MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 44579

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008319	CAC	2	6	23776	23781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113955252
502	NC_008319	CCA	2	6	23853	23858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113955252
503	NC_008319	AGAT	2	8	23864	23871	50 %	25 %	25 %	0 %	113955252
504	NC_008319	GTC	2	6	23945	23950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955252
505	NC_008319	AG	3	6	23969	23974	50 %	0 %	50 %	0 %	113955252
506	NC_008319	GAA	2	6	24059	24064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113955252
507	NC_008319	GGTA	2	8	24249	24256	25 %	25 %	50 %	0 %	113955237
508	NC_008319	TCC	2	6	24284	24289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113955237
509	NC_008319	CAC	3	9	24290	24298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113955237
510	NC_008319	ATC	2	6	24300	24305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955237
511	NC_008319	TCC	2	6	24405	24410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113955237
512	NC_008319	GAT	2	6	24524	24529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955237
513	NC_008319	GC	3	6	24585	24590	0 %	0 %	50 %	50 %	113955237
514	NC_008319	GTGA	2	8	24591	24598	25 %	25 %	50 %	0 %	113955237
515	NC_008319	ATG	2	6	24636	24641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955237
516	NC_008319	AAC	2	6	24651	24656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113955237
517	NC_008319	TAA	2	6	24708	24713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113955237
518	NC_008319	GGA	2	6	24767	24772	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113955237
519	NC_008319	CCA	2	6	24793	24798	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113955237
520	NC_008319	CAA	2	6	24968	24973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113955237
521	NC_008319	CCG	2	6	25008	25013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113955237
522	NC_008319	GCCT	2	8	25019	25026	0 %	25 %	25 %	50 %	113955237
523	NC_008319	CCA	2	6	25027	25032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113955237
524	NC_008319	TGC	3	9	25076	25084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955237
525	NC_008319	T	6	6	25130	25135	0 %	100 %	0 %	0 %	113955237
526	NC_008319	TGC	2	6	25152	25157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955237
527	NC_008319	GGT	2	6	25251	25256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955237
528	NC_008319	CTG	2	6	25294	25299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955237
529	NC_008319	CTTTTC	2	12	25342	25353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113955237
530	NC_008319	GCTT	2	8	25354	25361	0 %	50 %	25 %	25 %	113955237
531	NC_008319	GAC	2	6	25408	25413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955237
532	NC_008319	TGACCG	2	12	25438	25449	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	113955237
533	NC_008319	GTT	2	6	25518	25523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954482
534	NC_008319	GCTTT	2	10	25555	25564	0 %	60 %	20 %	20 %	113954482
535	NC_008319	TCA	2	6	25570	25575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954482
536	NC_008319	ATCA	2	8	25593	25600	50 %	25 %	0 %	25 %	113954482
537	NC_008319	CGC	2	6	25640	25645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113954482
538	NC_008319	AGCTG	2	10	25666	25675	20 %	20 %	40 %	20 %	113954482
539	NC_008319	TGGC	2	8	25703	25710	0 %	25 %	50 %	25 %	113954482
540	NC_008319	GA	3	6	25787	25792	50 %	0 %	50 %	0 %	113954482
541	NC_008319	CCA	2	6	25859	25864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954482
542	NC_008319	GCA	2	6	25930	25935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954482
543	NC_008319	CACC	2	8	25973	25980	25 %	0 %	0 %	75 %	113954482
544	NC_008319	TCT	2	6	25996	26001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954482
545	NC_008319	AGC	2	6	26007	26012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954482
546	NC_008319	GC	3	6	26011	26016	0 %	0 %	50 %	50 %	113954482
547	NC_008319	CCA	2	6	26234	26239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954482
548	NC_008319	CAA	2	6	26256	26261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954482
549	NC_008319	GGC	2	6	26301	26306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954482
550	NC_008319	CTT	2	6	26447	26452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954482
551	NC_008319	CTC	2	6	26463	26468	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954482
552	NC_008319	GGC	2	6	26506	26511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954482
553	NC_008319	CCAA	2	8	26632	26639	50 %	0 %	0 %	50 %	113954125
554	NC_008319	CTT	2	6	26641	26646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954125
555	NC_008319	CCA	2	6	26655	26660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954125
556	NC_008319	GTT	2	6	26698	26703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954125
557	NC_008319	GTG	2	6	26754	26759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954125
558	NC_008319	GCC	2	6	26865	26870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113954125
559	NC_008319	TTCA	2	8	26876	26883	25 %	50 %	0 %	25 %	113954125
560	NC_008319	AC	3	6	26899	26904	50 %	0 %	0 %	50 %	113954125
561	NC_008319	GTG	2	6	26963	26968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954125
562	NC_008319	GGT	2	6	27043	27048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954125
563	NC_008319	TCG	2	6	27144	27149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954125
564	NC_008319	GGT	2	6	27188	27193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954125
