MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 5 str. 8401 chromosome

Total Repeats: 75589

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_008258	GTT	2	6	227993	227998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804262
4002	NC_008258	GGT	2	6	227999	228004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804262
4003	NC_008258	ACC	2	6	228234	228239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804262
4004	NC_008258	AGT	2	6	228302	228307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804261
4005	NC_008258	TGG	2	6	228361	228366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804261
4006	NC_008258	TGA	2	6	228398	228403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804261
4007	NC_008258	CGCGG	2	10	228462	228471	0 %	0 %	60 %	40 %	110804261
4008	NC_008258	TGG	2	6	228586	228591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804261
4009	NC_008258	AACG	2	8	228664	228671	50 %	0 %	25 %	25 %	110804261
4010	NC_008258	GGT	2	6	228729	228734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804261
4011	NC_008258	GA	3	6	228763	228768	50 %	0 %	50 %	0 %	110804261
4012	NC_008258	CAG	2	6	228771	228776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804261
4013	NC_008258	CAA	2	6	228777	228782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110804261
4014	NC_008258	CAA	2	6	228790	228795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110804261
4015	NC_008258	AAGT	2	8	228818	228825	50 %	25 %	25 %	0 %	110804261
4016	NC_008258	GTT	2	6	228831	228836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804261
4017	NC_008258	GCA	2	6	228858	228863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804261
4018	NC_008258	AGA	2	6	228889	228894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804261
4019	NC_008258	CAG	2	6	229287	229292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804263
4020	NC_008258	TTA	2	6	229310	229315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110804263
4021	NC_008258	GCA	2	6	229355	229360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804263
4022	NC_008258	GCT	2	6	229374	229379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804263
4023	NC_008258	CGT	2	6	229430	229435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804263
4024	NC_008258	TCC	2	6	229483	229488	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110804263
4025	NC_008258	TCTGC	2	10	229511	229520	0 %	40 %	20 %	40 %	110804263
4026	NC_008258	TGG	2	6	229544	229549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804263
4027	NC_008258	GCT	2	6	229559	229564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804263
4028	NC_008258	GTG	2	6	229594	229599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804263
4029	NC_008258	CAG	2	6	229626	229631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804263
4030	NC_008258	CTG	2	6	229709	229714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804263
4031	NC_008258	CG	3	6	229745	229750	0 %	0 %	50 %	50 %	110804263
4032	NC_008258	CCG	2	6	229799	229804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804263
4033	NC_008258	GCA	2	6	229855	229860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804263
4034	NC_008258	CGC	2	6	229917	229922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804263
4035	NC_008258	GCA	2	6	229945	229950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804263
4036	NC_008258	CGG	2	6	229955	229960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804263
4037	NC_008258	GGAT	2	8	229987	229994	25 %	25 %	50 %	0 %	110804263
4038	NC_008258	CAG	2	6	230025	230030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804263
4039	NC_008258	CTG	2	6	230064	230069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804263
4040	NC_008258	GCAGC	2	10	230076	230085	20 %	0 %	40 %	40 %	110804263
4041	NC_008258	TGC	2	6	230111	230116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804263
4042	NC_008258	CAG	2	6	230121	230126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804263
4043	NC_008258	CTT	2	6	230198	230203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804263
4044	NC_008258	GCG	2	6	230212	230217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804263
4045	NC_008258	CAG	3	9	230226	230234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804263
4046	NC_008258	CCG	2	6	230276	230281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804263
4047	NC_008258	ACC	2	6	230419	230424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804264
4048	NC_008258	GCG	2	6	230441	230446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804264
4049	NC_008258	CAG	2	6	230474	230479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804264
4050	NC_008258	TGC	2	6	230532	230537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804264
4051	NC_008258	TCC	2	6	230558	230563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110804264
4052	NC_008258	GGCA	2	8	230656	230663	25 %	0 %	50 %	25 %	110804264
4053	NC_008258	GTG	2	6	230756	230761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804264
4054	NC_008258	GCC	2	6	230807	230812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804264
4055	NC_008258	CCG	2	6	231205	231210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804265
4056	NC_008258	G	8	8	231269	231276	0 %	0 %	100 %	0 %	110804265
4057	NC_008258	A	7	7	233202	233208	100 %	0 %	0 %	0 %	110804266
4058	NC_008258	GC	3	6	233235	233240	0 %	0 %	50 %	50 %	110804266
4059	NC_008258	CGC	2	6	233283	233288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804266
4060	NC_008258	GGC	2	6	233322	233327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804266
4061	NC_008258	GAT	2	6	233344	233349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804266
4062	NC_008258	GGC	2	6	233456	233461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804266
4063	NC_008258	GCA	2	6	233504	233509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804266
4064	NC_008258	ATC	2	6	233515	233520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804266
4065	NC_008258	CGG	2	6	233558	233563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804266
