MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 5 str. 8401 chromosome

Total Repeats: 75589

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008258	ATT	2	6	30298	30303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110804100
502	NC_008258	GCG	3	9	30329	30337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804100
503	NC_008258	GAA	2	6	30364	30369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804100
504	NC_008258	TC	4	8	30390	30397	0 %	50 %	0 %	50 %	110804100
505	NC_008258	TGAT	2	8	30413	30420	25 %	50 %	25 %	0 %	110804100
506	NC_008258	GTG	2	6	30457	30462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804100
507	NC_008258	CAT	2	6	30483	30488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804100
508	NC_008258	TGC	2	6	30611	30616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804100
509	NC_008258	GGT	2	6	30637	30642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804100
510	NC_008258	TTC	2	6	30717	30722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804100
511	NC_008258	GGC	2	6	30765	30770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804100
512	NC_008258	TGA	2	6	30803	30808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804100
513	NC_008258	CCT	2	6	30836	30841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110804100
514	NC_008258	CGCA	2	8	30964	30971	25 %	0 %	25 %	50 %	110804100
515	NC_008258	CG	3	6	31129	31134	0 %	0 %	50 %	50 %	110804100
516	NC_008258	CTGT	2	8	31138	31145	0 %	50 %	25 %	25 %	110804100
517	NC_008258	GAA	2	6	31198	31203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804100
518	NC_008258	GC	3	6	31297	31302	0 %	0 %	50 %	50 %	110804100
519	NC_008258	GGCG	2	8	31314	31321	0 %	0 %	75 %	25 %	110804100
520	NC_008258	GAA	2	6	31441	31446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804100
521	NC_008258	GCGAA	2	10	31451	31460	40 %	0 %	40 %	20 %	110804100
522	NC_008258	ACCG	2	8	31468	31475	25 %	0 %	25 %	50 %	110804100
523	NC_008258	A	6	6	31478	31483	100 %	0 %	0 %	0 %	110804100
524	NC_008258	GGC	2	6	31495	31500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804100
525	NC_008258	ACT	2	6	31535	31540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804100
526	NC_008258	CGG	2	6	31725	31730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804100
527	NC_008258	CTGAAA	2	12	31852	31863	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	110804100
528	NC_008258	TGG	2	6	31934	31939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804100
529	NC_008258	CGTC	2	8	31942	31949	0 %	25 %	25 %	50 %	110804100
530	NC_008258	CGG	2	6	31959	31964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804100
531	NC_008258	CGG	2	6	32018	32023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804100
532	NC_008258	TGA	2	6	32067	32072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804100
533	NC_008258	GGC	2	6	32125	32130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804100
534	NC_008258	GGCG	2	8	32151	32158	0 %	0 %	75 %	25 %	110804100
535	NC_008258	CAG	2	6	32230	32235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804100
536	NC_008258	TGA	2	6	32273	32278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804100
537	NC_008258	AAC	2	6	32299	32304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110804100
538	NC_008258	GCG	2	6	32335	32340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804100
539	NC_008258	GGC	2	6	32391	32396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804100
540	NC_008258	TGGC	2	8	32405	32412	0 %	25 %	50 %	25 %	110804100
541	NC_008258	GCTG	2	8	32418	32425	0 %	25 %	50 %	25 %	110804100
542	NC_008258	AAG	2	6	32441	32446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804100
543	NC_008258	CCG	2	6	32452	32457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804100
544	NC_008258	TAC	2	6	32458	32463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804100
545	NC_008258	GTG	2	6	32476	32481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804100
546	NC_008258	GCA	2	6	32600	32605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804100
547	NC_008258	CCA	2	6	32609	32614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804100
548	NC_008258	GAA	2	6	32616	32621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804100
549	NC_008258	GCT	2	6	32634	32639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804100
550	NC_008258	GTG	2	6	32668	32673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804100
551	NC_008258	GGC	2	6	32679	32684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804100
552	NC_008258	CTG	2	6	32689	32694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804100
553	NC_008258	CACGG	2	10	32722	32731	20 %	0 %	40 %	40 %	110804100
554	NC_008258	CAT	2	6	32835	32840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804100
