MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 44579

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_008319	ACCT	2	8	265321	265328	25 %	25 %	0 %	50 %	113955167
5002	NC_008319	GGC	2	6	265377	265382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113955167
5003	NC_008319	TC	3	6	265404	265409	0 %	50 %	0 %	50 %	113955167
5004	NC_008319	GGA	2	6	265521	265526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113955167
5005	NC_008319	CG	3	6	265669	265674	0 %	0 %	50 %	50 %	113955582
5006	NC_008319	TGG	2	6	265701	265706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955582
5007	NC_008319	TGC	2	6	265732	265737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955582
5008	NC_008319	GCT	2	6	265745	265750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955582
5009	NC_008319	GCT	2	6	265793	265798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955582
5010	NC_008319	AGG	2	6	265996	266001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113955582
5011	NC_008319	TGGTG	2	10	266011	266020	0 %	40 %	60 %	0 %	113955582
5012	NC_008319	GCT	2	6	266126	266131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955582
5013	NC_008319	AGC	2	6	266149	266154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955582
5014	NC_008319	TCT	2	6	266207	266212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113955582
5015	NC_008319	GCA	2	6	266213	266218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955582
5016	NC_008319	TCA	2	6	266277	266282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955582
5017	NC_008319	CTT	2	6	266285	266290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113955582
5018	NC_008319	GCT	2	6	266366	266371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955582
5019	NC_008319	TTG	2	6	266437	266442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113955582
5020	NC_008319	TCT	2	6	266495	266500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113955582
5021	NC_008319	TCC	2	6	266508	266513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113955582
5022	NC_008319	CTT	2	6	266527	266532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113955582
5023	NC_008319	TGC	2	6	266728	266733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953961
5024	NC_008319	ATCAG	2	10	266734	266743	40 %	20 %	20 %	20 %	113953961
5025	NC_008319	TGAT	2	8	266755	266762	25 %	50 %	25 %	0 %	113953961
5026	NC_008319	GCG	2	6	266779	266784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953961
5027	NC_008319	CGA	2	6	266795	266800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953961
5028	NC_008319	CT	3	6	266844	266849	0 %	50 %	0 %	50 %	113953961
5029	NC_008319	TCG	2	6	266864	266869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953961
5030	NC_008319	GGT	2	6	266924	266929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953961
5031	NC_008319	T	6	6	267021	267026	0 %	100 %	0 %	0 %	113953961
5032	NC_008319	GTC	2	6	267033	267038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953961
5033	NC_008319	CAC	2	6	267090	267095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953961
5034	NC_008319	CACC	2	8	267302	267309	25 %	0 %	0 %	75 %	113954610
5035	NC_008319	GGA	2	6	267357	267362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113954610
5036	NC_008319	GGTGC	2	10	267397	267406	0 %	20 %	60 %	20 %	113954610
5037	NC_008319	CAT	2	6	267475	267480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954610
5038	NC_008319	GCA	2	6	267539	267544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954610
5039	NC_008319	TTCG	2	8	267550	267557	0 %	50 %	25 %	25 %	113954610
5040	NC_008319	GAG	2	6	267577	267582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113954610
5041	NC_008319	AGG	2	6	267630	267635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113954610
5042	NC_008319	GAT	2	6	267703	267708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954610
5043	NC_008319	CTT	2	6	267709	267714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954610
5044	NC_008319	CTCC	2	8	267777	267784	0 %	25 %	0 %	75 %	113954610
5045	NC_008319	CGG	2	6	267786	267791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954610
5046	NC_008319	AG	3	6	267800	267805	50 %	0 %	50 %	0 %	113954610
5047	NC_008319	GCA	2	6	267893	267898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954610
5048	NC_008319	TGC	2	6	267933	267938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954610
5049	NC_008319	TCA	2	6	268218	268223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954610
5050	NC_008319	TGT	2	6	268251	268256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954610
5051	NC_008319	TTA	2	6	268269	268274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113954610
5052	NC_008319	AAG	2	6	268442	268447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113954610
5053	NC_008319	TCGCT	2	10	268458	268467	0 %	40 %	20 %	40 %	113954610
5054	NC_008319	GCCGCT	2	12	268474	268485	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	113954610
