MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 5 str. 8401 chromosome

Total Repeats: 75589

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_008258	CTG	2	6	163731	163736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804208
3002	NC_008258	CGT	2	6	163753	163758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804208
3003	NC_008258	ATC	2	6	163794	163799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804208
3004	NC_008258	TGGA	2	8	163818	163825	25 %	25 %	50 %	0 %	110804208
3005	NC_008258	GCT	2	6	163865	163870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804208
3006	NC_008258	GCT	2	6	163877	163882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804208
3007	NC_008258	GCA	2	6	163894	163899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804208
3008	NC_008258	GC	3	6	163903	163908	0 %	0 %	50 %	50 %	110804208
3009	NC_008258	GCG	2	6	163975	163980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804208
3010	NC_008258	TGT	2	6	163984	163989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804208
3011	NC_008258	TGG	3	9	163999	164007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804208
3012	NC_008258	GGC	2	6	164099	164104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804208
3013	NC_008258	TAT	2	6	164141	164146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110804208
3014	NC_008258	CGGCG	2	10	164201	164210	0 %	0 %	60 %	40 %	110804208
3015	NC_008258	TGGTG	2	10	164213	164222	0 %	40 %	60 %	0 %	110804208
3016	NC_008258	GTT	2	6	164261	164266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804208
3017	NC_008258	GCAG	2	8	164271	164278	25 %	0 %	50 %	25 %	110804208
3018	NC_008258	GCG	2	6	164286	164291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804208
3019	NC_008258	CGC	2	6	164315	164320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804208
3020	NC_008258	TGA	2	6	164395	164400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804208
3021	NC_008258	GTG	2	6	164413	164418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804208
3022	NC_008258	GCC	2	6	164536	164541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804208
3023	NC_008258	GCTG	2	8	164542	164549	0 %	25 %	50 %	25 %	110804208
3024	NC_008258	GTG	2	6	164566	164571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804208
3025	NC_008258	CG	3	6	164576	164581	0 %	0 %	50 %	50 %	110804208
3026	NC_008258	GCT	3	9	164618	164626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804208
3027	NC_008258	CGA	2	6	164653	164658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804208
3028	NC_008258	TTG	2	6	164680	164685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804208
3029	NC_008258	GAT	2	6	164711	164716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804208
3030	NC_008258	GACG	2	8	164725	164732	25 %	0 %	50 %	25 %	110804208
3031	NC_008258	CA	3	6	164737	164742	50 %	0 %	0 %	50 %	110804208
3032	NC_008258	TGG	2	6	164758	164763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804208
3033	NC_008258	CTG	2	6	164772	164777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804208
3034	NC_008258	TTCCA	2	10	164812	164821	20 %	40 %	0 %	40 %	110804208
3035	NC_008258	CGG	2	6	164827	164832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804208
3036	NC_008258	GCT	2	6	164834	164839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804208
3037	NC_008258	GCA	2	6	164957	164962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804209
3038	NC_008258	CAT	2	6	165055	165060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804209
3039	NC_008258	GAA	2	6	165064	165069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804209
3040	NC_008258	AGA	2	6	165138	165143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804209
3041	NC_008258	ACC	2	6	165154	165159	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804209
3042	NC_008258	CTT	2	6	165189	165194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804209
3043	NC_008258	CAG	2	6	165205	165210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804209
3044	NC_008258	TTCA	2	8	165271	165278	25 %	50 %	0 %	25 %	110804209
3045	NC_008258	ACG	2	6	165373	165378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804209
3046	NC_008258	ACC	2	6	165379	165384	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804209
3047	NC_008258	CCG	2	6	165407	165412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804209
3048	NC_008258	AAT	2	6	165453	165458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110804209
3049	NC_008258	TCA	2	6	165492	165497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804209
3050	NC_008258	GAT	2	6	165505	165510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804209
3051	NC_008258	TCG	2	6	165527	165532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804209
3052	NC_008258	GCG	2	6	165567	165572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804209
3053	NC_008258	TGCC	2	8	165588	165595	0 %	25 %	25 %	50 %	110804209
3054	NC_008258	CGA	2	6	165603	165608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804209
3055	NC_008258	TGGC	2	8	165724	165731	0 %	25 %	50 %	25 %	110804209
3056	NC_008258	CAG	2	6	165763	165768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804209
3057	NC_008258	AAC	2	6	165789	165794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110804209
3058	NC_008258	TCG	2	6	165855	165860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804209
3059	NC_008258	TCGG	2	8	165944	165951	0 %	25 %	50 %	25 %	110804209
3060	NC_008258	CGG	2	6	165975	165980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804209
3061	NC_008258	GCC	2	6	166120	166125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804209
3062	NC_008258	CG	3	6	166176	166181	0 %	0 %	50 %	50 %	110804209
3063	NC_008258	CG	3	6	166475	166480	0 %	0 %	50 %	50 %	110804210
3064	NC_008258	CTT	2	6	166509	166514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804210
3065	NC_008258	GTC	2	6	166557	166562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804210
3066	NC_008258	CTG	2	6	166648	166653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804210
3067	NC_008258	CGG	2	6	166693	166698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804210
3068	NC_008258	TGG	2	6	166806	166811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804210
3069	NC_008258	CGG	2	6	166853	166858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804210
3070	NC_008258	CGG	2	6	166898	166903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804210
3071	NC_008258	TGA	2	6	166946	166951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804210
3072	NC_008258	GCT	2	6	166964	166969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804210
3073	NC_008258	TGC	3	9	166979	166987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804210
3074	NC_008258	GCTG	2	8	166991	166998	0 %	25 %	50 %	25 %	110804210
3075	NC_008258	CGC	2	6	167011	167016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804210
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3077	NC_008258	TATT	2	8	167089	167096	25 %	75 %	0 %	0 %	110804210
3078	NC_008258	TTGA	2	8	167148	167155	25 %	50 %	25 %	0 %	110804210
3079	NC_008258	TAT	2	6	167213	167218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110804210
3080	NC_008258	TAA	2	6	167243	167248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110804210
