MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 44579

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
44001	NC_008319	GAC	2	6	2575427	2575432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953854
44002	NC_008319	CAC	2	6	2575442	2575447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953854
44003	NC_008319	AATC	2	8	2575467	2575474	50 %	25 %	0 %	25 %	113953854
44004	NC_008319	CAC	2	6	2575507	2575512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953854
44005	NC_008319	ACCA	2	8	2575555	2575562	50 %	0 %	0 %	50 %	113953854
44006	NC_008319	AAAG	2	8	2575626	2575633	75 %	0 %	25 %	0 %	113953854
44007	NC_008319	CCCA	2	8	2575651	2575658	25 %	0 %	0 %	75 %	113953854
44008	NC_008319	GA	3	6	2575662	2575667	50 %	0 %	50 %	0 %	113953854
44009	NC_008319	CAA	2	6	2575701	2575706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953854
44010	NC_008319	CTC	2	6	2575759	2575764	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113953854
44011	NC_008319	CAG	2	6	2575776	2575781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953854
44012	NC_008319	AG	3	6	2575780	2575785	50 %	0 %	50 %	0 %	113953854
44013	NC_008319	ACA	3	9	2575790	2575798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953854
44014	NC_008319	GGCCAA	2	12	2576008	2576019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953700
44015	NC_008319	TCC	2	6	2576051	2576056	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113953700
44016	NC_008319	TCA	2	6	2576060	2576065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953700
44017	NC_008319	CAT	2	6	2576106	2576111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953700
44018	NC_008319	C	6	6	2576157	2576162	0 %	0 %	0 %	100 %	113953700
44019	NC_008319	ATG	2	6	2576215	2576220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953700
44020	NC_008319	CCA	2	6	2576384	2576389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953700
44021	NC_008319	CAC	2	6	2576394	2576399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953700
44022	NC_008319	GAT	2	6	2576418	2576423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953700
44023	NC_008319	CAC	2	6	2576457	2576462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953700
44024	NC_008319	CAC	2	6	2576559	2576564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953700
44025	NC_008319	AAC	2	6	2576654	2576659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953700
44026	NC_008319	GTG	2	6	2576677	2576682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953700
44027	NC_008319	GCC	2	6	2576701	2576706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953700
44028	NC_008319	GCC	2	6	2576711	2576716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953700
44029	NC_008319	CCAG	2	8	2576723	2576730	25 %	0 %	25 %	50 %	113953700
44030	NC_008319	CTCA	2	8	2576731	2576738	25 %	25 %	0 %	50 %	113953700
44031	NC_008319	GCAG	2	8	2577024	2577031	25 %	0 %	50 %	25 %	113953071
44032	NC_008319	GCC	2	6	2577074	2577079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953071
44033	NC_008319	GGTC	2	8	2577139	2577146	0 %	25 %	50 %	25 %	113953071
44034	NC_008319	TGT	2	6	2577153	2577158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953071
44035	NC_008319	ATCA	2	8	2577161	2577168	50 %	25 %	0 %	25 %	113953071
44036	NC_008319	CAA	2	6	2577199	2577204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953071
44037	NC_008319	GGC	2	6	2577208	2577213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953071
44038	NC_008319	AAG	2	6	2577222	2577227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113953071
44039	NC_008319	GCC	2	6	2577248	2577253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953071
44040	NC_008319	CCG	2	6	2577333	2577338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953071
44041	NC_008319	TGGTGC	2	12	2577372	2577383	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	113954907
44042	NC_008319	GATC	2	8	2577438	2577445	25 %	25 %	25 %	25 %	113954907
44043	NC_008319	GCA	2	6	2577470	2577475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954907
44044	NC_008319	TCG	2	6	2577540	2577545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954907
44045	NC_008319	GCA	2	6	2577578	2577583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954907
44046	NC_008319	C	6	6	2577629	2577634	0 %	0 %	0 %	100 %	113954907
44047	NC_008319	TCAGC	2	10	2577737	2577746	20 %	20 %	20 %	40 %	113954907
44048	NC_008319	GGA	2	6	2577802	2577807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113954907
44049	NC_008319	CGC	2	6	2577862	2577867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113954907
44050	NC_008319	GAC	2	6	2577909	2577914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954907
44051	NC_008319	ACA	2	6	2577974	2577979	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954907
44052	NC_008319	TGT	2	6	2577993	2577998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954907
44053	NC_008319	TGC	2	6	2578028	2578033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954907
44054	NC_008319	CAG	2	6	2578127	2578132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954907
44055	NC_008319	TTGGC	2	10	2578182	2578191	0 %	40 %	40 %	20 %	113954907
44056	NC_008319	GAG	2	6	2578225	2578230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113954907
44057	NC_008319	ATGGC	2	10	2578299	2578308	20 %	20 %	40 %	20 %	113954907
44058	NC_008319	GGC	2	6	2578328	2578333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954907
44059	NC_008319	ACT	2	6	2578447	2578452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954907
44060	NC_008319	CCT	2	6	2578466	2578471	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954907
44061	NC_008319	GCACT	2	10	2578583	2578592	20 %	20 %	20 %	40 %	113954280
44062	NC_008319	CTGC	2	8	2578622	2578629	0 %	25 %	25 %	50 %	113954280
44063	NC_008319	TCG	2	6	2578630	2578635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954280
44064	NC_008319	ACA	2	6	2578656	2578661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954280
44065	NC_008319	CGT	2	6	2578866	2578871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954280
44066	NC_008319	CTCA	2	8	2578936	2578943	25 %	25 %	0 %	50 %	113954280
44067	NC_008319	GCCAA	2	10	2579000	2579009	40 %	0 %	20 %	40 %	113954280
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44071	NC_008319	AGC	2	6	2579095	2579100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954280
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44074	NC_008319	TCGA	2	8	2579311	2579318	25 %	25 %	25 %	25 %	113954280
44075	NC_008319	CAACGG	2	12	2579403	2579414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954280
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44080	NC_008319	A	8	8	2580333	2580340	100 %	0 %	0 %	0 %	113954871
