MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella sp. MR-4 chromosome

Total Repeats: 71525

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_008321	GTA	2	6	136371	136376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968469
2003	NC_008321	CTTG	2	8	136426	136433	0 %	50 %	25 %	25 %	113968469
2004	NC_008321	TTG	2	6	136470	136475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968469
2005	NC_008321	GCC	3	9	136479	136487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968469
2006	NC_008321	TTA	2	6	136563	136568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113968469
2007	NC_008321	TGG	2	6	136570	136575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968469
2008	NC_008321	GTT	2	6	136613	136618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968469
2009	NC_008321	CTA	2	6	136659	136664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968469
2010	NC_008321	CTG	2	6	136674	136679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968469
2011	NC_008321	TCGA	2	8	136797	136804	25 %	25 %	25 %	25 %	113968469
2012	NC_008321	TGA	2	6	136858	136863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968469
2013	NC_008321	TGG	2	6	137011	137016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968469
2014	NC_008321	TCT	2	6	137193	137198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968469
2015	NC_008321	CATT	2	8	137232	137239	25 %	50 %	0 %	25 %	113968469
2016	NC_008321	ACG	2	6	137303	137308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968469
2017	NC_008321	GAT	2	6	137330	137335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968469
2018	NC_008321	TGT	2	6	137356	137361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968469
2019	NC_008321	ACG	2	6	137397	137402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968469
2020	NC_008321	TACG	2	8	137410	137417	25 %	25 %	25 %	25 %	113968469
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2022	NC_008321	ATTCT	2	10	137484	137493	20 %	60 %	0 %	20 %	113968469
2023	NC_008321	TGA	2	6	137518	137523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968469
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2055	NC_008321	CTTAC	2	10	138862	138871	20 %	40 %	0 %	40 %	113968469
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2065	NC_008321	TGAT	2	8	139717	139724	25 %	50 %	25 %	0 %	113968470
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2092	NC_008321	TGAT	2	8	141304	141311	25 %	50 %	25 %	0 %	113968470
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2117	NC_008321	TTA	2	6	142910	142915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113968472
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2119	NC_008321	CGA	2	6	142963	142968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968472
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2121	NC_008321	TAC	2	6	143000	143005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968472
2122	NC_008321	ACTA	2	8	143027	143034	50 %	25 %	0 %	25 %	113968472
2123	NC_008321	AAG	2	6	143048	143053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968472
2124	NC_008321	GAT	2	6	143099	143104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968472
2125	NC_008321	GCT	2	6	143131	143136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968472
2126	NC_008321	GC	3	6	143137	143142	0 %	0 %	50 %	50 %	113968472
2127	NC_008321	GAA	2	6	143174	143179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968472
2128	NC_008321	GAA	2	6	143204	143209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968472
2129	NC_008321	CCG	2	6	143212	143217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968472
2130	NC_008321	AAT	2	6	143237	143242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113968472
2131	NC_008321	CTG	2	6	143243	143248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968472
2132	NC_008321	AAG	2	6	143253	143258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968472
2133	NC_008321	CTG	2	6	143282	143287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968472
2134	NC_008321	CCT	2	6	143292	143297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113968472
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2137	NC_008321	CT	3	6	143678	143683	0 %	50 %	0 %	50 %	113968473
2138	NC_008321	CAT	2	6	143689	143694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968473
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2141	NC_008321	ACT	2	6	143768	143773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968473
2142	NC_008321	GGC	2	6	143794	143799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968473
2143	NC_008321	GC	3	6	143808	143813	0 %	0 %	50 %	50 %	113968473
2144	NC_008321	GGC	2	6	143987	143992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968473
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2146	NC_008321	TCC	2	6	144063	144068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113968473
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2150	NC_008321	G	7	7	144208	144214	0 %	0 %	100 %	0 %	113968473
2151	NC_008321	GCA	2	6	144369	144374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968473
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2154	NC_008321	CAG	2	6	144603	144608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968474
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2158	NC_008321	CGC	2	6	144741	144746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968474
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2163	NC_008321	CAA	2	6	145078	145083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113968475
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2223	NC_008321	CATG	2	8	149086	149093	25 %	25 %	25 %	25 %	113968479
2224	NC_008321	TTC	2	6	149138	149143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968479
