MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 44579

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_008319	TGT	2	6	79561	79566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953978
1502	NC_008319	GCTCA	2	10	79569	79578	20 %	20 %	20 %	40 %	113953978
1503	NC_008319	AGC	2	6	79590	79595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953978
1504	NC_008319	TGC	2	6	79607	79612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953978
1505	NC_008319	CCA	2	6	79625	79630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953978
1506	NC_008319	TCACTT	2	12	79637	79648	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	113953978
1507	NC_008319	GCG	2	6	79708	79713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953978
1508	NC_008319	GCC	2	6	79785	79790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953978
1509	NC_008319	CCA	2	6	79799	79804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953978
1510	NC_008319	GTG	2	6	79807	79812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953978
1511	NC_008319	TGC	2	6	79817	79822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953978
1512	NC_008319	TGC	3	9	79868	79876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953978
1513	NC_008319	CGC	2	6	79913	79918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953978
1514	NC_008319	AGC	2	6	79944	79949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953978
1515	NC_008319	GAG	2	6	80001	80006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113953978
1516	NC_008319	GAC	2	6	80024	80029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953978
1517	NC_008319	GTG	2	6	80080	80085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953978
1518	NC_008319	ACC	2	6	80113	80118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953978
1519	NC_008319	GGT	2	6	80253	80258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953978
1520	NC_008319	GCT	3	9	80308	80316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953978
1521	NC_008319	GTG	2	6	80356	80361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953978
1522	NC_008319	CGG	2	6	80366	80371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953978
1523	NC_008319	CTG	2	6	80380	80385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953978
1524	NC_008319	ACC	2	6	80410	80415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953978
1525	NC_008319	CGGT	2	8	80449	80456	0 %	25 %	50 %	25 %	113953978
1526	NC_008319	GCG	2	6	80621	80626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953978
1527	NC_008319	TGTGG	2	10	80667	80676	0 %	40 %	60 %	0 %	113953978
1528	NC_008319	TCT	2	6	80713	80718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953978
1529	NC_008319	GACG	2	8	80769	80776	25 %	0 %	50 %	25 %	113953978
1530	NC_008319	GCC	2	6	80778	80783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953978
1531	NC_008319	CAG	2	6	80796	80801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953978
1532	NC_008319	TGT	2	6	80890	80895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954436
1533	NC_008319	ATTT	2	8	80921	80928	25 %	75 %	0 %	0 %	113954436
1534	NC_008319	T	6	6	80978	80983	0 %	100 %	0 %	0 %	113954436
1535	NC_008319	TTG	2	6	80997	81002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954436
1536	NC_008319	TGG	2	6	81074	81079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954436
1537	NC_008319	CGAA	2	8	81117	81124	50 %	0 %	25 %	25 %	113954436
1538	NC_008319	CTG	2	6	81129	81134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954436
1539	NC_008319	AAT	2	6	81218	81223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113954436
1540	NC_008319	TGC	2	6	81229	81234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954436
1541	NC_008319	AAT	2	6	81296	81301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113954436
1542	NC_008319	GTT	2	6	81401	81406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954436
1543	NC_008319	GTT	2	6	81425	81430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954436
1544	NC_008319	TGG	2	6	81484	81489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954436
1545	NC_008319	CTC	2	6	81498	81503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954436
1546	NC_008319	TGGTT	2	10	81508	81517	0 %	60 %	40 %	0 %	113954436
1547	NC_008319	GCA	2	6	81560	81565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954436
1548	NC_008319	CGAAA	2	10	81598	81607	60 %	0 %	20 %	20 %	113954436
1549	NC_008319	A	7	7	81605	81611	100 %	0 %	0 %	0 %	113954436
1550	NC_008319	TGA	2	6	81697	81702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954436
1551	NC_008319	CTC	2	6	81849	81854	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113953684
1552	NC_008319	GTC	2	6	81882	81887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953684
1553	NC_008319	AG	3	6	81891	81896	50 %	0 %	50 %	0 %	113953684
1554	NC_008319	TTGC	2	8	81928	81935	0 %	50 %	25 %	25 %	113953684
1555	NC_008319	CGG	2	6	81969	81974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953684
1556	NC_008319	TTG	2	6	82006	82011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953684
1557	NC_008319	AGCC	2	8	82031	82038	25 %	0 %	25 %	50 %	113953684
1558	NC_008319	AGG	2	6	82106	82111	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113953684
1559	NC_008319	TGG	2	6	82167	82172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953684
1560	NC_008319	CCA	2	6	82356	82361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953684
1561	NC_008319	GTTGGC	2	12	82362	82373	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	113953684
1562	NC_008319	GTG	2	6	82454	82459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953684
1563	NC_008319	GCAT	2	8	82561	82568	25 %	25 %	25 %	25 %	113953684
