MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella sp. MR-4 chromosome

Total Repeats: 71525

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008321	GGCA	2	8	31563	31570	25 %	0 %	50 %	25 %	113968372
502	NC_008321	ACG	2	6	31670	31675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968372
503	NC_008321	GTT	2	6	31741	31746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968372
504	NC_008321	CACC	2	8	31749	31756	25 %	0 %	0 %	75 %	113968372
505	NC_008321	TAA	2	6	31856	31861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113968373
506	NC_008321	TGT	2	6	31872	31877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968373
507	NC_008321	CTG	2	6	31921	31926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968373
508	NC_008321	GT	3	6	31932	31937	0 %	50 %	50 %	0 %	113968373
509	NC_008321	CAG	2	6	32051	32056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968373
510	NC_008321	TTC	2	6	32089	32094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968373
511	NC_008321	CGG	2	6	32135	32140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968373
512	NC_008321	CCA	2	6	32200	32205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113968373
513	NC_008321	TGC	2	6	32428	32433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968373
514	NC_008321	GTC	2	6	32477	32482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968373
515	NC_008321	CAT	2	6	32511	32516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968373
516	NC_008321	CTCA	2	8	32548	32555	25 %	25 %	0 %	50 %	113968373
517	NC_008321	GGC	2	6	32557	32562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968373
518	NC_008321	TTG	2	6	32594	32599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968373
519	NC_008321	TTAA	2	8	32678	32685	50 %	50 %	0 %	0 %	113968373
520	NC_008321	GCG	2	6	32730	32735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968373
521	NC_008321	GCA	2	6	32757	32762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968373
522	NC_008321	GAC	2	6	32770	32775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968373
523	NC_008321	GAC	2	6	32802	32807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968373
524	NC_008321	CGG	2	6	32814	32819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968373
525	NC_008321	GGC	2	6	32830	32835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968373
526	NC_008321	CAA	2	6	32874	32879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113968373
527	NC_008321	TGG	2	6	32888	32893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968373
528	NC_008321	AC	3	6	33057	33062	50 %	0 %	0 %	50 %	113968373
529	NC_008321	GCC	2	6	33092	33097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968373
530	NC_008321	TCA	2	6	33111	33116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968373
531	NC_008321	CGC	2	6	33161	33166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968374
532	NC_008321	T	6	6	33198	33203	0 %	100 %	0 %	0 %	113968374
533	NC_008321	AC	3	6	33233	33238	50 %	0 %	0 %	50 %	113968374
534	NC_008321	T	6	6	33264	33269	0 %	100 %	0 %	0 %	113968374
535	NC_008321	ATA	2	6	33280	33285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113968374
536	NC_008321	TGC	2	6	33302	33307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968374
537	NC_008321	TGG	2	6	33308	33313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968374
538	NC_008321	CTT	2	6	33395	33400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968374
539	NC_008321	CTT	3	9	33440	33448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968374
540	NC_008321	ATC	3	9	33588	33596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968374
541	NC_008321	CAG	2	6	33618	33623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968374
542	NC_008321	CG	3	6	33696	33701	0 %	0 %	50 %	50 %	113968374
543	NC_008321	CAC	2	6	33780	33785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113968374
544	NC_008321	ATA	2	6	33820	33825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113968374
545	NC_008321	GGC	2	6	33837	33842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968374
546	NC_008321	TGT	2	6	33896	33901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968374
547	NC_008321	T	6	6	33939	33944	0 %	100 %	0 %	0 %	113968374
548	NC_008321	TGTGA	2	10	33992	34001	20 %	40 %	40 %	0 %	113968374
549	NC_008321	GAT	2	6	34053	34058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968374
550	NC_008321	ACAA	2	8	34319	34326	75 %	0 %	0 %	25 %	113968375
551	NC_008321	AAT	2	6	34359	34364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113968375
552	NC_008321	GTT	2	6	34424	34429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968375
553	NC_008321	TGC	2	6	34449	34454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968375
554	NC_008321	ATC	2	6	34494	34499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968375
555	NC_008321	CAG	2	6	34517	34522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968375
556	NC_008321	ACA	2	6	34716	34721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113968376
557	NC_008321	AAG	2	6	34835	34840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968376
558	NC_008321	ATTTA	2	10	34935	34944	40 %	60 %	0 %	0 %	113968376
559	NC_008321	GTAT	2	8	35247	35254	25 %	50 %	25 %	0 %	113968376
560	NC_008321	CTT	2	6	35269	35274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968376
561	NC_008321	CAA	2	6	35275	35280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113968376
562	NC_008321	AAG	2	6	35304	35309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968376
563	NC_008321	CTG	2	6	35457	35462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968376