5055	NC_008319	GCG	2	6	268561	268566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954610
5056	NC_008319	TGAG	2	8	268580	268587	25 %	25 %	50 %	0 %	113954610
5057	NC_008319	AAT	2	6	268590	268595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113954610
5058	NC_008319	TGA	2	6	268617	268622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954610
5059	NC_008319	GAT	2	6	268624	268629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954610
5060	NC_008319	TTG	2	6	268717	268722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954610
5061	NC_008319	GCTA	2	8	268731	268738	25 %	25 %	25 %	25 %	113954610
5062	NC_008319	AAAGC	2	10	269181	269190	60 %	0 %	20 %	20 %	113953690
5063	NC_008319	AAT	2	6	269247	269252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113953690
5064	NC_008319	CTA	2	6	269308	269313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953690
5065	NC_008319	TC	3	6	269652	269657	0 %	50 %	0 %	50 %	113953690
5066	NC_008319	TTC	2	6	269672	269677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953690
5067	NC_008319	GTC	2	6	269739	269744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953690
5068	NC_008319	CTTCT	2	10	269768	269777	0 %	60 %	0 %	40 %	113953690
5069	NC_008319	AT	3	6	269806	269811	50 %	50 %	0 %	0 %	113953690
5070	NC_008319	TCA	2	6	269826	269831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953690
5071	NC_008319	ATC	2	6	269881	269886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953690
5072	NC_008319	TCAG	2	8	269928	269935	25 %	25 %	25 %	25 %	113953690
5073	NC_008319	T	6	6	269958	269963	0 %	100 %	0 %	0 %	113953690
5074	NC_008319	TAA	2	6	270032	270037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113953690
5075	NC_008319	AAGC	2	8	270042	270049	50 %	0 %	25 %	25 %	113953690
5076	NC_008319	GTT	2	6	270221	270226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953690
5077	NC_008319	TGGT	2	8	270250	270257	0 %	50 %	50 %	0 %	113953690
5078	NC_008319	GCT	2	6	270258	270263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953690
5079	NC_008319	A	6	6	270278	270283	100 %	0 %	0 %	0 %	113953690
5080	NC_008319	A	8	8	270305	270312	100 %	0 %	0 %	0 %	113953690
5081	NC_008319	TAC	2	6	270422	270427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953690
5082	NC_008319	TCCCC	2	10	270436	270445	0 %	20 %	0 %	80 %	113953690
5083	NC_008319	GT	3	6	270448	270453	0 %	50 %	50 %	0 %	113953690
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5085	NC_008319	TAATT	2	10	270566	270575	40 %	60 %	0 %	0 %	113953690
5086	NC_008319	TAG	2	6	270581	270586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953690
5087	NC_008319	TGA	2	6	270643	270648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953690
5088	NC_008319	AGA	2	6	270680	270685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113953690
5089	NC_008319	AGC	2	6	270686	270691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953690
5090	NC_008319	TAT	2	6	270702	270707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113953690
5091	NC_008319	CTT	2	6	270724	270729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953690
5092	NC_008319	CAA	3	9	270747	270755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953690
5093	NC_008319	ATCT	2	8	270763	270770	25 %	50 %	0 %	25 %	113953690
5094	NC_008319	ATCTTG	2	12	270781	270792	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	113953690
5095	NC_008319	TC	3	6	270820	270825	0 %	50 %	0 %	50 %	113953690
5096	NC_008319	CTTA	2	8	270961	270968	25 %	50 %	0 %	25 %	113953690
5097	NC_008319	AATC	2	8	271038	271045	50 %	25 %	0 %	25 %	113953690
5098	NC_008319	GAT	3	9	271086	271094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953690
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5100	NC_008319	TTTAC	2	10	271162	271171	20 %	60 %	0 %	20 %	113953690
5101	NC_008319	AAT	2	6	271247	271252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113953690
5102	NC_008319	CT	3	6	271380	271385	0 %	50 %	0 %	50 %	113953690
5103	NC_008319	TGA	2	6	271397	271402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953690
5104	NC_008319	TGA	2	6	271436	271441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953690
5105	NC_008319	ATT	2	6	271508	271513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113953690
5106	NC_008319	GGA	2	6	271553	271558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113953690
5107	NC_008319	GAT	2	6	271602	271607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953690
5108	NC_008319	TGT	2	6	271666	271671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953690
5109	NC_008319	GAT	2	6	271698	271703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953690
5110	NC_008319	TGA	2	6	271863	271868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954465
5111	NC_008319	CTA	2	6	271953	271958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954465
5112	NC_008319	AAG	2	6	272067	272072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113954465
5113	NC_008319	AG	3	6	272071	272076	50 %	0 %	50 %	0 %	113954465
