MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 5 str. 8401 chromosome

Total Repeats: 75589

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_008258	T	6	6	111023	111028	0 %	100 %	0 %	0 %	110804166
2003	NC_008258	TTGC	2	8	111082	111089	0 %	50 %	25 %	25 %	110804166
2004	NC_008258	GCA	2	6	111127	111132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804166
2005	NC_008258	CAG	2	6	111208	111213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804166
2006	NC_008258	ACC	2	6	111273	111278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804166
2007	NC_008258	AAT	2	6	111287	111292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110804166
2008	NC_008258	TA	3	6	111380	111385	50 %	50 %	0 %	0 %	110804166
2009	NC_008258	GAA	2	6	111625	111630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804167
2010	NC_008258	CGC	2	6	111765	111770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804167
2011	NC_008258	CTT	2	6	111815	111820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804167
2012	NC_008258	CTG	2	6	111833	111838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804167
2013	NC_008258	CAA	2	6	111879	111884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110804167
2014	NC_008258	TTC	2	6	111885	111890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804167
2015	NC_008258	A	6	6	111947	111952	100 %	0 %	0 %	0 %	110804167
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2018	NC_008258	GGC	2	6	112312	112317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804167
2019	NC_008258	GGC	2	6	112339	112344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804167
2020	NC_008258	AG	3	6	112362	112367	50 %	0 %	50 %	0 %	110804167
2021	NC_008258	CGG	2	6	112368	112373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804167
2022	NC_008258	GAG	2	6	112384	112389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110804167
2023	NC_008258	GGC	2	6	112453	112458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804167
2024	NC_008258	GCA	2	6	112474	112479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804167
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2030	NC_008258	CATCG	2	10	112709	112718	20 %	20 %	20 %	40 %	110804168
2031	NC_008258	CCA	3	9	112747	112755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804168
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2035	NC_008258	GCCA	2	8	112950	112957	25 %	0 %	25 %	50 %	110804168
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2122	NC_008258	CAGT	2	8	118603	118610	25 %	25 %	25 %	25 %	110804173
2123	NC_008258	CGG	2	6	118684	118689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804173
2124	NC_008258	CTG	2	6	118810	118815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804173
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2146	NC_008258	TTG	2	6	120212	120217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804174
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2241	NC_008258	AGC	2	6	124735	124740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804176
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2243	NC_008258	GGT	2	6	124757	124762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804176
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2270	NC_008258	ATCA	2	8	126113	126120	50 %	25 %	0 %	25 %	110804177
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2357	NC_008258	CCAG	2	8	130172	130179	25 %	0 %	25 %	50 %	110804179
2358	NC_008258	GTT	2	6	130182	130187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804179
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2362	NC_008258	TCT	2	6	130378	130383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804179
2363	NC_008258	CTG	2	6	130506	130511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804179
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2365	NC_008258	GTGC	2	8	130551	130558	0 %	25 %	50 %	25 %	110804179
2366	NC_008258	GGC	2	6	130560	130565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804179
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2442	NC_008258	TCG	2	6	134207	134212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804182
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2453	NC_008258	CGA	2	6	134891	134896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804184
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2480	NC_008258	ATG	2	6	136084	136089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804183
2481	NC_008258	GAT	2	6	136152	136157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804183
2482	NC_008258	CGG	2	6	136197	136202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804183
2483	NC_008258	CCA	2	6	136215	136220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804183
2484	NC_008258	GCG	3	9	136270	136278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804183
2485	NC_008258	ATG	2	6	136321	136326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804183
2486	NC_008258	CG	3	6	136399	136404	0 %	0 %	50 %	50 %	110804183
2487	NC_008258	CTG	2	6	136507	136512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804183
2488	NC_008258	GAT	2	6	136530	136535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804183
2489	NC_008258	CAT	2	6	136609	136614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804185
2490	NC_008258	CAC	2	6	136685	136690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804185
2491	NC_008258	ACC	2	6	136733	136738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804185
2492	NC_008258	TGT	2	6	136780	136785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804185
2493	NC_008258	GC	3	6	136788	136793	0 %	0 %	50 %	50 %	110804185
2494	NC_008258	GCG	2	6	136812	136817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804185
2495	NC_008258	CCG	2	6	136834	136839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804185
2496	NC_008258	GCCC	2	8	136849	136856	0 %	0 %	25 %	75 %	110804185
2497	NC_008258	GCG	2	6	136918	136923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804185
2498	NC_008258	CAC	2	6	136943	136948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804185
2499	NC_008258	GCTG	2	8	136989	136996	0 %	25 %	50 %	25 %	110804185
2500	NC_008258	GCT	2	6	137107	137112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804185

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