565	NC_008319	GT	3	6	27523	27528	0 %	50 %	50 %	0 %	113954125
566	NC_008319	TTGA	2	8	27565	27572	25 %	50 %	25 %	0 %	113954125
567	NC_008319	GCAA	2	8	27586	27593	50 %	0 %	25 %	25 %	113954125
568	NC_008319	TTG	2	6	27818	27823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954125
569	NC_008319	TTAA	2	8	27864	27871	50 %	50 %	0 %	0 %	113954125
570	NC_008319	CCA	2	6	27880	27885	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954125
571	NC_008319	TGA	2	6	27914	27919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954125
572	NC_008319	GAG	2	6	27933	27938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113954125
573	NC_008319	GCT	3	9	28178	28186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954125
574	NC_008319	CCA	2	6	28195	28200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954125
575	NC_008319	CGT	2	6	28207	28212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954125
576	NC_008319	GCG	2	6	28296	28301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954125
577	NC_008319	TGG	2	6	28396	28401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954125
578	NC_008319	GCG	2	6	28456	28461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954125
579	NC_008319	CAG	2	6	28509	28514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952817
580	NC_008319	GAG	2	6	28533	28538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113952817
581	NC_008319	GCT	3	9	28545	28553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952817
582	NC_008319	AGCAC	2	10	28627	28636	40 %	0 %	20 %	40 %	113952817
583	NC_008319	GAC	2	6	28728	28733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952817
584	NC_008319	GCA	2	6	28753	28758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952817
585	NC_008319	TTC	2	6	28771	28776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113952817
586	NC_008319	GAA	2	6	28827	28832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113952817
587	NC_008319	GTT	2	6	28917	28922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113952817
588	NC_008319	AGA	2	6	28985	28990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113952817
589	NC_008319	TGG	2	6	28993	28998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113952817
590	NC_008319	GAA	2	6	29001	29006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113952817
591	NC_008319	GCA	2	6	29081	29086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952817
592	NC_008319	GTG	2	6	29116	29121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113952817
593	NC_008319	CCA	2	6	29130	29135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113952817
594	NC_008319	GAT	2	6	29145	29150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113952817
595	NC_008319	GGC	2	6	29439	29444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113955228
596	NC_008319	GGT	2	6	29472	29477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955228
597	NC_008319	TGG	2	6	29513	29518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955228
598	NC_008319	TGC	2	6	29519	29524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955228
599	NC_008319	TGG	2	6	29525	29530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955228
600	NC_008319	GTC	2	6	29536	29541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955228
601	NC_008319	GATT	2	8	29591	29598	25 %	50 %	25 %	0 %	113955228
602	NC_008319	CAC	2	6	29657	29662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113955228
603	NC_008319	TAC	2	6	29708	29713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955228
604	NC_008319	TGG	2	6	29717	29722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955228
605	NC_008319	AGGTGA	2	12	30034	30045	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	113955228
606	NC_008319	TGGA	2	8	30091	30098	25 %	25 %	50 %	0 %	113955228
607	NC_008319	TCA	2	6	30197	30202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955228
608	NC_008319	GAA	2	6	30246	30251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113955228
609	NC_008319	GTG	2	6	30292	30297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955228
610	NC_008319	AGC	2	6	30298	30303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955228
611	NC_008319	CAC	2	6	30309	30314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113955228
612	NC_008319	CCAA	2	8	30408	30415	50 %	0 %	0 %	50 %	113954491
613	NC_008319	GCA	2	6	30458	30463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954491
614	NC_008319	GAG	2	6	30495	30500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113954491
615	NC_008319	TGG	2	6	30577	30582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954491
616	NC_008319	TG	3	6	30583	30588	0 %	50 %	50 %	0 %	113954491
617	NC_008319	GTG	3	9	30586	30594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954491
618	NC_008319	GTT	2	6	30622	30627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113955161
619	NC_008319	TGT	2	6	30692	30697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113955161
620	NC_008319	CGC	2	6	30703	30708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113955161
621	NC_008319	GCC	2	6	30834	30839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113955161
622	NC_008319	GGT	2	6	30858	30863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955161
623	NC_008319	CT	3	6	31069	31074	0 %	50 %	0 %	50 %	113955161
624	NC_008319	CAC	2	6	31221	31226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113955161
625	NC_008319	GAC	2	6	31306	31311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955161
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627	NC_008319	AGC	2	6	31358	31363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955161
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