MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 44579

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_008319	GCA	2	6	239078	239083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953997
4502	NC_008319	TGG	2	6	239188	239193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953997
4503	NC_008319	CTG	2	6	239194	239199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953997
4504	NC_008319	CAG	2	6	239247	239252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953997
4505	NC_008319	TTG	2	6	239256	239261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953997
4506	NC_008319	TGG	2	6	239433	239438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953997
4507	NC_008319	TCA	2	6	239528	239533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953997
4508	NC_008319	TGAT	2	8	239687	239694	25 %	50 %	25 %	0 %	113953348
4509	NC_008319	AT	3	6	239707	239712	50 %	50 %	0 %	0 %	113953348
4510	NC_008319	GTT	2	6	239714	239719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953348
4511	NC_008319	TAA	2	6	239734	239739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113953348
4512	NC_008319	ATT	2	6	239873	239878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113953348
4513	NC_008319	AGT	2	6	239882	239887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953348
4514	NC_008319	TGG	2	6	239891	239896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953348
4515	NC_008319	GT	3	6	239913	239918	0 %	50 %	50 %	0 %	113953348
4516	NC_008319	GTAT	2	8	239949	239956	25 %	50 %	25 %	0 %	113953348
4517	NC_008319	CATCA	2	10	240064	240073	40 %	20 %	0 %	40 %	113953348
4518	NC_008319	GCCAA	2	10	240105	240114	40 %	0 %	20 %	40 %	113953348
4519	NC_008319	GAT	2	6	240226	240231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953348
4520	NC_008319	ATT	2	6	240281	240286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113953348
4521	NC_008319	TGC	2	6	240292	240297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953348
4522	NC_008319	AGT	2	6	240322	240327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953348
4523	NC_008319	CAG	2	6	240357	240362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953348
4524	NC_008319	GTA	2	6	240409	240414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953348
4525	NC_008319	GTC	2	6	240442	240447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953348
4526	NC_008319	GAA	2	6	240510	240515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113953348
4527	NC_008319	T	6	6	240529	240534	0 %	100 %	0 %	0 %	113953348
4528	NC_008319	TAAT	2	8	240549	240556	50 %	50 %	0 %	0 %	113953348
4529	NC_008319	TAA	2	6	240571	240576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113953348
4530	NC_008319	TCG	2	6	240599	240604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953348
4531	NC_008319	CTA	2	6	240660	240665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953348
4532	NC_008319	TTGAG	2	10	240673	240682	20 %	40 %	40 %	0 %	113953348
4533	NC_008319	TTTG	2	8	240765	240772	0 %	75 %	25 %	0 %	113953348
4534	NC_008319	ATTA	2	8	240808	240815	50 %	50 %	0 %	0 %	113953348
4535	NC_008319	TCG	2	6	240818	240823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953348
4536	NC_008319	GGA	2	6	240907	240912	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113953348
4537	NC_008319	CTG	2	6	241209	241214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955094
4538	NC_008319	T	6	6	241222	241227	0 %	100 %	0 %	0 %	113955094
4539	NC_008319	GCA	2	6	241279	241284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955094
4540	NC_008319	GCT	2	6	241316	241321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955094
4541	NC_008319	T	6	6	241369	241374	0 %	100 %	0 %	0 %	113955094
4542	NC_008319	GCTGT	2	10	241396	241405	0 %	40 %	40 %	20 %	113955094
4543	NC_008319	AAC	2	6	241641	241646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113955094
4544	NC_008319	GCC	2	6	241772	241777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113955094
4545	NC_008319	GCT	2	6	242097	242102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955094
4546	NC_008319	ATC	2	6	242108	242113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955094
4547	NC_008319	TTC	2	6	242171	242176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113955094
4548	NC_008319	CGG	2	6	242211	242216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113955094
4549	NC_008319	TTTCCA	2	12	242228	242239	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	113955094
4550	NC_008319	CTA	2	6	242317	242322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955094
4551	NC_008319	GCATG	2	10	242326	242335	20 %	20 %	40 %	20 %	113955094
4552	NC_008319	TGT	2	6	242365	242370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113955094
4553	NC_008319	CTCG	2	8	242530	242537	0 %	25 %	25 %	50 %	113955094
4554	NC_008319	GGTG	2	8	242567	242574	0 %	25 %	75 %	0 %	113955094
4555	NC_008319	GGAG	2	8	242617	242624	25 %	0 %	75 %	0 %	113955094
4556	NC_008319	TCC	2	6	242632	242637	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113955094
4557	NC_008319	TGG	2	6	242696	242701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955094
4558	NC_008319	ATCG	2	8	242840	242847	25 %	25 %	25 %	25 %	113955094
4559	NC_008319	TTG	2	6	242888	242893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113955094
4560	NC_008319	GTT	2	6	242906	242911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113955094
4561	NC_008319	CGA	2	6	243013	243018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955094
4562	NC_008319	GATC	2	8	243055	243062	25 %	25 %	25 %	25 %	113955094
