MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 5 str. 8401 chromosome

Total Repeats: 75589

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_008258	AAAC	2	8	137149	137156	75 %	0 %	0 %	25 %	110804185
2502	NC_008258	GGC	2	6	137268	137273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804185
2503	NC_008258	TGG	2	6	137298	137303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804185
2504	NC_008258	TGG	2	6	137335	137340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804185
2505	NC_008258	TCG	2	6	137371	137376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804185
2506	NC_008258	GCA	2	6	137430	137435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804185
2507	NC_008258	ACC	2	6	137466	137471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804185
2508	NC_008258	ACG	2	6	137483	137488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804185
2509	NC_008258	AAT	2	6	137528	137533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110804185
2510	NC_008258	GTG	2	6	137606	137611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804185
2511	NC_008258	TAAAGG	2	12	137797	137808	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	110804185
2512	NC_008258	CAG	2	6	137864	137869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804185
2513	NC_008258	CAT	2	6	138103	138108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804185
2514	NC_008258	GAA	2	6	138115	138120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804185
2515	NC_008258	ACG	2	6	138125	138130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804185
2516	NC_008258	GGC	2	6	138266	138271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804185
2517	NC_008258	GCT	2	6	138370	138375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804185
2518	NC_008258	CTT	2	6	138403	138408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804185
2519	NC_008258	GTG	2	6	138445	138450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804185
2520	NC_008258	ACC	2	6	138593	138598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804185
2521	NC_008258	CAG	2	6	138605	138610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804185
2522	NC_008258	ACC	2	6	138615	138620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804185
2523	NC_008258	GAA	2	6	138692	138697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804185
2524	NC_008258	AGC	2	6	138774	138779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804185
2525	NC_008258	GCGCG	2	10	138799	138808	0 %	0 %	60 %	40 %	110804185
2526	NC_008258	GTA	2	6	138863	138868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804185
2527	NC_008258	GCC	2	6	138875	138880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804185
2528	NC_008258	CCAG	2	8	138889	138896	25 %	0 %	25 %	50 %	110804185
2529	NC_008258	TCG	2	6	138962	138967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804185
2530	NC_008258	TTG	2	6	139134	139139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804186
2531	NC_008258	GTC	2	6	139261	139266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804186
2532	NC_008258	TGG	2	6	139309	139314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804186
2533	NC_008258	CTG	2	6	139317	139322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804186
2534	NC_008258	TTTATG	2	12	139332	139343	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	110804186
2535	NC_008258	CCA	2	6	139420	139425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804186
2536	NC_008258	TTG	2	6	139486	139491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804186
2537	NC_008258	ATC	2	6	139497	139502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804186
2538	NC_008258	GCT	2	6	139577	139582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804186
2539	NC_008258	CCGTC	2	10	139590	139599	0 %	20 %	20 %	60 %	110804186
2540	NC_008258	GTGAA	2	10	139600	139609	40 %	20 %	40 %	0 %	110804186
2541	NC_008258	TGG	2	6	139654	139659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804186
2542	NC_008258	CTG	2	6	139719	139724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804186
2543	NC_008258	TGG	2	6	139848	139853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804187
2544	NC_008258	GCA	2	6	139872	139877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804187
2545	NC_008258	CGT	2	6	139881	139886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804187
2546	NC_008258	TGG	2	6	139950	139955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804187
2547	NC_008258	GTTCA	2	10	139987	139996	20 %	40 %	20 %	20 %	110804187
2548	NC_008258	CA	3	6	139995	140000	50 %	0 %	0 %	50 %	110804187
2549	NC_008258	GCA	2	6	140073	140078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804187
2550	NC_008258	GTT	2	6	140083	140088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804187
2551	NC_008258	CGG	2	6	140115	140120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804187
2552	NC_008258	CGC	3	9	140127	140135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804187
2553	NC_008258	ATA	2	6	140153	140158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110804187
2554	NC_008258	ATCCA	2	10	140313	140322	40 %	20 %	0 %	40 %	110804187
2555	NC_008258	A	6	6	140359	140364	100 %	0 %	0 %	0 %	110804187
2556	NC_008258	CCA	2	6	140379	140384	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804187
2557	NC_008258	TTG	2	6	140405	140410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804187
2558	NC_008258	TGA	2	6	140412	140417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804187
2559	NC_008258	TAT	2	6	140691	140696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110804188
2560	NC_008258	CT	3	6	140700	140705	0 %	50 %	0 %	50 %	110804188
2561	NC_008258	TAAA	2	8	140708	140715	75 %	25 %	0 %	0 %	110804188
2562	NC_008258	CGGG	2	8	140721	140728	0 %	0 %	75 %	25 %	110804188
2563	NC_008258	GCA	2	6	140829	140834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804188
2564	NC_008258	CAGG	2	8	140848	140855	25 %	0 %	50 %	25 %	110804188
2565	NC_008258	TAC	2	6	140857	140862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804188
2566	NC_008258	AGC	2	6	140909	140914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804188
2567	NC_008258	AACG	2	8	140935	140942	50 %	0 %	25 %	25 %	110804188
2568	NC_008258	ACT	2	6	141012	141017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804188
2569	NC_008258	CGA	2	6	141024	141029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804188
2570	NC_008258	ACCG	2	8	141030	141037	25 %	0 %	25 %	50 %	110804188
2571	NC_008258	CGC	2	6	141058	141063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804188
2572	NC_008258	CAC	2	6	141102	141107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804188
2573	NC_008258	CAT	2	6	141108	141113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804188
2574	NC_008258	CA	3	6	141120	141125	50 %	0 %	0 %	50 %	110804188
2575	NC_008258	GAA	2	6	141133	141138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804188
2576	NC_008258	ATT	2	6	141166	141171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110804188
2577	NC_008258	TGG	2	6	141185	141190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804188
