MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella sp. MR-4 chromosome

Total Repeats: 71525

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_008321	TGC	2	6	168774	168779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968494
2502	NC_008321	CAGT	2	8	168794	168801	25 %	25 %	25 %	25 %	113968494
2503	NC_008321	GCG	2	6	168956	168961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968494
2504	NC_008321	GCC	2	6	168977	168982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968494
2505	NC_008321	CAG	2	6	169033	169038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968494
2506	NC_008321	TAAA	2	8	169083	169090	75 %	25 %	0 %	0 %	113968494
2507	NC_008321	ATC	2	6	169181	169186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968494
2508	NC_008321	GGGCA	2	10	169243	169252	20 %	0 %	60 %	20 %	113968494
2509	NC_008321	GCC	2	6	169264	169269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968494
2510	NC_008321	GTG	2	6	169271	169276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968494
2511	NC_008321	GCG	2	6	169292	169297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968494
2512	NC_008321	GTG	2	6	169424	169429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968494
2513	NC_008321	AGC	2	6	169446	169451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968494
2514	NC_008321	TGACC	2	10	169509	169518	20 %	20 %	20 %	40 %	113968494
2515	NC_008321	CGT	2	6	169561	169566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968494
2516	NC_008321	GGT	2	6	169567	169572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968494
2517	NC_008321	TGG	2	6	169614	169619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968494
2518	NC_008321	AG	3	6	169630	169635	50 %	0 %	50 %	0 %	113968494
2519	NC_008321	GTT	2	6	170079	170084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968495
2520	NC_008321	CGA	2	6	170106	170111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968495
2521	NC_008321	GGC	2	6	170134	170139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968495
2522	NC_008321	ATT	2	6	170149	170154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113968495
2523	NC_008321	TAT	2	6	170218	170223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113968495
2524	NC_008321	TGG	2	6	170359	170364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968495
2525	NC_008321	GA	3	6	170418	170423	50 %	0 %	50 %	0 %	113968495
2526	NC_008321	AGC	2	6	170518	170523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968495
2527	NC_008321	GAT	2	6	170531	170536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968495
2528	NC_008321	ACG	2	6	170555	170560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968495
2529	NC_008321	TGC	2	6	170602	170607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968495
2530	NC_008321	CAG	2	6	170615	170620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968495
2531	NC_008321	AAG	2	6	170654	170659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968495
2532	NC_008321	ATC	2	6	170679	170684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968495
2533	NC_008321	GTC	2	6	170758	170763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968495
2534	NC_008321	GCAA	2	8	170771	170778	50 %	0 %	25 %	25 %	113968495
2535	NC_008321	TGG	2	6	170790	170795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968495
2536	NC_008321	ACTA	2	8	170864	170871	50 %	25 %	0 %	25 %	113968495
2537	NC_008321	GGA	2	6	170938	170943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113968495
2538	NC_008321	GAT	2	6	171119	171124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968495
2539	NC_008321	GACC	2	8	171151	171158	25 %	0 %	25 %	50 %	113968495
2540	NC_008321	GTT	2	6	171220	171225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968495
2541	NC_008321	TGG	2	6	171297	171302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968495
2542	NC_008321	CG	3	6	171356	171361	0 %	0 %	50 %	50 %	113968495
2543	NC_008321	CAA	2	6	171407	171412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113968495
2544	NC_008321	TGA	2	6	171460	171465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968495
2545	NC_008321	GCA	3	9	171472	171480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968495
2546	NC_008321	AGGCTA	2	12	171634	171645	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	113968496
2547	NC_008321	AGC	2	6	171728	171733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968496
2548	NC_008321	GCA	2	6	171753	171758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968496
2549	NC_008321	CGA	2	6	171859	171864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968496
2550	NC_008321	ATG	2	6	171932	171937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968496
2551	NC_008321	GCCGA	2	10	171965	171974	20 %	0 %	40 %	40 %	113968496
2552	NC_008321	CAACGC	2	12	172048	172059	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	113968496
2553	NC_008321	ATAA	2	8	172105	172112	75 %	25 %	0 %	0 %	113968496
2554	NC_008321	AGA	2	6	172122	172127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968496
2555	NC_008321	TAA	2	6	172142	172147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113968496
2556	NC_008321	AAT	2	6	172180	172185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113968496
2557	NC_008321	GTT	2	6	172195	172200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968496
2558	NC_008321	GAA	2	6	172243	172248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968496
2559	NC_008321	AAT	2	6	172255	172260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113968496
2560	NC_008321	GC	3	6	172302	172307	0 %	0 %	50 %	50 %	113968496
2561	NC_008321	AAC	2	6	172370	172375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113968496
2562	NC_008321	TCA	2	6	172424	172429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968496
2563	NC_008321	A	6	6	172546	172551	100 %	0 %	0 %	0 %	113968496
2564	NC_008321	ATT	2	6	172555	172560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113968496
2565	NC_008321	GGC	2	6	172582	172587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968496
