC_008321	ATCGA	2	10	268838	268847	40 %	20 %	20 %	20 %	113968595
3986	NC_008321	CAG	2	6	268902	268907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968595
3987	NC_008321	CTG	2	6	268948	268953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968595
3988	NC_008321	G	6	6	269013	269018	0 %	0 %	100 %	0 %	113968595
3989	NC_008321	GCA	2	6	269157	269162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968595
3990	NC_008321	CGC	2	6	269263	269268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968595
3991	NC_008321	GC	3	6	269267	269272	0 %	0 %	50 %	50 %	113968595
3992	NC_008321	TGG	2	6	269279	269284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968595
3993	NC_008321	GCC	2	6	269296	269301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968595
3994	NC_008321	CTG	2	6	269306	269311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968595
3995	NC_008321	AGTT	2	8	269312	269319	25 %	50 %	25 %	0 %	113968595
3996	NC_008321	GGC	2	6	269445	269450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968595
3997	NC_008321	ATC	2	6	269533	269538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968595
3998	NC_008321	TGG	2	6	269567	269572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968595
3999	NC_008321	CAT	2	6	269664	269669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968595
4000	NC_008321	CCG	2	6	269682	269687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968595

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