MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella sp. MR-4 chromosome

Total Repeats: 71525

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_008321	TCG	2	6	305725	305730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968630
4502	NC_008321	TAG	2	6	305854	305859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968630
4503	NC_008321	AG	3	6	305938	305943	50 %	0 %	50 %	0 %	113968630
4504	NC_008321	TCG	2	6	306091	306096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968630
4505	NC_008321	GGC	2	6	306336	306341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968630
4506	NC_008321	AAC	2	6	306544	306549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113968630
4507	NC_008321	GTC	2	6	306601	306606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968630
4508	NC_008321	GTT	2	6	306615	306620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968630
4509	NC_008321	GTT	2	6	306635	306640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968630
4510	NC_008321	TTC	2	6	306642	306647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968630
4511	NC_008321	GTT	2	6	306705	306710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968630
4512	NC_008321	TGT	2	6	306716	306721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968630
4513	NC_008321	AAG	2	6	306778	306783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968630
4514	NC_008321	CGT	2	6	306816	306821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968630
4515	NC_008321	GTA	2	6	306852	306857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968630
4516	NC_008321	TTA	2	6	306865	306870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113968630
4517	NC_008321	GAC	2	6	306987	306992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968630
4518	NC_008321	T	6	6	307014	307019	0 %	100 %	0 %	0 %	113968630
4519	NC_008321	TGA	2	6	307031	307036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968630
4520	NC_008321	ATC	2	6	307099	307104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968630
4521	NC_008321	ACC	2	6	307131	307136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113968630
4522	NC_008321	GGCG	2	8	307183	307190	0 %	0 %	75 %	25 %	113968630
4523	NC_008321	TCT	2	6	307220	307225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968630
4524	NC_008321	ATA	2	6	307261	307266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113968630
4525	NC_008321	GTG	2	6	307282	307287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968630
4526	NC_008321	TTATTC	2	12	307396	307407	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	113968630
4527	NC_008321	CTT	2	6	307424	307429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968630
4528	NC_008321	GGC	2	6	307452	307457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968630
4529	NC_008321	CAA	2	6	307472	307477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113968630
4530	NC_008321	A	6	6	307848	307853	100 %	0 %	0 %	0 %	113968631
4531	NC_008321	AGC	2	6	307872	307877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968631
4532	NC_008321	AT	3	6	307889	307894	50 %	50 %	0 %	0 %	113968631
4533	NC_008321	GCGG	2	8	307907	307914	0 %	0 %	75 %	25 %	113968631
4534	NC_008321	TGC	2	6	307945	307950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968631
4535	NC_008321	GTC	2	6	307971	307976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968631
4536	NC_008321	CAC	2	6	308262	308267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113968632
4537	NC_008321	A	6	6	308280	308285	100 %	0 %	0 %	0 %	113968632
4538	NC_008321	GCG	2	6	308309	308314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968632
4539	NC_008321	AT	3	6	308348	308353	50 %	50 %	0 %	0 %	113968632
4540	NC_008321	AGC	2	6	308485	308490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968632
4541	NC_008321	GCT	2	6	308537	308542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968633
4542	NC_008321	GCC	2	6	308618	308623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968633
4543	NC_008321	TGG	2	6	308709	308714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968633
4544	NC_008321	GCA	2	6	308741	308746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968633
4545	NC_008321	TGA	2	6	308762	308767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968633
4546	NC_008321	TGC	2	6	308853	308858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968633
4547	NC_008321	CAA	2	6	308867	308872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113968633
4548	NC_008321	GTT	2	6	308912	308917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968633
4549	NC_008321	CAA	2	6	308931	308936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113968633
4550	NC_008321	GGC	2	6	308952	308957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968633
4551	NC_008321	AGT	2	6	309109	309114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968633
4552	NC_008321	CTTC	2	8	309188	309195	0 %	50 %	0 %	50 %	113968634
