MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 44579

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_008319	CAG	2	6	320164	320169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954005
6002	NC_008319	GC	3	6	320181	320186	0 %	0 %	50 %	50 %	113954005
6003	NC_008319	CTT	2	6	320317	320322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954005
6004	NC_008319	CT	3	6	320335	320340	0 %	50 %	0 %	50 %	113954005
6005	NC_008319	TGT	2	6	320411	320416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954005
6006	NC_008319	CAA	2	6	320419	320424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954005
6007	NC_008319	TGC	2	6	320633	320638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954005
6008	NC_008319	GTG	2	6	320663	320668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954005
6009	NC_008319	GCT	2	6	320689	320694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954005
6010	NC_008319	GC	3	6	320741	320746	0 %	0 %	50 %	50 %	113954005
6011	NC_008319	GGT	2	6	320814	320819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954005
6012	NC_008319	TGC	2	6	320936	320941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954005
6013	NC_008319	GCA	2	6	321165	321170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954005
6014	NC_008319	GCC	2	6	321226	321231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113954005
6015	NC_008319	GTG	2	6	321239	321244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954005
6016	NC_008319	CAG	2	6	321260	321265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954005
6017	NC_008319	TGGC	2	8	321316	321323	0 %	25 %	50 %	25 %	113954005
6018	NC_008319	CAG	2	6	321446	321451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954005
6019	NC_008319	GCT	2	6	321492	321497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954005
6020	NC_008319	GTG	2	6	321512	321517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954005
6021	NC_008319	GGC	2	6	321525	321530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954005
6022	NC_008319	AGC	2	6	321575	321580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954005
6023	NC_008319	CCT	2	6	321596	321601	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954005
6024	NC_008319	GTTG	2	8	321707	321714	0 %	50 %	50 %	0 %	113954005
6025	NC_008319	TCA	2	6	321791	321796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954005
6026	NC_008319	ATC	2	6	321828	321833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954005
6027	NC_008319	GTC	2	6	321840	321845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952981
6028	NC_008319	T	6	6	321850	321855	0 %	100 %	0 %	0 %	113952981
6029	NC_008319	GCC	2	6	321907	321912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113952981
6030	NC_008319	CAC	2	6	322120	322125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954836
6031	NC_008319	TTC	2	6	322176	322181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954836
6032	NC_008319	ACA	2	6	322188	322193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954836
6033	NC_008319	GAAT	2	8	322257	322264	50 %	25 %	25 %	0 %	113952822
6034	NC_008319	CTT	2	6	322313	322318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113952822
6035	NC_008319	TAA	2	6	322414	322419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113952822
6036	NC_008319	GTG	2	6	322566	322571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953631
6037	NC_008319	AC	3	6	322603	322608	50 %	0 %	0 %	50 %	113953631
6038	NC_008319	GCGATT	2	12	322721	322732	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	113953631
6039	NC_008319	ATTGG	2	10	322784	322793	20 %	40 %	40 %	0 %	113953631
6040	NC_008319	CGTTTG	2	12	322854	322865	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	113953631
6041	NC_008319	CG	3	6	322937	322942	0 %	0 %	50 %	50 %	113953631
6042	NC_008319	GCAAG	2	10	322987	322996	40 %	0 %	40 %	20 %	113953631
6043	NC_008319	GAG	2	6	323034	323039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113953631
6044	NC_008319	TTG	2	6	323058	323063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953631
6045	NC_008319	GAG	2	6	323157	323162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113953631
6046	NC_008319	ACC	2	6	323183	323188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954917
6047	NC_008319	T	6	6	323279	323284	0 %	100 %	0 %	0 %	113954917
6048	NC_008319	CCCT	2	8	323309	323316	0 %	25 %	0 %	75 %	113954917
6049	NC_008319	GGT	2	6	323384	323389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954917
6050	NC_008319	AAT	2	6	323459	323464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113954115
6051	NC_008319	GCG	2	6	323482	323487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954115
6052	NC_008319	AAGC	2	8	323529	323536	50 %	0 %	25 %	25 %	113954115
6053	NC_008319	GGT	2	6	323589	323594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954115
6054	NC_008319	TGG	2	6	323627	323632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954115
6055	NC_008319	GTT	3	9	323636	323644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954115
6056	NC_008319	TGC	2	6	323654	323659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954115
6057	NC_008319	TCCA	2	8	323716	323723	25 %	25 %	0 %	50 %	113954115
6058	NC_008319	GC	3	6	323725	323730	0 %	0 %	50 %	50 %	113954115
6059	NC_008319	CGA	2	6	323837	323842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954115
6060	NC_008319	CTG	2	6	323884	323889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953301