1564	NC_008319	GCA	2	6	82587	82592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953684
1565	NC_008319	ACC	2	6	82595	82600	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953684
1566	NC_008319	AGG	2	6	82618	82623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113953684
1567	NC_008319	TCC	2	6	82634	82639	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113953684
1568	NC_008319	GGC	2	6	82677	82682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953684
1569	NC_008319	TGC	2	6	82692	82697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953684
1570	NC_008319	CCT	2	6	82716	82721	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113953684
1571	NC_008319	GTC	2	6	82759	82764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953684
1572	NC_008319	CAG	2	6	82963	82968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952958
1573	NC_008319	GGC	2	6	82984	82989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113952958
1574	NC_008319	CTG	2	6	82991	82996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952958
1575	NC_008319	GGC	2	6	83074	83079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113952958
1576	NC_008319	GCG	2	6	83081	83086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113952958
1577	NC_008319	GGC	2	6	83098	83103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113952958
1578	NC_008319	GCT	2	6	83127	83132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952958
1579	NC_008319	CGC	2	6	83157	83162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113952958
1580	NC_008319	CGG	3	9	83178	83186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113952958
1581	NC_008319	AAGC	2	8	83368	83375	50 %	0 %	25 %	25 %	113952958
1582	NC_008319	CGG	2	6	83425	83430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113952958
1583	NC_008319	TGG	2	6	83439	83444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113952958
1584	NC_008319	CAG	3	9	83445	83453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952958
1585	NC_008319	TGC	2	6	83463	83468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952958
1586	NC_008319	CAC	2	6	83509	83514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113955376
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1588	NC_008319	CCA	2	6	83570	83575	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113955376
1589	NC_008319	GCG	2	6	83576	83581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113955376
1590	NC_008319	TTC	2	6	83614	83619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113955376
1591	NC_008319	GTGG	2	8	83683	83690	0 %	25 %	75 %	0 %	113955376
1592	NC_008319	TCG	2	6	83786	83791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955376
1593	NC_008319	CGAG	2	8	83799	83806	25 %	0 %	50 %	25 %	113955376
1594	NC_008319	CCA	2	6	83850	83855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113955376
1595	NC_008319	GCC	2	6	83933	83938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113955376
1596	NC_008319	AGC	2	6	83969	83974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955376
1597	NC_008319	AGC	2	6	84000	84005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955376
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1600	NC_008319	CAG	2	6	84094	84099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955376
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1602	NC_008319	CG	3	6	84230	84235	0 %	0 %	50 %	50 %	113955376
1603	NC_008319	CGG	2	6	84239	84244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113955376
1604	NC_008319	GGCACG	2	12	84310	84321	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	113955376
1605	NC_008319	CCCT	2	8	84338	84345	0 %	25 %	0 %	75 %	113955376
1606	NC_008319	TGA	2	6	84363	84368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955376
1607	NC_008319	GGC	2	6	84393	84398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113955376
1608	NC_008319	TGT	2	6	84489	84494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113955376
1609	NC_008319	TGC	2	6	84495	84500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955376
1610	NC_008319	GCCA	2	8	84527	84534	25 %	0 %	25 %	50 %	113955376
1611	NC_008319	TCA	2	6	84545	84550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955376
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1613	NC_008319	CCCT	2	8	84601	84608	0 %	25 %	0 %	75 %	113955376
1614	NC_008319	TGA	2	6	84641	84646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955376
1615	NC_008319	GCTC	2	8	84652	84659	0 %	25 %	25 %	50 %	113955376
1616	NC_008319	GCC	2	6	84712	84717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113955376
1617	NC_008319	GCTG	2	8	84723	84730	0 %	25 %	50 %	25 %	113955376
1618	NC_008319	GCA	2	6	84852	84857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955376
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1620	NC_008319	CG	3	6	84974	84979	0 %	0 %	50 %	50 %	113955376
1621	NC_008319	CGAT	2	8	84998	85005	25 %	25 %	25 %	25 %	113955376
1622	NC_008319	AGC	2	6	85013	85018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955376
1623	NC_008319	GCG	2	6	85066	85071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113955376
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1625	NC_008319	GTC	2	6	85150	85155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955376
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1997	NC_008319	TCA	2	6	104653	104658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954483
1998	NC_008319	GAT	2	6	104879	104884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954483
1999	NC_008319	GCT	2	6	105074	105079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954483
2000	NC_008319	CTG	2	6	105153	105158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954483

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