44081	NC_008319	TCA	3	9	2580392	2580400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954871
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44084	NC_008319	CAT	2	6	2580479	2580484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954871
44085	NC_008319	TCA	2	6	2580521	2580526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954871
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44087	NC_008319	CT	3	6	2580568	2580573	0 %	50 %	0 %	50 %	113954871
44088	NC_008319	ATT	2	6	2580654	2580659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113954871
44089	NC_008319	CA	3	6	2580736	2580741	50 %	0 %	0 %	50 %	113954871
44090	NC_008319	TTTCC	2	10	2580778	2580787	0 %	60 %	0 %	40 %	113954871
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44093	NC_008319	AACC	2	8	2580904	2580911	50 %	0 %	0 %	50 %	113954871
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44101	NC_008319	CCT	2	6	2581127	2581132	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954871
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44103	NC_008319	ACAG	2	8	2581140	2581147	50 %	0 %	25 %	25 %	113954871
44104	NC_008319	GTC	2	6	2581177	2581182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954871
44105	NC_008319	G	6	6	2581223	2581228	0 %	0 %	100 %	0 %	113954871
44106	NC_008319	GTC	2	6	2581241	2581246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954871
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44112	NC_008319	GTT	2	6	2581495	2581500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954871
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44114	NC_008319	CATT	2	8	2581599	2581606	25 %	50 %	0 %	25 %	113954871
44115	NC_008319	GCA	2	6	2581626	2581631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954871
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44117	NC_008319	TTA	2	6	2581677	2581682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113954871
44118	NC_008319	TAA	2	6	2581776	2581781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113954871
44119	NC_008319	AGATT	2	10	2581792	2581801	40 %	40 %	20 %	0 %	113954871
44120	NC_008319	AT	3	6	2581808	2581813	50 %	50 %	0 %	0 %	113954871
44121	NC_008319	GAAA	2	8	2581825	2581832	75 %	0 %	25 %	0 %	113954871
44122	NC_008319	AG	3	6	2581916	2581921	50 %	0 %	50 %	0 %	113954871
44123	NC_008319	AAAT	2	8	2581967	2581974	75 %	25 %	0 %	0 %	113954871
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44149	NC_008319	GGATG	2	10	2583669	2583678	20 %	20 %	60 %	0 %	113953173
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44154	NC_008319	CCCA	2	8	2583843	2583850	25 %	0 %	0 %	75 %	113953173
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44217	NC_008319	C	6	6	2587300	2587305	0 %	0 %	0 %	100 %	113953842
44218	NC_008319	GCA	2	6	2587350	2587355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953842
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44221	NC_008319	GAT	2	6	2587451	2587456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953557
44222	NC_008319	TGT	2	6	2587505	2587510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953557
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44227	NC_008319	TGCC	2	8	2587832	2587839	0 %	25 %	25 %	50 %	113953557
44228	NC_008319	ATTG	2	8	2587887	2587894	25 %	50 %	25 %	0 %	113953557
44229	NC_008319	ACC	2	6	2587905	2587910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953557
44230	NC_008319	GATCTC	2	12	2587920	2587931	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	113953557
44231	NC_008319	CCA	2	6	2587994	2587999	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953557
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44233	NC_008319	T	6	6	2588067	2588072	0 %	100 %	0 %	0 %	113953557
44234	NC_008319	TCC	2	6	2588119	2588124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113953557
44235	NC_008319	GAC	2	6	2588276	2588281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953557
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44237	NC_008319	CG	3	6	2588343	2588348	0 %	0 %	50 %	50 %	113953557
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44352	NC_008319	ATC	2	6	2594258	2594263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953186
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44452	NC_008319	ATCTGT	2	12	2599553	2599564	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	113953342
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44460	NC_008319	GCAT	2	8	2600188	2600195	25 %	25 %	25 %	25 %	113953342
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44465	NC_008319	CAC	2	6	2600283	2600288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953342
44466	NC_008319	CCA	2	6	2600355	2600360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953342
44467	NC_008319	TGA	2	6	2600378	2600383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953342
44468	NC_008319	CAG	2	6	2600454	2600459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953342
44469	NC_008319	T	7	7	2600491	2600497	0 %	100 %	0 %	0 %	113953342
44470	NC_008319	CT	3	6	2600801	2600806	0 %	50 %	0 %	50 %	113953342
44471	NC_008319	ACC	2	6	2600885	2600890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953342
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44477	NC_008319	CGA	2	6	2601013	2601018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953342
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44484	NC_008319	CCT	2	6	2601247	2601252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954486
44485	NC_008319	TGA	2	6	2601267	2601272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954486
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44488	NC_008319	CA	3	6	2601305	2601310	50 %	0 %	0 %	50 %	113954486
44489	NC_008319	GCA	2	6	2601340	2601345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954486
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44492	NC_008319	CCT	2	6	2601471	2601476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954486
44493	NC_008319	A	6	6	2601528	2601533	100 %	0 %	0 %	0 %	113954486
44494	NC_008319	TCA	2	6	2601625	2601630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954486
44495	NC_008319	CTC	2	6	2601635	2601640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954486
44496	NC_008319	CCT	2	6	2601709	2601714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954486
44497	NC_008319	CAC	2	6	2601751	2601756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954486
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44499	NC_008319	GCA	2	6	2601859	2601864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954486
44500	NC_008319	CT	3	6	2601885	2601890	0 %	50 %	0 %	50 %	113954486

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