MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Shewanella sp. MR-7 plasmid1

Total Repeats: 48

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008320	TCT	2	6	944	949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113951723
2	NC_008320	TTA	2	6	1155	1160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113951723
3	NC_008320	GAA	2	6	1173	1178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113951723
4	NC_008320	CCT	2	6	1294	1299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113951723
5	NC_008320	CTA	2	6	1356	1361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113951723
6	NC_008320	GCC	2	6	1686	1691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113951724
7	NC_008320	GGC	2	6	1723	1728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113951724
8	NC_008320	CTG	2	6	1750	1755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113951724
9	NC_008320	AAC	2	6	1822	1827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113951724
10	NC_008320	ACA	2	6	1863	1868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113951724
11	NC_008320	CTT	2	6	1870	1875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113951724
12	NC_008320	TAC	2	6	1888	1893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113951724
13	NC_008320	TAA	2	6	1894	1899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113951724
14	NC_008320	GAA	2	6	1949	1954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113951724
15	NC_008320	AGA	2	6	2018	2023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113951724
16	NC_008320	AAG	2	6	2041	2046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113951724
17	NC_008320	TAT	2	6	2147	2152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113951725
18	NC_008320	ATC	2	6	2163	2168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113951725
19	NC_008320	CAA	2	6	2177	2182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113951725
20	NC_008320	TAG	2	6	2219	2224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113951725
21	NC_008320	ACT	2	6	2238	2243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113951725
22	NC_008320	TTG	2	6	2353	2358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113951725
23	NC_008320	TGT	2	6	2528	2533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113951725
24	NC_008320	TCT	2	6	2654	2659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113951726
25	NC_008320	TTC	2	6	2695	2700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113951726
26	NC_008320	AAC	2	6	2828	2833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113951726
27	NC_008320	TAT	2	6	2850	2855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113951726
28	NC_008320	ATC	2	6	4088	4093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113951728
29	NC_008320	CAA	2	6	4131	4136	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113951728
30	NC_008320	CAT	2	6	4145	4150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113951728
31	NC_008320	CTT	2	6	4218	4223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113951728
32	NC_008320	GAT	2	6	4265	4270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113951728
33	NC_008320	CTT	2	6	4356	4361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113951728
34	NC_008320	GTG	2	6	4978	4983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113951729
35	NC_008320	TGC	2	6	4993	4998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113951729
36	NC_008320	ACT	2	6	5137	5142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113951729
37	NC_008320	GCC	2	6	5184	5189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113951729
38	NC_008320	TTC	2	6	5502	5507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113951730
39	NC_008320	CCA	2	6	5575	5580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113951730
40	NC_008320	GCT	2	6	5618	5623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113951730
41	NC_008320	GCT	2	6	5696	5701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113951730
42	NC_008320	GTT	2	6	5774	5779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113951730
43	NC_008320	CGC	2	6	5843	5848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113951730
44	NC_008320	CGC	2	6	5887	5892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113951730
45	NC_008320	TGC	2	6	5905	5910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113951730
46	NC_008320	CTT	2	6	6119	6124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113951730
47	NC_008320	CAA	2	6	6138	6143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113951730
48	NC_008320	CTT	2	6	6183	6188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113951730

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.