5114	NC_008319	AAT	2	6	272108	272113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113954465
5115	NC_008319	T	6	6	272195	272200	0 %	100 %	0 %	0 %	113954465
5116	NC_008319	GTT	2	6	272212	272217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954465
5117	NC_008319	AGC	2	6	272221	272226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954465
5118	NC_008319	TCT	2	6	272382	272387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954465
5119	NC_008319	TGC	2	6	272457	272462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954465
5120	NC_008319	GGCT	2	8	272589	272596	0 %	25 %	50 %	25 %	113954465
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5122	NC_008319	TAT	2	6	272628	272633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113954465
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5243	NC_008319	CAG	2	6	280010	280015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953074
5244	NC_008319	CAA	2	6	280042	280047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953074
5245	NC_008319	TGATG	2	10	280060	280069	20 %	40 %	40 %	0 %	113953074
5246	NC_008319	CGC	3	9	280087	280095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953074
5247	NC_008319	TGC	2	6	280108	280113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953074
5248	NC_008319	TGG	2	6	280137	280142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953074
5249	NC_008319	CTG	2	6	280144	280149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953074
5250	NC_008319	ATC	2	6	280301	280306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953074
5251	NC_008319	AGCG	2	8	280315	280322	25 %	0 %	50 %	25 %	113953074
5252	NC_008319	GATC	2	8	280328	280335	25 %	25 %	25 %	25 %	113953074
5253	NC_008319	A	6	6	280369	280374	100 %	0 %	0 %	0 %	113953074
5254	NC_008319	GCT	2	6	280508	280513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953074
5255	NC_008319	AAG	2	6	280544	280549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113953074
5256	NC_008319	GCGA	2	8	280575	280582	25 %	0 %	50 %	25 %	113953074
5257	NC_008319	GCC	2	6	280607	280612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953074
5258	NC_008319	GAT	2	6	280616	280621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953074
5259	NC_008319	CAC	2	6	280622	280627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953074
5260	NC_008319	GGC	2	6	280705	280710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954106
5261	NC_008319	GTT	2	6	280752	280757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954106
5262	NC_008319	GC	3	6	280772	280777	0 %	0 %	50 %	50 %	113954106
5263	NC_008319	CTG	2	6	280810	280815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954106
5264	NC_008319	TCGA	2	8	280853	280860	25 %	25 %	25 %	25 %	113954106
5265	NC_008319	TGC	2	6	280911	280916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954106
5266	NC_008319	ATC	2	6	280927	280932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954106
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5268	NC_008319	CAC	2	6	281063	281068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954106
5269	NC_008319	CTG	2	6	281072	281077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954106
5270	NC_008319	G	7	7	281077	281083	0 %	0 %	100 %	0 %	113954106
5271	NC_008319	CCAC	2	8	281177	281184	25 %	0 %	0 %	75 %	113954106
5272	NC_008319	GCTTC	2	10	281217	281226	0 %	40 %	20 %	40 %	113954106
5273	NC_008319	GAGC	2	8	281238	281245	25 %	0 %	50 %	25 %	113954106
5274	NC_008319	CGG	2	6	281310	281315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954106
5275	NC_008319	ATC	2	6	281387	281392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954106
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5278	NC_008319	TCA	2	6	281523	281528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954106
5279	NC_008319	TCA	2	6	281564	281569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954106
5280	NC_008319	AGC	2	6	281582	281587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954106
5281	NC_008319	GCT	2	6	281620	281625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954106
5282	NC_008319	GAT	2	6	281649	281654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954106
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5284	NC_008319	G	6	6	281687	281692	0 %	0 %	100 %	0 %	113954106
5285	NC_008319	CGG	2	6	281694	281699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954106
5286	NC_008319	AG	3	6	281705	281710	50 %	0 %	50 %	0 %	113954106
5287	NC_008319	TCA	2	6	281718	281723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954106
5288	NC_008319	ACTCC	2	10	281766	281775	20 %	20 %	0 %	60 %	113954192
5289	NC_008319	GCT	2	6	281795	281800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954192
5290	NC_008319	TCA	2	6	281830	281835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954192
5291	NC_008319	CTC	2	6	282030	282035	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954192
5292	NC_008319	TCA	2	6	282097	282102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954192