564	NC_008321	TAA	2	6	35614	35619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113968376
565	NC_008321	TGG	2	6	35667	35672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968376
566	NC_008321	GTC	2	6	35680	35685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968376
567	NC_008321	CGA	2	6	35797	35802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968376
568	NC_008321	AATT	2	8	35805	35812	50 %	50 %	0 %	0 %	113968376
569	NC_008321	AAT	2	6	35841	35846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113968376
570	NC_008321	GAC	2	6	35938	35943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968377
571	NC_008321	TGC	2	6	36033	36038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968377
572	NC_008321	CAG	2	6	36052	36057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968377
573	NC_008321	ACC	2	6	36068	36073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113968377
574	NC_008321	GTTT	2	8	36076	36083	0 %	75 %	25 %	0 %	113968377
575	NC_008321	TCC	2	6	36099	36104	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113968377
576	NC_008321	TCC	2	6	36126	36131	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113968377
577	NC_008321	TTAT	2	8	36139	36146	25 %	75 %	0 %	0 %	113968377
578	NC_008321	TGT	2	6	36167	36172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968377
579	NC_008321	GA	3	6	36245	36250	50 %	0 %	50 %	0 %	113968377
580	NC_008321	ATT	2	6	36370	36375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113968377
581	NC_008321	AGC	2	6	36392	36397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968377
582	NC_008321	TAA	2	6	36428	36433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113968377
583	NC_008321	CGAAA	2	10	36476	36485	60 %	0 %	20 %	20 %	113968377
584	NC_008321	ATT	2	6	36490	36495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113968377
585	NC_008321	TCTT	2	8	36501	36508	0 %	75 %	0 %	25 %	113968377
586	NC_008321	TGG	2	6	36518	36523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968377
587	NC_008321	TCA	2	6	36551	36556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968377
588	NC_008321	CGG	2	6	36615	36620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968377
589	NC_008321	TCA	2	6	36624	36629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968377
590	NC_008321	TTA	2	6	36643	36648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113968377
591	NC_008321	GAA	2	6	36724	36729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968377
592	NC_008321	CCA	2	6	36741	36746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113968377
593	NC_008321	ACA	2	6	36814	36819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113968377
594	NC_008321	GGTTG	2	10	36895	36904	0 %	40 %	60 %	0 %	113968377
595	NC_008321	GGT	2	6	36916	36921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968377
596	NC_008321	ACTC	2	8	37034	37041	25 %	25 %	0 %	50 %	113968378
597	NC_008321	TTGG	2	8	37082	37089	0 %	50 %	50 %	0 %	113968378
598	NC_008321	AGGA	2	8	37108	37115	50 %	0 %	50 %	0 %	113968378
599	NC_008321	CATT	2	8	37146	37153	25 %	50 %	0 %	25 %	113968378
600	NC_008321	AGA	2	6	37169	37174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968378
601	NC_008321	GCCT	2	8	37289	37296	0 %	25 %	25 %	50 %	113968378
602	NC_008321	AGC	2	6	37393	37398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968378
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605	NC_008321	GCAC	2	8	37585	37592	25 %	0 %	25 %	50 %	113968379
606	NC_008321	AAC	2	6	37676	37681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113968379
607	NC_008321	GCA	2	6	37714	37719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968379
608	NC_008321	TCC	2	6	37990	37995	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113968379
609	NC_008321	A	6	6	38079	38084	100 %	0 %	0 %	0 %	113968379
610	NC_008321	CG	3	6	38099	38104	0 %	0 %	50 %	50 %	113968379
611	NC_008321	GGT	2	6	38294	38299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968380
612	NC_008321	GCGA	2	8	38420	38427	25 %	0 %	50 %	25 %	113968380
613	NC_008321	TGA	2	6	38689	38694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968380
614	NC_008321	CCA	2	6	38766	38771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113968380
615	NC_008321	GCAA	2	8	38931	38938	50 %	0 %	25 %	25 %	113968381
616	NC_008321	GGCGGT	2	12	38971	38982	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	113968381
617	NC_008321	TGG	2	6	39217	39222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968381
618	NC_008321	TGG	3	9	39225	39233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968381
619	NC_008321	GAA	2	6	39262	39267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968381
620	NC_008321	CGA	2	6	39318	39323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968381
621	NC_008321	AT	3	6	39325	39330	50 %	50 %	0 %	0 %	113968381
622	NC_008321	AAG	2	6	39340	39345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968381
623	NC_008321	TGA	2	6	39351	39356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968381
624	NC_008321	TTC	2	6	39361	39366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968381
625	NC_008321	CTT	2	6	39474	39479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968381
626	NC_008321	TTG	2	6	39497	39502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968381
627	NC_008321	CGTGAG	2	12	39532	39543	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	113968381
628	NC_008321	TCG	2	6	39555	39560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968381
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