MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella sp. MR-4 chromosome

Total Repeats: 71525

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_008321	TTG	2	6	339644	339649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968656
5002	NC_008321	GGCAA	2	10	339665	339674	40 %	0 %	40 %	20 %	113968656
5003	NC_008321	T	6	6	339757	339762	0 %	100 %	0 %	0 %	113968656
5004	NC_008321	CTT	2	6	340213	340218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968657
5005	NC_008321	CGG	2	6	340249	340254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968657
5006	NC_008321	GCA	2	6	340303	340308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968657
5007	NC_008321	ATA	2	6	340311	340316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113968657
5008	NC_008321	TTC	2	6	340319	340324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968657
5009	NC_008321	ACC	2	6	340325	340330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113968657
5010	NC_008321	GTG	2	6	340374	340379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968657
5011	NC_008321	GAT	2	6	340457	340462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968657
5012	NC_008321	TGT	2	6	340476	340481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968657
5013	NC_008321	CTT	2	6	340513	340518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968657
5014	NC_008321	CGC	2	6	340562	340567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968657
5015	NC_008321	TCC	2	6	340581	340586	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113968657
5016	NC_008321	TTC	2	6	340601	340606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968657
5017	NC_008321	GAT	2	6	340628	340633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968657
5018	NC_008321	ATAA	2	8	340687	340694	75 %	25 %	0 %	0 %	113968657
5019	NC_008321	CGA	2	6	340744	340749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968657
5020	NC_008321	GAG	2	6	340763	340768	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113968657
5021	NC_008321	CAT	2	6	340832	340837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968657
5022	NC_008321	GGC	2	6	340841	340846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968657
5023	NC_008321	GCT	2	6	340850	340855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968657
5024	NC_008321	GC	3	6	340867	340872	0 %	0 %	50 %	50 %	113968657
5025	NC_008321	CAT	2	6	340979	340984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968657
5026	NC_008321	TCA	2	6	341011	341016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968657
5027	NC_008321	CCCG	2	8	341099	341106	0 %	0 %	25 %	75 %	113968657
5028	NC_008321	ATAA	2	8	341154	341161	75 %	25 %	0 %	0 %	113968657
5029	NC_008321	AGC	2	6	341229	341234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968657
5030	NC_008321	TGT	2	6	341254	341259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968657
5031	NC_008321	TGC	2	6	341322	341327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968657
5032	NC_008321	CGC	2	6	341406	341411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968657
5033	NC_008321	TAT	2	6	341668	341673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113968657
5034	NC_008321	AGC	2	6	341727	341732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968657
5035	NC_008321	TGT	2	6	342181	342186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968658
5036	NC_008321	GGC	2	6	342207	342212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968658
5037	NC_008321	CGGCG	2	10	342223	342232	0 %	0 %	60 %	40 %	113968658
5038	NC_008321	TCA	2	6	342241	342246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968658
5039	NC_008321	CGG	2	6	342261	342266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968658
5040	NC_008321	GCG	2	6	342293	342298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968658
5041	NC_008321	GGCT	2	8	342301	342308	0 %	25 %	50 %	25 %	113968658
5042	NC_008321	TTG	2	6	342372	342377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968658
5043	NC_008321	CAT	2	6	342391	342396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968658
5044	NC_008321	CGG	2	6	342397	342402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968658
5045	NC_008321	CCA	2	6	342459	342464	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113968658
5046	NC_008321	CTGAA	2	10	342499	342508	40 %	20 %	20 %	20 %	113968658
5047	NC_008321	CAA	2	6	342626	342631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113968658
5048	NC_008321	GCC	2	6	342639	342644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968658
5049	NC_008321	CGC	2	6	342721	342726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968659
5050	NC_008321	ACC	2	6	342780	342785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113968659
5051	NC_008321	AG	3	6	342786	342791	50 %	0 %	50 %	0 %	113968659
5052	NC_008321	ACT	2	6	342800	342805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968659
5053	NC_008321	GCC	2	6	342827	342832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968659
5054	NC_008321	A	6	6	342868	342873	100 %	0 %	0 %	0 %	113968659
5055	NC_008321	GCG	2	6	342887	342892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968659
5056	NC_008321	TTG	2	6	342913	342918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968659
5057	NC_008321	AAG	2	6	343012	343017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968660
5058	NC_008321	CTG	2	6	343066	343071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968660
5059	NC_008321	ATCAA	2	10	343097	343106	60 %	20 %	0 %	20 %	113968660
5060	NC_008321	CG	3	6	343111	343116	0 %	0 %	50 %	50 %	113968660
5061	NC_008321	TGG	2	6	343157	343162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968660
5062	NC_008321	CGG	2	6	343253	343258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968660
5063	NC_008321	TTG	2	6	343289	343294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968660
5064	NC_008321	GTG	2	6	343339	343344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968660
5065	NC_008321	AAT	2	6	343381	343386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113968660
5066	NC_008321	GTG	3	9	343414	343422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968660
5067	NC_008321	TGG	2	6	343466	343471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968660
5068	NC_008321	GTG	2	6	343498	343503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968660
5069	NC_008321	T	7	7	343573	343579	0 %	100 %	0 %	0 %	113968660