4553	NC_008321	CTG	2	6	309356	309361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968634
4554	NC_008321	ATC	2	6	309449	309454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968634
4555	NC_008321	GCA	2	6	309526	309531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968634
4556	NC_008321	GAA	2	6	309539	309544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968634
4557	NC_008321	CGC	2	6	309685	309690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968634
4558	NC_008321	TAA	2	6	309696	309701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113968634
4559	NC_008321	TGAG	2	8	309715	309722	25 %	25 %	50 %	0 %	113968634
4560	NC_008321	TTG	2	6	310041	310046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968635
4561	NC_008321	ACT	2	6	310065	310070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968635
4562	NC_008321	GTCT	2	8	310081	310088	0 %	50 %	25 %	25 %	113968635
4563	NC_008321	CCA	2	6	310106	310111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113968635
4564	NC_008321	TTGA	2	8	310115	310122	25 %	50 %	25 %	0 %	113968635
4565	NC_008321	CAG	2	6	310178	310183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968635
4566	NC_008321	CGC	3	9	310202	310210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968635
4567	NC_008321	CTG	2	6	310260	310265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968635
4568	NC_008321	TGT	2	6	310533	310538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968635
4569	NC_008321	TGGCG	2	10	310541	310550	0 %	20 %	60 %	20 %	113968635
4570	NC_008321	TGCC	2	8	310577	310584	0 %	25 %	25 %	50 %	113968635
4571	NC_008321	T	6	6	310603	310608	0 %	100 %	0 %	0 %	113968635
4572	NC_008321	GTGC	2	8	310671	310678	0 %	25 %	50 %	25 %	113968635
4573	NC_008321	AGCG	2	8	310679	310686	25 %	0 %	50 %	25 %	113968635
4574	NC_008321	AGCG	2	8	310742	310749	25 %	0 %	50 %	25 %	113968635
4575	NC_008321	GC	3	6	310818	310823	0 %	0 %	50 %	50 %	113968635
4576	NC_008321	CCG	2	6	310915	310920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968635
4577	NC_008321	GCTTG	2	10	310953	310962	0 %	40 %	40 %	20 %	113968635
4578	NC_008321	CAC	2	6	311023	311028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113968635
4579	NC_008321	ATA	2	6	311106	311111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113968635
4580	NC_008321	AAG	2	6	311430	311435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968636
4581	NC_008321	GC	3	6	311468	311473	0 %	0 %	50 %	50 %	113968636
4582	NC_008321	GCT	2	6	311547	311552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968636
4583	NC_008321	AAG	2	6	311661	311666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968636
4584	NC_008321	ATA	2	6	311721	311726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113968636
4585	NC_008321	GGC	2	6	311734	311739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968636
4586	NC_008321	AGC	2	6	311811	311816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968636
4587	NC_008321	GGT	2	6	311960	311965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968637
4588	NC_008321	CAG	2	6	311969	311974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968637
4589	NC_008321	GAT	2	6	312017	312022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968637
4590	NC_008321	ATG	2	6	312036	312041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968637
4591	NC_008321	TGG	2	6	312055	312060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968637
4592	NC_008321	GTAG	2	8	312105	312112	25 %	25 %	50 %	0 %	113968637
4593	NC_008321	CAA	2	6	312149	312154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113968637
4594	NC_008321	GGTT	2	8	312264	312271	0 %	50 %	50 %	0 %	113968637
4595	NC_008321	CAC	2	6	312275	312280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113968637
4596	NC_008321	AGTA	2	8	312322	312329	50 %	25 %	25 %	0 %	113968637
4597	NC_008321	CAT	3	9	312455	312463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968637
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4600	NC_008321	GAA	2	6	312569	312574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968637
4601	NC_008321	CAG	2	6	312617	312622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968637
4602	NC_008321	ACG	2	6	312710	312715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968637
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4604	NC_008321	CGC	2	6	312742	312747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968637
4605	NC_008321	TGC	2	6	312810	312815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968637
4606	NC_008321	GCC	2	6	312816	312821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968637
4607	NC_008321	TTC	2	6	312927	312932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968637
4608	NC_008321	GAT	2	6	312947	312952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968637
4609	NC_008321	GGT	2	6	313007	313012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968637
4610	NC_008321	GCG	2	6	313015	313020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968637