555	NC_008258	ACC	2	6	32845	32850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804100
556	NC_008258	CGT	2	6	32857	32862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804100
557	NC_008258	ACC	2	6	32923	32928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804100
558	NC_008258	GGT	2	6	32935	32940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804100
559	NC_008258	GCAC	2	8	33003	33010	25 %	0 %	25 %	50 %	110804100
560	NC_008258	ATA	2	6	33018	33023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110804100
561	NC_008258	AT	3	6	33197	33202	50 %	50 %	0 %	0 %	110804101
562	NC_008258	TG	3	6	33284	33289	0 %	50 %	50 %	0 %	110804101
563	NC_008258	GAT	2	6	33333	33338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804101
564	NC_008258	GGTG	2	8	33350	33357	0 %	25 %	75 %	0 %	110804101
565	NC_008258	AG	3	6	33364	33369	50 %	0 %	50 %	0 %	110804101
566	NC_008258	GAT	2	6	33462	33467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804101
567	NC_008258	TAA	2	6	33471	33476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110804101
568	NC_008258	CG	3	6	33543	33548	0 %	0 %	50 %	50 %	110804101
569	NC_008258	AAGA	2	8	33585	33592	75 %	0 %	25 %	0 %	110804101
570	NC_008258	GAT	2	6	33648	33653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804101
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572	NC_008258	CGT	2	6	33785	33790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804102
573	NC_008258	TCC	2	6	33813	33818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110804102
574	NC_008258	TCG	2	6	33912	33917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804102
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576	NC_008258	CAA	2	6	34009	34014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110804102
577	NC_008258	CT	3	6	34017	34022	0 %	50 %	0 %	50 %	110804102
578	NC_008258	CCAT	2	8	34038	34045	25 %	25 %	0 %	50 %	110804102
579	NC_008258	CA	3	6	34085	34090	50 %	0 %	0 %	50 %	110804102
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584	NC_008258	CTT	2	6	34482	34487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804103
585	NC_008258	TGG	2	6	34503	34508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804103
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589	NC_008258	GCA	2	6	34713	34718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804103
590	NC_008258	CCG	2	6	34721	34726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804103
591	NC_008258	GCC	2	6	34799	34804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804103
592	NC_008258	CCG	2	6	34820	34825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804103
593	NC_008258	ACC	2	6	34897	34902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804103
594	NC_008258	CTG	2	6	34935	34940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804103
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596	NC_008258	TAA	2	6	34989	34994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110804103
597	NC_008258	T	6	6	35165	35170	0 %	100 %	0 %	0 %	110804103
598	NC_008258	GAC	2	6	35174	35179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804103
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602	NC_008258	ATT	2	6	35273	35278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110804104
603	NC_008258	A	6	6	35364	35369	100 %	0 %	0 %	0 %	110804104
604	NC_008258	TTCA	2	8	35394	35401	25 %	50 %	0 %	25 %	110804104
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606	NC_008258	CGAAT	2	10	35431	35440	40 %	20 %	20 %	20 %	110804104
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609	NC_008258	CGA	2	6	35555	35560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804104
610	NC_008258	A	7	7	35564	35570	100 %	0 %	0 %	0 %	110804104
611	NC_008258	CTT	2	6	35573	35578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804104
612	NC_008258	AGCC	2	8	35608	35615	25 %	0 %	25 %	50 %	110804104
613	NC_008258	TCG	2	6	35740	35745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804104
614	NC_008258	CCCG	2	8	35770	35777	0 %	0 %	25 %	75 %	110804104
615	NC_008258	CGT	2	6	35794	35799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804104
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621	NC_008258	CAC	2	6	36231	36236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804104
622	NC_008258	TCGG	2	8	36242	36249	0 %	25 %	50 %	25 %	110804104
623	NC_008258	GGT	2	6	36252	36257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804104
624	NC_008258	CCG	2	6	36278	36283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804104
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626	NC_008258	GTT	2	6	36326	36331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804104
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