MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 5 str. 8401 chromosome

Total Repeats: 75589

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_008258	TCC	2	6	323437	323442	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110804367
5502	NC_008258	GCA	2	6	323643	323648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804368
5503	NC_008258	GTGG	2	8	323658	323665	0 %	25 %	75 %	0 %	110804368
5504	NC_008258	TCG	2	6	323779	323784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804368
5505	NC_008258	GCA	2	6	323826	323831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804368
5506	NC_008258	GCAG	2	8	323848	323855	25 %	0 %	50 %	25 %	110804368
5507	NC_008258	GGC	2	6	323911	323916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804368
5508	NC_008258	CT	3	6	324123	324128	0 %	50 %	0 %	50 %	110804368
5509	NC_008258	GGCA	2	8	324134	324141	25 %	0 %	50 %	25 %	110804368
5510	NC_008258	CG	3	6	324154	324159	0 %	0 %	50 %	50 %	110804368
5511	NC_008258	CCG	2	6	324272	324277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804368
5512	NC_008258	TGG	2	6	324317	324322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804368
5513	NC_008258	GAT	2	6	325441	325446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804369
5514	NC_008258	AAT	2	6	325448	325453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110804369
5515	NC_008258	AT	3	6	325525	325530	50 %	50 %	0 %	0 %	110804369
5516	NC_008258	GATC	2	8	325567	325574	25 %	25 %	25 %	25 %	110804369
5517	NC_008258	ATA	2	6	325667	325672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110804369
5518	NC_008258	TTC	2	6	325700	325705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804369
5519	NC_008258	GCT	2	6	325735	325740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804369
5520	NC_008258	GCCC	2	8	325799	325806	0 %	0 %	25 %	75 %	110804369
5521	NC_008258	CGTCC	2	10	325814	325823	0 %	20 %	20 %	60 %	110804369
5522	NC_008258	CT	3	6	325884	325889	0 %	50 %	0 %	50 %	110804369
5523	NC_008258	CA	3	6	325995	326000	50 %	0 %	0 %	50 %	110804369
5524	NC_008258	CGGT	2	8	326025	326032	0 %	25 %	50 %	25 %	110804369
5525	NC_008258	TGC	2	6	326101	326106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804369
5526	NC_008258	TGA	2	6	326107	326112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804369
5527	NC_008258	GCT	2	6	326146	326151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804369
5528	NC_008258	TAGCGG	2	12	326187	326198	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	110804369
5529	NC_008258	CTG	2	6	326455	326460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804370
5530	NC_008258	TGCG	2	8	326546	326553	0 %	25 %	50 %	25 %	110804370
5531	NC_008258	GTA	2	6	326638	326643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804370
5532	NC_008258	TGC	2	6	326657	326662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804370
5533	NC_008258	CTT	2	6	326811	326816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804370
5534	NC_008258	TGC	2	6	326882	326887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804370
5535	NC_008258	GCA	2	6	326898	326903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804370
5536	NC_008258	GGC	2	6	326904	326909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804370
5537	NC_008258	CTG	2	6	326926	326931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804370
5538	NC_008258	GAT	2	6	326968	326973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804370
5539	NC_008258	CCGT	2	8	327043	327050	0 %	25 %	25 %	50 %	110804370
5540	NC_008258	CGT	2	6	327054	327059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804370
5541	NC_008258	CGTTGC	2	12	327081	327092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804370
5542	NC_008258	GC	3	6	327160	327165	0 %	0 %	50 %	50 %	110804370
5543	NC_008258	CG	3	6	327174	327179	0 %	0 %	50 %	50 %	110804370
5544	NC_008258	GCT	2	6	327223	327228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804370
5545	NC_008258	CTG	2	6	327262	327267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804370
5546	NC_008258	CGTC	2	8	327339	327346	0 %	25 %	25 %	50 %	110804370
5547	NC_008258	CCG	2	6	327348	327353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804370
5548	NC_008258	CG	3	6	327426	327431	0 %	0 %	50 %	50 %	110804370
5549	NC_008258	CGC	2	6	327453	327458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804370
5550	NC_008258	TCA	2	6	327494	327499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804370
5551	NC_008258	GTC	2	6	327583	327588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804370
5552	NC_008258	CAC	2	6	327670	327675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804370