4611	NC_008321	GGC	2	6	313045	313050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968637
4612	NC_008321	CAT	2	6	313073	313078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968637
4613	NC_008321	ACC	2	6	313088	313093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113968637
4614	NC_008321	AACTC	2	10	313639	313648	40 %	20 %	0 %	40 %	113968638
4615	NC_008321	CAG	2	6	313671	313676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968638
4616	NC_008321	ACCG	2	8	313677	313684	25 %	0 %	25 %	50 %	113968638
4617	NC_008321	GCT	2	6	313757	313762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968638
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4619	NC_008321	GCC	2	6	313833	313838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968638
4620	NC_008321	GTC	2	6	313840	313845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968638
4621	NC_008321	ACC	2	6	313965	313970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113968638
4622	NC_008321	CGA	2	6	314018	314023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968638
4623	NC_008321	ACA	2	6	314041	314046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113968638
4624	NC_008321	TTA	2	6	314085	314090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113968638
4625	NC_008321	TC	3	6	314110	314115	0 %	50 %	0 %	50 %	113968638
4626	NC_008321	ATT	2	6	314186	314191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113968638
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4628	NC_008321	CTT	2	6	314213	314218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968638
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4630	NC_008321	TGG	2	6	314365	314370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968638
4631	NC_008321	ATG	2	6	314385	314390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968638
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4633	NC_008321	ATGC	2	8	314417	314424	25 %	25 %	25 %	25 %	113968638
4634	NC_008321	GATG	2	8	314438	314445	25 %	25 %	50 %	0 %	113968638
4635	NC_008321	GCA	2	6	314471	314476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968638
4636	NC_008321	AT	3	6	314570	314575	50 %	50 %	0 %	0 %	113968638
4637	NC_008321	AGC	2	6	314599	314604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968638
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4641	NC_008321	TAAGG	2	10	314749	314758	40 %	20 %	40 %	0 %	113968638
4642	NC_008321	TGC	2	6	314762	314767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968639
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4645	NC_008321	GGC	2	6	315052	315057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968639
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4647	NC_008321	TGA	2	6	315068	315073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968639
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4649	NC_008321	TG	3	6	315177	315182	0 %	50 %	50 %	0 %	113968639
4650	NC_008321	CAG	2	6	315247	315252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968639
4651	NC_008321	GCT	2	6	315293	315298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968639
4652	NC_008321	GGTT	2	8	315469	315476	0 %	50 %	50 %	0 %	113968639
4653	NC_008321	CTGCG	2	10	315530	315539	0 %	20 %	40 %	40 %	113968639
4654	NC_008321	GTC	2	6	315658	315663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968639
4655	NC_008321	GCGA	2	8	315737	315744	25 %	0 %	50 %	25 %	113968639
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4660	NC_008321	CAG	2	6	316105	316110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968640
4661	NC_008321	GCGGA	2	10	316116	316125	20 %	0 %	60 %	20 %	113968640
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4664	NC_008321	CCAA	2	8	316269	316276	50 %	0 %	0 %	50 %	113968640
4665	NC_008321	CAA	2	6	316498	316503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113968641
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4677	NC_008321	GCC	3	9	316955	316963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968641
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4682	NC_008321	ATG	2	6	317139	317144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968641
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4685	NC_008321	TGG	2	6	317281	317286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968641
4686	NC_008321	CGG	2	6	317398	317403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968641
4687	NC_008321	AAT	2	6	317405	317410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113968641
4688	NC_008321	T	6	6	317460	317465	0 %	100 %	0 %	0 %	113968641
4689	NC_008321	ACA	2	6	317530	317535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113968641
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4700	NC_008321	T	6	6	319080	319085	0 %	100 %	0 %	0 %	113968642
4701	NC_008321	TCA	2	6	319102	319107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968642
4702	NC_008321	TGAC	2	8	319133	319140	25 %	25 %	25 %	25 %	113968642
