MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 5 str. 8401 chromosome

Total Repeats: 75589

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_008258	CACC	2	8	55432	55439	25 %	0 %	0 %	75 %	110804120
1002	NC_008258	TTC	2	6	55517	55522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804120
1003	NC_008258	AAT	2	6	55532	55537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110804120
1004	NC_008258	CTAC	2	8	55542	55549	25 %	25 %	0 %	50 %	110804120
1005	NC_008258	AGG	2	6	55579	55584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110804120
1006	NC_008258	GTT	2	6	55627	55632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804120
1007	NC_008258	TCA	2	6	55633	55638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804120
1008	NC_008258	CCA	2	6	55666	55671	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804120
1009	NC_008258	TCG	2	6	55755	55760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804120
1010	NC_008258	GTAC	2	8	55788	55795	25 %	25 %	25 %	25 %	110804120
1011	NC_008258	TCG	2	6	55839	55844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804120
1012	NC_008258	TGG	2	6	56062	56067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804120
1013	NC_008258	T	6	6	56087	56092	0 %	100 %	0 %	0 %	110804120
1014	NC_008258	AT	3	6	56346	56351	50 %	50 %	0 %	0 %	110804121
1015	NC_008258	CGTGGC	2	12	56376	56387	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	110804121
1016	NC_008258	GCG	2	6	56399	56404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804121
1017	NC_008258	T	6	6	56509	56514	0 %	100 %	0 %	0 %	110804121
1018	NC_008258	CCA	2	6	56516	56521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804121
1019	NC_008258	GCCA	2	8	56587	56594	25 %	0 %	25 %	50 %	110804121
1020	NC_008258	GCG	2	6	56635	56640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804121
1021	NC_008258	GGC	2	6	56763	56768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804121
1022	NC_008258	GAA	2	6	56824	56829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804121
1023	NC_008258	ATG	2	6	56869	56874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804121
1024	NC_008258	GGC	2	6	56893	56898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804121
1025	NC_008258	CAG	2	6	56905	56910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804121
1026	NC_008258	GGT	2	6	56920	56925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804121
1027	NC_008258	GCA	2	6	56931	56936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804121
1028	NC_008258	GAT	2	6	56995	57000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804121
1029	NC_008258	ACC	2	6	57004	57009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804121
1030	NC_008258	TGA	2	6	57032	57037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804121
1031	NC_008258	TGG	2	6	57059	57064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804121
1032	NC_008258	GCC	2	6	57075	57080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804121
1033	NC_008258	GAT	2	6	57084	57089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804121
1034	NC_008258	CAG	2	6	57121	57126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804121
1035	NC_008258	AGC	2	6	57143	57148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804121
1036	NC_008258	CAA	2	6	57360	57365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110804122
1037	NC_008258	CCG	2	6	57503	57508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804122
1038	NC_008258	CCA	2	6	57515	57520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804122
1039	NC_008258	CCA	2	6	57608	57613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804122
1040	NC_008258	GATG	2	8	57628	57635	25 %	25 %	50 %	0 %	110804122
1041	NC_008258	GCTCGC	2	12	57668	57679	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	110804122
1042	NC_008258	CGC	2	6	57734	57739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804122
1043	NC_008258	CTGC	2	8	57770	57777	0 %	25 %	25 %	50 %	110804122
1044	NC_008258	TCA	2	6	57800	57805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804122
1045	NC_008258	GAC	2	6	57827	57832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804122
1046	NC_008258	ACA	2	6	57842	57847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110804122
1047	NC_008258	TTG	2	6	57859	57864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804122
1048	NC_008258	ACC	2	6	57865	57870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804122
1049	NC_008258	ATA	2	6	57871	57876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110804122
1050	NC_008258	AACC	2	8	57897	57904	50 %	0 %	0 %	50 %	110804122
1051	NC_008258	CCTG	2	8	57999	58006	0 %	25 %	25 %	50 %	110804123
1052	NC_008258	CTG	2	6	58025	58030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804123
1053	NC_008258	TCG	2	6	58056	58061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804123
1054	NC_008258	TCG	2	6	58125	58130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804123
1055	NC_008258	ATCA	2	8	58148	58155	50 %	25 %	0 %	25 %	110804123
1056	NC_008258	CTG	2	6	58214	58219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804123
1057	NC_008258	TGC	2	6	58237	58242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804123
1058	NC_008258	GCC	2	6	58299	58304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804123
1059	NC_008258	GTT	2	6	58307	58312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804123
1060	NC_008258	CAG	2	6	58325	58330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804123
1061	NC_008258	CCA	2	6	58411	58416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804123
1062	NC_008258	TACC	2	8	58423	58430	25 %	25 %	0 %	50 %	110804123
1063	NC_008258	T	6	6	58443	58448	0 %	100 %	0 %	0 %	110804123
1064	NC_008258	TGC	2	6	58462	58467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804123
1065	NC_008258	TAA	2	6	58528	58533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110804123
1066	NC_008258	GGTGAT	2	12	58574	58585	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	110804123
1067	NC_008258	TGT	2	6	58651	58656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804123
1068	NC_008258	CGC	2	6	58657	58662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804123
1069	NC_008258	TGAT	2	8	58671	58678	25 %	50 %	25 %	0 %	110804123
1070	NC_008258	ATA	2	6	58683	58688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110804123
1071	NC_008258	CAG	2	6	58793	58798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804123
1072	NC_008258	GAC	2	6	59071	59076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804123
1073	NC_008258	GCT	2	6	59083	59088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804123
1074	NC_008258	CAG	2	6	59177	59182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804123
