MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 5 str. 8401 chromosome

Total Repeats: 75589

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_008258	TGA	2	6	83989	83994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162139364
1502	NC_008258	ACG	2	6	83999	84004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162139364
1503	NC_008258	TGG	2	6	84188	84193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162139364
1504	NC_008258	CAG	2	6	84194	84199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162139364
1505	NC_008258	GC	3	6	84211	84216	0 %	0 %	50 %	50 %	162139364
1506	NC_008258	GCA	2	6	84328	84333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162139364
1507	NC_008258	TGC	2	6	84343	84348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162139364
1508	NC_008258	TAT	2	6	84353	84358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162139364
1509	NC_008258	CGG	2	6	84391	84396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162139364
1510	NC_008258	AGA	2	6	84454	84459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162139364
1511	NC_008258	TGG	2	6	84546	84551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162139364
1512	NC_008258	CGTC	2	8	84652	84659	0 %	25 %	25 %	50 %	162139364
1513	NC_008258	TC	3	6	84693	84698	0 %	50 %	0 %	50 %	162139364
1514	NC_008258	AAT	2	6	84749	84754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162139364
1515	NC_008258	TTG	2	6	84765	84770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162139364
1516	NC_008258	GA	3	6	84854	84859	50 %	0 %	50 %	0 %	162139364
1517	NC_008258	T	6	6	84932	84937	0 %	100 %	0 %	0 %	110804140
1518	NC_008258	ACA	2	6	84950	84955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110804140
1519	NC_008258	CGA	2	6	84981	84986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804140
1520	NC_008258	GTGA	2	8	85084	85091	25 %	25 %	50 %	0 %	110804140
1521	NC_008258	GC	3	6	85103	85108	0 %	0 %	50 %	50 %	110804140
1522	NC_008258	GCTC	2	8	85309	85316	0 %	25 %	25 %	50 %	110804140
1523	NC_008258	CG	3	6	85334	85339	0 %	0 %	50 %	50 %	110804140
1524	NC_008258	AAT	2	6	85347	85352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110804140
1525	NC_008258	TTA	2	6	85597	85602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110804142
1526	NC_008258	ACC	2	6	85678	85683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804142
1527	NC_008258	CTG	2	6	85818	85823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804142
1528	NC_008258	AGA	2	6	85835	85840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804142
1529	NC_008258	ATT	2	6	85899	85904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110804142
1530	NC_008258	CGT	2	6	85912	85917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804142
1531	NC_008258	TGGT	2	8	86014	86021	0 %	50 %	50 %	0 %	110804142
1532	NC_008258	GAT	2	6	86031	86036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804142
1533	NC_008258	CCG	2	6	86071	86076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804142
1534	NC_008258	GC	3	6	86095	86100	0 %	0 %	50 %	50 %	110804142
1535	NC_008258	GAT	2	6	86157	86162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804142
1536	NC_008258	CG	3	6	86164	86169	0 %	0 %	50 %	50 %	110804142
1537	NC_008258	GGC	2	6	86207	86212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804142
1538	NC_008258	CGT	2	6	86272	86277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804142
1539	NC_008258	GTT	2	6	86282	86287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804142
1540	NC_008258	GATG	2	8	86297	86304	25 %	25 %	50 %	0 %	110804142
1541	NC_008258	CTT	2	6	86378	86383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804142
1542	NC_008258	CGC	2	6	86517	86522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804142
1543	NC_008258	TGC	2	6	86616	86621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804143
1544	NC_008258	ATG	2	6	86641	86646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804143
1545	NC_008258	TTCCAT	2	12	86671	86682	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	110804143
1546	NC_008258	TCCT	2	8	86689	86696	0 %	50 %	0 %	50 %	110804143
1547	NC_008258	GTG	2	6	86714	86719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804143
1548	NC_008258	A	6	6	86917	86922	100 %	0 %	0 %	0 %	110804144
1549	NC_008258	GTGAT	2	10	86963	86972	20 %	40 %	40 %	0 %	110804144
1550	NC_008258	GCTG	2	8	87029	87036	0 %	25 %	50 %	25 %	110804144
1551	NC_008258	GGA	2	6	87059	87064	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110804144
1552	NC_008258	TCT	2	6	87114	87119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804144
1553	NC_008258	CTG	2	6	87124	87129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804144
1554	NC_008258	AATCTG	2	12	87244	87255	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	110804144
1555	NC_008258	ACA	2	6	87258	87263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110804144
1556	NC_008258	GCT	2	6	87996	88001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804145
1557	NC_008258	TCA	2	6	88041	88046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804145
1558	NC_008258	CTG	2	6	88054	88059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804145
1559	NC_008258	CCTG	2	8	88068	88075	0 %	25 %	25 %	50 %	110804145
1560	NC_008258	GATG	2	8	88176	88183	25 %	25 %	50 %	0 %	110804145
1561	NC_008258	AAG	2	6	88238	88243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804145
1562	NC_008258	CAA	2	6	88263	88268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110804145
1563	NC_008258	AAC	2	6	88287	88292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110804145
1564	NC_008258	ATG	2	6	88382	88387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804146
1565	NC_008258	TAC	2	6	88402	88407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804146
1566	NC_008258	TGC	2	6	88410	88415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804146