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3084	NC_008258	TG	3	6	167338	167343	0 %	50 %	50 %	0 %	110804210
3085	NC_008258	GCG	2	6	167377	167382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804210
3086	NC_008258	TCG	2	6	167446	167451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804210
3087	NC_008258	ACC	2	6	167463	167468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804210
3088	NC_008258	GC	3	6	167488	167493	0 %	0 %	50 %	50 %	110804210
3089	NC_008258	GGC	2	6	167630	167635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804210
3090	NC_008258	CG	3	6	167643	167648	0 %	0 %	50 %	50 %	110804210
3091	NC_008258	TTCTGG	2	12	167665	167676	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	110804210
3092	NC_008258	ATT	2	6	167712	167717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110804210
3093	NC_008258	CGG	2	6	167753	167758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804210
3094	NC_008258	GC	3	6	167784	167789	0 %	0 %	50 %	50 %	110804210
3095	NC_008258	CAGC	2	8	167839	167846	25 %	0 %	25 %	50 %	110804210
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3099	NC_008258	TGA	2	6	168092	168097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804211
3100	NC_008258	TGG	2	6	168145	168150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804211
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3102	NC_008258	TGCGGT	2	12	168255	168266	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	110804211
3103	NC_008258	GCC	2	6	168386	168391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804212
3104	NC_008258	CAT	2	6	168421	168426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804212
3105	NC_008258	TAA	2	6	168458	168463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110804212
3106	NC_008258	CCG	2	6	168482	168487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804212
3107	NC_008258	ATA	2	6	168488	168493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110804212
3108	NC_008258	CGC	2	6	168564	168569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804212
3109	NC_008258	TGGC	2	8	168709	168716	0 %	25 %	50 %	25 %	110804212
3110	NC_008258	TGT	2	6	169023	169028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804213
3111	NC_008258	ATA	2	6	169038	169043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110804213
3112	NC_008258	GGTCC	2	10	169135	169144	0 %	20 %	40 %	40 %	110804213
3113	NC_008258	T	6	6	169325	169330	0 %	100 %	0 %	0 %	110804213
3114	NC_008258	CAG	2	6	169373	169378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804213
3115	NC_008258	GGA	2	6	169629	169634	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110804213
3116	NC_008258	GCT	2	6	169646	169651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804213
3117	NC_008258	CGG	2	6	169672	169677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804213
3118	NC_008258	TGA	2	6	169711	169716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804213
3119	NC_008258	CG	3	6	169717	169722	0 %	0 %	50 %	50 %	110804213
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3121	NC_008258	ACA	2	6	169912	169917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110804214
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3242	NC_008258	CGT	2	6	177374	177379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804219
3243	NC_008258	GCT	2	6	177381	177386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804219
3244	NC_008258	TGG	2	6	177450	177455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804219
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3246	NC_008258	TGA	2	6	177531	177536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804219
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3265	NC_008258	AAG	2	6	178493	178498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804219
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3273	NC_008258	TCA	2	6	179165	179170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804219
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3282	NC_008258	CGC	2	6	179654	179659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162139362
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3330	NC_008258	TGG	2	6	182622	182627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804223
3331	NC_008258	TGCAC	2	10	182736	182745	20 %	20 %	20 %	40 %	110804223
3332	NC_008258	ACAGCT	2	12	182801	182812	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	110804223
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3342	NC_008258	CTG	2	6	183580	183585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804224
3343	NC_008258	ACGCCG	2	12	183613	183624	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	110804224
3344	NC_008258	AGA	2	6	183651	183656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804224
3345	NC_008258	GCC	2	6	183780	183785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804224
3346	NC_008258	GAA	2	6	183793	183798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804224
3347	NC_008258	CGT	2	6	183799	183804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804224
3348	NC_008258	TCGT	2	8	183821	183828	0 %	50 %	25 %	25 %	110804224
3349	NC_008258	CGT	2	6	183868	183873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804224
3350	NC_008258	GAC	2	6	183925	183930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804224
3351	NC_008258	ACTG	2	8	183960	183967	25 %	25 %	25 %	25 %	110804224
3352	NC_008258	TGC	2	6	183969	183974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804224
3353	NC_008258	GCG	2	6	183991	183996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804224
3354	NC_008258	AAG	2	6	184007	184012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804224
3355	NC_008258	GCA	2	6	184167	184172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804225
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3357	NC_008258	TGG	2	6	184221	184226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804225
3358	NC_008258	TC	3	6	184269	184274	0 %	50 %	0 %	50 %	110804225
3359	NC_008258	CTT	2	6	184313	184318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804225
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3482	NC_008258	GC	3	6	192226	192231	0 %	0 %	50 %	50 %	110804231
3483	NC_008258	CGT	2	6	192293	192298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804231
3484	NC_008258	CGG	2	6	192313	192318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804231
3485	NC_008258	CGG	2	6	192374	192379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804231
3486	NC_008258	CAA	2	6	192500	192505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110804231
3487	NC_008258	TGA	2	6	192532	192537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804231
3488	NC_008258	TGA	2	6	192542	192547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804231
3489	NC_008258	CAA	2	6	192588	192593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110804231
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3491	NC_008258	ACT	2	6	192707	192712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804232
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3499	NC_008258	A	6	6	193056	193061	100 %	0 %	0 %	0 %	110804232
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