6061	NC_008319	CCG	2	6	323931	323936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953301
6062	NC_008319	GA	3	6	324002	324007	50 %	0 %	50 %	0 %	113953301
6063	NC_008319	CGT	2	6	324012	324017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953301
6064	NC_008319	GGT	2	6	324098	324103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953301
6065	NC_008319	TC	3	6	324115	324120	0 %	50 %	0 %	50 %	113953301
6066	NC_008319	CT	3	6	324122	324127	0 %	50 %	0 %	50 %	113953301
6067	NC_008319	GCT	2	6	324195	324200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953301
6068	NC_008319	CAG	2	6	324275	324280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953301
6069	NC_008319	GCA	2	6	324307	324312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953301
6070	NC_008319	TTG	2	6	324314	324319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953301
6071	NC_008319	GGT	2	6	324401	324406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953301
6072	NC_008319	CTG	2	6	324420	324425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953301
6073	NC_008319	CGC	2	6	324441	324446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953301
6074	NC_008319	TTCT	2	8	324479	324486	0 %	75 %	0 %	25 %	113953301
6075	NC_008319	CGCT	2	8	324644	324651	0 %	25 %	25 %	50 %	113953301
6076	NC_008319	TGT	2	6	324659	324664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953301
6077	NC_008319	GCTT	2	8	324678	324685	0 %	50 %	25 %	25 %	113953301
6078	NC_008319	CAC	2	6	324842	324847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953301
6079	NC_008319	CAAG	2	8	324871	324878	50 %	0 %	25 %	25 %	113953301
6080	NC_008319	CGAT	2	8	325083	325090	25 %	25 %	25 %	25 %	113953828
6081	NC_008319	GAC	2	6	325104	325109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953828
6082	NC_008319	CAG	2	6	325241	325246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953828
6083	NC_008319	GAC	2	6	325263	325268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953828
6084	NC_008319	ATC	2	6	325293	325298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953828
6085	NC_008319	GAA	2	6	325309	325314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113953828
6086	NC_008319	CTG	2	6	325317	325322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953828
6087	NC_008319	GATCG	2	10	325441	325450	20 %	20 %	40 %	20 %	113953828
6088	NC_008319	TTC	2	6	325514	325519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953828
6089	NC_008319	GA	3	6	325539	325544	50 %	0 %	50 %	0 %	113953828
6090	NC_008319	CCA	2	6	325618	325623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953828
6091	NC_008319	CCG	2	6	325708	325713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953828
6092	NC_008319	TTG	2	6	325720	325725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953828
6093	NC_008319	GTG	2	6	325726	325731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953828
6094	NC_008319	CG	3	6	325875	325880	0 %	0 %	50 %	50 %	113954193
6095	NC_008319	ATC	2	6	325884	325889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954193
6096	NC_008319	T	7	7	325895	325901	0 %	100 %	0 %	0 %	113954193
6097	NC_008319	TCA	2	6	326003	326008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954193
6098	NC_008319	GTCGAG	2	12	326049	326060	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	113954193
6099	NC_008319	CGG	2	6	326093	326098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954193
6100	NC_008319	TTG	2	6	326136	326141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954193
6101	NC_008319	ATCAC	2	10	326221	326230	40 %	20 %	0 %	40 %	113954193
6102	NC_008319	GC	3	6	326278	326283	0 %	0 %	50 %	50 %	113954193
6103	NC_008319	CT	3	6	326340	326345	0 %	50 %	0 %	50 %	113954193
6104	NC_008319	CAGG	2	8	326369	326376	25 %	0 %	50 %	25 %	113954193
6105	NC_008319	CCCTT	2	10	326401	326410	0 %	40 %	0 %	60 %	113954193
6106	NC_008319	CTT	2	6	326435	326440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954193
6107	NC_008319	GTG	2	6	326464	326469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954193
6108	NC_008319	GAT	2	6	326481	326486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954193
6109	NC_008319	CGTC	2	8	326554	326561	0 %	25 %	25 %	50 %	113954193
6110	NC_008319	TGA	2	6	326715	326720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955124
6111	NC_008319	TCAGCC	2	12	326724	326735	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	113955124
6112	NC_008319	CAT	2	6	326741	326746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955124
6113	NC_008319	AGCA	2	8	326784	326791	50 %	0 %	25 %	25 %	113955124
6114	NC_008319	AGC	2	6	326990	326995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955124
6115	NC_008319	TGC	2	6	327055	327060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955124
6116	NC_008319	AGG	2	6	327096	327101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113955124
6117	NC_008319	TTGGC	2	10	327165	327174	0 %	40 %	40 %	20 %	113955124
6118	NC_008319	GATG	2	8	327238	327245	25 %	25 %	50 %	0 %	113955124
6119	NC_008319	GAT	2	6	327277	327282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955124
6120	NC_008319	TCA	2	6	327570	327575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953966
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6122	NC_008319	TCCT	2	8	327599	327606	0 %	50 %	0 %	50 %	113953966
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