MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 44579

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_008319	TGG	2	6	131981	131986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954123
2502	NC_008319	GGC	2	6	132076	132081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954123
2503	NC_008319	GCG	2	6	132106	132111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954123
2504	NC_008319	CAC	2	6	132126	132131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954123
2505	NC_008319	GTG	2	6	132142	132147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954123
2506	NC_008319	C	6	6	132185	132190	0 %	0 %	0 %	100 %	113954123
2507	NC_008319	GTG	2	6	132199	132204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954123
2508	NC_008319	GTTG	2	8	132277	132284	0 %	50 %	50 %	0 %	113954451
2509	NC_008319	GTG	2	6	132312	132317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954451
2510	NC_008319	GCC	2	6	132400	132405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113954451
2511	NC_008319	GGGAT	2	10	132431	132440	20 %	20 %	60 %	0 %	113954451
2512	NC_008319	GAC	2	6	132462	132467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954451
2513	NC_008319	GCT	2	6	132468	132473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954451
2514	NC_008319	AGA	2	6	132563	132568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113954451
2515	NC_008319	GAG	2	6	132600	132605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113954451
2516	NC_008319	GCA	2	6	132611	132616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954451
2517	NC_008319	GGAA	2	8	132619	132626	50 %	0 %	50 %	0 %	113954451
2518	NC_008319	GC	3	6	132780	132785	0 %	0 %	50 %	50 %	113954451
2519	NC_008319	CAG	2	6	132788	132793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954451
2520	NC_008319	CGT	2	6	132858	132863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954451
2521	NC_008319	GGCT	2	8	132887	132894	0 %	25 %	50 %	25 %	113954451
2522	NC_008319	GCG	2	6	132948	132953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954451
2523	NC_008319	GCC	2	6	133013	133018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113954451
2524	NC_008319	ACC	3	9	133067	133075	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954451
2525	NC_008319	TGGC	2	8	133213	133220	0 %	25 %	50 %	25 %	113955421
2526	NC_008319	CCT	2	6	133347	133352	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113955421
2527	NC_008319	ATGC	2	8	133367	133374	25 %	25 %	25 %	25 %	113955421
2528	NC_008319	TTG	2	6	133421	133426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113955421
2529	NC_008319	AGG	2	6	133431	133436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113955421
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2531	NC_008319	GC	3	6	133507	133512	0 %	0 %	50 %	50 %	113955421
2532	NC_008319	GTT	2	6	133540	133545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113955421
2533	NC_008319	GCT	2	6	133610	133615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955421
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2536	NC_008319	AGG	2	6	133722	133727	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113955421
2537	NC_008319	GTC	2	6	133734	133739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955421
2538	NC_008319	TGG	2	6	133761	133766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955421
2539	NC_008319	CCT	2	6	133825	133830	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113955421
2540	NC_008319	GAG	2	6	133886	133891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113955421
2541	NC_008319	C	6	6	133955	133960	0 %	0 %	0 %	100 %	113955421
2542	NC_008319	AAC	2	6	134010	134015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113955421
2543	NC_008319	CCCT	2	8	134048	134055	0 %	25 %	0 %	75 %	113955421
2544	NC_008319	GCA	2	6	134097	134102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955421
2545	NC_008319	GATG	2	8	134129	134136	25 %	25 %	50 %	0 %	113955421
2546	NC_008319	GCA	2	6	134281	134286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954946
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2549	NC_008319	GTG	2	6	134395	134400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954946
2550	NC_008319	CGT	2	6	134404	134409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954946
2551	NC_008319	CGC	2	6	134413	134418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113954946
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2554	NC_008319	GAG	2	6	134504	134509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113954126
2555	NC_008319	GC	3	6	134512	134517	0 %	0 %	50 %	50 %	113954126
2556	NC_008319	AAC	2	6	134631	134636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954126
2557	NC_008319	TGC	2	6	134718	134723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954126
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2559	NC_008319	GC	3	6	134746	134751	0 %	0 %	50 %	50 %	113954126
2560	NC_008319	GCT	2	6	134756	134761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954126
2561	NC_008319	TTGG	2	8	134833	134840	0 %	50 %	50 %	0 %	113954126
2562	NC_008319	GCA	2	6	134847	134852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954126
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2565	NC_008319	GGTT	2	8	134973	134980	0 %	50 %	50 %	0 %	113954126
2566	NC_008319	GCT	2	6	135022	135027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954126
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2569	NC_008319	GCT	3	9	135065	135073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954126