4563	NC_008319	TTC	2	6	243068	243073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113955094
4564	NC_008319	TGA	2	6	243148	243153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955094
4565	NC_008319	CTG	2	6	243165	243170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955094
4566	NC_008319	GCGA	2	8	243311	243318	25 %	0 %	50 %	25 %	113954542
4567	NC_008319	TGCG	2	8	243323	243330	0 %	25 %	50 %	25 %	113954542
4568	NC_008319	GCC	2	6	243347	243352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113954542
4569	NC_008319	GGC	2	6	243376	243381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954542
4570	NC_008319	CGC	2	6	243430	243435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113954542
4571	NC_008319	CAC	2	6	243448	243453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954542
4572	NC_008319	CGCT	2	8	243462	243469	0 %	25 %	25 %	50 %	113954542
4573	NC_008319	AGC	2	6	243518	243523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954542
4574	NC_008319	GTC	2	6	243607	243612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954542
4575	NC_008319	CGG	2	6	243635	243640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954542
4576	NC_008319	TAA	2	6	243657	243662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113954542
4577	NC_008319	TTG	2	6	243674	243679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954542
4578	NC_008319	GCCA	2	8	243759	243766	25 %	0 %	25 %	50 %	113954542
4579	NC_008319	CTGG	2	8	243769	243776	0 %	25 %	50 %	25 %	113954542
4580	NC_008319	CTG	2	6	243929	243934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954542
4581	NC_008319	CAG	2	6	243973	243978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954542
4582	NC_008319	CAA	2	6	243990	243995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954542
4583	NC_008319	CTCC	2	8	244140	244147	0 %	25 %	0 %	75 %	113954542
4584	NC_008319	TGC	2	6	244168	244173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954542
4585	NC_008319	GTTG	2	8	244181	244188	0 %	50 %	50 %	0 %	113954542
4586	NC_008319	CAG	2	6	244291	244296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954542
4587	NC_008319	CAG	2	6	244342	244347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954542
4588	NC_008319	TGG	2	6	244475	244480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955389
4589	NC_008319	CTG	2	6	244483	244488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955389
4590	NC_008319	ACG	2	6	244500	244505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955389
4591	NC_008319	GC	3	6	244528	244533	0 %	0 %	50 %	50 %	113955389
4592	NC_008319	TGG	2	6	244628	244633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955389
4593	NC_008319	CTT	2	6	244650	244655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113955389
4594	NC_008319	AGC	2	6	244713	244718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955389
4595	NC_008319	CGG	2	6	244764	244769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113955389
4596	NC_008319	CAG	2	6	244848	244853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955389
4597	NC_008319	CCTGG	2	10	244881	244890	0 %	20 %	40 %	40 %	113955389
4598	NC_008319	TGAC	2	8	244898	244905	25 %	25 %	25 %	25 %	113955389
4599	NC_008319	GAT	2	6	244954	244959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955389
4600	NC_008319	GAG	2	6	244996	245001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113955389
4601	NC_008319	CAC	2	6	245040	245045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113955389
4602	NC_008319	CAG	2	6	245086	245091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955389
4603	NC_008319	CTG	2	6	245092	245097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955389
4604	NC_008319	ATG	2	6	245099	245104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955389
4605	NC_008319	GTT	2	6	245112	245117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113955389
4606	NC_008319	GT	3	6	245158	245163	0 %	50 %	50 %	0 %	113955389
4607	NC_008319	CTG	2	6	245167	245172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955389
4608	NC_008319	TAC	2	6	245227	245232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955389
4609	NC_008319	GGT	2	6	245293	245298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955389
4610	NC_008319	ACG	2	6	245303	245308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955389
4611	NC_008319	GGT	2	6	245326	245331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955389
4612	NC_008319	GCT	2	6	245392	245397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955389
4613	NC_008319	G	6	6	245519	245524	0 %	0 %	100 %	0 %	113955389
4614	NC_008319	CGT	2	6	245558	245563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955389
4615	NC_008319	CGA	2	6	245622	245627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955389
4616	NC_008319	CGGC	2	8	245636	245643	0 %	0 %	50 %	50 %	113955389
4617	NC_008319	GTG	2	6	245666	245671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955389
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4619	NC_008319	GGA	2	6	245697	245702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113955389
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4621	NC_008319	CCA	2	6	245831	245836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954555
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4731	NC_008319	GACC	2	8	251698	251705	25 %	0 %	25 %	50 %	113954408
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4739	NC_008319	CCGAA	2	10	252078	252087	40 %	0 %	20 %	40 %	113954408
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