MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella sp. MR-4 chromosome

Total Repeats: 71525

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_008321	CATTT	2	10	69228	69237	20 %	60 %	0 %	20 %	113968404
1002	NC_008321	TCA	2	6	69304	69309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968404
1003	NC_008321	ATC	2	6	69313	69318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968404
1004	NC_008321	TG	3	6	69351	69356	0 %	50 %	50 %	0 %	113968404
1005	NC_008321	AAT	2	6	69387	69392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113968404
1006	NC_008321	TTA	2	6	69397	69402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113968404
1007	NC_008321	CTG	2	6	69662	69667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968404
1008	NC_008321	GAAA	2	8	69724	69731	75 %	0 %	25 %	0 %	113968404
1009	NC_008321	A	6	6	69740	69745	100 %	0 %	0 %	0 %	113968404
1010	NC_008321	A	6	6	69750	69755	100 %	0 %	0 %	0 %	113968404
1011	NC_008321	T	6	6	70218	70223	0 %	100 %	0 %	0 %	113968405
1012	NC_008321	TGG	2	6	70227	70232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968405
1013	NC_008321	CGG	2	6	70279	70284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968405
1014	NC_008321	CGG	2	6	70338	70343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968405
1015	NC_008321	T	6	6	70375	70380	0 %	100 %	0 %	0 %	113968405
1016	NC_008321	TGG	2	6	70394	70399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968405
1017	NC_008321	GTT	2	6	70471	70476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968405
1018	NC_008321	ATT	2	6	70494	70499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113968405
1019	NC_008321	GGC	2	6	70593	70598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968405
1020	NC_008321	GCGG	2	8	70640	70647	0 %	0 %	75 %	25 %	113968405
1021	NC_008321	CCA	2	6	70649	70654	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113968405
1022	NC_008321	TGC	2	6	70668	70673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968405
1023	NC_008321	T	6	6	70718	70723	0 %	100 %	0 %	0 %	113968405
1024	NC_008321	GGT	2	6	70726	70731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968405
1025	NC_008321	AAGAT	2	10	70851	70860	60 %	20 %	20 %	0 %	113968405
1026	NC_008321	GTT	2	6	70870	70875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968405
1027	NC_008321	CAT	2	6	70882	70887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968405
1028	NC_008321	TGG	2	6	70905	70910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968405
1029	NC_008321	GC	3	6	71107	71112	0 %	0 %	50 %	50 %	113968406
1030	NC_008321	GCG	2	6	71197	71202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968406
1031	NC_008321	GGC	2	6	71220	71225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968406
1032	NC_008321	GTCG	2	8	71258	71265	0 %	25 %	50 %	25 %	113968406
1033	NC_008321	GAA	2	6	71307	71312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968406
1034	NC_008321	GCAC	2	8	71389	71396	25 %	0 %	25 %	50 %	113968406
1035	NC_008321	AAT	2	6	71421	71426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113968406
1036	NC_008321	CGA	2	6	71440	71445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968406
1037	NC_008321	CCG	2	6	71611	71616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968407
1038	NC_008321	GGC	2	6	71636	71641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968407
1039	NC_008321	GGC	2	6	71694	71699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968407
1040	NC_008321	GGC	2	6	71744	71749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968407
1041	NC_008321	GGCT	2	8	71766	71773	0 %	25 %	50 %	25 %	113968407
1042	NC_008321	TGA	2	6	71803	71808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968407
1043	NC_008321	GTG	2	6	71817	71822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968407
1044	NC_008321	TCC	2	6	71887	71892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113968407
1045	NC_008321	GGT	2	6	71901	71906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968407
1046	NC_008321	TGA	2	6	71914	71919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968407
1047	NC_008321	GGC	2	6	72015	72020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968407
1048	NC_008321	TGG	2	6	72029	72034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968407
1049	NC_008321	GGC	2	6	72106	72111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968407
1050	NC_008321	ATC	2	6	72192	72197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968407
1051	NC_008321	GCT	2	6	72203	72208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968407
1052	NC_008321	TG	3	6	72282	72287	0 %	50 %	50 %	0 %	113968407
1053	NC_008321	TGT	2	6	72301	72306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968407
1054	NC_008321	GCC	2	6	72399	72404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968407
1055	NC_008321	GAT	2	6	72416	72421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968407
1056	NC_008321	CTT	2	6	72422	72427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968407
1057	NC_008321	GGTC	2	8	72446	72453	0 %	25 %	50 %	25 %	113968407
1058	NC_008321	TGC	2	6	72481	72486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968407
1059	NC_008321	CCA	2	6	72520	72525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113968407
1060	NC_008321	GCC	2	6	72623	72628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968407
1061	NC_008321	TGG	2	6	72661	72666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968407
1062	NC_008321	GTG	2	6	72705	72710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968407