2570	NC_008319	CTAA	2	8	135091	135098	50 %	25 %	0 %	25 %	113954126
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2572	NC_008319	GTG	2	6	135361	135366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955068
2573	NC_008319	GAT	2	6	135444	135449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955068
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2577	NC_008319	TCGA	2	8	135730	135737	25 %	25 %	25 %	25 %	113955068
2578	NC_008319	GAT	2	6	135751	135756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955068
2579	NC_008319	CAT	2	6	135765	135770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955068
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2583	NC_008319	TGC	2	6	136032	136037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955068
2584	NC_008319	CTGAA	2	10	136046	136055	40 %	20 %	20 %	20 %	113955068
2585	NC_008319	GAA	2	6	136155	136160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113955068
2586	NC_008319	TGGCA	2	10	136273	136282	20 %	20 %	40 %	20 %	113955068
2587	NC_008319	GGA	2	6	136335	136340	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113955068
2588	NC_008319	GAT	2	6	136423	136428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955068
2589	NC_008319	ACG	2	6	136511	136516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955068
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2591	NC_008319	CAAG	2	8	136539	136546	50 %	0 %	25 %	25 %	113955068
2592	NC_008319	TG	3	6	136562	136567	0 %	50 %	50 %	0 %	113955068
2593	NC_008319	GGAC	2	8	136614	136621	25 %	0 %	50 %	25 %	113955068
2594	NC_008319	TGC	2	6	136647	136652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955068
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2600	NC_008319	TCG	2	6	137086	137091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953070
2601	NC_008319	GAC	2	6	137115	137120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953070
2602	NC_008319	CCG	2	6	137239	137244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953070
2603	NC_008319	TCGA	2	8	137257	137264	25 %	25 %	25 %	25 %	113953070
2604	NC_008319	CAC	2	6	137348	137353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953070
2605	NC_008319	GATGG	2	10	137410	137419	20 %	20 %	60 %	0 %	113953070
2606	NC_008319	TGG	2	6	137431	137436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953070
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2608	NC_008319	GCC	2	6	137556	137561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953070
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2612	NC_008319	GCC	2	6	137727	137732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953070
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2619	NC_008319	TGA	2	6	138128	138133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953070
2620	NC_008319	TTG	2	6	138142	138147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953070
2621	NC_008319	GCCA	2	8	138224	138231	25 %	0 %	25 %	50 %	113953070
2622	NC_008319	GTGAT	2	10	138292	138301	20 %	40 %	40 %	0 %	113953070
2623	NC_008319	GTC	2	6	138303	138308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953070
2624	NC_008319	CAAT	2	8	138317	138324	50 %	25 %	0 %	25 %	113953070
2625	NC_008319	GGCC	2	8	138341	138348	0 %	0 %	50 %	50 %	113953070
2626	NC_008319	TTG	2	6	138439	138444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953070
2627	NC_008319	GGT	2	6	138516	138521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953070
2628	NC_008319	GTC	2	6	138597	138602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953070
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2630	NC_008319	GCA	2	6	138647	138652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953070
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2653	NC_008319	CAG	2	6	140006	140011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953673
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2737	NC_008319	A	8	8	144634	144641	100 %	0 %	0 %	0 %	113954640
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2741	NC_008319	TTA	2	6	144740	144745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113954640
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2987	NC_008319	TCA	2	6	158373	158378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954055
2988	NC_008319	GAG	2	6	158396	158401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113954055
2989	NC_008319	CAATC	2	10	158402	158411	40 %	20 %	0 %	40 %	113954055
2990	NC_008319	ATACGG	2	12	158443	158454	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	113954055
2991	NC_008319	GATATG	3	18	158457	158474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954055
2992	NC_008319	ACA	2	6	158481	158486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954055
2993	NC_008319	AGA	2	6	158524	158529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113954055
2994	NC_008319	CAA	2	6	158650	158655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953412
2995	NC_008319	CTC	2	6	158705	158710	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113953412
2996	NC_008319	GAGCG	2	10	158711	158720	20 %	0 %	60 %	20 %	113953412
2997	NC_008319	GAG	2	6	158776	158781	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113953412
2998	NC_008319	CAC	2	6	158786	158791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953412
2999	NC_008319	CT	3	6	158799	158804	0 %	50 %	0 %	50 %	113953412
3000	NC_008319	TGCC	2	8	158817	158824	0 %	25 %	25 %	50 %	113953412

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