2578	NC_008258	GCT	2	6	141210	141215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804188
2579	NC_008258	TGTT	2	8	141428	141435	0 %	75 %	25 %	0 %	110804188
2580	NC_008258	ATG	2	6	141468	141473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804188
2581	NC_008258	GCC	2	6	141554	141559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804189
2582	NC_008258	TCA	2	6	141562	141567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804189
2583	NC_008258	CTTTA	2	10	141576	141585	20 %	60 %	0 %	20 %	110804189
2584	NC_008258	ATG	2	6	141669	141674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804189
2585	NC_008258	TCA	2	6	141708	141713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804189
2586	NC_008258	T	6	6	141714	141719	0 %	100 %	0 %	0 %	110804189
2587	NC_008258	GCT	2	6	141749	141754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804189
2588	NC_008258	ATT	2	6	141780	141785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110804189
2589	NC_008258	CGG	2	6	141797	141802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804189
2590	NC_008258	TGGCG	2	10	141803	141812	0 %	20 %	60 %	20 %	110804189
2591	NC_008258	TGTT	2	8	141820	141827	0 %	75 %	25 %	0 %	110804189
2592	NC_008258	T	6	6	141855	141860	0 %	100 %	0 %	0 %	110804189
2593	NC_008258	CGG	2	6	141913	141918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804189
2594	NC_008258	GCC	2	6	142049	142054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804189
2595	NC_008258	ATG	2	6	142132	142137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804189
2596	NC_008258	TGG	2	6	142165	142170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804189
2597	NC_008258	ACGTGG	2	12	142214	142225	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	110804189
2598	NC_008258	CTG	2	6	142871	142876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804190
2599	NC_008258	TGC	2	6	142939	142944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804190
2600	NC_008258	TTA	2	6	143032	143037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110804190
2601	NC_008258	CAA	2	6	143134	143139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110804190
2602	NC_008258	GC	3	6	143325	143330	0 %	0 %	50 %	50 %	110804190
2603	NC_008258	CGA	2	6	143386	143391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804190
2604	NC_008258	CGA	2	6	143418	143423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804190
2605	NC_008258	GAA	2	6	143515	143520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804190
2606	NC_008258	GGT	2	6	143545	143550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804190
2607	NC_008258	TGA	2	6	143560	143565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804190
2608	NC_008258	T	6	6	143755	143760	0 %	100 %	0 %	0 %	110804190
2609	NC_008258	CGC	2	6	143840	143845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804190
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2611	NC_008258	GTT	2	6	143992	143997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804190
2612	NC_008258	TTTCA	2	10	144116	144125	20 %	60 %	0 %	20 %	110804191
2613	NC_008258	CTT	2	6	144169	144174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804191
2614	NC_008258	GAT	2	6	144200	144205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804191
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2616	NC_008258	AAT	2	6	144254	144259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110804191
2617	NC_008258	GCA	2	6	144442	144447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804191
2618	NC_008258	GATG	2	8	144733	144740	25 %	25 %	50 %	0 %	110804192
2619	NC_008258	ATGC	2	8	144785	144792	25 %	25 %	25 %	25 %	110804192
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2621	NC_008258	AAGC	2	8	144982	144989	50 %	0 %	25 %	25 %	110804192
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2742	NC_008258	GCG	2	6	151147	151152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162139363
2743	NC_008258	ATG	2	6	151164	151169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162139363
2744	NC_008258	CGT	2	6	151187	151192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162139363
2745	NC_008258	GTACAG	2	12	151225	151236	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	162139363
2746	NC_008258	TAA	2	6	151237	151242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162139363
2747	NC_008258	CGT	2	6	151286	151291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162139363
2748	NC_008258	TCT	2	6	151399	151404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162139363
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2762	NC_008258	CTT	2	6	152048	152053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804200
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2772	NC_008258	GT	3	6	152743	152748	0 %	50 %	50 %	0 %	110804201
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2774	NC_008258	CG	3	6	152910	152915	0 %	0 %	50 %	50 %	110804201
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2780	NC_008258	TCA	2	6	153252	153257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804203
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2847	NC_008258	A	6	6	156448	156453	100 %	0 %	0 %	0 %	110804204
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2853	NC_008258	ATC	2	6	156715	156720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804204
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2982	NC_008258	GCT	2	6	163109	163114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804208
2983	NC_008258	TGG	2	6	163135	163140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804208
2984	NC_008258	CGA	2	6	163183	163188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804208
2985	NC_008258	GC	3	6	163207	163212	0 %	0 %	50 %	50 %	110804208
2986	NC_008258	CAC	2	6	163229	163234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804208
2987	NC_008258	TGC	2	6	163271	163276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804208
2988	NC_008258	GTT	2	6	163293	163298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804208
2989	NC_008258	GCG	2	6	163384	163389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804208
2990	NC_008258	CAAT	2	8	163390	163397	50 %	25 %	0 %	25 %	110804208
2991	NC_008258	CAT	2	6	163416	163421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804208
2992	NC_008258	TGC	2	6	163531	163536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804208
2993	NC_008258	TGA	2	6	163565	163570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804208
2994	NC_008258	TGGCG	2	10	163571	163580	0 %	20 %	60 %	20 %	110804208
2995	NC_008258	GGC	2	6	163616	163621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804208
2996	NC_008258	TCA	2	6	163639	163644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804208
2997	NC_008258	GCT	2	6	163649	163654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804208
2998	NC_008258	GTT	2	6	163688	163693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804208
2999	NC_008258	CGC	2	6	163696	163701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804208
3000	NC_008258	GCG	2	6	163724	163729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804208

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