MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 5 str. 8401 chromosome

Total Repeats: 75589

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_008258	AGT	2	6	193111	193116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804232
3502	NC_008258	GAT	2	6	193129	193134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804232
3503	NC_008258	TGAT	2	8	193164	193171	25 %	50 %	25 %	0 %	110804233
3504	NC_008258	CA	3	6	193233	193238	50 %	0 %	0 %	50 %	110804233
3505	NC_008258	TGA	2	6	193512	193517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804233
3506	NC_008258	GGTA	2	8	193546	193553	25 %	25 %	50 %	0 %	110804233
3507	NC_008258	CAA	2	6	193570	193575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110804233
3508	NC_008258	GAC	2	6	193604	193609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804233
3509	NC_008258	ATC	2	6	193616	193621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804233
3510	NC_008258	GGC	2	6	193622	193627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804233
3511	NC_008258	CAT	2	6	193651	193656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804233
3512	NC_008258	GGC	2	6	193676	193681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804233
3513	NC_008258	CCT	2	6	193706	193711	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110804233
3514	NC_008258	CG	3	6	193932	193937	0 %	0 %	50 %	50 %	110804233
3515	NC_008258	TGAC	2	8	193952	193959	25 %	25 %	25 %	25 %	110804234
3516	NC_008258	TTG	2	6	194063	194068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804234
3517	NC_008258	AGA	2	6	194121	194126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804234
3518	NC_008258	TTG	2	6	194144	194149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804234
3519	NC_008258	GTC	2	6	194159	194164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804234
3520	NC_008258	TTG	2	6	194231	194236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804234
3521	NC_008258	CATT	2	8	194301	194308	25 %	50 %	0 %	25 %	110804234
3522	NC_008258	ATGCC	2	10	194459	194468	20 %	20 %	20 %	40 %	110804234
3523	NC_008258	TTG	2	6	194536	194541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804234
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3525	NC_008258	GTG	2	6	194635	194640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804234
3526	NC_008258	CGC	2	6	194659	194664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804234
3527	NC_008258	TGGA	2	8	194720	194727	25 %	25 %	50 %	0 %	110804234
3528	NC_008258	ACT	2	6	194763	194768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804234
3529	NC_008258	TGG	3	9	194816	194824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804234
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3532	NC_008258	GCG	2	6	194965	194970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804234
3533	NC_008258	CAG	2	6	195037	195042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804234
3534	NC_008258	GGC	2	6	195066	195071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804234
3535	NC_008258	GTC	2	6	195174	195179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804235
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3537	NC_008258	CG	3	6	195309	195314	0 %	0 %	50 %	50 %	110804235
3538	NC_008258	CGA	2	6	195329	195334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804235
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3540	NC_008258	TTGA	2	8	195411	195418	25 %	50 %	25 %	0 %	110804235
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3544	NC_008258	CTG	2	6	195954	195959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804236
3545	NC_008258	TGA	2	6	195962	195967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804236
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3551	NC_008258	GC	3	6	196171	196176	0 %	0 %	50 %	50 %	110804236
3552	NC_008258	GT	3	6	196187	196192	0 %	50 %	50 %	0 %	110804236
3553	NC_008258	GAA	2	6	196203	196208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804236
3554	NC_008258	GAA	2	6	196260	196265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804236
3555	NC_008258	CGG	2	6	196279	196284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804236
3556	NC_008258	GC	3	6	196299	196304	0 %	0 %	50 %	50 %	110804236
3557	NC_008258	CGT	2	6	196313	196318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804236
3558	NC_008258	CAG	2	6	196346	196351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804236
3559	NC_008258	ACG	2	6	196387	196392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804236
3560	NC_008258	CGA	2	6	196403	196408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804236
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3569	NC_008258	CTG	2	6	196884	196889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804236
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3572	NC_008258	AGCCG	2	10	197156	197165	20 %	0 %	40 %	40 %	110804236
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3604	NC_008258	TGA	2	6	198421	198426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804236
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3619	NC_008258	TGA	2	6	199472	199477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804237
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3621	NC_008258	TCG	2	6	199525	199530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804237
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3740	NC_008258	CGA	2	6	207685	207690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162139361
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3985	NC_008258	CT	3	6	227427	227432	0 %	50 %	0 %	50 %	110804260
3986	NC_008258	TTG	2	6	227433	227438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804260
3987	NC_008258	TGC	2	6	227449	227454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804260
3988	NC_008258	AACA	2	8	227484	227491	75 %	0 %	0 %	25 %	110804260
3989	NC_008258	GGA	2	6	227493	227498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110804260
3990	NC_008258	TTG	2	6	227545	227550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804260
3991	NC_008258	CGC	2	6	227705	227710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804262
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3993	NC_008258	CGTT	2	8	227733	227740	0 %	50 %	25 %	25 %	110804262
3994	NC_008258	CCCATT	2	12	227767	227778	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	110804262
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3998	NC_008258	T	6	6	227840	227845	0 %	100 %	0 %	0 %	110804262
3999	NC_008258	CTG	2	6	227848	227853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804262
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