1063	NC_008321	CGG	2	6	72916	72921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968407
1064	NC_008321	TGG	2	6	72925	72930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968407
1065	NC_008321	GCC	2	6	73204	73209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968408
1066	NC_008321	GGC	2	6	73242	73247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968408
1067	NC_008321	AT	3	6	73308	73313	50 %	50 %	0 %	0 %	113968408
1068	NC_008321	AAG	3	9	73501	73509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968408
1069	NC_008321	GCC	2	6	73570	73575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968408
1070	NC_008321	AGG	2	6	73823	73828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113968408
1071	NC_008321	GGA	2	6	73929	73934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113968408
1072	NC_008321	TCGTG	2	10	73938	73947	0 %	40 %	40 %	20 %	113968408
1073	NC_008321	TGA	2	6	73962	73967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968408
1074	NC_008321	CTCG	2	8	73973	73980	0 %	25 %	25 %	50 %	113968408
1075	NC_008321	CCA	2	6	73984	73989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113968408
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1077	NC_008321	CGA	2	6	74049	74054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968408
1078	NC_008321	TGAG	2	8	74181	74188	25 %	25 %	50 %	0 %	113968409
1079	NC_008321	TCA	2	6	74226	74231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968409
1080	NC_008321	TGC	2	6	74327	74332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968409
1081	NC_008321	TGC	2	6	74354	74359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968409
1082	NC_008321	TTA	2	6	74364	74369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113968409
1083	NC_008321	TTG	2	6	74420	74425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968409
1084	NC_008321	GTA	2	6	74522	74527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968409
1085	NC_008321	TAA	2	6	74607	74612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113968409
1086	NC_008321	TTGAT	2	10	74619	74628	20 %	60 %	20 %	0 %	113968409
1087	NC_008321	GGC	2	6	74645	74650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968409
1088	NC_008321	AAT	2	6	74730	74735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113968409
1089	NC_008321	CCAT	2	8	74745	74752	25 %	25 %	0 %	50 %	113968409
1090	NC_008321	ATA	2	6	74766	74771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113968409
1091	NC_008321	ATG	2	6	74939	74944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968409
1092	NC_008321	GCTT	2	8	74985	74992	0 %	50 %	25 %	25 %	113968409
1093	NC_008321	AGC	2	6	75034	75039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968409
1094	NC_008321	AAT	2	6	75130	75135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113968409
1095	NC_008321	ATCGAT	2	12	75158	75169	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	113968409
1096	NC_008321	GGT	2	6	75185	75190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968409
1097	NC_008321	TTC	2	6	75197	75202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968409
1098	NC_008321	AGC	2	6	75235	75240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968409
1099	NC_008321	GATA	2	8	75256	75263	50 %	25 %	25 %	0 %	113968409
1100	NC_008321	ATG	2	6	75411	75416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968409
1101	NC_008321	GTT	2	6	75589	75594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968409
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1103	NC_008321	CT	3	6	76047	76052	0 %	50 %	0 %	50 %	113968410
1104	NC_008321	GAT	2	6	76085	76090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968410
1105	NC_008321	T	6	6	76121	76126	0 %	100 %	0 %	0 %	113968410
1106	NC_008321	TTA	2	6	76158	76163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113968410
1107	NC_008321	TGT	3	9	76168	76176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968410
1108	NC_008321	T	6	6	76190	76195	0 %	100 %	0 %	0 %	113968410
1109	NC_008321	TAT	2	6	76218	76223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113968410
1110	NC_008321	CTG	2	6	76227	76232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968410
1111	NC_008321	TGG	2	6	76243	76248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968410
1112	NC_008321	T	6	6	76350	76355	0 %	100 %	0 %	0 %	113968410
1113	NC_008321	TGG	2	6	76369	76374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968410
1114	NC_008321	GCCA	2	8	76376	76383	25 %	0 %	25 %	50 %	113968410
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1116	NC_008321	GTATTT	2	12	76421	76432	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	113968410
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1121	NC_008321	TGC	2	6	76633	76638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968410
1122	NC_008321	T	6	6	76689	76694	0 %	100 %	0 %	0 %	113968410
1123	NC_008321	TTAGC	2	10	76771	76780	20 %	40 %	20 %	20 %	113968410
1124	NC_008321	CT	3	6	76845	76850	0 %	50 %	0 %	50 %	113968410
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1126	NC_008321	GTT	2	6	76900	76905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968410
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1252	NC_008321	GAC	2	6	85776	85781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968419
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1499	NC_008321	TTG	2	6	104116	104121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968439
1500	NC_008321	ATA	2	6	104147	104152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113968439

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