MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 5 str. 8401 chromosome

Total Repeats: 75589

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_008258	AGGA	2	8	354059	354066	50 %	0 %	50 %	0 %	110804393
6002	NC_008258	CTG	2	6	354074	354079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804393
6003	NC_008258	GCC	2	6	354082	354087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804393
6004	NC_008258	GTT	2	6	354097	354102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804393
6005	NC_008258	TGC	2	6	354117	354122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804393
6006	NC_008258	CTC	2	6	354184	354189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110804393
6007	NC_008258	AAG	2	6	354191	354196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804393
6008	NC_008258	A	6	6	354216	354221	100 %	0 %	0 %	0 %	110804393
6009	NC_008258	TGGA	2	8	354333	354340	25 %	25 %	50 %	0 %	110804394
6010	NC_008258	GCC	2	6	354343	354348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804394
6011	NC_008258	GTC	2	6	354352	354357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804394
6012	NC_008258	TGA	2	6	354362	354367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804394
6013	NC_008258	TCG	2	6	354425	354430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804394
6014	NC_008258	GCT	2	6	354440	354445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804394
6015	NC_008258	CTG	2	6	354541	354546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804394
6016	NC_008258	GAAA	2	8	354587	354594	75 %	0 %	25 %	0 %	110804394
6017	NC_008258	CTG	2	6	354629	354634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804394
6018	NC_008258	GA	4	8	354643	354650	50 %	0 %	50 %	0 %	110804394
6019	NC_008258	CTG	2	6	354674	354679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804394
6020	NC_008258	GCACT	2	10	354690	354699	20 %	20 %	20 %	40 %	110804394
6021	NC_008258	CGG	2	6	354713	354718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804394
6022	NC_008258	CGC	2	6	354765	354770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804394
6023	NC_008258	CGT	2	6	354787	354792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804394
6024	NC_008258	AGTGG	2	10	354797	354806	20 %	20 %	60 %	0 %	110804394
6025	NC_008258	GAA	2	6	354878	354883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804394
6026	NC_008258	CGG	2	6	354886	354891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804394
6027	NC_008258	AG	3	6	354920	354925	50 %	0 %	50 %	0 %	110804394
6028	NC_008258	AAG	2	6	355001	355006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804394
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6030	NC_008258	GACAG	2	10	355287	355296	40 %	0 %	40 %	20 %	110804395
6031	NC_008258	CTGG	2	8	355308	355315	0 %	25 %	50 %	25 %	110804395
6032	NC_008258	TGA	2	6	355403	355408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804395
6033	NC_008258	TGA	2	6	355521	355526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804395
6034	NC_008258	GGCT	2	8	355567	355574	0 %	25 %	50 %	25 %	110804395
6035	NC_008258	GTT	3	9	355585	355593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804395
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6039	NC_008258	T	6	6	355833	355838	0 %	100 %	0 %	0 %	110804395
6040	NC_008258	GTT	2	6	355842	355847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804395
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6044	NC_008258	TAA	2	6	356734	356739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110804396
6045	NC_008258	TC	3	6	356808	356813	0 %	50 %	0 %	50 %	110804396
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6051	NC_008258	ATT	2	6	356968	356973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110804396
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6053	NC_008258	TGA	2	6	357018	357023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804396
6054	NC_008258	GTC	2	6	357059	357064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804396
6055	NC_008258	GCT	2	6	357077	357082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804396
6056	NC_008258	GGC	2	6	357092	357097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804396
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6059	NC_008258	ATC	2	6	357294	357299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804397
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6062	NC_008258	AAT	2	6	357341	357346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110804397
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