5070	NC_008321	CGC	2	6	343584	343589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968660
5071	NC_008321	TA	3	6	343601	343606	50 %	50 %	0 %	0 %	113968660
5072	NC_008321	TGG	2	6	343607	343612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968660
5073	NC_008321	GGC	2	6	343662	343667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968660
5074	NC_008321	A	6	6	343687	343692	100 %	0 %	0 %	0 %	113968660
5075	NC_008321	GAT	2	6	343791	343796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968660
5076	NC_008321	TGC	2	6	343799	343804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968660
5077	NC_008321	CAG	2	6	343854	343859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968660
5078	NC_008321	GCG	2	6	343897	343902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968660
5079	NC_008321	CGC	2	6	343914	343919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968660
5080	NC_008321	GAC	2	6	343962	343967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968660
5081	NC_008321	CGC	2	6	343988	343993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968660
5082	NC_008321	CCG	2	6	344100	344105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968661
5083	NC_008321	TGA	2	6	344114	344119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968661
5084	NC_008321	GCA	2	6	344130	344135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968661
5085	NC_008321	GCT	2	6	344175	344180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968661
5086	NC_008321	TGG	2	6	344190	344195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968661
5087	NC_008321	TTTA	2	8	344229	344236	25 %	75 %	0 %	0 %	113968661
5088	NC_008321	GTG	2	6	344273	344278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968661
5089	NC_008321	GCG	2	6	344521	344526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968661
5090	NC_008321	TGC	2	6	344556	344561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968661
5091	NC_008321	ATTGG	2	10	344569	344578	20 %	40 %	40 %	0 %	113968661
5092	NC_008321	ATTT	2	8	344582	344589	25 %	75 %	0 %	0 %	113968661
5093	NC_008321	CCG	2	6	344646	344651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968661
5094	NC_008321	CCTA	2	8	344694	344701	25 %	25 %	0 %	50 %	113968661
5095	NC_008321	A	6	6	344754	344759	100 %	0 %	0 %	0 %	113968661
5096	NC_008321	CTGT	2	8	344846	344853	0 %	50 %	25 %	25 %	113968661
5097	NC_008321	TTA	2	6	344863	344868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113968661
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5101	NC_008321	GC	4	8	345129	345136	0 %	0 %	50 %	50 %	113968662
5102	NC_008321	GGT	2	6	345152	345157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968662
5103	NC_008321	GCC	3	9	345183	345191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968662
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5105	NC_008321	TAA	2	6	345272	345277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113968662
5106	NC_008321	TGC	2	6	345305	345310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968662
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5108	NC_008321	TGC	2	6	345430	345435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968662
5109	NC_008321	ATCCAA	2	12	345453	345464	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	113968662
5110	NC_008321	CGC	2	6	345507	345512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968662
5111	NC_008321	TGT	2	6	345517	345522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968662
5112	NC_008321	GGC	2	6	345531	345536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968662
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5115	NC_008321	TGA	2	6	345781	345786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968663
5116	NC_008321	TAG	2	6	345856	345861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968663
5117	NC_008321	GCC	2	6	345879	345884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968663
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5121	NC_008321	CAG	2	6	346332	346337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968664
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5239	NC_008321	A	6	6	354032	354037	100 %	0 %	0 %	0 %	113968675
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5243	NC_008321	TA	3	6	354210	354215	50 %	50 %	0 %	0 %	113968675
5244	NC_008321	TCCATT	2	12	354226	354237	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	113968675
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5251	NC_008321	ACT	2	6	354429	354434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968675
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5342	NC_008321	CGTTT	2	10	359956	359965	0 %	60 %	20 %	20 %	113968682
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5350	NC_008321	TCG	2	6	360489	360494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968682
5351	NC_008321	CAATC	2	10	360628	360637	40 %	20 %	0 %	40 %	113968682
5352	NC_008321	TGT	2	6	360654	360659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968682
5353	NC_008321	TG	3	6	360813	360818	0 %	50 %	50 %	0 %	113968683
5354	NC_008321	AG	3	6	360825	360830	50 %	0 %	50 %	0 %	113968683
5355	NC_008321	TCG	2	6	360833	360838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968683
5356	NC_008321	CA	3	6	360936	360941	50 %	0 %	0 %	50 %	113968683
5357	NC_008321	CAT	2	6	361009	361014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968683
5358	NC_008321	CTG	2	6	361067	361072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968683
5359	NC_008321	TGCC	2	8	361105	361112	0 %	25 %	25 %	50 %	113968683
5360	NC_008321	TTCGAG	2	12	361150	361161	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	113968683
5361	NC_008321	AGC	2	6	361403	361408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968683
5362	NC_008321	AGCA	2	8	361442	361449	50 %	0 %	25 %	25 %	113968683
5363	NC_008321	CTT	2	6	361552	361557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968684
5364	NC_008321	ACC	2	6	361572	361577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113968684
5365	NC_008321	ATC	2	6	361653	361658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968684
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5367	NC_008321	CGG	2	6	361777	361782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968684
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5485	NC_008321	GA	3	6	368776	368781	50 %	0 %	50 %	0 %	113968689
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