MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 5 str. 8401 chromosome

Total Repeats: 75589

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_008258	GCC	2	6	495629	495634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804520
8502	NC_008258	TGC	2	6	495692	495697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804520
8503	NC_008258	CTG	3	9	495703	495711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804520
8504	NC_008258	TGC	2	6	495713	495718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804520
8505	NC_008258	GCA	3	9	495741	495749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804520
8506	NC_008258	ACT	2	6	495770	495775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804520
8507	NC_008258	TTAA	2	8	495778	495785	50 %	50 %	0 %	0 %	110804520
8508	NC_008258	CAT	2	6	495832	495837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804520
8509	NC_008258	GCC	2	6	495996	496001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804520
8510	NC_008258	TATTT	2	10	496156	496165	20 %	80 %	0 %	0 %	110804520
8511	NC_008258	GGTC	2	8	496305	496312	0 %	25 %	50 %	25 %	110804520
8512	NC_008258	TGG	2	6	496349	496354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804520
8513	NC_008258	TGTTGC	2	12	496376	496387	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	110804520
8514	NC_008258	CAGGTG	2	12	496393	496404	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	110804520
8515	NC_008258	TCA	2	6	496419	496424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804520
8516	NC_008258	TGG	2	6	496430	496435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804520
8517	NC_008258	A	6	6	496459	496464	100 %	0 %	0 %	0 %	110804520
8518	NC_008258	CTG	2	6	496465	496470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804520
8519	NC_008258	GTTT	2	8	496506	496513	0 %	75 %	25 %	0 %	110804520
8520	NC_008258	TGG	2	6	496520	496525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804520
8521	NC_008258	GCT	3	9	496632	496640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804520
8522	NC_008258	CGG	2	6	496650	496655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804520
8523	NC_008258	CTGG	2	8	496656	496663	0 %	25 %	50 %	25 %	110804520
8524	NC_008258	TGA	2	6	496711	496716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804520
8525	NC_008258	T	6	6	497488	497493	0 %	100 %	0 %	0 %	110804521
8526	NC_008258	CCAG	2	8	497544	497551	25 %	0 %	25 %	50 %	110804521
8527	NC_008258	TGC	2	6	497568	497573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804521
8528	NC_008258	GGT	2	6	497575	497580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804521
8529	NC_008258	TCG	2	6	497705	497710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804521
8530	NC_008258	ATG	2	6	497731	497736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804521
8531	NC_008258	TTCA	2	8	497755	497762	25 %	50 %	0 %	25 %	110804521
8532	NC_008258	TCT	2	6	497789	497794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804521
8533	NC_008258	ACC	2	6	497795	497800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804521
8534	NC_008258	CGC	2	6	497806	497811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804521
8535	NC_008258	TCGC	2	8	497821	497828	0 %	25 %	25 %	50 %	110804521
8536	NC_008258	ATC	2	6	497858	497863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804521
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8538	NC_008258	TGT	2	6	498035	498040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804521
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8540	NC_008258	AATC	2	8	498168	498175	50 %	25 %	0 %	25 %	110804521
8541	NC_008258	CAGC	2	8	498187	498194	25 %	0 %	25 %	50 %	110804521
8542	NC_008258	GCA	2	6	498229	498234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804521
8543	NC_008258	GCT	2	6	498285	498290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804521
8544	NC_008258	CCA	2	6	498306	498311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804521
8545	NC_008258	CAGCGC	2	12	498322	498333	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	110804521
8546	NC_008258	CGG	2	6	498369	498374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804521
8547	NC_008258	GCG	2	6	498410	498415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804521
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8549	NC_008258	CAG	2	6	498478	498483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804521
8550	NC_008258	GT	3	6	498503	498508	0 %	50 %	50 %	0 %	110804521
8551	NC_008258	CT	3	6	498509	498514	0 %	50 %	0 %	50 %	110804521
8552	NC_008258	TCT	2	6	498664	498669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804522
8553	NC_008258	AGG	2	6	498717	498722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110804522
8554	NC_008258	GTT	2	6	498752	498757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804522
8555	NC_008258	A	6	6	498793	498798	100 %	0 %	0 %	0 %	110804522
8556	NC_008258	GCG	2	6	498823	498828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804522
8557	NC_008258	AAT	2	6	498852	498857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110804522
8558	NC_008258	CCG	2	6	498926	498931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804522
8559	NC_008258	GAT	2	6	498983	498988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804522
8560	NC_008258	CCG	2	6	498989	498994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804522
8561	NC_008258	GTT	2	6	499215	499220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804522
8562	NC_008258	CAT	2	6	499250	499255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804522
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8564	NC_008258	TCG	2	6	499418	499423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804522
8565	NC_008258	GCA	2	6	499809	499814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804523
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8569	NC_008258	TGG	2	6	500012	500017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804523
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8572	NC_008258	CGG	2	6	500166	500171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804523
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8588	NC_008258	GAT	2	6	500973	500978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804524
8589	NC_008258	GTT	2	6	500988	500993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804524
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8593	NC_008258	GTCA	2	8	501045	501052	25 %	25 %	25 %	25 %	110804524
8594	NC_008258	CCGC	2	8	501073	501080	0 %	0 %	25 %	75 %	110804524
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8596	NC_008258	ATGT	2	8	501239	501246	25 %	50 %	25 %	0 %	110804525
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8602	NC_008258	CG	3	6	501516	501521	0 %	0 %	50 %	50 %	110804525
8603	NC_008258	AGA	2	6	501535	501540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804525
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8613	NC_008258	ATATTG	2	12	502101	502112	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	110804525
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8987	NC_008258	AGCG	2	8	528262	528269	25 %	0 %	50 %	25 %	110804548
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8991	NC_008258	GCG	2	6	528500	528505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804548
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