5553	NC_008258	CCG	2	6	327773	327778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804370
5554	NC_008258	TCA	2	6	327812	327817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804370
5555	NC_008258	ACC	2	6	327819	327824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804370
5556	NC_008258	ACC	2	6	327854	327859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804370
5557	NC_008258	GT	3	6	327914	327919	0 %	50 %	50 %	0 %	110804370
5558	NC_008258	CCA	2	6	327921	327926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804370
5559	NC_008258	CG	3	6	327927	327932	0 %	0 %	50 %	50 %	110804370
5560	NC_008258	GGTA	2	8	327957	327964	25 %	25 %	50 %	0 %	110804370
5561	NC_008258	TCA	2	6	327996	328001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804370
5562	NC_008258	CAC	2	6	328048	328053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804370
5563	NC_008258	CAGT	2	8	328056	328063	25 %	25 %	25 %	25 %	110804370
5564	NC_008258	TCG	2	6	328073	328078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804370
5565	NC_008258	CGCC	2	8	328106	328113	0 %	0 %	25 %	75 %	110804370
5566	NC_008258	GCT	2	6	328186	328191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804370
5567	NC_008258	TCA	2	6	328286	328291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804370
5568	NC_008258	TCA	2	6	328295	328300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804370
5569	NC_008258	CGGT	2	8	328316	328323	0 %	25 %	50 %	25 %	110804370
5570	NC_008258	GCA	2	6	328329	328334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804370
5571	NC_008258	TGG	2	6	328391	328396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804370
5572	NC_008258	AT	3	6	328457	328462	50 %	50 %	0 %	0 %	110804370
5573	NC_008258	TGGC	2	8	328535	328542	0 %	25 %	50 %	25 %	110804370
5574	NC_008258	CAGG	2	8	328563	328570	25 %	0 %	50 %	25 %	110804370
5575	NC_008258	GCA	2	6	328599	328604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804370
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5577	NC_008258	GTG	2	6	328619	328624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804370
5578	NC_008258	CCA	2	6	328688	328693	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804370
5579	NC_008258	GCTG	2	8	328934	328941	0 %	25 %	50 %	25 %	110804371
5580	NC_008258	GGC	2	6	329025	329030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804371
5581	NC_008258	A	7	7	329187	329193	100 %	0 %	0 %	0 %	110804371
5582	NC_008258	AAT	2	6	329211	329216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110804371
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5587	NC_008258	GGC	2	6	329600	329605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804372
5588	NC_008258	GGT	2	6	329613	329618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804372
5589	NC_008258	CAGG	2	8	329726	329733	25 %	0 %	50 %	25 %	110804372
5590	NC_008258	AGC	2	6	329738	329743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804372
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5592	NC_008258	T	6	6	329790	329795	0 %	100 %	0 %	0 %	110804373
5593	NC_008258	GGTA	2	8	329812	329819	25 %	25 %	50 %	0 %	110804373
5594	NC_008258	ATC	2	6	329830	329835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804373
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5599	NC_008258	TGG	2	6	330075	330080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804373
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5601	NC_008258	T	6	6	330164	330169	0 %	100 %	0 %	0 %	110804373
5602	NC_008258	ATC	2	6	330226	330231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804373
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5604	NC_008258	CCCT	2	8	330259	330266	0 %	25 %	0 %	75 %	110804373
5605	NC_008258	CGG	2	6	330319	330324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804373
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5609	NC_008258	GCCGG	2	10	330563	330572	0 %	0 %	60 %	40 %	110804373
5610	NC_008258	TGG	2	6	330642	330647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804373
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5987	NC_008258	CGT	2	6	352489	352494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804392
5988	NC_008258	GCACA	2	10	352511	352520	40 %	0 %	20 %	40 %	110804392
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5990	NC_008258	GA	3	6	352666	352671	50 %	0 %	50 %	0 %	110804392
5991	NC_008258	ACGGA	2	10	352686	352695	40 %	0 %	40 %	20 %	110804392
5992	NC_008258	GTC	2	6	352784	352789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804392
5993	NC_008258	TCT	2	6	352794	352799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804392
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