1567	NC_008258	GGT	2	6	88484	88489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804146
1568	NC_008258	CGAT	2	8	88539	88546	25 %	25 %	25 %	25 %	110804146
1569	NC_008258	TGA	2	6	88582	88587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804146
1570	NC_008258	CAT	2	6	88600	88605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804146
1571	NC_008258	TGA	2	6	88708	88713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804146
1572	NC_008258	AGA	2	6	88810	88815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804146
1573	NC_008258	GCT	2	6	88943	88948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804146
1574	NC_008258	GGA	2	6	89029	89034	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110804146
1575	NC_008258	GCTC	2	8	89055	89062	0 %	25 %	25 %	50 %	110804146
1576	NC_008258	GGC	2	6	89082	89087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804146
1577	NC_008258	ATC	2	6	89093	89098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804146
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1579	NC_008258	A	6	6	89201	89206	100 %	0 %	0 %	0 %	110804146
1580	NC_008258	AGTTC	2	10	89285	89294	20 %	40 %	20 %	20 %	110804146
1581	NC_008258	AG	3	6	89305	89310	50 %	0 %	50 %	0 %	110804146
1582	NC_008258	CAG	2	6	89325	89330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804147
1583	NC_008258	ATT	2	6	89455	89460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110804147
1584	NC_008258	CGG	2	6	89465	89470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804147
1585	NC_008258	AAC	2	6	89522	89527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110804147
1586	NC_008258	GCA	2	6	89640	89645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804147
1587	NC_008258	AGC	2	6	89706	89711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804148
1588	NC_008258	GAA	2	6	89740	89745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804148
1589	NC_008258	GTT	2	6	89775	89780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804148
1590	NC_008258	AAG	2	6	89987	89992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804148
1591	NC_008258	TTTA	2	8	90106	90113	25 %	75 %	0 %	0 %	110804148
1592	NC_008258	A	6	6	90154	90159	100 %	0 %	0 %	0 %	110804148
1593	NC_008258	TCCG	2	8	90207	90214	0 %	25 %	25 %	50 %	110804148
1594	NC_008258	TCT	2	6	90364	90369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804148
1595	NC_008258	TGA	2	6	90408	90413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804148
1596	NC_008258	AAC	2	6	90445	90450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110804148
1597	NC_008258	TGG	2	6	90491	90496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804148
1598	NC_008258	TGG	2	6	90635	90640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804148
1599	NC_008258	TGA	2	6	90641	90646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804148
1600	NC_008258	CGTGG	2	10	90658	90667	0 %	20 %	60 %	20 %	110804148
1601	NC_008258	TACT	2	8	90834	90841	25 %	50 %	0 %	25 %	110804148
1602	NC_008258	GGT	2	6	90917	90922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804148
1603	NC_008258	AG	3	6	90930	90935	50 %	0 %	50 %	0 %	110804148
1604	NC_008258	C	6	6	91050	91055	0 %	0 %	0 %	100 %	110804148
1605	NC_008258	GTG	2	6	91099	91104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804148
1606	NC_008258	ATG	2	6	91108	91113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804148
1607	NC_008258	GGC	4	12	91132	91143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804148
1608	NC_008258	GGC	2	6	91149	91154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804148
1609	NC_008258	TATCG	2	10	91165	91174	20 %	40 %	20 %	20 %	110804148
1610	NC_008258	AATA	2	8	91225	91232	75 %	25 %	0 %	0 %	110804148
1611	NC_008258	GTT	3	9	91285	91293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804148
1612	NC_008258	TAC	2	6	91318	91323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804148
1613	NC_008258	GGC	2	6	91324	91329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804148
1614	NC_008258	CAT	2	6	91356	91361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804148
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1616	NC_008258	CTT	2	6	91478	91483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804149
1617	NC_008258	GA	3	6	91521	91526	50 %	0 %	50 %	0 %	110804149
1618	NC_008258	GCG	2	6	91550	91555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804149
1619	NC_008258	GTA	2	6	91574	91579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804149
1620	NC_008258	TCA	2	6	91582	91587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804149
1621	NC_008258	AT	3	6	91603	91608	50 %	50 %	0 %	0 %	110804149
1622	NC_008258	ATT	2	6	91640	91645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110804149
1623	NC_008258	CGAC	2	8	91665	91672	25 %	0 %	25 %	50 %	110804149
1624	NC_008258	ATCT	2	8	91706	91713	25 %	50 %	0 %	25 %	110804149
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1626	NC_008258	ACG	2	6	91817	91822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804149
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1992	NC_008258	CGC	2	6	110600	110605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804165
1993	NC_008258	GAA	2	6	110640	110645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804165
1994	NC_008258	GC	3	6	110651	110656	0 %	0 %	50 %	50 %	110804165
1995	NC_008258	T	6	6	110729	110734	0 %	100 %	0 %	0 %	110804165
1996	NC_008258	GTGC	2	8	110818	110825	0 %	25 %	50 %	25 %	110804166
1997	NC_008258	TTA	2	6	110865	110870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110804166
1998	NC_008258	CG	3	6	110905	110910	0 %	0 %	50 %	50 %	110804166
1999	NC_008258	AGC	2	6	110918	110923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804166
2000	NC_008258	CAT	2	6	110953	110958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804166

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