MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 44579

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
44501	NC_008319	TC	3	6	2601956	2601961	0 %	50 %	0 %	50 %	113954486
44502	NC_008319	TGC	2	6	2601999	2602004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954486
44503	NC_008319	TCG	2	6	2602161	2602166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954486
44504	NC_008319	CAA	2	6	2602190	2602195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954486
44505	NC_008319	TCC	2	6	2602206	2602211	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954486
44506	NC_008319	GAC	2	6	2602225	2602230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954486
44507	NC_008319	ACTC	2	8	2602288	2602295	25 %	25 %	0 %	50 %	113954486
44508	NC_008319	TCGA	2	8	2602334	2602341	25 %	25 %	25 %	25 %	113954486
44509	NC_008319	ACG	2	6	2602346	2602351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954486
44510	NC_008319	AAGC	2	8	2602366	2602373	50 %	0 %	25 %	25 %	113954486
44511	NC_008319	TCAA	2	8	2602401	2602408	50 %	25 %	0 %	25 %	113954486
44512	NC_008319	TGC	2	6	2602431	2602436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954486
44513	NC_008319	GCT	2	6	2602469	2602474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954486
44514	NC_008319	TCA	2	6	2602527	2602532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954486
44515	NC_008319	CGC	2	6	2602557	2602562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113954486
44516	NC_008319	GCA	2	6	2602563	2602568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954486
44517	NC_008319	CG	3	6	2602598	2602603	0 %	0 %	50 %	50 %	113954486
44518	NC_008319	TGT	2	6	2602765	2602770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954486
44519	NC_008319	GGC	2	6	2602861	2602866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954943
44520	NC_008319	CTG	2	6	2602967	2602972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954943
44521	NC_008319	CGC	2	6	2602973	2602978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113954943
44522	NC_008319	TCA	2	6	2603121	2603126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954943
44523	NC_008319	TCC	2	6	2603164	2603169	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954943
44524	NC_008319	TGC	2	6	2603172	2603177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954943
44525	NC_008319	TGC	2	6	2603431	2603436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954943
44526	NC_008319	TTG	2	6	2603475	2603480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954943
44527	NC_008319	CGA	2	6	2603488	2603493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954943
44528	NC_008319	GAA	2	6	2603513	2603518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113954943
44529	NC_008319	CAAA	2	8	2603547	2603554	75 %	0 %	0 %	25 %	113954943
44530	NC_008319	CCA	2	6	2603613	2603618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954943
44531	NC_008319	CTT	2	6	2603744	2603749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954943
44532	NC_008319	CTT	2	6	2603789	2603794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954943
44533	NC_008319	ATG	2	6	2603834	2603839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954943
44534	NC_008319	TGAC	2	8	2604045	2604052	25 %	25 %	25 %	25 %	113954943
44535	NC_008319	AGATCC	2	12	2604214	2604225	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	113954943
44536	NC_008319	TGT	2	6	2604252	2604257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954943
44537	NC_008319	TCG	2	6	2604297	2604302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954943
44538	NC_008319	CGG	2	6	2604379	2604384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954943
44539	NC_008319	CAAT	2	8	2604394	2604401	50 %	25 %	0 %	25 %	113954943
44540	NC_008319	ACC	2	6	2604487	2604492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954943
44541	NC_008319	TAC	2	6	2604495	2604500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954943
44542	NC_008319	TC	3	6	2604515	2604520	0 %	50 %	0 %	50 %	113954943
44543	NC_008319	AGC	3	9	2604709	2604717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954943
44544	NC_008319	GCC	2	6	2604772	2604777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953119
44545	NC_008319	CGAT	2	8	2604882	2604889	25 %	25 %	25 %	25 %	113953119
44546	NC_008319	GTGA	2	8	2604894	2604901	25 %	25 %	50 %	0 %	113953119
44547	NC_008319	TTCT	2	8	2604940	2604947	0 %	75 %	0 %	25 %	113953119
44548	NC_008319	TTC	2	6	2604952	2604957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953119
44549	NC_008319	AAG	2	6	2604979	2604984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113953119
44550	NC_008319	TCA	2	6	2605063	2605068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953119
44551	NC_008319	AGA	2	6	2605166	2605171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113953119
44552	NC_008319	G	6	6	2605172	2605177	0 %	0 %	100 %	0 %	113953119
44553	NC_008319	CAG	2	6	2605210	2605215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953119
44554	NC_008319	TTC	2	6	2605290	2605295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953119
44555	NC_008319	CCAT	2	8	2605547	2605554	25 %	25 %	0 %	50 %	113953941
44556	NC_008319	TCA	2	6	2605587	2605592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953941
44557	NC_008319	ACG	2	6	2605596	2605601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953941
44558	NC_008319	AAG	2	6	2605662	2605667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113953941
44559	NC_008319	GCC	5	15	2605712	2605726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953941
44560	NC_008319	AGC	2	6	2605873	2605878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953941
44561	NC_008319	A	6	6	2605935	2605940	100 %	0 %	0 %	0 %	113953941
44562	NC_008319	TCG	2	6	2605956	2605961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953941
44563	NC_008319	CAA	2	6	2606051	2606056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953941
44564	NC_008319	ATG	2	6	2606084	2606089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953941
44565	NC_008319	TGAA	2	8	2606121	2606128	50 %	25 %	25 %	0 %	113953941
44566	NC_008319	ACC	2	6	2606129	2606134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953941
44567	NC_008319	GA	3	6	2606190	2606195	50 %	0 %	50 %	0 %	113953941
44568	NC_008319	CCTT	2	8	2606229	2606236	0 %	50 %	0 %	50 %	113953941
44569	NC_008319	GAA	2	6	2606249	2606254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113953941
44570	NC_008319	CGG	2	6	2606278	2606283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953941
44571	NC_008319	AAG	2	6	2606286	2606291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113953941
44572	NC_008319	TCT	2	6	2606295	2606300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953941
44573	NC_008319	GGT	2	6	2606371	2606376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953941
44574	NC_008319	TG	3	6	2606378	2606383	0 %	50 %	50 %	0 %	113953941
44575	NC_008319	CAA	3	9	2606422	2606430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953941
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44577	NC_008319	ACC	2	6	2606468	2606473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953941
44578	NC_008319	CAG	2	6	2606522	2606527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954741
44579	NC_008319	CTGC	2	8	2606563	2606570	0 %	25 %	25 %	50 %	113954741

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.