4066	NC_008258	CGT	2	6	233625	233630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804266
4067	NC_008258	CA	3	6	233631	233636	50 %	0 %	0 %	50 %	110804266
4068	NC_008258	GCA	2	6	233655	233660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804266
4069	NC_008258	TG	3	6	233897	233902	0 %	50 %	50 %	0 %	110804267
4070	NC_008258	AT	3	6	234007	234012	50 %	50 %	0 %	0 %	110804267
4071	NC_008258	CCGC	2	8	234016	234023	0 %	0 %	25 %	75 %	110804267
4072	NC_008258	ACCGG	2	10	234037	234046	20 %	0 %	40 %	40 %	110804267
4073	NC_008258	GTCGCT	2	12	234054	234065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804267
4074	NC_008258	GCC	2	6	234081	234086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804267
4075	NC_008258	GC	3	6	234122	234127	0 %	0 %	50 %	50 %	110804267
4076	NC_008258	CAC	2	6	234158	234163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804267
4077	NC_008258	CAG	2	6	234186	234191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804267
4078	NC_008258	TCC	2	6	234193	234198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110804267
4079	NC_008258	GGCG	2	8	234204	234211	0 %	0 %	75 %	25 %	110804267
4080	NC_008258	GGC	2	6	234398	234403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804267
4081	NC_008258	CCA	2	6	234458	234463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804267
4082	NC_008258	AAT	2	6	234467	234472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110804267
4083	NC_008258	GCA	2	6	234476	234481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804267
4084	NC_008258	TTGT	2	8	234511	234518	0 %	75 %	25 %	0 %	110804267
4085	NC_008258	AT	3	6	234523	234528	50 %	50 %	0 %	0 %	110804268
4086	NC_008258	TGT	2	6	234536	234541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804268
4087	NC_008258	ATG	2	6	234575	234580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804268
4088	NC_008258	CCA	2	6	234749	234754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804268
4089	NC_008258	GAG	2	6	234818	234823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110804268
4090	NC_008258	AAAAGG	2	12	234835	234846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804268
4091	NC_008258	AAC	2	6	234881	234886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110804268
4092	NC_008258	GAT	2	6	235519	235524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804269
4093	NC_008258	CA	3	6	235561	235566	50 %	0 %	0 %	50 %	110804269
4094	NC_008258	CAG	2	6	235586	235591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804269
4095	NC_008258	AGC	2	6	235642	235647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804269
4096	NC_008258	AGGA	2	8	235680	235687	50 %	0 %	50 %	0 %	110804269
4097	NC_008258	CTG	2	6	235695	235700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804269
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4099	NC_008258	GTT	2	6	235718	235723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804269
4100	NC_008258	TGC	2	6	235738	235743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804269
4101	NC_008258	CTC	2	6	235805	235810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110804269
4102	NC_008258	AAG	2	6	235812	235817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804269
4103	NC_008258	A	6	6	235837	235842	100 %	0 %	0 %	0 %	110804269
4104	NC_008258	TGGA	2	8	235954	235961	25 %	25 %	50 %	0 %	110804270
4105	NC_008258	GCC	2	6	235964	235969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804270
4106	NC_008258	GTC	2	6	235973	235978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804270
4107	NC_008258	TGA	2	6	235983	235988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804270
4108	NC_008258	TCG	2	6	236046	236051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804270
4109	NC_008258	GCT	2	6	236061	236066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804270
4110	NC_008258	TGA	2	6	236085	236090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804270
4111	NC_008258	CTG	2	6	236162	236167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804270
4112	NC_008258	GAAA	2	8	236208	236215	75 %	0 %	25 %	0 %	110804270
4113	NC_008258	CTG	2	6	236250	236255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804270
4114	NC_008258	GA	4	8	236264	236271	50 %	0 %	50 %	0 %	110804270
4115	NC_008258	CTG	2	6	236295	236300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804270
4116	NC_008258	GCACT	2	10	236311	236320	20 %	20 %	20 %	40 %	110804270
4117	NC_008258	CGG	2	6	236334	236339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804270
4118	NC_008258	CGC	2	6	236386	236391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804270
4119	NC_008258	CGT	2	6	236408	236413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804270
4120	NC_008258	AGTGG	2	10	236418	236427	20 %	20 %	60 %	0 %	110804270
4121	NC_008258	GAA	2	6	236499	236504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804270
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4237	NC_008258	ACTAC	2	10	244726	244735	40 %	20 %	0 %	40 %	110804281
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4242	NC_008258	ATG	2	6	245230	245235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804281
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4259	NC_008258	GATGCT	2	12	246236	246247	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	110804281
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4482	NC_008258	CGG	2	6	258949	258954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804297
4483	NC_008258	TGT	2	6	258959	258964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804297
4484	NC_008258	TGG	2	6	258997	259002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804297
4485	NC_008258	CTGT	2	8	259026	259033	0 %	50 %	25 %	25 %	110804297
4486	NC_008258	TGG	2	6	259034	259039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804297
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4491	NC_008258	T	6	6	259191	259196	0 %	100 %	0 %	0 %	110804298
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4499	NC_008258	ACGCTG	2	12	259553	259564	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	110804298
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