2225	NC_008321	CACGG	2	10	149282	149291	20 %	0 %	40 %	40 %	113968479
2226	NC_008321	GTT	2	6	149299	149304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968479
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2229	NC_008321	CATGG	2	10	149672	149681	20 %	20 %	40 %	20 %	113968479
2230	NC_008321	AT	3	6	149697	149702	50 %	50 %	0 %	0 %	113968479
2231	NC_008321	CAG	2	6	149723	149728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968479
2232	NC_008321	TGC	2	6	149772	149777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968479
2233	NC_008321	AGTG	2	8	149813	149820	25 %	25 %	50 %	0 %	113968479
2234	NC_008321	GCTTAC	2	12	149860	149871	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	113968479
2235	NC_008321	ATAA	2	8	149880	149887	75 %	25 %	0 %	0 %	113968479
2236	NC_008321	ATT	2	6	149901	149906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113968479
2237	NC_008321	CTT	2	6	150001	150006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968479
2238	NC_008321	CGG	3	9	150193	150201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968479
2239	NC_008321	TCG	2	6	150276	150281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968479
2240	NC_008321	GATATT	2	12	150296	150307	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	113968479
2241	NC_008321	CGG	2	6	150319	150324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968479
2242	NC_008321	AAT	2	6	150377	150382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113968479
2243	NC_008321	CGG	2	6	150409	150414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968479
2244	NC_008321	TCA	2	6	150504	150509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968479
2245	NC_008321	ACC	2	6	150550	150555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113968479
2246	NC_008321	CTG	2	6	150564	150569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968479
2247	NC_008321	GGC	2	6	150602	150607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968479
2248	NC_008321	CTG	2	6	150677	150682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968479
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2255	NC_008321	TGC	2	6	151467	151472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968479
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2260	NC_008321	TCA	3	9	151657	151665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968479
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2267	NC_008321	TGG	2	6	152396	152401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968480
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2274	NC_008321	CTTGGC	2	12	152666	152677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968480
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2278	NC_008321	A	6	6	153523	153528	100 %	0 %	0 %	0 %	113968481
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2285	NC_008321	CGA	2	6	153719	153724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968481
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2353	NC_008321	CGGT	2	8	158287	158294	0 %	25 %	50 %	25 %	113968484
2354	NC_008321	GCT	3	9	158340	158348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968484
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2357	NC_008321	CAAC	2	8	158691	158698	50 %	0 %	0 %	50 %	113968485
2358	NC_008321	GCG	2	6	158740	158745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968485
2359	NC_008321	GCA	2	6	158751	158756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968485
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2361	NC_008321	GAG	2	6	158989	158994	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113968485
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2363	NC_008321	TAAG	2	8	159044	159051	50 %	25 %	25 %	0 %	113968485
2364	NC_008321	ACA	2	6	159129	159134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113968485
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2474	NC_008321	TTGG	2	8	166592	166599	0 %	50 %	50 %	0 %	113968492
2475	NC_008321	CGG	2	6	166647	166652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968492
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2482	NC_008321	AAC	2	6	167535	167540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113968493
2483	NC_008321	ATT	3	9	167605	167613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113968493
2484	NC_008321	TC	3	6	167635	167640	0 %	50 %	0 %	50 %	113968493
2485	NC_008321	TGAT	2	8	167724	167731	25 %	50 %	25 %	0 %	113968493
2486	NC_008321	AGC	2	6	167739	167744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968493
2487	NC_008321	GGTTG	2	10	167918	167927	0 %	40 %	60 %	0 %	113968494
2488	NC_008321	GCT	2	6	167965	167970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968494
2489	NC_008321	TTTA	2	8	167995	168002	25 %	75 %	0 %	0 %	113968494
2490	NC_008321	GTA	2	6	168061	168066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968494
2491	NC_008321	TCC	2	6	168098	168103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113968494
2492	NC_008321	AGC	2	6	168122	168127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968494
2493	NC_008321	GCC	2	6	168130	168135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968494
2494	NC_008321	TCT	2	6	168323	168328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968494
2495	NC_008321	GTTT	2	8	168350	168357	0 %	75 %	25 %	0 %	113968494
2496	NC_008321	AT	3	6	168370	168375	50 %	50 %	0 %	0 %	113968494
2497	NC_008321	ATTG	2	8	168516	168523	25 %	50 %	25 %	0 %	113968494
2498	NC_008321	T	6	6	168583	168588	0 %	100 %	0 %	0 %	113968494
2499	NC_008321	ATC	2	6	168644	168649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968494
2500	NC_008321	CAG	2	6	168687	168692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968494

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