2566	NC_008321	CCG	2	6	172679	172684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968496
2567	NC_008321	GCG	2	6	172700	172705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968496
2568	NC_008321	GAC	2	6	172725	172730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968496
2569	NC_008321	AGA	2	6	172740	172745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968496
2570	NC_008321	TAA	2	6	172878	172883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113968496
2571	NC_008321	ACA	2	6	172928	172933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113968496
2572	NC_008321	GCC	2	6	172993	172998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968496
2573	NC_008321	TCA	2	6	173048	173053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968496
2574	NC_008321	CCG	2	6	173118	173123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968496
2575	NC_008321	CGA	2	6	173142	173147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968496
2576	NC_008321	CGA	2	6	173686	173691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968497
2577	NC_008321	GC	3	6	173694	173699	0 %	0 %	50 %	50 %	113968497
2578	NC_008321	GCC	2	6	173738	173743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968497
2579	NC_008321	CCAG	2	8	173747	173754	25 %	0 %	25 %	50 %	113968497
2580	NC_008321	TCA	2	6	173797	173802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968497
2581	NC_008321	GAA	2	6	173834	173839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968497
2582	NC_008321	GC	3	6	173842	173847	0 %	0 %	50 %	50 %	113968497
2583	NC_008321	AG	3	6	173924	173929	50 %	0 %	50 %	0 %	113968497
2584	NC_008321	TGG	2	6	173969	173974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968497
2585	NC_008321	TGCG	2	8	174011	174018	0 %	25 %	50 %	25 %	113968497
2586	NC_008321	TCT	2	6	174036	174041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968497
2587	NC_008321	GCT	2	6	174095	174100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968497
2588	NC_008321	AGC	2	6	174220	174225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968497
2589	NC_008321	GAA	2	6	174335	174340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968497
2590	NC_008321	GCA	2	6	174406	174411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968497
2591	NC_008321	CTT	2	6	174437	174442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968497
2592	NC_008321	CCG	2	6	174505	174510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968497
2593	NC_008321	TGA	2	6	174562	174567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968497
2594	NC_008321	TTC	2	6	174599	174604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968497
2595	NC_008321	GAT	2	6	174608	174613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968497
2596	NC_008321	GTC	2	6	174654	174659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968497
2597	NC_008321	CTGG	2	8	174667	174674	0 %	25 %	50 %	25 %	113968497
2598	NC_008321	ACAA	2	8	174711	174718	75 %	0 %	0 %	25 %	113968497
2599	NC_008321	CGC	2	6	174916	174921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968497
2600	NC_008321	ATCC	2	8	174979	174986	25 %	25 %	0 %	50 %	113968497
2601	NC_008321	CTG	2	6	175196	175201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968498
2602	NC_008321	TGC	2	6	175232	175237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968498
2603	NC_008321	TCT	2	6	175419	175424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968498
2604	NC_008321	TGG	2	6	175486	175491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968498
2605	NC_008321	TCT	2	6	175530	175535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968498
2606	NC_008321	GCTT	2	8	175569	175576	0 %	50 %	25 %	25 %	113968498
2607	NC_008321	GGTA	2	8	175601	175608	25 %	25 %	50 %	0 %	113968498
2608	NC_008321	AGT	2	6	175627	175632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968498
2609	NC_008321	CA	3	6	175637	175642	50 %	0 %	0 %	50 %	113968498
2610	NC_008321	GCT	2	6	175644	175649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968498
2611	NC_008321	TCG	2	6	175755	175760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968498
2612	NC_008321	TGC	2	6	175797	175802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968498
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2615	NC_008321	CAG	2	6	175922	175927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968498
2616	NC_008321	GGGT	2	8	175940	175947	0 %	25 %	75 %	0 %	113968498
2617	NC_008321	CAC	2	6	175999	176004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113968498
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2621	NC_008321	TTC	2	6	176222	176227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968499
2622	NC_008321	T	7	7	176273	176279	0 %	100 %	0 %	0 %	113968499
2623	NC_008321	GCC	2	6	176381	176386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968499
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2744	NC_008321	GTTT	2	8	183321	183328	0 %	75 %	25 %	0 %	113968505
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2985	NC_008321	AACC	2	8	197153	197160	50 %	0 %	0 %	50 %	113968521
2986	NC_008321	CCA	2	6	197202	197207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113968521
2987	NC_008321	TGG	2	6	197242	197247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968521
2988	NC_008321	GAA	2	6	197358	197363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968521
2989	NC_008321	TCA	2	6	197465	197470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968521
2990	NC_008321	CACG	2	8	197531	197538	25 %	0 %	25 %	50 %	113968521
2991	NC_008321	GCA	2	6	197576	197581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968521
2992	NC_008321	GAT	2	6	197666	197671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968521
2993	NC_008321	TAATGC	2	12	197700	197711	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	113968521
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2998	NC_008321	ATGA	2	8	198257	198264	50 %	25 %	25 %	0 %	113968522
2999	NC_008321	CGA	2	6	198283	198288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968522
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