MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 44579

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_008319	TTG	2	6	292497	292502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113952961
5502	NC_008319	CAC	2	6	292614	292619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113952961
5503	NC_008319	AGG	2	6	292628	292633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113952961
5504	NC_008319	GCT	2	6	292686	292691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952961
5505	NC_008319	CCAG	2	8	292802	292809	25 %	0 %	25 %	50 %	113952961
5506	NC_008319	GTT	2	6	292856	292861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113952961
5507	NC_008319	CCG	2	6	292875	292880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113952961
5508	NC_008319	CACTG	2	10	292890	292899	20 %	20 %	20 %	40 %	113952961
5509	NC_008319	GCT	2	6	292928	292933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952961
5510	NC_008319	CAG	2	6	293005	293010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952961
5511	NC_008319	GCT	2	6	293018	293023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952961
5512	NC_008319	AG	3	6	293036	293041	50 %	0 %	50 %	0 %	113952961
5513	NC_008319	TGA	2	6	293122	293127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113952961
5514	NC_008319	CGG	2	6	293134	293139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113952961
5515	NC_008319	C	6	6	293160	293165	0 %	0 %	0 %	100 %	113952961
5516	NC_008319	GTTC	2	8	293191	293198	0 %	50 %	25 %	25 %	113952961
5517	NC_008319	CTC	2	6	293211	293216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113952961
5518	NC_008319	GA	3	6	293245	293250	50 %	0 %	50 %	0 %	113952961
5519	NC_008319	GAC	2	6	293319	293324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952961
5520	NC_008319	GCGTT	2	10	293431	293440	0 %	40 %	40 %	20 %	113952961
5521	NC_008319	C	6	6	293465	293470	0 %	0 %	0 %	100 %	113952961
5522	NC_008319	GTA	2	6	293514	293519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113952961
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5524	NC_008319	AGCT	2	8	293589	293596	25 %	25 %	25 %	25 %	113952961
5525	NC_008319	GCA	2	6	293597	293602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952961
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5527	NC_008319	TGT	2	6	293675	293680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113952961
5528	NC_008319	CAT	2	6	293748	293753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113952961
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5530	NC_008319	TGCGT	2	10	293807	293816	0 %	40 %	40 %	20 %	113952961
5531	NC_008319	CGA	2	6	293833	293838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952961
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5533	NC_008319	ACC	2	6	293974	293979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113952961
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5535	NC_008319	GCA	2	6	294265	294270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954626
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5538	NC_008319	TG	3	6	294479	294484	0 %	50 %	50 %	0 %	113954626
5539	NC_008319	TGG	2	6	294491	294496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954626
5540	NC_008319	TTG	2	6	294605	294610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954626
5541	NC_008319	TGGGTG	2	12	294677	294688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954626
5542	NC_008319	CAC	2	6	294725	294730	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954626
5543	NC_008319	TTTG	2	8	294817	294824	0 %	75 %	25 %	0 %	113954626
5544	NC_008319	CAAA	2	8	294861	294868	75 %	0 %	0 %	25 %	113954626
5545	NC_008319	AGCA	2	8	294869	294876	50 %	0 %	25 %	25 %	113954626
5546	NC_008319	AAC	2	6	294885	294890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954626
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5552	NC_008319	GTGCC	2	10	295294	295303	0 %	20 %	40 %	40 %	113953818
5553	NC_008319	TGCC	2	8	295305	295312	0 %	25 %	25 %	50 %	113953818
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5557	NC_008319	CCT	2	6	295560	295565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113953818
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5559	NC_008319	GCGT	2	8	295629	295636	0 %	25 %	50 %	25 %	113953818
5560	NC_008319	TCC	2	6	295917	295922	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113953818
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5563	NC_008319	TGC	2	6	296095	296100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953818
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5565	NC_008319	T	6	6	296234	296239	0 %	100 %	0 %	0 %	113954875
5566	NC_008319	TGCC	2	8	296249	296256	0 %	25 %	25 %	50 %	113954875
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5593	NC_008319	TG	3	6	297317	297322	0 %	50 %	50 %	0 %	113953355
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5602	NC_008319	CAAGGC	2	12	297694	297705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953355
5603	NC_008319	GGC	2	6	297736	297741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953355
5604	NC_008319	GAAG	2	8	297843	297850	50 %	0 %	50 %	0 %	113953355
5605	NC_008319	GTC	2	6	297863	297868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953355
5606	NC_008319	TCTT	2	8	298388	298395	0 %	75 %	0 %	25 %	113954035
5607	NC_008319	A	6	6	298441	298446	100 %	0 %	0 %	0 %	113954035
5608	NC_008319	GTC	3	9	298460	298468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954035
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5612	NC_008319	G	6	6	298634	298639	0 %	0 %	100 %	0 %	113954035
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5616	NC_008319	T	6	6	298903	298908	0 %	100 %	0 %	0 %	113952833
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5620	NC_008319	G	6	6	299060	299065	0 %	0 %	100 %	0 %	113952833
5621	NC_008319	GCCATG	2	12	299147	299158	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	113952833
5622	NC_008319	CCT	2	6	299162	299167	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113952833
5623	NC_008319	T	7	7	299233	299239	0 %	100 %	0 %	0 %	113952833
5624	NC_008319	GCT	2	6	299252	299257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952833
5625	NC_008319	CGG	2	6	299262	299267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113952833
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5630	NC_008319	CGG	2	6	299475	299480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113952833
5631	NC_008319	G	6	6	299582	299587	0 %	0 %	100 %	0 %	113954282
5632	NC_008319	GCT	2	6	299631	299636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954282
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5641	NC_008319	G	9	9	300269	300277	0 %	0 %	100 %	0 %	113954282
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5651	NC_008319	GT	3	6	300573	300578	0 %	50 %	50 %	0 %	113954282
5652	NC_008319	GGC	2	6	300618	300623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954282
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5732	NC_008319	AAAC	2	8	304799	304806	75 %	0 %	0 %	25 %	113955348
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5770	NC_008319	TGA	2	6	306759	306764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954218
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5802	NC_008319	AATA	2	8	309007	309014	75 %	25 %	0 %	0 %	113954253
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5987	NC_008319	ATCTCG	2	12	319484	319495	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	113954005
5988	NC_008319	GCG	2	6	319528	319533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954005
5989	NC_008319	CAG	2	6	319657	319662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954005
5990	NC_008319	AGG	2	6	319766	319771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113954005
5991	NC_008319	GGC	2	6	319796	319801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954005
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