MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 44579

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_008319	AGT	2	6	105310	105315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954483
2003	NC_008319	TGA	2	6	105472	105477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954483
2004	NC_008319	CCT	2	6	105552	105557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954483
2005	NC_008319	CTG	2	6	105577	105582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954483
2006	NC_008319	GAA	2	6	105701	105706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113954483
2007	NC_008319	TGA	2	6	105751	105756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954483
2008	NC_008319	TCT	2	6	105777	105782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954483
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2011	NC_008319	AGGA	2	8	105902	105909	50 %	0 %	50 %	0 %	113954483
2012	NC_008319	CAC	2	6	105929	105934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954483
2013	NC_008319	AGCC	2	8	105949	105956	25 %	0 %	25 %	50 %	113954483
2014	NC_008319	GCG	2	6	105965	105970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954483
2015	NC_008319	ATC	2	6	105978	105983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954483
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2122	NC_008319	C	6	6	112024	112029	0 %	0 %	0 %	100 %	113952912
2123	NC_008319	AGC	2	6	112070	112075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952912
2124	NC_008319	TCC	2	6	112105	112110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113952912
2125	NC_008319	AGA	2	6	112120	112125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113952912
2126	NC_008319	TCT	2	6	112141	112146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113952912
2127	NC_008319	C	6	6	112155	112160	0 %	0 %	0 %	100 %	113952912
2128	NC_008319	AC	3	6	112164	112169	50 %	0 %	0 %	50 %	113952912
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2130	NC_008319	TCC	2	6	112341	112346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113952896
2131	NC_008319	CCA	2	6	112356	112361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113952896
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2133	NC_008319	TTG	2	6	112377	112382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113952896
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2137	NC_008319	TGG	2	6	112572	112577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113952896
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2230	NC_008319	TGA	2	6	117168	117173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953317
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2232	NC_008319	CTGAG	2	10	117318	117327	20 %	20 %	40 %	20 %	113953317
2233	NC_008319	GTCT	2	8	117861	117868	0 %	50 %	25 %	25 %	113952923
2234	NC_008319	TGC	2	6	117946	117951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952923
2235	NC_008319	GCA	2	6	118021	118026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952923
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2240	NC_008319	GAG	2	6	118178	118183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113952923
2241	NC_008319	CG	3	6	118186	118191	0 %	0 %	50 %	50 %	113952923
2242	NC_008319	GCC	2	6	118194	118199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113952923
2243	NC_008319	CTG	2	6	118278	118283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952923
2244	NC_008319	GGT	2	6	118463	118468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113952923
2245	NC_008319	CGC	2	6	118496	118501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113952923
2246	NC_008319	CCG	2	6	118506	118511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113952923
2247	NC_008319	CCT	2	6	118605	118610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954014
2248	NC_008319	TCC	2	6	118624	118629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954014
2249	NC_008319	AAG	2	6	118672	118677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113954014
2250	NC_008319	TGC	2	6	118707	118712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954014
2251	NC_008319	TTC	2	6	118714	118719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954014
2252	NC_008319	GAT	2	6	118762	118767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954014
2253	NC_008319	GAG	2	6	118771	118776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113954014
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2255	NC_008319	TCG	3	9	118850	118858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954014
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2258	NC_008319	TCG	2	6	119119	119124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954196
2259	NC_008319	GTG	2	6	119219	119224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954196
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2261	NC_008319	CGGT	2	8	119256	119263	0 %	25 %	50 %	25 %	113954196
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2263	NC_008319	GTGCG	2	10	119307	119316	0 %	20 %	60 %	20 %	113954196
2264	NC_008319	TTCA	2	8	119375	119382	25 %	50 %	0 %	25 %	113954196
2265	NC_008319	TGG	3	9	119421	119429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954196
2266	NC_008319	GCCGT	2	10	119460	119469	0 %	20 %	40 %	40 %	113954196
2267	NC_008319	AGGC	2	8	119475	119482	25 %	0 %	50 %	25 %	113954196
2268	NC_008319	CGA	2	6	119512	119517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954196
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2273	NC_008319	GATG	2	8	119794	119801	25 %	25 %	50 %	0 %	113954196
2274	NC_008319	CCT	2	6	119815	119820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954196
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2277	NC_008319	C	7	7	119928	119934	0 %	0 %	0 %	100 %	113954196
2278	NC_008319	GGC	2	6	119941	119946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954196
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2280	NC_008319	GTG	2	6	120068	120073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954196
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2282	NC_008319	CTC	2	6	120174	120179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954774
2283	NC_008319	GCTC	2	8	120231	120238	0 %	25 %	25 %	50 %	113954774
2284	NC_008319	ATGCCT	2	12	120290	120301	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	113954774
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2340	NC_008319	GAC	2	6	122907	122912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954007
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2348	NC_008319	TGGC	2	8	123148	123155	0 %	25 %	50 %	25 %	113954007
2349	NC_008319	GAC	2	6	123171	123176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954007
2350	NC_008319	GAACG	2	10	123349	123358	40 %	0 %	40 %	20 %	113954007
2351	NC_008319	CTT	2	6	123387	123392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954007
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2356	NC_008319	CT	3	6	123696	123701	0 %	50 %	0 %	50 %	113955017
2357	NC_008319	CGAG	2	8	123841	123848	25 %	0 %	50 %	25 %	113955017
2358	NC_008319	TGA	2	6	123876	123881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955017
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2360	NC_008319	GCTCA	2	10	123980	123989	20 %	20 %	20 %	40 %	113955017
2361	NC_008319	TGG	2	6	123996	124001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955017
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2365	NC_008319	TCA	2	6	124320	124325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955017
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2487	NC_008319	CGA	2	6	131291	131296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954123
2488	NC_008319	CGA	2	6	131325	131330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954123
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