1075	NC_008258	TCT	2	6	59199	59204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804123
1076	NC_008258	GGC	2	6	59216	59221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804123
1077	NC_008258	CG	3	6	59389	59394	0 %	0 %	50 %	50 %	110804123
1078	NC_008258	CCA	2	6	59405	59410	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804123
1079	NC_008258	TCGCTG	2	12	59679	59690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804123
1080	NC_008258	TGC	2	6	59693	59698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804123
1081	NC_008258	ATC	2	6	59730	59735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804123
1082	NC_008258	CAG	2	6	59780	59785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804123
1083	NC_008258	CAG	2	6	59867	59872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804123
1084	NC_008258	CAG	3	9	59924	59932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804123
1085	NC_008258	GTT	2	6	59956	59961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804123
1086	NC_008258	ACC	2	6	60024	60029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804123
1087	NC_008258	ACG	2	6	60077	60082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804123
1088	NC_008258	TCA	3	9	60162	60170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804123
1089	NC_008258	GCA	2	6	60199	60204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804123
1090	NC_008258	CAG	2	6	60259	60264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804123
1091	NC_008258	AG	3	6	60269	60274	50 %	0 %	50 %	0 %	110804123
1092	NC_008258	ATC	2	6	60291	60296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804123
1093	NC_008258	CAGC	2	8	60331	60338	25 %	0 %	25 %	50 %	110804123
1094	NC_008258	CG	3	6	60343	60348	0 %	0 %	50 %	50 %	110804123
1095	NC_008258	GGC	2	6	60355	60360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804123
1096	NC_008258	CAT	2	6	60367	60372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804123
1097	NC_008258	CG	4	8	60462	60469	0 %	0 %	50 %	50 %	110804123
1098	NC_008258	TCT	2	6	60630	60635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804123
1099	NC_008258	CTT	2	6	60640	60645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804123
1100	NC_008258	TGCG	2	8	60724	60731	0 %	25 %	50 %	25 %	110804123
1101	NC_008258	AAAGT	2	10	60760	60769	60 %	20 %	20 %	0 %	110804123
1102	NC_008258	GTG	2	6	61137	61142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804124
1103	NC_008258	TGG	2	6	61173	61178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804124
1104	NC_008258	TTC	2	6	61240	61245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804124
1105	NC_008258	GCG	2	6	61259	61264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804124
1106	NC_008258	CTG	2	6	61426	61431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804124
1107	NC_008258	CTG	2	6	61435	61440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804124
1108	NC_008258	GCG	2	6	61446	61451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804124
1109	NC_008258	GCT	2	6	61494	61499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804124
1110	NC_008258	CCT	2	6	61506	61511	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110804124
1111	NC_008258	GTT	2	6	61623	61628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804124
1112	NC_008258	CCA	2	6	61645	61650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804124
1113	NC_008258	TGC	2	6	61661	61666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804124
1114	NC_008258	CGC	2	6	61687	61692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804124
1115	NC_008258	CTT	2	6	61695	61700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804124
1116	NC_008258	AGTCG	2	10	61729	61738	20 %	20 %	40 %	20 %	110804124
1117	NC_008258	CGT	2	6	61755	61760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804124
1118	NC_008258	TCAA	2	8	61772	61779	50 %	25 %	0 %	25 %	110804124
1119	NC_008258	TGA	2	6	61802	61807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804124
1120	NC_008258	CGA	2	6	61822	61827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804124
1121	NC_008258	GAA	2	6	61843	61848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804124
1122	NC_008258	GGT	2	6	61858	61863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804124
1123	NC_008258	TTA	2	6	61919	61924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110804124
1124	NC_008258	GGCA	2	8	61976	61983	25 %	0 %	50 %	25 %	110804124
1125	NC_008258	ATCA	2	8	62074	62081	50 %	25 %	0 %	25 %	110804124
1126	NC_008258	GAT	2	6	62092	62097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804124
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1133	NC_008258	TAT	2	6	62625	62630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110804124
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1139	NC_008258	GAG	2	6	62807	62812	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110804124
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1141	NC_008258	GCG	2	6	62928	62933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804124
1142	NC_008258	GGTGA	2	10	63008	63017	20 %	20 %	60 %	0 %	110804124
1143	NC_008258	GGCG	2	8	63044	63051	0 %	0 %	75 %	25 %	110804124
1144	NC_008258	TCA	2	6	63105	63110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804124
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1146	NC_008258	CCTG	2	8	63362	63369	0 %	25 %	25 %	50 %	110804124
1147	NC_008258	CAG	2	6	63501	63506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804125
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1151	NC_008258	TGG	2	6	63839	63844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804125
1152	NC_008258	GCC	2	6	63870	63875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804125
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1155	NC_008258	CGA	2	6	64349	64354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804126
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1157	NC_008258	GC	3	6	64503	64508	0 %	0 %	50 %	50 %	110804126
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1230	NC_008258	CAG	2	6	68545	68550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804128
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1234	NC_008258	A	6	6	68692	68697	100 %	0 %	0 %	0 %	110804128
1235	NC_008258	CGAG	2	8	68714	68721	25 %	0 %	50 %	25 %	110804128
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1241	NC_008258	CGCTGG	2	12	68943	68954	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	110804129
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1245	NC_008258	CTGG	2	8	69085	69092	0 %	25 %	50 %	25 %	110804129
1246	NC_008258	GAA	2	6	69133	69138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804129
1247	NC_008258	GGTC	2	8	69202	69209	0 %	25 %	50 %	25 %	110804129
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