4703	NC_008321	A	6	6	319155	319160	100 %	0 %	0 %	0 %	113968642
4704	NC_008321	CTA	3	9	319162	319170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968642
4705	NC_008321	A	8	8	319191	319198	100 %	0 %	0 %	0 %	113968642
4706	NC_008321	CTT	2	6	319276	319281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968642
4707	NC_008321	AAAC	2	8	319288	319295	75 %	0 %	0 %	25 %	113968642
4708	NC_008321	TCT	2	6	319303	319308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968642
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4710	NC_008321	TA	3	6	319325	319330	50 %	50 %	0 %	0 %	113968642
4711	NC_008321	ACA	2	6	319384	319389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113968642
4712	NC_008321	CTG	2	6	319412	319417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968642
4713	NC_008321	ATAG	2	8	319444	319451	50 %	25 %	25 %	0 %	113968642
4714	NC_008321	CATTT	2	10	319465	319474	20 %	60 %	0 %	20 %	113968642
4715	NC_008321	AGA	2	6	319817	319822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968643
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4717	NC_008321	GGTGCT	2	12	319838	319849	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	113968643
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4720	NC_008321	CCAAT	2	10	320087	320096	40 %	20 %	0 %	40 %	113968643
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4722	NC_008321	GGC	2	6	320273	320278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968643
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4724	NC_008321	A	6	6	320354	320359	100 %	0 %	0 %	0 %	113968643
4725	NC_008321	ACA	2	6	320380	320385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113968643
4726	NC_008321	TCA	2	6	320400	320405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968643
4727	NC_008321	TTG	2	6	320421	320426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968643
4728	NC_008321	GGT	2	6	320519	320524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968643
4729	NC_008321	GGC	2	6	320699	320704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968643
4730	NC_008321	TGCTC	2	10	320719	320728	0 %	40 %	20 %	40 %	113968643
4731	NC_008321	ATGA	2	8	320783	320790	50 %	25 %	25 %	0 %	113968643
4732	NC_008321	T	6	6	320870	320875	0 %	100 %	0 %	0 %	113968643
4733	NC_008321	AGA	2	6	320899	320904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968643
4734	NC_008321	CAAA	2	8	320995	321002	75 %	0 %	0 %	25 %	113968643
4735	NC_008321	ACA	2	6	321015	321020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113968643
4736	NC_008321	ATG	2	6	321059	321064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968643
4737	NC_008321	ACT	2	6	321123	321128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968643
4738	NC_008321	TGC	2	6	321165	321170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968643
4739	NC_008321	GGC	2	6	321224	321229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968643
4740	NC_008321	ATG	2	6	321332	321337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968644
4741	NC_008321	TAC	2	6	321345	321350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968644
4742	NC_008321	GTT	2	6	321359	321364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968644
4743	NC_008321	GCA	2	6	321432	321437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968644
4744	NC_008321	ATTT	2	8	321445	321452	25 %	75 %	0 %	0 %	113968644
4745	NC_008321	CCA	2	6	321475	321480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113968644
4746	NC_008321	CA	3	6	321588	321593	50 %	0 %	0 %	50 %	113968644
4747	NC_008321	GCT	2	6	321621	321626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968644
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4749	NC_008321	ATG	3	9	321739	321747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968645
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4751	NC_008321	TGT	2	6	321767	321772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968645
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4850	NC_008321	GTA	2	6	328369	328374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968649
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4859	NC_008321	ACGT	2	8	328843	328850	25 %	25 %	25 %	25 %	113968649
4860	NC_008321	GAA	2	6	328861	328866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968649
4861	NC_008321	TTCTGG	2	12	328867	328878	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	113968649
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4864	NC_008321	TTC	2	6	329014	329019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968649
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4869	NC_008321	TGC	2	6	329171	329176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968649
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4972	NC_008321	A	6	6	337921	337926	100 %	0 %	0 %	0 %	113968655
4973	NC_008321	GCG	2	6	337955	337960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968655
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