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5300	NC_008319	GCT	2	6	282473	282478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954192
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5303	NC_008319	GGC	2	6	282690	282695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954192
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5307	NC_008319	CTG	2	6	283034	283039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953334
5308	NC_008319	TGC	2	6	283059	283064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953334
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5310	NC_008319	AGCG	2	8	283160	283167	25 %	0 %	50 %	25 %	113953334
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5322	NC_008319	CTTCC	2	10	283748	283757	0 %	40 %	0 %	60 %	113954476
5323	NC_008319	CGAGCA	2	12	283768	283779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954476
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5330	NC_008319	TGC	2	6	284041	284046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954476
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5332	NC_008319	TCGCCA	2	12	284082	284093	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	113954476
5333	NC_008319	GCA	2	6	284145	284150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954476
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5335	NC_008319	TGA	2	6	284230	284235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954476
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5338	NC_008319	CGA	2	6	284299	284304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954476
5339	NC_008319	GCCA	2	8	284411	284418	25 %	0 %	25 %	50 %	113954476
5340	NC_008319	CCA	2	6	284487	284492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954476
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5348	NC_008319	ATCGG	2	10	284839	284848	20 %	20 %	40 %	20 %	113954476
5349	NC_008319	AGCGGG	2	12	284859	284870	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	113954476
5350	NC_008319	TGC	2	6	284977	284982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954573
5351	NC_008319	AGG	2	6	285003	285008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113954573
5352	NC_008319	GAT	2	6	285036	285041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954573
5353	NC_008319	GAT	2	6	285075	285080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954573
5354	NC_008319	CTG	2	6	285102	285107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954573
5355	NC_008319	GTG	2	6	285159	285164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954573
5356	NC_008319	CTG	2	6	285186	285191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954573
5357	NC_008319	GCC	2	6	285307	285312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113954573
5358	NC_008319	CTGG	2	8	285345	285352	0 %	25 %	50 %	25 %	113954573
5359	NC_008319	TGGC	2	8	285403	285410	0 %	25 %	50 %	25 %	113954573
5360	NC_008319	GAGCGT	2	12	285426	285437	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	113954573
5361	NC_008319	GCA	2	6	285448	285453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954573
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5363	NC_008319	CTG	2	6	285480	285485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954573
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5484	NC_008319	GGC	2	6	291815	291820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113952961
5485	NC_008319	TCC	2	6	291841	291846	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113952961
5486	NC_008319	GCG	2	6	291882	291887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113952961
5487	NC_008319	TCC	2	6	291901	291906	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113952961
5488	NC_008319	GGT	2	6	291920	291925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113952961
5489	NC_008319	CG	3	6	291984	291989	0 %	0 %	50 %	50 %	113952961
5490	NC_008319	CAG	2	6	292008	292013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952961
5491	NC_008319	GCT	2	6	292047	292052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952961
5492	NC_008319	GCTCCT	2	12	292094	292105	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	113952961
5493	NC_008319	GTAG	2	8	292142	292149	25 %	25 %	50 %	0 %	113952961
5494	NC_008319	GTT	2	6	292176	292181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113952961
5495	NC_008319	CAG	2	6	292302	292307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952961
5496	NC_008319	CAG	2	6	292323	292328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952961
5497	NC_008319	TGA	2	6	292403	292408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113952961
5498	NC_008319	TGAC	2	8	292435	292442	25 %	25 %	25 %	25 %	113952961
5499	NC_008319	TCT	2	6	292453	292458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113952961
5500	NC_008319	TCG	2	6	292489	292494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952961

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